시작하려면 이미지 처리 소프트웨어를 실행하고 파일을 선택한 다음 데이터를 열고 이전에 생성된 마이크로 CT 스캔 이미지를 도트 BMP 형식으로 선택합니다. 이미지 읽기 매개변수 창이 열리면 매개변수를 확인하고 올바른 경우 수락합니다. 메인 패널에서 프로젝트 뷰를 클릭하여 도트 BMP 파일의 이름으로 생성된 새 개체를 찾습니다.
생성된 개체를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 ortho slice 옵션을 선택한 다음 create를 클릭합니다. 속성에서 보려는 방향 평면과 슬라이스 번호를 선택합니다. 메인 패널에서 전체 헤드의 3D 볼륨을 얻으려면 프로젝트 뷰로 이동하여 이미지 객체를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 대화형 임계값 옵션을 선택한 다음 생성을 클릭합니다.
속성에서 동물의 머리에 해당하는 이미지 부분이 선택될 때까지 최소 임계값 RGB 및 최대 임계값 RGB의 값을 변경합니다. 그런 다음, 적용을 선택합니다. 프로젝트 뷰에서 생성된 임계값 개체를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭합니다.
속성에서 등가곡면을 선택하고 표면을 시각화할 임계값을 선택한 다음 적용을 클릭합니다. 랜드마크를 디지타이징하려면 프로젝트 뷰를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 객체 생성을 선택한 다음 포인트와 선을 선택하고 랜드마크를 선택한 다음 생성을 클릭합니다. 그런 다음 새 개체 랜드마크를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭합니다.
랜드마크 보기를 선택하고 만들기를 클릭합니다. 크기에서 포인트 크기를 수정합니다. 속성에 랜드마크를 추가하려면 편집 모드에서 추가를 선택합니다.
중뇌 피질 교차점의 다음 랜드마크까지 곡선 주위에 균등하게 분포된 5개의 점을 디지타이즈한 다음 피질 주위의 8개의 반 랜드마크를 디지타이즈합니다. 디지타이징된 포인트를 저장하려면 개체 랜드마크를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 데이터 저장을 선택합니다. 브레인을 분할하려면 프로젝트 보기를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭한 다음 create object를 클릭하고 이미지와 필드를 선택한 다음 필드에 레이블을 지정합니다.
만들기를 클릭합니다. label field 객체를 선택하고 properties에서 segmentation editor 옵션을 누릅니다. 재질에서 새 재질을 추가하고 이름을 brain으로 바꿉니다.
선택에서 현재 슬라이스를 선택하여 각 슬라이스의 뇌에 해당하는 조직을 분할합니다. 도구에서 마술 지팡이와 브러시를 사용하여 각 조각의 뇌 조직을 선택합니다. 그런 다음 선택에서 추가를 누릅니다.
이제 프로젝트 뷰로 돌아가서 label 필드를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 Generate surface를 선택한 다음 apply를 클릭합니다. 표면을 얻으면 추출 표면을 적용하여 내보냅니다. 마이크로 CT 스캔을 통해 신생아 쥐의 뇌는 크기가 작음에도 불구하고 후각구, 피질, 중뇌, 소뇌, 후뇌와 같은 해부학적 구조를 구별할 수 있습니다.
전체 뇌를 수동으로 분할하여 신생아 뇌의 3D 모델을 재구성했습니다.
