私たちは、私たちは、この研究のために彼の赤いクローバーのプロットからサンプルを使用できるようにするための、ケンタッキー大学遅く博士ノーム·テイラー、専攻植物や土壌学に感謝。このプロジェクトは、米国農務省によって資金を供給された。

1。植物エキスの調製<ol><li> アカツメクサの CVからのフェノール化合物の抽出にケーガンとFlythe 10を参照してください。 Kenland。 </li><li>他の植物に他の化合物を抽出するために、（多くは説明されている）植物または代謝固有の抽出方法のための植物化学物質の分析資料を確認するか、ワイドで多くの化合物を分離するようなKhurram ら 7,8のもののようなプロトコルを探す極性の範囲。 </li></ol> 2。薄層プレートの作製<ol><li>現像所のゾーンから吸着された汚染物質を移動させるために、1種以上の極性、中性溶媒中で現像したクリーンTLCプレート。 <ol><li>ドラフト内で、十分な洗浄溶剤を作製し（酢酸エチル-メタノール2:1、例えば 15〜100ミリリットル、v / v）でTLC現像室の底部、並びにTLCプレートの下縁組覆うようにチャンバー内。 </li><li>商業を使うcially可能なガラスTLCは、箔で覆われたパイレックスビーカーや保存瓶（蓋で利用可能なさまざまなサイズ、）チャンバを開発する。 </li><li>アルミニウムまたは利用可能な現像室に合わせて、様々なサイズ（20センチのX 20センチメートル以下）に来るプラスチック担保（フレックス）シリカゲルプレートを、カットするはさみを使用してください。 （注意：吸入するとシリカは、肺の損傷を引き起こす可能性シリカに皮脂が出るのを避けるためにドラフト内で作業し、手袋をTLCプレートを処理します。） </li><li>チャンバ壁に立てかけトップスと、チャンバー内にプレートを挿入します。プレートは互いに接触しないようにしてください。室内をカバーし、溶媒を毛細管現象によって、プレートを上に移動してみましょう。 </li><li>溶媒をプレートの上部に到達したときに、チャンバからプレートを取り外し、溶媒が蒸発するまでヒュームフード内で起立位置​​に配置する。 </li><li>不純物が目に見えるの下に黄色の帯を探すことによって、TLCプレートの上部に移動したかどうかを確認します光、紫外線（UV）光下での蛍光バンド（「不純物前」または図2BのIFを参照してください）。プレートの大部分は依然として黄色味を有する場合に、洗浄工程を繰り返す。 </li><li>チャンバーからTLCプレートを除去した後、溶剤を捨てる。残留溶媒は、プロトコル2用のチャンバーを使用する前に完全に蒸発することができます。 </li><li>シリカ上の化合物16の移動に影響を与えることができる残留水分を除去するために、100°C（19センチ×20センチ板10〜15分間、7センチメートル×10cmプレートで5分間の乾燥オーブン中で直立板を支える）。 </li><li> 100℃の乾燥炉を使用できない場合は、より低い温度（60℃、 即ち 40分）でのより長時間熱板。 </li><li>プレートが乾燥した後、それらをロードする前に、周囲温度まで冷却してみましょう。 </li></ol></li></ol> 3。抽出分離のためのチェンバースを開発する準備<oL&gt; <li>少しチャンバ高下の濾紙、幅約半分のチャンバ周囲をカットするはさみを使用してください。本論文では、このように分離1の再現性を向上させる、チャンバ壁を溶剤および溶剤蒸気とのチェンバーを飽和描く芯として機能します。 </li><li>ドラフト内で、（この研究のための酢酸エチル - メタノール4:1、体積/体積）の溶媒を混合する。チャンバー内に混合溶媒を注ぎ、カバーしています。全体芯が溶媒で濡れになるまでチャンバー内にプレートを入れて、チャンバー飽和を示す、待ちます。 </li></ol> 4。 TLCプレートのロードと開発<ol><li>軽く鉛筆で起源をマーク。 TLCプレートの吸着剤は柔らかく、容易に破損している場合は、エッジにマークを作る。 TLCプレートをチャンバー内に挿入されたときの化合物は、現像溶媒の表面上にあるべきである。 </li><li>代わりに濁っの濃縮溶液を持つように十分な有機溶剤（この場合は、メタノール）での抽出物を溶解させるサスペンション。 </li><li>プレートの側面に1cmのボーダーを残しマイクロシリンジまたはキャピラリーマイクロピペットと狭帯域などの負荷サンプルと標準。バンドは（ドラフト内でプレートをあおるか、それをロードすることができます）乾燥させます。 </li><li>サンプルの高い濃度は、乾燥したバンドで再度サンプルをロードすることによって、プレート、「overspot」に必要な場合。 </li><li>ピンセットやトングで、飽和TLC室内プレート（複数可）を設定します。それはこのように、化合物の移行のパスを変更すること、接触点でプレートに溶剤を提供する可能性があるため、プレートを芯に触れないようにしてください。室内をカバーし、プレートを開発してみましょう。 </li></ol> 5。バイオアッセイ用プレートの作製<ol><li>溶媒先端がプレートの最上部に到達する前に、TLCタンクからプレートを取り外して、鉛筆で溶媒先端の​​高さをマーク。ドラフト内でプレートを乾燥させる。 <ol><li> GEと同じTLCチャンバー内に残っているTLCプレートを開発閉じたままかどう全体の日のnerally使える。チャンバ内の溶媒の量が顕著に減少した場合TLCチャンバーのための溶媒の混合物を作り直す。 </li></ol></li><li>プレートが乾燥した後、可視光または紫外光の下でバンドを可視化し、鉛筆でバンドを描く。ポータブルUVランプで表示する室は、ランプが254ナノメートル（短波長紫外線）と365 nmの（長波長紫外線）の両方で化合物を検出することができる場合は特に便利です。 注：この時点で、または次の工程の後に、プレートをホイルで覆い、プラスチックラップでラップすることができ、-20℃で保存最大蓄積時間は、化合物の安定性に依存している。シリカは中立的ではないので、いくつかの化合物は、TLCプレート上でしばらく低下することがあります。 </li><li>写真やプレートを描く。 <ol><li>オーバーヘッドUVおよび/または可視光を搭載した1が利用可能な場合はゲルphotodocumentationシステムを使用しています。 </li><li>商用photodocumentationシステムが使用できない場合、暗い紙や布を敷いた箱の内部写真プレート、ウィスコンシン州三脚にカメラをセットし、携帯用のUV光を17番目のリングスタンドにクランプ。全く蛍光指示薬を持っていないプレートを撮影すると、バンドの外観17を改善するためにカメラのレンズを介して青色光フィルターを使用しています。 </li></ol></li><li>特徴付けるバンドを助けるために、化合物および溶媒先端が移動した距離を測定し、後者（ 図2A）によって、前者を分割して保持係数（R f）の値を計算する。 </li></ol> 6。細菌培養およびアッセイ<ol><li>準備し、嫌気的条件下でメディアを接種する。この場合に使用される文化は、ジェームズ·B.ラッセル、コーネル大学、ニューヨーク州イサカの培養コレクションから得られたクロストリジウムsticklandiiひずみSR、だった。 <ol><li> Flytheとケーガン13とHABの媒体の説明のための材料のリストを参照してください。 </li></ol></li><li>指数関数的または定常期に文化を育てる。無菌嫌気techniquを使用ES嫌気性微生物を扱う。 </li><li> 60℃未満まで減少した寒天（V / Wの0.75％）の温度が溶融寒天に（1％v / v）の培養物に接種穏やかに混合し、すぐに注ぐた ​​めに嫌気性チャンバー（HABメディアの95％がCO 2 -5％H 2雰囲気）に持ち込む。 </li><li> 15ミリメートル×100ミリメートルのプラスチックペトリ皿に注ぎ、固化することを可能にする。 </li><li>はさみで、目的のバンドを含有するゾーンにTLCプレートをカット。バンドは、TLCプレート上に元の方向を追跡するために、バッキングプレート上にマーキングバンドを、寒天プレート上に下向きに横たわっ。コントロールとして寒天プレート上に未使用のTLCストリップを置く。 </li><li>嫌気性チャンバー（24時間、39℃）で、ダウン寒天プレートをインキュベートし、寒天側。 </li></ol> 7。バイオアッセイ寒天プレートの可視化<ol><li>彼らは嫌気室にいる間鉗子で、寒天プレートからバンドを削除します。 </li><li> 1％の追加（w / v）のテ水中で調製trazolium赤は、寒天プレートの表面に滴下した。色は、少なくとも20分間開発できるようにするか、制御板は、嫌気性チャンバーから取り外す前に、完全に赤に変わるまで。嫌気性細菌はすぐに嫌気槽から取り出し、実行可能性を失い始めますが、色は24以上の時間安定している。 </li><li>可視光下で撮影しています。 </li></ol>

