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Processing the Loblolly Pine PtGen2 cDNA Microarray

PtGen2 is a 26,496 feature cDNA microarray containing amplified loblolly pine ESTs.  The array is produced in our laboratory for use by researchers ...

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An Improved Method of RNA Isolation from Loblolly Pine (<em>P. taeda</em> L.) and Other Conifer Species

Tissues isolated from conifer species, particularly those belonging to the Pinaceae family, such as loblolly pine (Pinus taeda L.), contain high ...

University of Georgia (UGA)

&#x6728;&#x6750;&#x5F62;&#x6210;&#x4E86;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7EC6;&#x80DE;&#x548C;&#x751F;&#x5316;&#x7EA7;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4ECD;&#x7136;&#x5BF9;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x4E0E;&#x8C03;&#x63A7;&#x7684;&#x7406;&#x89E3;&#x5F88;&#x5DEE;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B65;&#x5177;&#x4F53;&#x786E;&#x5B9A;&#x57FA;&#x56E0;&#x53C2;&#x4E0E;&#x6728;&#x6750;&#x5F62;&#x6210;&#x548C;&#x8868;&#x5F81;&#x5B83;&#x4EEC;&#x5728;&#x786E;&#x5B9A;&#x6728;&#x6750;&#x8D28;&#x91CF;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#xFF0C;&#x4E32;&#x884C;&#x5206;&#x6790;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE; (SAGE) &#x7528;&#x4E8E;&#x91CF;&#x5316; lignifying &#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x4ECE;&#x5355;&#x4E00;&#x3001; 10 &#x5C81;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.&#xFF09; &#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x4E24;&#x4E2A;&#x5723;&#x4EBA;&#x5E93;&#x751F;&#x6210;&#x57FA;&#x4E8E; lignifying &#x5206;&#x79BB;&#x7684;&#x4E0A;&#x5C42; &#xFF08;&#x5B98;&#x65B9;&#xFF09; &#x6216;&#x8F83;&#x4F4E; &#xFF08;&#x57FA;&#x672C;&#xFF09; &#x90E8;&#x5206;&#x6811;&#x5E72;&#x7684;&#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x3002;&#x4ECE;&#x51A0;&#x6728;&#x5E93;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x5206;&#x6790;&#x4E86;&#x4EE3;&#x8868; 27,398 &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x6700;&#x591A;&#x7684;&#x8D85;&#x8FC7; 85,000 &#x6807;&#x8BB0;&#x5E76;&#x8D85;&#x8FC7; 65,000 &#x6807;&#x8BB0;&#xFF0C;&#x4EE3;&#x8868; 25,983 &#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#xFF0C;&#x6700;&#x591A;&#x57FA;&#x6728;&#x5E93;&#x4E2D;&#x8FDB;&#x884C;&#x5206;&#x6790;&#x3002;&#x7ED3;&#x5408;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CD;&#x6620;&#x5728; lignifying &#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x8868;&#x8FBE;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x603B;&#x548C;&#xFF0C;150,855 &#x6807;&#x8BB0;&#x88AB;&#x7F16;&#x5F55;&#xFF0C;&#x4EE3;&#x8868; 42,641 &#x4E0D;&#x540C;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x6700;&#x591A;&#x3002;&#x76EE;&#x524D;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x8868;&#x793A;&#x5176;&#x79CD;&#x9AD8;&#x7B49;&#x690D;&#x7269;&#x7684;&#x6700;&#x5E7F;&#x6CDB;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#xFF0C;&#x5E76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5B9A;&#x91CF;&#x63CF;&#x8FF0;&#x7684;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x4EE3;&#x8868;&#x7684; lignifying &#x6728;&#x8D28;&#x90E8; 10 &#x5C81;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x3002;

SAGE &#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x5DEE;&#x5F02;&#x6CBF;&#x8F74;&#x5411;&#x53D1;&#x5C55;&#x68AF;&#x5EA6;&#x7684; lignifying &#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E;) &#x6728;&#x8D28;&#x90E8;&#x793A;&#x8303;&#x3002;

Wood formation has been studied extensively at the cellular and biochemical levels, but remains poorly understood with respect to gene expression and regulation. As a first step toward identifying genes specifically involved in wood formation and characterizing their roles in determining wood quality, serial analysis of gene expression (SAGE) was used to quantify gene expression in lignifying xylem from a single, 10-year-old loblolly pine (Pinus taeda L.). Two SAGE libraries were generated based on lignifying xylem isolated from either the upper (crown) or lower (base) portions of the trunk. Over 85,000 tags representing a maximum of 27,398 expressed genes were analyzed from the crown wood library, and more than 65,000 tags, representing a maximum of 25,983 expressed genes, were analyzed in the base wood library. Combining these data sets to reflect the sum of genes expressed in lignifying xylem, 150,855 tags were cataloged, representing a maximum of 42,641 different genes. Currently, this study represents the most extensive analysis of its kind in a higher plant and provides a quantitative description of the transcriptome representing the lignifying xylem of a 10-year-old loblolly pine.

SAGE profiling and demonstration of differential gene expression along the axial developmental gradient of lignifying xylem in loblolly pine (Pinus taeda).

La formation du bois a &#xE9;t&#xE9; largement &#xE9;tudi&#xE9;e aux niveaux cellulaires et biochimiques, mais reste mal comprise &#xE0; l&#x26;#39;&#xE9;gard de l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes et de la r&#xE9;glementation. En tant que premi&#xE8;re &#xE9;tape vers l&#x26;#39;identification de g&#xE8;nes sp&#xE9;cifiquement impliqu&#xE9;s dans la formation du bois et la caract&#xE9;risation de leurs r&#xF4;les dans la d&#xE9;termination de la qualit&#xE9; du bois, l&#x26;#39;analyse en s&#xE9;rie de l&#x26;#39;expression g&#xE9;nique (SAGE) a &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;e pour quantifier l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes dans lignification du xyl&#xE8;me &#xE0; partir d&#x26;#39;un seul, le pin &#xE0; encens 10 ans ( Pinus taeda L.). Deux biblioth&#xE8;ques SAGE ont &#xE9;t&#xE9; g&#xE9;n&#xE9;r&#xE9;s sur la base du xyl&#xE8;me lignification isol&#xE9; soit la partie sup&#xE9;rieure (couronne) ou inf&#xE9;rieur (de base) des parties du tronc. Plus de 85.000 &#xE9;tiquettes repr&#xE9;sentant un maximum de 27.398 g&#xE8;nes exprim&#xE9;s ont &#xE9;t&#xE9; analys&#xE9;s &#xE0; partir de la biblioth&#xE8;que bois de la Couronne, et plus de 65.000 tags, repr&#xE9;sentant un maximum de 25,983 g&#xE8;nes exprim&#xE9;s, ont &#xE9;t&#xE9; analys&#xE9;s dans la biblioth&#xE8;que en bois de base. La combinaison de ces ensembles de donn&#xE9;es afin de refl&#xE9;ter la somme des g&#xE8;nes exprim&#xE9;s dans le xyl&#xE8;me lignification, 150,855 balises ont &#xE9;t&#xE9; catalogu&#xE9;s, ce qui repr&#xE9;sente un maximum de 42,641 g&#xE8;nes diff&#xE9;rents. Actuellement, cette &#xE9;tude repr&#xE9;sente l&#x26;#39;analyse la plus vaste de son genre dans une plante sup&#xE9;rieure et fournit une description quantitative du transcriptome repr&#xE9;sentant le xyl&#xE8;me lignification d&#x26;#39;un pin &#xE0; l&#x26;#39;encens de 10 ans.

