데이터 준비를 시작하려면 2D HPLC-MS 원시 질량 스펙트럼 데이터를 내보냅니다. 세션 구성 페이지의 WINSCP 인터페이스에서 GNPS FTP 서버에 연결한 다음 연결 정보를 입력합니다. 정보를 입력한 후 시작 버튼을 클릭하여 GNPS FTP 서버에 연결합니다.
웹 브라우저를 열고 GNPS 웹 사이트를 방문하여 분자 네트워크를 만듭니다. 새 사용자는 계정에 가입한 다음 로그인해야 합니다. GNPS 웹사이트의 기본 인터페이스에서 Data Analysis(데이터 분석) 아래의 Create Molecular Network(분자 네트워크 생성)를 클릭합니다.
Task Creation(작업 생성) 페이지에서 select Input Files(입력 파일 선택) 버튼을 클릭한 다음 데이터 파일을 선택하고 업로드합니다. Workflow Option 탭에서 분자 네트워크 또는 MN을 생성하는 다양한 파라미터를 설정합니다. 이러한 매개변수에는 피크 추출 알고리즘, 이동 구간에 대한 피크 값, 유사성 계산 방법 등이 포함됩니다. 필요에 따라 적절한 매개 변수를 설정한 후 페이지 하단의 제출 버튼을 클릭하여 작업을 실행합니다.
작업이 실행된 후 작업 탭에서 생성된 작업을 찾고 워크플로 이름을 클릭하여 분석 결과를 확인합니다. 이 웹사이트는 MN 다이어그램, 대체품, 공생 네트워크 및 기타 관련 정보를 제공합니다. MN에 의해 확인된 APB 샘플의 알칼로이드 성분 중 4개는 아코니틴, 14-벤조일라코닌, 14-O-아세틸네오린 및 히파코니틴이었습니다.
4개의 화합물은 동일한 모핵을 가졌습니다. 아코니틴, 14-벤질 아코닌, 14-벤조일라코닌, 히파코니틴은 비슷하고, 치환기만 달랐다.