<ol>
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Prod. 50 (1), 19-22 (1987).</li><li>Flythe, M., Kagan, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Antimicrobial+effect+of+red+clover+(Trifolium+pratense)+phenolic+extract+on+the+ruminal+hyper+ammonia-producing+bacterium,+Clostridium+sticklandii.">Antimicrobial effect of red clover (Trifolium pratense) phenolic extract on the ruminal hyper ammonia-producing bacterium, Clostridium sticklandii.</a> Curr. Microbiol. 61, 125-131 .</li><li>Rahalison, L., Hamburger, M., Hostettmann, K., Monod, M., Frenk, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+bioautographic+agar+overlay+method+for+the+detection+of+antifungal+compounds+from+higher+plants.">A bioautographic agar overlay method for the detection of antifungal compounds from higher plants.</a> Phytochem. Anal. 2 (5), 199-203 (1991).</li><li>Chomnawang, M. T., Trinapakul, C., Gritsanapan, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In+vitro+antigonococcal+activity+of+Coscinium+fenestratum+stem+extract.">In vitro antigonococcal activity of Coscinium fenestratum stem extract.</a> J. Ethnopharmacol. 122, 445-449 (2009).</li><li>Stahl, E., Kaldewey, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Spurenanalyse+physiologisch+aktiver,+einfacher+Indolderivate.">Spurenanalyse physiologisch aktiver, einfacher Indolderivate.</a> Hoppe-Seyler&#8217;s Z. Physiol. Chem. 323, 182-191 .</li><li>Kagan, I. 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G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+new+2D-TLC+bioautography+method+for+the+discovery+of+novel+antifungal+agents+to+control+plant+pathogens.">A new 2D-TLC bioautography method for the discovery of novel antifungal agents to control plant pathogens.</a> J. Nat. Prod. 63 (8), 1050-1054 (2000).</li><li>Beck, A. B., Knox, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+acylated+isoflavone+glycosides+from+subterranean+clover+and+red+clover.">The acylated isoflavone glycosides from subterranean clover and red clover.</a> Aust. J. Chem. 24 (7), 1509-1518 (1971).</li><li>Kahn, R. A., Bak, S., Svendsen, I., Halkier, B. A., M&#248;ller, B. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Isolation+and+reconstitution+of+cytochrome+P450ox+and+in+vitro+reconstitution+of+the+entire+biosynthetic+pathway+of+the+cyanogenic+glucoside+dhurrin+from+sorghum.">Isolation and reconstitution of cytochrome P450ox and in vitro reconstitution of the entire biosynthetic pathway of the cyanogenic glucoside dhurrin from sorghum.</a> Plant Physiol. 115 (4), (1997).</li><li>Peterson, C. A., Edgington, L. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+estimation+of+the+fungicide+benomyl+using+a+bioautograph+technique.">Quantitative estimation of the fungicide benomyl using a bioautograph technique.</a> J. Agr. Food Chem. 17 (4), 898-899 (1969).</li></ol>