Profilage SAGE et de d&#xE9;monstration de l&#x26;#39;expression diff&#xE9;rentielle des g&#xE8;nes le long du gradient axial du d&#xE9;veloppement de la lignification du xyl&#xE8;me en pin &#xE0; encens (Pinus taeda)

SAGE-Profiling und Demonstration der differentiellen Genexpression entlang der axialen Entwicklungsst&#xF6;rungen Gef&#xE4;lle von verholzenden Xylem in Loblolly Kiefer (Pinus taeda).

Formazione di legno &egrave; stato ampiamente studiato a livello cellulare e biochimico, ma rimane scarsamente comprensibile rispetto al regolamento ed espressione genica. Come un primo passo verso l&#39;identificazione di geni specificamente coinvolti nella formazione di legno e che caratterizzano il loro ruolo nel determinare la qualit&agrave; di legno, serial analysis of gene expression (SAGE) &egrave; stato utilizzato per quantificare l&#39;espressione genica in lignifying xilema da una singola, 10-year-old loblolly pine (Pinus taeda L.). Due librerie di salvia sono state generate basato su lignifying xilema isolato dalla superiore (corona) o inferiore (base) porzioni del tronco. Oltre 85.000 Tag che rappresenta un massimo di 27.398 geni espressi sono stati analizzati dalla libreria legno corona, e pi&ugrave; di 65.000 Tag, che rappresenta un massimo di 25.983 geni espressi, sono stati analizzati nella libreria base di legna. Combinando questi insiemi di dati in modo da riflettere la somma dei geni espressi in lignifying xilema, 150.855 tag sono stati catalogati, che rappresenta un massimo di 42.641 diversi geni. Attualmente, questo studio rappresenta l&#39;analisi pi&ugrave; estesa del suo genere in una pianta superiore e fornisce una descrizione quantitativa del transcriptome che rappresenta la lignifying xilema di un pino del loblolly 10-year-old.

SALVIA profilatura e dimostrazione di espressione genica differenziale lungo il gradiente dello sviluppo assiale di lignifying xilema loblolly Pine (Pinus taeda).

&#x6728;&#x90E8;&#x5F62;&#x6210;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x5B66;&#x7684;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x751F;&#x5316;&#x5B66;&#x7684;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x76DB;&#x3093;&#x306B;&#x7814;&#x7A76;&#x304C;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3068;&#x8ABF;&#x7BC0;&#x306B;&#x95A2;&#x3057;&#x3066;&#x3088;&#x304F;&#x308F;&#x304B;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x307E;&#x307E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7279;&#x306B;&#x6728;&#x6750;&#x306E;&#x5F62;&#x6210;&#x306B;&#x95A2;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x9023;&#x7D9A;&#x5206;&#x6790;&#xFF08;SAGE&#xFF09;&#x3092;&#x6728;&#x6750;&#x306E;&#x54C1;&#x8CEA;&#x3092;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3059;&#x308B;&#x4E0A;&#x3067;&#x305D;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7B2C;&#x4E00;&#x6B69;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x30EB;&#x3001;10&#x6B73;&#x306E;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF08;&#x304B;&#x3089;&#x6728;&#x90E8;&#x3092;lignifying&#x3067;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x5B9A;&#x91CF;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x3002;&#x3064;&#x306E;SAGE&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x306F;&#x3001;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30AF;&#x306E;&#x4E0A;&#x90E8;&#xFF08;&#x30AF;&#x30E9;&#x30A6;&#x30F3;&#xFF09;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4E0B;&#xFF08;&#x5E95;&#xFF09;&#x90E8;&#x5206;&#x306E;&#x3044;&#x305A;&#x308C;&#x304B;&#x304B;&#x3089;&#x5358;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x305F;lignifying&#x6728;&#x90E8;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002; 27398&#x767A;&#x73FE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x5024;&#x3092;&#x8868;&#x3059;85000&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x30BF;&#x30B0;&#x304C;&#x30AF;&#x30E9;&#x30A6;&#x30F3;&#x6728;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x304B;&#x3089;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x3001;65,000&#x4EBA;&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x30BF;&#x30B0;&#x304C;&#x3001;25983&#x767A;&#x73FE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x5024;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x3001;&#x57FA;&#x672C;&#x6728;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x3067;&#x5206;&#x6790;&#x3057;&#x305F;&#x3057;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x6728;&#x90E8;&#x3092;lignifying&#x306B;&#x767A;&#x73FE;&#x3059;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5408;&#x8A08;&#x3092;&#x53CD;&#x6620;&#x3059;&#x308B;&#x3088;&#x3046;&#x306B;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x3057;&#x3001;150855&#x30BF;&#x30B0;&#x306F;&#x3001;42641&#x306E;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x5024;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x3001;&#x30AB;&#x30BF;&#x30ED;&#x30B0;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x73FE;&#x5728;&#x3001;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x9AD8;&#x7B49;&#x690D;&#x7269;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x305D;&#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x6700;&#x3082;&#x5E83;&#x7BC4;&#x306A;&#x5206;&#x6790;&#x3092;&#x8868;&#x3057;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;10&#x6B73;&#x306E;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;lignifying&#x6728;&#x90E8;&#x3092;&#x8868;&#x3059;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x306E;&#x5B9A;&#x91CF;&#x7684;&#x306A;&#x8AAC;&#x660E;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x6728;&#x90E8;&#x3092;Lignifying&#x306E;&#x8EF8;&#x65B9;&#x5411;&#x767A;&#x9054;&#x52FE;&#x914D;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF09;&#x306B;&#x6CBF;&#x3063;&#x3066;&#x7570;&#x306A;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;SAGE&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x3068;&#x30C7;&#x30E2;&#x30F3;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;

&#xB098;&#xBB34; &#xD615;&#xC131; &#xC138;&#xD3EC; &#xBC0F; &#xC0DD;&#xD654;&#xD559; &#xC801;&#xC778; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD558; &#xAC8C; &#xACF5;&#xBD80; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; &#xBC0F; &#xC870;&#xC808;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xC81C;&#xB300;&#xB85C; &#xC774;&#xD574; &#xB0A8;&#xC544; &#xC788;&#xB2E4;. &#xCC98;&#xC74C;&#xC73C;&#xB85C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD2B9;&#xBCC4;&#xD788; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB2E8;&#xACC4;&#xB85C; &#xB098;&#xBB34; &#xD615;&#xC131;&#xC5D0; &#xAD00;&#xC5EC; &#xD558; &#xACE0; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604; (&#xC138;&#xC774; &#xC9C0;)&#xC758; &#xC9C1;&#xB82C; &#xBD84;&#xC11D; xylem &#xB2E8;&#xC77C;, 10 &#xC0B4;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.)&#xC5D0;&#xC11C; lignifying&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xACC4;&#xB7C9; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD55C; &#xBAA9;&#xC7AC; &#xD488;&#xC9C8; &#xACB0;&#xC815;&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC744; &#xD2B9;&#xC131;&#xD654;. &#xC138;&#xC774; &#xC9C0; &#xB3C4;&#xC11C;&#xAD00; xylem &#xC0C1;&#xB2E8; (&#xD06C;&#xB77C;&#xC6B4;) &#xB610;&#xB294; &#xD2B8;&#xB801;&#xD06C;&#xC758; &#xB0AE;&#xC740; (&#xAE30;&#xBCF8;) &#xBD80;&#xBD84;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xB41C; lignifying &#xAE30;&#xBC18;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0DD;&#xC131; &#xB41C;. &#xD06C;&#xB77C;&#xC6B4; &#xB098;&#xBB34; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; 27398 &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xCD5C;&#xB300; 85000 &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xD0DC;&#xADF8; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4; &#xACE0; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; 25,983 &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xCD5C;&#xB300; 65000 &#xAC1C; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xD0DC;&#xADF8; &#xAE30;&#xBCF8; &#xB098;&#xBB34; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD588;&#xB2E4;. Xylem lignifying&#xB85C; &#xD45C;&#xD604; &#xD558;&#xB294; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xD569;&#xC744; &#xBC18;&#xC601; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC9D1;&#xD569;&#xC744; &#xC870;&#xD569;, 150,855 &#xD0DC;&#xADF8; &#xD588;&#xB2E4; &#xCE74;&#xD0C8;&#xB85C;&#xADF8;, 42,641 &#xB2E4;&#xB978; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xCD5C;&#xB300;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294;. &#xD604;&#xC7AC;&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xB192;&#xC740; &#xD50C;&#xB79C;&#xD2B8;&#xC5D0; &#xC788;&#xB294; &#xADF8;&#xAC83;&#xC758; &#xC885;&#xB958;&#xC758; &#xAC00;&#xC7A5; &#xAD11;&#xBC94;&#xC704; &#xD55C; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xD558; &#xACE0; 10 &#xC0B4;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; lignifying xylem &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; transcriptome&#xC758; &#xC591;&#xC801; &#xC124;&#xBA85;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC138;&#xC774; &#xC9C0; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C;&#xB9C1; &#xBC0F; xylem&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda)&#xC5D0;&#xC11C; lignifying&#xC758; &#xCD95; &#xBC1C;&#xB2EC; &#xADF8;&#xB77C;&#xB370;&#xC774;&#xC158; &#xB530;&#xB77C; &#xCC28;&#xB4F1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xB370;&#xBAA8;.

