고해상도 자기 공명 이미징을 수행한 후 dcm2niix 도구를 사용하여 T1 가중, T2 가중 및 제로 타임 에코 DICOM 스캔 파일을 DICOM에서 NIfTI 형식으로 변환합니다. SimNIBS Charm 도구를 사용하여 공동 정합 및 조직 마스크 추출을 실행합니다. 다음으로 Brainsight를 엽니다.
New Empty Project(새 빈 프로젝트)를 클릭하고 참가자의 T1 가중치 NIfTI 이미지를 로드합니다. Reconstructions 탭을 클릭한 다음 New Reconstruction 드롭다운 메뉴를 클릭합니다. Skin(스킨)을 클릭한 다음 새 창에서 Compute Skin(스킨 계산)을 클릭합니다.
완료되면 창의 왼쪽 상단 모서리에 있는 닫기 버튼을 클릭합니다. 재구성(Reconstructions) 탭에서 새 재건(New Reconstruction) 드롭다운 메뉴를 클릭한 다음 Full Brain Curvilinear를 클릭합니다. 이제 시상면, 코로나 평면 및 횡평면에서 녹색 상자의 가장자리를 드래그하여 뇌를 단단히 둘러싸도록 상자의 위치를 조정합니다.
모든 슬라이스를 스크롤하여 조직 가장자리가 겹치지 않도록 합니다. Compute Curvilinear를 클릭하고 박리 깊이를 4mm로 조정합니다. 그런 다음 Brainsight에서 랜드마크 탭을 클릭한 다음 랜드마크 구성을 클릭합니다.
코끝에 십자선을 놓고 이름 필드에 랜드마크 Nose라는 레이블을 지정합니다. 그런 다음 콧등 위의 눈 사이의 십자선을 놓고 랜드 마크에 Nasion이라는 레이블을 붙입니다. 그런 다음 왼쪽 귀에 십자선을 놓고 랜드마크 L Ear에 레이블을 지정합니다.
그런 다음 오른쪽 귀에 십자선을 놓고 랜드 마크에 R Ear라는 레이블을 지정합니다. 그런 다음 Targets 탭을 클릭한 다음 Configure Targets를 클릭합니다. 원하는 대상의 위치에 십자선을 배치하고 화면 오른쪽의 각도 토글을 사용하여 궤적 각도를 설정합니다.
원하는 대상과 궤적을 선택했으면 새 드롭다운 메뉴를 클릭하고 궤적을 선택합니다. 대상의 이름을 지정하려면 이름 옆의 텍스트 상자에 입력합니다. Export(내보내기)를 클릭하여 대상을 내보내고 적절한 subject 폴더에 저장합니다.
BabelBrain을 열고 음향 및 열 시뮬레이션에 필요한 파일을 선택합니다. Brainsite에서 이전에 내보낸 텍스트 파일을 선택하려면 Select Trajectory(궤적 선택)를 클릭하고 적절한 참가자 파일을 선택합니다. SimNIBS 선택을 클릭하여 이전에 만든 SimNIBS 파일을 선택합니다.
Select T1W(T1W 선택)를 클릭하고 이전에 대상 및 궤적 매핑에 사용 및 생성된 T1 가중치 이미지를 선택합니다. 이제 CT 스캔의 경우 Real CT를 선택하고, CTE 스캔의 경우 CTE를 선택하고, 참 도구에서 생성된 단순화된 마스크를 사용하려면 no를 선택합니다. CT 또는 CTE 이미지를 사용하는 경우 Coreg 드롭다운 메뉴를 클릭한 다음 CT에서 MR로 클릭합니다. 선택을 클릭하고 해당 참가자 파일에서 해당 이미지를 선택합니다.
Select Thermal Profile(열 프로파일 선택)을 클릭하고 지속 시간 on, duration off 및 듀티 사이클 측면에서 실험 초음파 처리 매개변수를 설명하는 열 프로파일 파일을 선택합니다. 그런 다음 변환기 옆의 드롭다운 메뉴를 클릭하고 실험에 사용되는 변환기를 선택합니다. 컴퓨팅 백엔드 옆에 있는 드롭다운 메뉴를 클릭하고 시뮬레이션을 실행하는 컴퓨터의 컴퓨팅 백엔드를 선택합니다.
모든 정보를 입력했으면 계속을 클릭하여 나머지 시뮬레이션을 완료합니다. 이제 변환기의 초음파 주파수와 파장당 적절한 지점을 선택합니다. Calculate Planning Mask(계획 마스크 계산)를 클릭합니다.
피부, 두개골 및 뇌의 경계가 정확하게 인식되었는지 확인하기 위해 이미지를 검사합니다. 음향 시뮬레이션의 경우 Step 2 AC Sim 탭을 클릭하여 엽니다. 적절한 거리를 입력하여 원뿔에서 초점까지의 거리를 조정합니다.
시뮬레이션을 실행하려면 Calculate Fields 버튼을 클릭합니다. 십자선이 초점의 중심에 오도록 Z스티링 값을 조정합니다. 위쪽 또는 아래쪽 화살표를 누르거나 필요한 값을 수동으로 입력합니다.
그런 다음 Calculate Fields(필드 계산)를 클릭합니다. 열 시뮬레이션의 경우 Step 3 Thermal Sim 탭을 클릭한 다음 Calculate Thermal Fields를 클릭합니다.