記事の商号または商用製品に関する記述は、特定の情報を提供する目的のためだけで、米国農務省による推奨や保証を意味するものではありません。著者らは、競合する経済的利害関係を宣言していません。

このプロトコルは、化合物の部分集合に抽出分離し、接触バイオオートグラフィーにより、これらのサブセットを分析するための簡単​​な方法を説明します。この方法は、淋病を引き起こす細菌に対する阻害植物代謝をスクリーニングするChomnawang ら 15によって使用されるものとよく似ています。抗菌植物化合物をスクリーニングするために使用されるバイオオートグラフィ...

植物中の抗菌性化合物をアッセイすることは、植物抽出物の成分を分離するこれらのコンポーネントに試験微生物を露出し、微生物の増殖が化合物のいずれかによって阻害されるかどうかを決定する必要である。多くの化合物は、平坦な表面上で分離することができるので、紙又は薄層クロマトグラフィー（PC又はTLC）による分離が便利である。分離は、いくつかの化合物が吸着剤（パソコンの場合には、セルロース、およびTLCの場合、吸着剤の品種）に強固に結合し、他の1未満の移行で、極性に基づいています。 図1の相対位置の例を示していますシリカTLCプレート上で分離した後、極性および非極性のフェノール化合物。 <img alt="図1" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/51411/51411fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/51411/51411fig1.jpg" /> 図1。シリカ薄層クロマトグラフィー（TLC）プレート上の分離後に異なる極性の化合物の分布を示す図。アカツメクサ（ トリフォチモシー L.）のフェノール化合物は、実施例として使用される。パーティションより容易なclovamideなどの極性化合物、シリカのような極性の吸着剤への強い親和性を有し、原点（OR）の近くに残っている、そのような溶媒先端（SF）に近い3イソフラボンなどの極性の低い化合物、しばらく、溶剤へ（水、酸、または塩基が含まれている場合を除き、シリカよりも極性である）と、遠くプレートまで移動する。 TLCプレート上で抽出物を分離した後、試験微生物は、このように抽出物2の活性成分の同定を迅速化、プレート上の全ての化合物に暴露することができる。真菌や細菌培養がクロマトグラムにさらされている場合は、微生物の増殖は、成長阻害剤を用いた領域上を除いてどこでも発生しますYの化合物。真菌細胞を生きた4により低減又は加水分解されたときに色を変更する化合物を噴霧することにより3または適用された場合に阻害ゾーンは、その後、菌糸体の成長および増殖を含まない領域とのコントラストを観察することによって視覚化することができる。抗菌性アッセイのための紙又は薄層クロマトグラムの使用は、第5の抗生物質及び殺菌剤3,6に適用したが、植物抽出物は、現在、頻繁に、しばしばバイオオートグラフィーと称されるこの方法では、抗菌性化合物についてスクリーニングされる。ここに記載されたプロトコルは、薄層クロマトグラムのバイオオートグラフィーに適用されます。それは比較的迅速であり、異なる吸着剤（ 例えば 、シリカ、デンプン、アルミナ）、ならびに良好な解像度及び感度1を提供することで行うことができるので、TLCが広く用いられている。 植物抽出物は、多くの方法でTLCのために調製することができる。一般的な方法は、ALCで抽出植物材料を含むそのような可能性の酸または塩基9を添加し、80％エタノール、7,8、等ohol -水の混合物である。彼らは最小容量のTLCプレートに適用することができるように、いくつかの水を含んでいて、おそらく酸性または塩基性であり、このような溶媒中で抽出後、抽出液を濃縮する必要があります。アルコール-水抽出物の濃度は、水非混和性有機溶媒8または例えば酢酸エチル-エチルエーテル（1:1、v / v）の10,11のような溶媒の混合物を分割することによって達成することができる。異なる植物代謝産物は、その極性に応じて、異なる有機溶媒中に抽出される。その植物有機酸または塩基がこの段階で有機溶媒中に抽出されるように、アルコール - 水抽出物のpHを上昇またはその後であり、それらの非解離形へと解離した分析物を変換するための水溶性の酸または塩基を低下させることができる中性有機溶剤に可溶で9。有機相をEすることができます減圧下、または窒素下でvaporatedとTLC用所望の容量に調整した。抽出液のpHを中性溶剤、小さな最終容量、および分離前にTLCプレート上の抽出物の蒸発への検体のパーティショニングによるバイオアッセイの微生物に対して致死的になることはほとんどありません。 真菌および細菌の両方は、植物抽出物2のバイオオートグラフィーの試験微生物として使用される。栄養溶液中でプレート上に噴霧し、数日3湿潤環境でインキュベートした場合などクラドスポリウムククメリヌムなどの一部の真菌の胞子は、TLCプレート（別に阻害化合物を用いた地域からの）上で発芽する。 Cの暗い菌糸非阻害性のゾーンにククメリヌムは菌糸成長のフリーゾーンに鋭い対照を提供しています。細菌は、同様に4,12薄層クロマトグラフィー（TLC）プレートに適用されてきたが、細菌はまた、TLC上に注ぐ寒天オーバーレイ中の板面13,14。例えば、 カンジダ·アルビカンス（Candida albicans）などの酵母は、、ならびに14寒天オーバーレイを適用することができる。あるいは、TLCプレート10,15は、細菌または酵母8、コンタクトバイオオートグラフィー2として知られている方法で接種した寒天上にフェイスダウンで載置することができる。 私たちは、レッドクローバー（ アカツメクサ品種 。Kenland）から抗菌フェノール化合物をスクリーニングするために、コンタクトバイオオートグラフィーのための方法が記載されている。試験微生物は、 クロストリジウム·sticklandii、第一胃ハイパーアンモニア生産菌（HAB）で、嫌気性菌を義務づける。使用分離は抽出物のすべてのコンポーネントを解決しないが、彼らはこのように可能な抗菌性化合物のプールを狭め、抗菌活性のゾーンの識別を容易にする。プロトコルは、TLC 1のための標準的な手順を利用しています。プロトコルは、培養obliに必要な技術のいくつかを説明このようなアッセイのためのゲート嫌気性菌、生細胞2,4を染色するテトラゾリウム塩、接触バイオオートグラフィー15と可視化手法の利用。