Formaci&#xF3;n de la madera ha sido estudiado ampliamente en los niveles celular y bioqu&#xED;mica, pero sigue siendo dif&#xED;cil de entender con respecto a la expresi&#xF3;n de genes y la regulaci&#xF3;n. Como un primer paso hacia la identificaci&#xF3;n de genes que intervienen espec&#xED;ficamente en la formaci&#xF3;n de la madera y la caracterizaci&#xF3;n de su papel en la determinaci&#xF3;n de calidad de la madera, el an&#xE1;lisis serial de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica (SAGE) se utiliz&#xF3; para cuantificar la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica en lignifying xilema de un pino solo taeda de 10 a&#xF1;os de edad ( Pinus taeda L.). Dos SAGE bibliotecas se generaron sobre la base de xilema lignifying aislado de la parte superior (corona) o inferior (base) partes del tronco. M&#xE1;s de 85.000 etiquetas que representan un m&#xE1;ximo de 27.398 genes que se expresan se analizaron desde la biblioteca de madera de la corona, y m&#xE1;s de 65.000 etiquetas, lo que representa un m&#xE1;ximo de 25.983 genes que se expresan, se analizaron en la biblioteca de la base de madera. La combinaci&#xF3;n de estos conjuntos de datos para reflejar la suma de los genes expresados &#x200B;&#x200B;en lignifying xilema, 150,855 etiquetas fueron catalogados, lo que representa un m&#xE1;ximo de 42,641 genes diferentes. En la actualidad, este estudio representa el an&#xE1;lisis m&#xE1;s extenso de su tipo en una planta superior y proporciona una descripci&#xF3;n cuantitativa de la transcriptoma en representaci&#xF3;n del xilema lignifying de un pino taeda de 10 a&#xF1;os de edad.

SAGE perfil y la demostraci&#xF3;n de la expresi&#xF3;n g&#xE9;nica diferencial en el gradiente axial del desarrollo de Lignifying Xilema de pino taeda (Pinus taeda)

&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7CFB;&#x5217;&#x5206;&#x6790;&#x88AB;&#x7528;&#x5230;&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x6839;&#x914D;&#x7F6E;&#x6587;&#x4EF6;&#x7B54;&#x95EE;&#x5168;&#x6587;&#x7684;&#x6C34;&#x5E73;&#xFF0C;&#x8BC4;&#x4F30;&#x5B83;&#x4EEC;&#x54CD;&#x5E94; 246-&#x4E09;&#x785D;&#x57FA;&#x7532;&#x82EF; (TNT) &#x66DD;&#x5149;&#x3002;SAGE &#x56FE;&#x4E66;&#x9986;&#x4EE3;&#x8868;&#x63A7;&#x5236;&#x548C; TNT &#x66B4;&#x9732;&#x82D7;&#x6839;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355;&#x5EFA;&#x9020;&#x7684;&#x548C;&#x6BCF;&#x4E2A;&#x5E8F;&#x5927;&#x7EA6; 32,000 &#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x6DF1;&#x5EA6;&#x3002;&#x8D85;&#x8FC7; 19,000 &#x7684;&#x552F;&#x4E00;&#x6807;&#x8BB0;&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x6574;&#x4F53;&#x3002;&#x7B2C;&#x4E8C;&#x4E2A;&#x6700;&#x9AD8;&#x81F4;&#x6807;&#x8BB0; &#xFF08;27-fold &#x589E;&#x52A0;&#xFF09; &#x4EE3;&#x8868;&#x8C37;&#x80F1;&#x7518;&#x80BD; S-&#x8F6C;&#x79FB;&#x9176;&#x3002;&#x7EC6;&#x80DE;&#x8272;&#x7D20; p450 &#x6C27;&#x5316;&#x7684;&#x9176;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA; ABC &#x8F6C;&#x8FD0;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x53EF;&#x80FD;&#x7684; nitroreductase&#xFF0C;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x88AB;&#x8BF1;&#x5BFC; TNT &#x66DD;&#x5149;&#x3002;&#x5206;&#x6790;&#x8FD8;&#x663E;&#x793A;&#x5728; TNT &#x66DD;&#x5149;&#x540E;&#x7684;&#x6C27;&#x5316;&#x5E94;&#x6FC0;&#x53CD;&#x5E94;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x6839;&#x636E;&#x5F53;&#x524D;&#x6A21;&#x578B;&#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x5F02;&#x751F;&#x4EE3;&#x8C22;&#x9884;&#x8BA1;&#x7565;&#x6709;&#x589E;&#x52A0;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E5F;&#x6709;&#x4EBA;&#x6307;&#x51FA;&#x610F;&#x5916;&#x7684;&#x5171;&#x8F6D;&#x901A;&#x8DEF;&#x7684;&#x8BC1;&#x636E;&#x3002;&#x786E;&#x5B9A; TNT &#x66DD;&#x5149;&#x8F6C;&#x5F55;&#x7EC4;&#x7EA7;&#x54CD;&#x5E94;&#x5C06;&#x66F4;&#x597D;&#x5730;&#x754C;&#x5B9A;&#x690D;&#x7269;&#x7528;&#x4E8E;&#x89E3;&#x6BD2;&#x8FD9;&#x79CD;&#x53D8;&#x6001;&#x53CD;&#x5E94;&#x7684;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#xFF0C;&#x5E94;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E;&#x6539;&#x5584;&#x9488;&#x5BF9; TNT &#x7684;&#x690D;&#x7269;&#x4FEE;&#x590D;&#x6280;&#x672F;&#x6218;&#x7565;&#x548C;&#x5176;&#x4ED6;&#x785D;&#x57FA;&#x82B3;&#x9999;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x7684;&#x4EE3;&#x8C22;&#x9014;&#x5F84;&#x3002;

&#x62DF;&#x5357;&#x82A5;&#x6839; 246-&#x4E09;&#x785D;&#x57FA;&#x7532;&#x82EF;&#x4F5C;&#x4E1A;&#x4E2D;&#x8F6C;&#x5F55;&#x8FC7;&#x7A0B;&#x54CD;&#x5E94;&#x5723;&#x4EBA;&#x5206;&#x6790;&#x3002;

Serial analysis of gene expression was used to profile transcript levels in Arabidopsis roots and assess their responses to 2,4,6-trinitrotoluene (TNT) exposure. SAGE libraries representing control and TNT-exposed seedling root transcripts were constructed, and each was sequenced to a depth of roughly 32,000 tags. More than 19,000 unique tags were identified overall. The second most highly induced tag (27-fold increase) represented a glutathione S-transferase. Cytochrome P450 enzymes, as well as an ABC transporter and a probable nitroreductase, were highly induced by TNT exposure. Analyses also revealed an oxidative stress response upon TNT exposure. Although some increases were anticipated in light of current models for xenobiotic metabolism in plants, evidence for unsuspected conjugation pathways was also noted. Identifying transcriptome-level responses to TNT exposure will better define the metabolic pathways plants use to detoxify this xenobiotic compound, which should help improve phytoremediation strategies directed at TNT and other nitroaromatic compounds.

SAGE analysis of transcriptome responses in Arabidopsis roots exposed to 2,4,6-trinitrotoluene.

L&#x26;#39;analyse s&#xE9;rielle d&#x26;#39;expression g&#xE9;nique a &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9; pour profiler les niveaux de transcription dans les racines d&#x26;#39;Arabidopsis et d&#x26;#39;&#xE9;valuer leurs r&#xE9;ponses au 2,4,6-trinitrotolu&#xE8;ne (TNT) d&#x26;#39;exposition. Biblioth&#xE8;ques SAGE repr&#xE9;sentant le contr&#xF4;le et la TNT-expos&#xE9;s transcriptions des racines des plantules ont &#xE9;t&#xE9; construits, et chacun a &#xE9;t&#xE9; s&#xE9;quenc&#xE9; &#xE0; une profondeur d&#x26;#39;environ 32 000 &#xE9;tiquettes. Plus de 19.000 &#xE9;tiquettes uniques ont &#xE9;t&#xE9; identifi&#xE9;s dans son ensemble. La seconde balise la plus fortement induit (27 fois plus &#xE9;lev&#xE9;e) a repr&#xE9;sent&#xE9; un glutathion S-transf&#xE9;rase. Les enzymes du cytochrome P450, ainsi que d&#x26;#39;un transporteur ABC et un nitror&#xE9;ductase probable, ont &#xE9;t&#xE9; fortement induite par l&#x26;#39;exposition TNT. Les analyses ont aussi r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; une r&#xE9;ponse au stress oxydatif lors de l&#x26;#39;exposition TNT. Bien que certaines augmentations ont &#xE9;t&#xE9; pr&#xE9;vu &#xE0; la lumi&#xE8;re des mod&#xE8;les actuels pour le m&#xE9;tabolisme des x&#xE9;nobiotiques dans les usines, les preuves de voies de conjugaison insoup&#xE7;onn&#xE9;es a &#xE9;galement &#xE9;t&#xE9; not&#xE9;. Identifier transcriptome des r&#xE9;ponses au niveau de l&#x26;#39;exposition TNT permettra de mieux d&#xE9;finir les voies m&#xE9;taboliques des plantes utilisent pour d&#xE9;toxifier ce compos&#xE9; x&#xE9;nobiotique, qui devrait contribuer &#xE0; am&#xE9;liorer les strat&#xE9;gies visant &#xE0; phytorem&#xE9;diation TNT et d&#x26;#39;autres compos&#xE9;s aromatiques nitr&#xE9;s.

Analyse des r&#xE9;ponses SAGE du transcriptome dans les racines d&#x26;#39;Arabidopsis expos&#xE9;s au 2,4,6-trinitrotolu&#xE8;ne

SAGE Analyse von Transkriptom-Reaktionen in Arabidopsis Wurzeln ausgesetzt 2,4,6-Trinitrotoluol.

Serial analysis of gene expression &egrave; stato utilizzato a livelli di trascrizione di profilo in Arabidopsis radici e valutare le loro risposte alla esposizione di 2, 4,6-trinitrotoluene (TNT). SALVIA librerie che rappresenta il semenzale esposte al TNT radice trascrizioni e controllo sono state costruite, e ciascuno &egrave; stato sequenziato per una profondit&agrave; di circa 32.000 Tag. Pi&ugrave; di 19.000 unico tag sono stati identificati nel complesso. La seconda pi&ugrave; altamente indotta tag (27-fold aumento) rappresentato un glutatione S-transferasi. Enzimi di citocromo P450, come pure un trasportatore ABC e un probabile nitroreductase, altamente sono stati indotti dall&#39;esposizione di TNT. Analisi hanno rivelato anche una risposta di stress ossidativo all&#39;esposizione di TNT. Anche se alcuni aumenti erano previsti alla luce dei modelli attuali per Metabolismo xenobiotico in piante, prove per vie insospettate coniugazione inoltre &egrave; stata notata. Identificazione livello transcriptome responses to esposizione TNT definire meglio le vie metaboliche che piante utilizzano per disintossicare questo composto di xenobiotico, che dovrebbe aiutare a migliorare le strategie di phytoremediation diretti a TNT e altri composti nitroaromatic.

SALVIA analisi del transcriptome responses in Arabidopsis radici esposte a 2, 4,6-trinitrotoluene.

&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x306E;&#x9023;&#x7D9A;&#x5206;&#x6790;&#x304C;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8EE2;&#x5199;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3092;&#x30D7;&#x30ED;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30EB;&#x3057;&#x3001;2,4,6  - &#x30C8;&#x30EA;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30C8;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#xFF08;TNT&#xFF09;&#x306E;&#x66B4;&#x9732;&#x306B;&#x5F7C;&#x3089;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5236;&#x5FA1;&#x304A;&#x3088;&#x3073;TNT&#x306B;&#x3055;&#x3089;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x82D7;&#x306E;&#x6839;&#x306E;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#x3092;&#x8868;&#x3059;SAGE&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x30FC;&#x304C;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3055;&#x308C;&#x3001;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x304C;&#x7D04;32000&#x30BF;&#x30B0;&#x306E;&#x6DF1;&#x3055;&#x306B;&#x914D;&#x5217;&#x6C7A;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002; 19,000&#x4EE5;&#x4E0A;&#x306E;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x30BF;&#x30B0;&#x304C;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x756A;&#x76EE;&#x306E;&#x6700;&#x3082;&#x9AD8;&#x5EA6;&#x306B;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x30BF;&#x30B0;&#xFF08;27&#x500D;&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x30B0;&#x30EB;&#x30BF;&#x30C1;&#x30AA;&#x30F3;S-&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30D5;&#x30A7;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x3092;&#x8868;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x30C1;&#x30C8;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30E0;P450&#x9175;&#x7D20;&#x3068;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3001;ABC&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30DD;&#x30FC;&#x30BF;&#x30FC;&#x3068;&#x8003;&#x3048;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x306F;&#x3001;&#x975E;&#x5E38;&#x306B;TNT&#x66DD;&#x9732;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x307E;&#x305F;&#x3001;TNT&#x306E;&#x66B4;&#x9732;&#x9178;&#x5316;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3044;&#x304F;&#x3064;&#x304B;&#x306E;&#x5897;&#x52A0;&#x304C;&#x690D;&#x7269;&#x306E;&#x751F;&#x4F53;&#x7570;&#x7269;&#x306E;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306E;&#x5149;&#x306E;&#x4E2D;&#x3067;&#x4E88;&#x60F3;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x304C;&#x3001;&#x601D;&#x3044;&#x3082;&#x5BC4;&#x3089;&#x306A;&#x3044;&#x62B1;&#x5408;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x306E;&#x8A3C;&#x62E0;&#x3082;&#x8A8D;&#x3081;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x3002; TNT&#x66DD;&#x9732;&#x306B;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306E;&#x5FDC;&#x7B54;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x512A;&#x308C;&#x305F;&#x690D;&#x7269;&#x306F;TNT&#x3084;&#x4ED6;&#x306E;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x82B3;&#x9999;&#x65CF;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x306B;&#x5411;&#x3051;&#x305F;&#x30D5;&#x30A1;&#x30A4;&#x30C8;&#x30EC;&#x30E1;&#x30C7;&#x30A3;&#x30A8;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x6226;&#x7565;&#x3092;&#x6539;&#x5584;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x751F;&#x4F53;&#x7570;&#x7269;&#x5316;&#x5408;&#x7269;&#x3092;&#x89E3;&#x6BD2;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x4EE3;&#x8B1D;&#x7D4C;&#x8DEF;&#x3092;&#x5B9A;&#x7FA9;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