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="739">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Silica F254 TLC plates, aluminum-backed, 0.2 mm thickness, 20 &#215; 20 cm</td>
			<td>EMD Chemicals&#160;</td>
			<td>5554/7</td>
			<td>These plates are coated with silica that contains an indicator fluorescing at 254 nm.&#160; Compounds absorbing at that wavelength appear dark on a fluorescent green background.&#160; Alternative sources include Analtech, Selecto Scientific, Fluka.&#160; Adsorbents other than silica may be needed.&#160; Plastic-backed plates may be suitable, depending on the solvents to be used.&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sharp, heavy-duty scissors&#160;</td>
			<td>any sewing supply company</td>
			<td>similar to Fiskars&#160; 175800-1002</td>
			<td>For cutting TLC plates.&#160; A paper cutter with a sharp blade can be used as well.&#160; Do not inhale silica dust.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Drying oven at 100 &#176;C (mechanical convection)</td>
			<td>Thermo Scientific</td>
			<td>PR305225M</td>
			<td>Quincy Lab, Inc, Chicago, IL (www.quincylab.com); Cascade Technical Sciences, Hillsboro, OR (www.cascadetek.com)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>TLC chamber</td>
			<td>Kimble Chase&#160;</td>
			<td>416180-0000</td>
			<td>Alternative sources:&#160; Aldrich. Pyrex beakers or preserving jars can be used for small plates (i.e. 5 &#215; 10 cm).&#160; Cover with aluminum foil (jar lids may contain material extractable by solvent vapors).</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>50-&#181;L syringe with flat needle tip</td>
			<td>Hamilton</td>
			<td>80965</td>
			<td>For loading amounts of standard or sample exceeding 5-10 &#181;L.&#160; Alternative sources are equivalent.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>micropipets</td>
			<td>Drummond</td>
			<td>2-000-001</td>
			<td>For loading small amounts of standards or samples.&#160; Alternative sources:&#160; VWR.&#160; Also, Pasteur pipets can be stretched to a thinner diameter with a butane torch.&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Filter paper (#1 grade)</td>
			<td>Whatman</td>
			<td>1001 917</td>
			<td>Serves as a chamber wick.&#160; Other grades of filter paper are OK.&#160; This size can be trimmed for the chambers holding 20 &#215; 20 cm plates.&#160;&#160;&#160;&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Beaker tongs</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>15-186</td>
			<td>For putting plates in and out of a large TLC chamber.&#160; Alternate sources: VWR&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Flat-edge forceps&#160;</td>
			<td>Fisher Scientific</td>
			<td>10-275</td>
			<td>For putting plates in and out of a small chamber.&#160;&#160; Alternate sources: VWR&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Small portable UV lamp with 4-Watt or 6-Watt bulbs for short- and long-wave UV light illumination (254 and 365 nm, respectively)</td>
			<td>Ultraviolet Products&#160;</td>
			<td>95-0271-01</td>
			<td>Alternate sources: Spectronics Corporation (www.spectroline.net)</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Viewing cabinet for use with hand-held UV lamp</td>
			<td>Ultraviolet Products&#160;</td>
			<td>Chromato-Vue C-10E</td>
			<td>UV-active bands are more easily circled if plates can be set in here.&#160; Alternate sources: Spectronics Corporation.&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Photodocumentation system with overhead UV lamp and visible lamp</td>
			<td>Kodak&#160;</td>
			<td>Gel Logic 200</td>
			<td>&#160;Alternate sources: Ultraviolet Products (www.uvp.com).&#160; See protocol for homemade alternative.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Anaerobic Chamber, Type A, Vinyl</td>
			<td>Coy&#160;</td>
			<td>7150000</td>
			<td>This chamber is appropriate for anaerobic bacteria, like Clostridium sticklandii, as described. &#160;However, growth conditions must be tailored to organism used in the assay.&#160; A biosafety cabinet and other precautions should be taken if pathogenic organisms are used. Alternate sources: Anaerobe Systems, BioRad, Plas Labs, others&#160;</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Tetrazolium red</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>T8877</td>
			<td>Alternate sources: MP Biomedicals, Santa Cruz Biotechnology, Alfa Aesar</td>
		</tr>
		<tr>
			<td></td>
			<td></td>
			<td></td>
			<td>Ingredients for HAB media</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pyridoxamine &#183; 2 HCl</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P9380</td>
			<td>For this and for all the other reagents in this table, alternative sources are equivalent.</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Riboflavin</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>R4500</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Thiamine HCl</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>T3902</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nicotinamide</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>N3376</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Calcium D-Pantothenate</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>C8731</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Lipoic Acid&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>T5625</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>p-Aminobenzoic acid&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>A9878</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Folic acid</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>F8798</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Biotin</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>B4639</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cobalamine&#160;</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>C3607</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pyridoxal HCl</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P9130</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Pyridoxine</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>P5669</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EDTA</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>&#160;E6758</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Iron sulfate &#183; 7 H2O</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>&#160;F8263</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Zinc sulfate &#183; 7 H2O</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>Z0251</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Manganese chloride &#183; 4 H2O</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>M8054</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Boric acid</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>B6768</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cobalt chloride &#183; 6 H2O</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>&#160;C8661</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Copper chloride &#183; 2 H2O</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>459097</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Nickel chloride &#183; 6 H2O</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>203866</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium molybdate &#183; 2 H2O</td>
			<td>Sigma-Aldrich</td>
			<td>331058</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>&#160;Trypticase (Pancreatic digest of casein)</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>B11921</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Potassium phosphate monobasic anhydrous</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>P284</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>sodium carbonate &#183; H2O&#160;</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>S636</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Agar</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>50841063</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Magnesium sulfate &#183; 6 H2O</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>7791-18-6</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Calcium chloride &#183; 2 H2O</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>BP510</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Cysteine HCl</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>19464780</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Potassium phosphate dibasic anhydrous</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>P290</td>
			<td></td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Sodium chloride</td>
			<td>Thermo Fisher</td>
			<td>BP358</td>
			<td></td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

thin-layer chromatographic (tlc) separations and bioassays of plant extracts to identify antimicrobial compounds

植物の抗微生物化合物のための共通の画面（ 例えば 、真菌又は細菌ブロスまたは寒天）、微生物のための時間には成長させる微生物の懸濁液にクロマトグラムを露出させる、紙又は薄層クロマトグラフィー（PC又はTLC）によって植物抽出物を分離することから成り湿った環境、無微生物の増殖のゾーンを可視化する。バイオオートグラフィーとして知られているこのスクリーニング方法の有効性は、クロマトグラフィー分離の品質および微生物の培養条件で撮影されたケアの両方に依存する。本稿では、酸発酵菌アミノための新しいアプリケーションと、TLCおよびコンタクトバイオオートグラフィーのための標準的なプロトコルについて説明します。抽出液を可撓性（アルミニウムで裏打ち）シリカTLCプレート上で分離し、バンドを紫外線（UV）光下で可視化する。ゾーンは、試験微生物を接種した寒天上に切り出し、表面を下にインキュベートする。阻害バンドは寒天プレートを染色することによって可視化されるsのテトラゾリウム赤。この方法は、レッドクローバー（ アカツメクサ品種 。Kenland）フェノール性化合物およびクロストリジウムsticklandii、ウシ第一胃にネイティブなハイパーアンモニア生産菌（HAB）に対する活性のための彼らのスクリーニングの分離に適用されます。 TLC法は、（好気性または嫌気性）、ならびに菌類植物抽出物及び他の細菌種の多くの種類に適用される培養条件は、種の成長要件に適合するように変更された場合に、試験生物として使用することができる。

レッドクローバー（ アカツメクサ品種 。Kenland）抽出物、フェノール化合物を含有する、の代表的なシリカTLC分離は、 図2に示されている。酢酸エチル-ヘキサン中レッドクローバー抽出物の分離は（9:1、v / v）で、8.5を超えるセンチメートル、5つのバンド、不完全原点から解決一方（ 図2A）をもたらした。しかし、 図2（b）は、レッドクローバー?...

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Thin-layer Chromatographic TLC Separations and Bioassays of Plant Extracts to Identify Antimicrobial Compounds

方法は、植物抽出物の薄層クロマトグラフ（TLC）分離および抗菌性代謝物を同定するためのコンタクトバイオオートグラフィーのために記載されている。方法は、ウシ第一胃にネイティブ過剰のアンモニア産生菌（HAB）を阻害レッドクローバーフェノール化合物のスクリーニングに適用される。

薄層クロマトグラフィー（TLC）分離および植物抽出物のバイオアッセイは、抗菌化合物を同定するために

A common screen for plant antimicrobial compounds consists of separating plant extracts by paper or thin-layer chromatography (PC or TLC), exposing the ...