2,4,6  - &#x30C8;&#x30EA;&#x30CB;&#x30C8;&#x30ED;&#x30C8;&#x30EB;&#x30A8;&#x30F3;&#x306B;&#x66B4;&#x9732;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B7;&#x30ED;&#x30A4;&#x30CC;&#x30CA;&#x30BA;&#x30CA;&#x306E;&#x6839;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30C8;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x30AF;&#x30EA;&#x30D7;&#x30C8;&#x30FC;&#x30E0;&#x5FDC;&#x7B54;&#x306E;SAGE&#x89E3;&#x6790;

&#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC758; &#xC9C1;&#xB82C; &#xBD84;&#xC11D; &#xD504;&#xB85C; &#xD30C;&#xC77C; &#xC0AC;&#xBCF8; &#xB808;&#xBCA8; Arabidopsis &#xBFCC;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xD558; &#xACE0; 2,4,6-&#xD1A8;&#xB8E8;&#xC5D4; (TNT) &#xB178;&#xCD9C;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC0D0;&#xBE44;&#xC5B4; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC; &#xC81C;&#xC5B4; &#xBC0F; TNT &#xB178;&#xCD9C; &#xC885;&#xBB18; &#xB8E8;&#xD2B8; &#xB179;&#xCDE8; &#xB85D; &#xAC74;&#xC124; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xAE4A;&#xC774; &#xC57D; 32000 &#xD0DC;&#xADF8; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xB294; &#xAC01;. 19000 &#xAC1C; &#xC774;&#xC0C1;&#xC758; &#xACE0;&#xC720; &#xD0DC;&#xADF8; &#xC804;&#xBC18;&#xC801;&#xC73C;&#xB85C; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xB450; &#xBC88;&#xC9F8;&#xB294; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB192;&#xC740; &#xD0DC;&#xADF8;&#xB97C; &#xC720;&#xB3C4; (27-fold &#xC99D;&#xAC00;) &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; glutathione S-&#xC804;&#xC774;. &#xC2DC; &#xD1A0; &#xD06C;&#xB86C; P450 &#xD6A8;&#xC18C;&#xC640; ABC transporter &#xBC0F; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; nitroreductase &#xB192;&#xC740; TNT &#xB178;&#xCD9C;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC720;&#xB3C4; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0;&#xB294; TNT &#xB178;&#xCD9C; &#xC2DC; &#xC0B0;&#xD654; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xC751;&#xB2F5;&#xC744; &#xACF5;&#xAC1C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC77C;&#xBD80; &#xC99D;&#xAC00; &#xC2DD;&#xBB3C; xenobiotic &#xB300;&#xC0AC;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD604;&#xC7AC;&#xC758; &#xBAA8;&#xB378;&#xC5D0; &#xBE44;&#xCD94;&#xC5B4; &#xC608;&#xC0C1; &#xD588;&#xB2E4;, &#xBE44;&#xB85D; &#xB73B;&#xBC16;&#xB41C; &#xD65C;&#xC6A9; &#xACBD;&#xB85C; &#xB300; &#xD55C; &#xC99D;&#xAC70;&#xB294; &#xB610;&#xD55C; &#xC9C0;&#xC801; &#xD588;&#xB2E4;. TNT &#xB178;&#xCD9C; transcriptome &#xC218;&#xC900; &#xC751;&#xB2F5; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB354; &#xB098;&#xC740; &#xC2DD;&#xBB3C; &#xB3C5; TNT&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC10;&#xB3C5; phytoremediation &#xC804;&#xB7B5;&#xC744; &#xAC1C;&#xC120; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xB3C4;&#xC6C0;&#xC774; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;&#xC774; xenobiotic &#xD654;&#xD569;&#xBB3C; &#xBC0F; &#xAE30;&#xD0C0; nitroaromatic &#xD654;&#xD569;&#xBB3C;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xB300;&#xC0AC; &#xACBD;&#xB85C; &#xC815;&#xC758; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Arabidopsis &#xBFCC;&#xB9AC; 2,4,6-&#xD1A8;&#xB8E8;&#xC5D4;&#xC5D0; &#xB178;&#xCD9C;&#xC5D0;&#xC11C; transcriptome &#xC751;&#xB2F5;&#xC758; &#xC138;&#xC774; &#xC9C0; &#xBD84;&#xC11D; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Serie de an&#xE1;lisis de expresi&#xF3;n g&#xE9;nica se utiliza para perfilar los niveles de transcripci&#xF3;n en las ra&#xED;ces de Arabidopsis y evaluar sus respuestas al 2,4,6-trinitrotolueno (TNT) de la exposici&#xF3;n. SAGE bibliotecas que representan el control y TNT-expuestos transcripciones de ra&#xED;ces de pl&#xE1;ntulas fueron construidos, y cada uno se secuenci&#xF3; a una profundidad de aproximadamente 32.000 etiquetas. M&#xE1;s de 19.000 etiquetas &#xFA;nicas se identificaron en general. La segunda etiqueta m&#xE1;s alta inducida (27 veces m&#xE1;s) represent&#xF3; una glutati&#xF3;n S-transferasa. Las enzimas del citocromo P450, as&#xED; como un transportador ABC y un nitroreductasa probable, fueron inducidos por la exposici&#xF3;n altamente TNT. Los an&#xE1;lisis tambi&#xE9;n revel&#xF3; una respuesta de estr&#xE9;s oxidativo en la exposici&#xF3;n de TNT. A pesar de algunos aumentos se anticipa a la luz de los modelos actuales para el metabolismo de xenobi&#xF3;ticos en las plantas, las pruebas de las v&#xED;as de conjugaci&#xF3;n insospechados se se&#xF1;al&#xF3;. La identificaci&#xF3;n del transcriptoma respuestas en el nivel de exposici&#xF3;n a TNT definir&#xE1; mejor las rutas metab&#xF3;licas centrales utilizan para desintoxicar este compuesto xenobi&#xF3;tico, que deber&#xED;a ayudar a mejorar las estrategias de fitorremediaci&#xF3;n dirigidas a TNT y otros compuestos nitroarom&#xE1;ticos.