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Thin-layer Chromatographic (TLC) Separations and Bioassays of Plant Extracts to Identify Antimicrobial Compounds

Principles of Chromatography

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67.3K ビュー.  United States Department of Agriculture. 方法は、植物抽出物の薄層クロマトグラフ（TLC）分離および抗菌性代謝物を同定するためのコンタクトバイオオートグラフィーのために記載されている。方法は、ウシ第一胃にネイティブ過剰のアンモニア産生菌（HAB）を阻害レッドクローバーフェノール化合物のスクリーニングに適用される。 

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Profiling the Triacylglyceride Contents in Bat Integumentary Lipids by Preparative Thin Layer Chromatography and MALDI-TOF Mass Spectrometry

The mammalian integument includes sebaceous glands that secrete an oily material onto the skin surface. Sebum production is part of the innate immune system that is protective against pathogenic microbes. Abnormal sebum production and chemical composition are also a clinical symptom of specific skin diseases. Sebum contains a complex mixture of lipids, including triacylglycerides, which is species-specific. The broad chemical properties exhibited by diverse lipid classes hinder the specific determination of sebum composition. Analytical techniques for lipids typically require chemical derivatizations that are labor-intensive and increase sample preparation costs. This paper describes how to extract lipids from mammalian integument, separate broad lipid classes by thin-layer chromatography, and profile the triacylglyceride contents using matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry. This robust method enables a direct determination of the triacylglyceride profiles among species and individuals, and it can be readily applied to any taxonomic group of mammals.

Mammalian integument contains solvent-extractable lipids that can provide chemical compositions characteristic of individual species. This paper presents a routine method for separating broad lipid classes isolated from integumentary tissues using thin layer chromatography and determining the triacylglyceride profile by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry.

分取薄層クロマトグラフィーおよびMALDI-TOF質量分析によってバット外皮脂質中トリアシルグリセリドの内容をプロファイリング

The mammalian integument includes sebaceous glands that secrete an oily material onto the skin surface. Sebum production is part of the innate immune ...

化学

Methods to Identify the NMR Resonances of the 13C-Dimethyl N-terminal Amine on Reductively Methylated Proteins

Nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy is a proven technique for protein structure and dynamic studies. To study proteins with NMR, stable magnetic isotopes are typically incorporated metabolically to improve the sensitivity and allow for sequential resonance assignment. Reductive 13C-methylation is an alternative labeling method for proteins that are not amenable to bacterial host over-expression, the most common method of isotope incorporation. Reductive 13C-methylation is a chemical reaction performed under mild conditions that modifies a protein&#39;s primary amino groups (lysine &#949;-amino groups and the N-terminal &#945;-amino group) to 13C-dimethylamino groups. The structure and function of most proteins are not altered by the modification, making it a viable alternative to metabolic labeling. Because reductive 13C-methylation adds sparse, isotopic labels, traditional methods of assigning the NMR signals are not applicable. An alternative assignment method using mass spectrometry (MS) to aid in the assignment of protein 13C-dimethylamine NMR signals has been developed. The method relies on partial and different amounts of 13C-labeling at each primary amino group. One limitation of the method arises when the protein&#39;s N-terminal residue is a lysine because the &#945;- and &#949;-dimethylamino groups of Lys1 cannot be individually measured with MS. To circumvent this limitation, two methods are described to identify the NMR resonance of the 13C-dimethylamines associated with both the N-terminal &#945;-amine and the side chain &#949;-amine. The NMR signals of the N-terminal &#945;-dimethylamine and the side chain &#949;-dimethylamine of hen egg white lysozyme, Lys1, are identified in 1H-13C heteronuclear single-quantum coherence spectra.

Methods to Identify the NMR Resonances of the 13C-Dimethyl N-terminal Amine on Reductively Methylated Proteins

Two methods for assigning the &#945;- and &#949;-dimethylamine nuclear magnetic resonance signals of a reductively 13C-methylated N-terminal lysine are described. One method utilizes the pH-induced selectivity of the reductive methylation reaction, and the other uses aminopeptidase to selectively remove the N-terminal lysine.

Nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy is a proven technique for protein structure and dynamic studies. To study proteins with NMR, stable magnetic ...

Analysis of Volatile and Oxidation Sensitive Compounds Using a Cold Inlet System and Electron Impact Mass Spectrometry

This video presents a protocol for the mass spectrometrical analysis of volatile and oxidation sensitive compounds using electron impact ionization. The analysis of volatile and oxidation sensitive compounds by mass spectrometry is not easily achieved, as all state-of-the-art mass spectrometric methods require at least one sample preparation step, e.g., dissolution and dilution of the analyte (electrospray ionization), co-crystallization of the analyte with a matrix compound (matrix-assisted laser desorption/ionization), or transfer of the prepared samples into the ionization source of the mass spectrometer, to be conducted under atmospheric conditions. Here, the use of a sample inlet system is described which enables the analysis of volatile metal organyls, silanes, and phosphanes using a sector field mass spectrometer equipped with an electron impact ionization source. All sample preparation steps and the sample introduction into the ion source of the mass spectrometer take place either under air-free conditions or under vacuum, enabling the analysis of compounds highly susceptible to oxidation. The presented technique is especially of interest for inorganic chemists, working with metal organyls, silanes, or phosphanes, which have to be handled using inert conditions, such as the Schlenk technique. The principle of operation is presented in this video.

This video presents a protocol for the mass spectrometrical analysis of volatile and oxidation sensitive compounds using electron impact ionization. The presented technique is especially of interest for inorganic chemists, working with metal organyls, silanes, or phosphanes which have to be handled using inert conditions, such as the Schlenk technique.

コー​​ルドインレットシステムおよび電子衝撃質量分析法を用いて揮発し、酸化に敏感な化合物の分析

This video presents a protocol for the mass spectrometrical analysis of volatile and oxidation sensitive compounds using electron impact ionization. The ...

Sequencing of Plant Wall Heteroxylans Using Enzymic, Chemical (Methylation) and Physical (Mass Spectrometry, Nuclear Magnetic Resonance) Techniques

This protocol describes the specific techniques used for the characterization of reducing end (RE) and internal region glycosyl sequence(s) of heteroxylans. De-starched wheat endosperm cell walls were isolated as an alcohol-insoluble residue (AIR)1 and sequentially extracted with water (W-sol Fr) and 1 M KOH containing 1% NaBH4 (KOH-sol Fr) as described by Ratnayake et al. (2014)2. Two different approaches (see summary in Figure 1) are adopted. In the first, intact W-sol AXs are treated with 2AB to tag the original RE backbone chain sugar residue and then treated with an endoxylanase to generate a mixture of 2AB-labelled RE and internal region reducing oligosaccharides, respectively. In a second approach, the KOH-sol Fr is hydrolyzed with endoxylanase to first generate a mixture of oligosaccharides which are subsequently labelled with 2AB. The enzymically released ((un)tagged) oligosaccharides from both W- and KOH-sol Frs are then methylated and the detailed structural analysis of both the native and methylated oligosaccharides is performed using a combination of MALDI-TOF-MS, RP-HPLC-ESI-QTOF-MS and ESI-MSn. Endoxylanase digested KOH-sol AXs are also characterized by nuclear magnetic resonance (NMR) that also provides information on the anomeric configuration. These techniques can be applied to other classes of polysaccharides using the appropriate endo-hydrolases.

Sequencing of Plant Wall Heteroxylans Using Enzymic, Chemical Methylation and Physical Mass Spectrometry, Nuclear Magnetic Resonance Techniques

This protocol describes the specific techniques used for the structural characterization of reducing end (RE) and internal region glycosyl sequence(s) of heteroxylans by tagging the RE with 2 aminobenzamide prior to enzymatic (endoxylanase) hydrolysis and then analysis of the resultant oligosaccharides using mass spectrometry (MS) and nuclear magnetic resonance (NMR).

酵素的、化学（メチル化）と物理（質量分析、核磁気共鳴）技術を用いた植物の壁ヘテロキシランのシーケンシング

This protocol describes the specific techniques used for the characterization of reducing end (RE) and internal region glycosyl sequence(s) of ...

On-line Analysis of Nitrogen Containing Compounds in Complex Hydrocarbon Matrixes

The shift to heavy crude oils and the use of alternative fossil resources such as shale oil are a challenge for the petrochemical industry. The composition of heavy crude oils and shale oils varies substantially depending on the origin of the mixture. In particular they contain an increased amount of nitrogen containing compounds compared to the conventionally used sweet crude oils. As nitrogen compounds have an influence on the operation of thermal processes occurring in coker units and steam crackers, and as some species are considered as environmentally hazardous, a detailed analysis of the reactions involving nitrogen containing compounds under pyrolysis conditions provides valuable information. Therefore a novel method has been developed and validated with a feedstock containing a high nitrogen content, i.e., a shale oil. First, the feed was characterized offline by comprehensive two-dimensional gas chromatography (GC &#215; GC) coupled with a nitrogen chemiluminescence detector (NCD). In a second step the on-line analysis method was developed and tested on a steam cracking pilot plant by feeding pyridine dissolved in heptane. The former being a representative compound for one of the most abundant classes of compounds present in shale oil. The composition of the reactor effluent was determined via an in-house developed automated sampling system followed by immediate injection of the sample on a GC &#215; GC coupled with a time-of-flight mass spectrometer (TOF-MS), flame ionization detector (FID) and NCD. A novel method for quantitative analysis of nitrogen containing compounds using NCD and 2-chloropyridine as an internal standard has been developed and demonstrated.

A method combining comprehensive two-dimensional gas chromatography with nitrogen chemiluminescence detection has been developed and applied to on-line analysis of nitrogen containing compounds in a complex hydrocarbon matrix.

オンライン複雑な炭化水素マトリックス中の窒素含有化合物の分析

The shift to heavy crude oils and the use of alternative fossil resources such as shale oil are a challenge for the petrochemical industry. The ...

Using Capillary Electrophoresis to Quantify Organic Acids from Plant Tissue: A Test Case Examining Coffea arabica Seeds

Carboxylic acids are organic acids containing one or more terminal carboxyl (COOH) functional groups. Short chain carboxylic acids (SCCAs; carboxylic acids containing three to six carbons), such as malate and citrate, are critical to the proper functioning of many biological systems, where they function in cellular respiration and can serve as indicators of cell health. In foods, organic acid content can have significant impact on taste, with increased SCCA levels resulting in a sour or &#34;acid&#34; taste. Because of this, methods for the rapid analysis of organic acid levels are of particular interest to the food and beverage industries. Unfortunately, however, most methods used for SCCA quantification are dependent on time-consuming protocols requiring the derivatization of samples with hazardous reagents, followed by costly chromatographic and/or mass spectrometric analyses. This method details an alternate method for the detection and quantification of organic acids from plant material and food samples using free zonal capillary electrophoresis (CZE), sometimes simply referred to as capillary electrophoresis (CE). CZE provides a cost-effective method for measuring SCCAs with a low limit of detection (0.005 mg/ml). This article details the extraction and quantification of SCCAs from plant samples. While the method provided focuses on measurement of SCCAs from coffee beans, the method provided can be applied to multiple plant-based food materials.

Using Capillary Electrophoresis to Quantify Organic Acids from Plant Tissue: A Test Case Examining Coffea arabica Seeds

This article presents a method for the detection and quantification of organic acids from plant material using free zonal capillary electrophoresis. An example of the potential application of this method, determining the effects of a secondary fermentation on organic acid levels in coffee seeds, is provided.