SAGE An&#xE1;lisis de las respuestas transcriptoma en las ra&#xED;ces de Arabidopsis expuesto al 2,4,6-trinitrotolueno

&#x5E72;&#x65F1;&#x80C1;&#x8FEB;&#x662F;&#x5E7C;&#x82D7;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x5728;&#x7F8E;&#x56FD;&#x4E1C;&#x5357;&#x90E8;&#x7684;&#x677E;&#x6811;&#x6797;&#x548C;&#x8BB8;&#x591A;&#x5176;&#x4ED6;&#x7684;&#x68EE;&#x6797;&#x5730;&#x533A;&#xFF0C;&#x5728;&#x5168;&#x7403;&#x8303;&#x56F4;&#x5185;&#x7684;&#x4E3B;&#x8981;&#x539F;&#x56E0;&#x3002;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x66F4;&#x5927;&#x7684;&#x52AA;&#x529B;&#x6765;&#x53D1;&#x73B0;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x4E00;&#x90E8;&#x5206;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x53D7;&#x5230;&#x751F;&#x6839;&#x5230;&#x4E09;&#x65E0;&#x5173;&#x7684;&#x677E;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x5BF9;&#x6D47;&#x6C34;&#x7684;&#x4E09;&#x4E2A;&#x7597;&#x7A0B;&#x3002;&#x4ECE;&#x4ECE;&#x6839;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x751F;&#x6210;&#x7684; 12,918 &#x968F;&#x673A;&#x9009;&#x62E9;&#x6269;&#x589E; 3&#39; &#x548C; 5&#39; &#x7AEF;&#x83B7;&#x5F97;&#x4E86;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x7B7E; (&#x65E0;&#x5BB3;&#x73AF;&#x5883;&#x6280;&#x672F;)&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x65E0;&#x5BB3;&#x73AF;&#x5883;&#x6280;&#x672F;&#x90FD;&#x805A;&#x96C6;&#x6765;&#x6807;&#x8BC6; 6,765 &#x72EC;&#x7279;&#x6210;&#x7EE9;&#x5355; (UniScripts) &#x6765;&#x81EA; 6,202 &#x5047;&#x5B9A;&#x72EC;&#x7279;&#x57FA;&#x56E0; (UniGenes S)&#x3002;&#x6682;&#x5B9A;&#x6CE8;&#x91CA;&#x88AB;&#x5206;&#x914D;&#x5230;&#x86CB;&#x767D;&#x975E;&#x5197;&#x4F59;&#x53C2;&#x8003;&#x4FE1;&#x606F;&#x8D44;&#x6E90; &#xFF08;PIR-NREF) &#x6570;&#x636E;&#x5E93; BLASTX &#x6BD4;&#x8F83;&#x7684;&#x57FA;&#x7840;&#x4E0A;&#x3002;&#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x7684; 42 UniScripts &#x5177;&#x6709;&#x9AD8;&#x7684;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x610F;&#x4E49;&#xFF0C;&#x5728;&#x6CBB;&#x7597;&#x65B9;&#x9762;&#x5404;&#x4E0D;&#x76F8;&#x540C;&#x3002;&#x5176;&#x4E2D;&#x8BB8;&#x591A;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x8BC1;&#x660E;&#x662F;&#x91CD;&#x8981;&#x7684;&#x5728;&#x5176;&#x4ED6;&#x7269;&#x79CD;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x5305;&#x62EC;&#x8131;&#x6C34;&#x3001; endochitinases&#x3001; &#x7EC6;&#x80DE;&#x8272;&#x7D20; p450 &#x6C27;&#x5316;&#x9176;&#x3001; &#x75C5;&#x7A0B;&#x76F8;&#x5173;&#x86CB;&#x767D;&#x548C;&#x5404;&#x79CD;&#x540E;&#x671F;&#x80DA;&#x80CE;&#x53D1;&#x751F;&#x4E30;&#x5BCC; (LEA) &#x57FA;&#x56E0;&#x4EA7;&#x54C1;&#x7684;&#x8010;&#x65F1;&#x6027;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x4EA7;&#x54C1;&#x3002;&#x540C;&#x6837;&#xFF0C;110 UniScripts &#x8868;&#x8FBE;&#x6C34;&#x5E73;&#x4E0E;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#xFF0C;&#x8868;&#x660E;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E00;&#x7269;&#x79CD;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x8C31;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x6BD4;&#x6CBB;&#x7597;&#x66F4;&#x591A;&#x4F9D;&#x8D56;&#x9AD8;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x610F;&#x4E49;&#x5404;&#x4E0D;&#x76F8;&#x540C;&#x3002;&#x5927;&#x90E8;&#x5206;&#x7684;&#x6C34;&#x5E94;&#x6FC0;&#x677E;&#x4F3C;&#x4E4E;&#x7F16;&#x7801;&#x4EA7;&#x54C1;&#x7C7B;&#x4F3C;&#x4E8E;&#x5E72;&#x65F1;&#x516C;&#x5DEE;&#x56E0;&#x5B50;&#x7684;&#x5176;&#x4ED6;&#x7269;&#x79CD;&#x7684; UniScripts &#x6700;&#x9AD8;&#x88AB;&#x5F15;&#x8BF1;&#x5728;&#x5355;&#x4E00;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#xFF0C;&#x6697;&#x793A;&#x6297;&#x65F1;&#x7279;&#x522B;&#x6709;&#x7528;&#x81EA;&#x9002;&#x5E94;&#x7684;&#x7B49;&#x4F4D;&#x57FA;&#x56E0;&#x53EF;&#x80FD;&#x5B58;&#x5728;&#x7684;&#x6269;&#x589E;&#x4ECE;&#x8FD9;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x578B;&#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x5728;&#x96C6;&#x5408;&#x4E2D;&#x3002;&#x6316;&#x6398;&#x548C;&#x53EF;&#x89C6;&#x5316;&#x5B8C;&#x6574;&#x7684;&#x6570;&#x636E;&#x96C6;&#xFF0C;&#x4EE5;&#x53CA;&#x4E0B;&#x8F7D;&#x7684; EST &#x548C; UniScript contig &#x5E8F;&#x5217;&#xFF0C;&#x6709;&#x53EF;&#x80FD;&#x5728; http://fungen.org/genediscovery/ &#x4F7F;&#x7528;&#x9B54;&#x6CD5;&#x57FA;&#x56E0;&#x53D1;&#x73B0;&#x3002;

&#x6C34;&#x5E94;&#x6FC0;&#x53CD;&#x5E94;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x7684;&#x5E8F;&#x5217;&#x6807;&#x7B7E;&#x5E93;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x7531;&#x6807;&#x8BC6;&#x7684;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E;) &#x6839;&#x7684;&#x3002;

Drought stress is the principal cause of seedling mortality in pine forests of the southeastern United States and in many other forested regions around the globe. As part of a larger effort to discover loblolly pine genes, this study subjected rooted cuttings of three unrelated pine genotypes to three watering regimens. Expressed sequence tags (ESTs) were obtained from both the 3' and 5' ends of 12,918 randomly selected cDNAs generated from root tissues. These ESTs were clustered to identify 6,765 unique transcripts (UniScripts) derived from 6,202 putative unique genes (UniGenes-S). Tentative annotations were assigned on the basis of BLASTX comparisons to the Protein Information Resource Nonredundant Reference (PIR-NREF) database. Expression levels of 42 UniScripts varied with high statistical significance with respect to treatment. Many of them resembled gene products shown to be important for drought tolerance in other species, including dehydrins, endochitinases, cytochrome P450 enzymes, pathogenesis-related proteins and various late-embryogenesis abundant (LEA) gene products. Similarly, expression levels of 110 UniScripts varied with high statistical significance among genotypes, indicating that gene expression patterns in this species are much more dependent on genotype than on treatment. Most of the water stress-induced pine UniScripts that appeared to encode products resembling drought tolerance factors in other species were most highly induced in a single genotype, suggesting that particularly useful adaptive alleles for drought tolerance might exist within the collection of cDNAs characterized from this genotype. Mining and visualizing the complete data set, as well as downloading of both EST and UniScript contig sequences, are possible using MAGIC Gene Discovery at http://fungen.org/genediscovery/.