植物組織からの有機酸を定量化するためにキャピラリー電気泳動を使用した：テストケースを調べます<em&gt;コーヒーノキアラビカ</em&gt;種子

Carboxylic acids are organic acids containing one or more terminal carboxyl (COOH) functional groups. Short chain carboxylic acids (SCCAs; carboxylic ...

Raman and IR Spectroelectrochemical Methods as Tools to Analyze Conjugated Organic Compounds

In the presented work, two spectroelectrochemical techniques are discussed as tools for the analysis of the structural changes occurring in the molecule on the vibrational level of energy. Raman and IR spectroelectrochemistry can be used for advanced characterization of the structural changes in the organic electroactive compounds. Here, the step-by-step analysis by means of Raman and IR spectroelectrochemistry is shown. Raman and IR spectroelectrochemical techniques provide complementary information about structural changes occurring during an electrochemical process, i.e. allows for the investigation of redox processes and their products. The examples of IR and Raman spectroelectrochemical analysis are presented, in which the products of the redox reactions, both in solution and solid state, are identified.

A protocol of step-by-step Raman and IR spectroelectrochemical analysis is presented.

ラマン散乱とツールとしての IR 分光電気化学法共役有機化合物を分析するには

In the presented work, two spectroelectrochemical techniques are discussed as tools for the analysis of the structural changes occurring in the molecule ...

Using Cyclic Voltammetry, UV-Vis-NIR, and EPR Spectroelectrochemistry to Analyze Organic Compounds

Cyclic voltammetry (CV) is a technique used in the analysis of organic compounds. When this technique is combined with electron paramagnetic resonance (EPR) or ultraviolet-visible and near-infrared (UV-Vis-NIR) spectroscopies, we obtain useful information such as electron affinity, ionization potential, band-gap energies, the type of charge carriers, and degradation information that can be used to synthesize stable organic electronic devices. In this study, we present electrochemical and spectroelectrochemical methods to analyze the processes occurring in active layers of an organic device as well as the generated charge carriers.

In this article, we describe electrochemical, electron paramagnetic resonance, and ultraviolet-visible and near-infrared spectroelectrochemical methods to analyze organic compounds for application in organic electronics.

サイクリックボルタンメトリー、紫外-可視-近赤外、および EPR 分光電気化学を使用して有機性化合物を分析するには

Cyclic voltammetry (CV) is a technique used in the analysis of organic compounds. When this technique is combined with electron paramagnetic resonance ...

Electrophoretic Crystallization of Ultrathin High-performance Metal-organic Framework Membranes

We report the synthesis of thin, highly intergrown, polycrystalline metal-organic framework (MOF) membranes on a wide range of unmodified porous and non-porous supports (polymer, ceramic, metal, carbon, and graphene). We developed a novel crystallization technique, which is termed the ENACT approach: the electrophoretic nuclei assembly for the crystallization of highly intergrown thin films (ENACT). This approach allows for a high density of heterogeneous nucleation of MOFs on a chosen substrate via the electrophoretic deposition (EPD) directly from the precursor sol. The growth of well-packed MOF nuclei leads to a highly intergrown polycrystalline MOF film. We show that this simple approach can be used for the synthesis of thin, intergrown zeolite imidazole framework (ZIF)-7 and ZIF-8 films. The resulting 500 nm-thick ZIF-8 membranes show a considerably high H2 permeance (8.3 x 10-6 mol m-2 s-1 Pa-1) and ideal gas selectivities (7.3 for H2/CO2, 15.5 for H2/N2, 16.2 for H2/CH4, and 2655 for H2/C3H8). An attractive performance for C3H6/C3H8 separation is also achieved (a C3H6 permeance of 9.9 x 10-8 mol m-2 s-1 Pa-1 and a C3H6/C3H8 ideal selectivity of 31.6 at 25 &#176;C). Overall, the ENACT process, owing to its simplicity, can be extended to synthesize intergrown thin films of a wide range of nanoporous crystalline materials.

A simple, reproducible, and versatile approach for the synthesis of intergrown, polycrystalline metal-organic framework membranes on a wide range of unmodified porous and non-porous supports is presented.

極薄高性能金属有機性フレームワーク膜の電気泳動の結晶化

We report the synthesis of thin, highly intergrown, polycrystalline metal-organic framework (MOF) membranes on a wide range of unmodified porous and ...

Design, Synthesis, and Photochemical Properties of Clickable Caged Compounds

Caged compounds enable the photo-mediated manipulation of the cell physiology with high spatiotemporal resolution. However, the limited structural diversity of currently available caging groups and the difficulties in synthetic modification without sacrificing their photolysis efficiencies are obstacles to expanding the repertoire of caged compounds for live cell applications. As the chemical modification of coumarin-type photo-caging groups is a promising approach for the preparation of caged compounds with diverse physical and chemical properties, we report a method for the synthesis of clickable caged compounds that can be modified easily with various functional units via the copper(I)-catalyzed Huisgen cyclization. The modular platform molecule contains a (6-bromo-7-hydroxycoumarin-4-yl)methyl (Bhc) group as a photo-caging group, which exhibits a high photolysis efficiency compared to those of the conventional 2-nitrobenzyls. General procedures for the preparation of clickable caged compounds containing amines, alcohols, and carboxylates are presented. Additional properties such as the water solubility and cell targeting ability can be readily incorporated into clickable caged compounds. Furthermore, the physical and photochemical properties, including the photolysis quantum yield, were measured and were found to be superior to those of the corresponding Bhc caged compounds. The described protocol could therefore be considered a potential solution for the lack of structural diversity in the available caged compounds.

A protocol for the synthesis and measurement of the photochemical properties of modular caged compounds with clickable moieties is presented.