Water stress-responsive genes in loblolly pine (Pinus taeda) roots identified by analyses of expressed sequence tag libraries.

Le stress hydrique est la principale cause de mortalit&#xE9; des semis dans les for&#xEA;ts de pins du sud-est des &#xC9;tats-Unis et dans beaucoup d&#x26;#39;autres r&#xE9;gions foresti&#xE8;res du monde entier. Dans le cadre d&#x26;#39;un vaste effort visant &#xE0; d&#xE9;couvrir les g&#xE8;nes de pins &#xE0; encens, cette &#xE9;tude soumis boutures racin&#xE9;es de trois g&#xE9;notypes de pin sans rapport avec trois sch&#xE9;mas d&#x26;#39;arrosage. &#xC9;tiquettes de s&#xE9;quences exprim&#xE9;es (EST) ont &#xE9;t&#xE9; obtenus &#xE0; la fois de la 3 &#x26;#39;et 5&#x26;#39; extr&#xE9;mit&#xE9;s de 12,918 ADNc choisis au hasard g&#xE9;n&#xE9;r&#xE9;s &#xE0; partir de tissus racinaires. Ces EST ont &#xE9;t&#xE9; regroup&#xE9;s afin d&#x26;#39;identifier 6,765 transcriptions uniques (UniScripts) provenant de 6,202 putatifs g&#xE8;nes uniques (unig&#xE8;nes-S). Annotations indicatives ont &#xE9;t&#xE9; attribu&#xE9;es sur la base de comparaisons BLASTX &#xE0; la Source de r&#xE9;f&#xE9;rence des prot&#xE9;ines de l&#x26;#39;information non redondant (PIR-NREF) base de donn&#xE9;es. Les niveaux d&#x26;#39;expression de 42 UniScripts vari&#xE9; avec une signification statistique &#xE9;lev&#xE9;e par rapport &#xE0; un traitement. Beaucoup d&#x26;#39;entre eux ressemblait &#xE0; des produits g&#xE9;niques r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9;es importante tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse dans d&#x26;#39;autres esp&#xE8;ces, y compris, les d&#xE9;hydrines endochitinases enzymes du cytochrome P450, li&#xE9;e &#xE0; la pathogen&#xE8;se des prot&#xE9;ines et divers en fin de l&#x26;#39;embryogen&#xE8;se abondantes produits g&#xE9;niques (LEA). De m&#xEA;me, les niveaux d&#x26;#39;expression de 110 UniScripts vari&#xE9; avec une signification statistique &#xE9;lev&#xE9; chez les g&#xE9;notypes, ce qui indique que l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes de cette esp&#xE8;ce sont beaucoup plus d&#xE9;pendants du g&#xE9;notype que sur le traitement. La plupart des UniScripts eau des pins induites par le stress qui semblaient codent pour des produits qui ressemblent &#xE0; des facteurs tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse dans d&#x26;#39;autres esp&#xE8;ces ont &#xE9;t&#xE9; les plus fortement induite dans un seul g&#xE9;notype, ce qui sugg&#xE8;re que particuli&#xE8;rement utiles all&#xE8;les adaptatifs pour tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse pourrait exister dans la collection d&#x26;#39;ADNc caract&#xE9;ris&#xE9;s &#xE0; partir de ce g&#xE9;notype . Mines et la visualisation de l&#x26;#39;ensemble complet des donn&#xE9;es, ainsi que le t&#xE9;l&#xE9;chargement &#xE0; la fois de l&#x26;#39;EST et UniScript s&#xE9;quences contigs, sont possibles en utilisant Gene Discovery MAGIC &#xE0; http://fungen.org/genediscovery/.

De stress hydrique g&#xE8;nes sensibles &#xE0; pin &#xE0; encens (Pinus taeda) Roots identifi&#xE9;s par des analyses de s&#xE9;quences exprim&#xE9;es biblioth&#xE8;ques de balises

Trockenstress ist die Hauptursache der S&auml;mling Sterblichkeit in Kiefernw&auml;lder der s&uuml;d&ouml;stlichen Vereinigten Staaten und in vielen anderen bewaldeten Regionen rund um den Globus. Als Teil einer gr&ouml;&szlig;eren Anstrengung Loblolly Pine Gene zu entdecken Wurzelreben von drei unabh&auml;ngigen Kiefer-Genotypen zu drei Tr&auml;nken Therapien dieser Studie unterzogen. Exprimierten Sequenz Markierungen (ESTs) stammen von die 3&#39; und 5&#39;-Enden der 12.918 zuf&auml;llig ausgew&auml;hlte cDNAs aus Stamm Gewebe generiert. Diese ESTs waren damals, um 6.765 einzigartige Transkripte (UniScripts) abgeleitet 6.202 vermeintliche eindeutigen Gene (UniGenes-S) zu identifizieren. Vorl&auml;ufige Anmerkungen wurden auf der Grundlage BLASTX Vergleiche der Protein Information Resource redundantes Reference (PIR-NREF)-Datenbank zugewiesen. Stufen von 42 UniScripts mit hohe statistische Signifikanz in Bezug auf Behandlung variiert. Viele von ihnen &auml;hnelte Genprodukte f&uuml;r Trockenheit sch&uuml;tzt andere Arten, einschlie&szlig;lich Dehydrins, Endochitinases, Zellfarbstoff P450 Enzyme, Pathogenese-&auml;hnliche Proteine und reichlich (LEA)-Genprodukte mit verschiedenen sp&auml;ten Embryogenese wichtig erwiesen. Ebenso vielf&auml;ltig Ausdruck Niveaus von 110 UniScripts mit hohe statistische Signifikanz zwischen den Genotypen, dass Genausdruck Muster in dieser Spezies Genotyp als Behandlung viel st&auml;rker abh&auml;ngig sind. Die meisten Wasser Stress-induced Kiefer UniScripts, die zum Codieren von Produkten wie D&uuml;rre Toleranz Faktoren bei anderen Arten erschienen waren h&ouml;chst induziert in einem einzigen Genotyp, darauf hindeutet, dass besonders n&uuml;tzlich adaptive Allele f&uuml;r Trockenheitstoleranz innerhalb der Auflistung von cDNAs gekennzeichnet von diesem Genotyp vorhanden sein k&ouml;nnen. Bergbau und Visualisierung das Daten-Komplettset, sowie Download der EST und UniScript Contig-Sequenzen, sind m&ouml;glich &uuml;ber MAGIC Gene Discovery am http://fungen.org/genediscovery/.

Wasser Druck-responsive Gene in Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda) Wurzeln durch Analysen der exprimierten Sequenz-Tag-Bibliotheken identifiziert.

Siccit&agrave; lo stress &egrave; la principale causa di mortalit&agrave; semenzale in pinete di Stati Uniti sudorientali e in molte altre regioni boscose intorno al globo. Come parte di un pi&ugrave; ampio sforzo per scoprire geni loblolly pine, questo studio sottoposto barbatelle franche di tre genotipi di pino non correlate a tre regimi d&#39;innaffiatura. Expressed sequence tags (ESTs) sono stati ottenuti da entrambi il 3&#39; e 5&#39; estremit&agrave; di 12.918 cDNAs selezionato casualmente generati dai tessuti della radice. Questi ESTs erano raggruppati per identificare 6.765 trascrizioni uniche (UniScripts) derivate da 6.202 putativi geni unici (UniGenes-S). Annotazioni provvisorie sono state assegnate sulla base di confronti BLASTX al database di proteine informazioni risorsa Nonredundant riferimento (NREF-PIR). I livelli di espressione di 42 UniScripts vario con elevata significativit&agrave; statistica rispetto al trattamento. Molti di loro somigliava a prodotti del gene indicati per essere importante per la tolleranza alla siccit&agrave; in altre specie, tra cui dehydrins, endochitinases, gli enzimi del citocromo P450, proteine correlate a patogenesi e vari tardo-embriogenesi abbondanti (LEA) prodotti del gene. Allo stesso modo, i livelli di espressione di 110 UniScripts vario con elevata significativit&agrave; statistica tra genotipi, che indica che il pattern di espressione genica in questa specie sono molto pi&ugrave; dipendente dal genotipo rispetto sul trattamento. La maggior parte del pino stress-induced acqua UniScripts che &egrave; apparso per la codifica dei prodotti simile a fattori di tolleranza alla siccit&agrave; in altre specie pi&ugrave; altamente sono stati indotti in un unico genotipo, suggerendo che gli alleli adattivi particolarmente utili per la tolleranza alla siccit&agrave; potrebbero esistere all&#39;interno dell&#39;insieme dei cDNAs caratterizzata da questo genotipo. Data mining e visualizzare il set di dati completo, cos&igrave; come download di sequenze contig sia EST e UniScript, sono possibili utilizzando MAGIC Gene Discovery a http://fungen.org/genediscovery/.

L&#39;acqua lo stress-responsive geni nelle radici loblolly pine (Pinus taeda) identificate da analisi di librerie di tag expressed sequence.

&#x4E7E;&#x71E5;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x306F;&#x3001;&#x7C73;&#x56FD;&#x5357;&#x6771;&#x90E8;&#x306E;&#x677E;&#x6797;&#x3067;&#x3001;&#x4E16;&#x754C;&#x4E2D;&#x306E;&#x4ED6;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x68EE;&#x6797;&#x5730;&#x57DF;&#x3067;&#x306E;&#x5B9F;&#x751F;&#x306E;&#x6B7B;&#x4EA1;&#x7387;&#x306E;&#x4E3B;&#x8981;&#x539F;&#x56E0;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x767A;&#x898B;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x52AA;&#x529B;&#x306E;&#x4E00;&#x74B0;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;3&#x6563;&#x6C34;&#x30EC;&#x30B8;&#x30E1;&#x30F3;&#x306B;3&#x3064;&#x306E;&#x7121;&#x95A2;&#x4FC2;&#x306A;&#x677E;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x306E;&#x633F;&#x3057;&#x6728;&#x3092;&#x884C;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x767A;&#x73FE;&#x914D;&#x5217;&#x30BF;&#x30B0;&#xFF08;EST&#xFF09;&#x306F;&#x6839;&#x306E;&#x7D44;&#x7E54;&#x304B;&#x3089;&#x751F;&#x6210;&#x3055;&#x308C;&#x305F;12918&#x30E9;&#x30F3;&#x30C0;&#x30E0;&#x306B;&#x9078;&#x629E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;cDNA&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;3 &#x26;#39;&#x304A;&#x3088;&#x3073;5&#x26;#39;&#x672B;&#x7AEF;&#x304B;&#x3089;&#x5F97;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;EST&#x306F;6202&#x306E;&#x63A8;&#x5B9A;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#xFF08;UniGenes-S&#xFF09;&#x304B;&#x3089;&#x6D3E;&#x751F;&#x3057;&#x305F;6765&#x306E;&#x30E6;&#x30CB;&#x30FC;&#x30AF;&#x306A;&#x8EE2;&#x5199;&#x7523;&#x7269;&#xFF08;UniScripts&#xFF09;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x30AF;&#x30E9;&#x30B9;&#x30BF;&#x5316;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x66AB;&#x5B9A;&#x7684;&#x306A;&#x30A2;&#x30CE;&#x30C6;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x60C5;&#x5831;&#x30EA;&#x30BD;&#x30FC;&#x30B9;&#x975E;&#x5197;&#x9577;&#x30EA;&#x30D5;&#x30A1;&#x30EC;&#x30F3;&#x30B9;&#xFF08;PIR-NREF&#xFF09;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x3078;&#x306E;BLASTX&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x306B;&#x57FA;&#x3065;&#x3044;&#x3066;&#x5272;&#x308A;&#x5F53;&#x3066;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; 42 UniScripts&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x6CBB;&#x7642;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x3066;&#x9AD8;&#x3044;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x306B;&#x5909;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x591A;&#x304F;&#x306F;dehydrins&#x3001;endochitinases&#x3001;&#x30C1;&#x30C8;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30E0;P450&#x9175;&#x7D20;&#x3001;&#x75C5;&#x56E0;&#x95A2;&#x9023;&#x30BF;&#x30F3;&#x30D1;&#x30AF;&#x8CEA;&#x3084;&#x69D8;&#x3005;&#x306A;&#x5F8C;&#x671F;&#x80DA;&#x767A;&#x751F;&#x8C4A;&#x5BCC;&#x306A;&#xFF08;LEA&#xFF09;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7523;&#x7269;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x4ED6;&#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x4E7E;&#x71E5;&#x8010;&#x6027;&#x306B;&#x91CD;&#x8981;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x793A;&#x3055;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x7523;&#x7269;&#x306B;&#x4F3C;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3001;110 UniScripts&#x306E;&#x767A;&#x73FE;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x7A2E;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x304C;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x306B;&#x4F9D;&#x5B58;&#x3057;&#x3066;&#x6CBB;&#x7642;&#x306B;&#x6BD4;&#x3079;&#x3066;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3001;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x9AD8;&#x3044;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x306B;&#x6709;&#x610F;&#x306B;&#x5909;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x4ED6;&#x306E;&#x7A2E;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x8010;&#x4E7E;&#x6027;&#x56E0;&#x5B50;&#x306B;&#x4F3C;&#x305F;&#x88FD;&#x54C1;&#x3092;&#x30A8;&#x30F3;&#x30B3;&#x30FC;&#x30C9;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x73FE;&#x308C;&#x305F;&#x6C34;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x8A98;&#x5C0E;&#x677E;UniScripts&#x306E;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x306F;&#x3001;&#x6700;&#x3082;&#x9AD8;&#x3044;&#x8010;&#x4E7E;&#x6027;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x7279;&#x306B;&#x6709;&#x7528;&#x306A;&#x9069;&#x5FDC;&#x306E;&#x5BFE;&#x7ACB;&#x306F;&#x3001;&#x3053;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x578B;&#x304B;&#x3089;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x308B;cDNA&#x306E;&#x30B3;&#x30EC;&#x30AF;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x5185;&#x306B;&#x5B58;&#x5728;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3001;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306B;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3002;&#x9271;&#x696D;&#x3001;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x30C7;&#x30FC;&#x30BF;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#x3092;&#x53EF;&#x8996;&#x5316;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3068;&#x3082;&#x306B;&#x3001;EST&#x3068;UniScript&#x30B3;&#x30F3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30B0;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x4E21;&#x65B9;&#x306E;&#x30C0;&#x30A6;&#x30F3;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C9;&#x306F;&#x3001;http://fungen.org/genediscovery/&#x3067;MAGIC&#x30B8;&#x30FC;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30B9;&#x30AB;&#x30D0;&#x30EA;&#x30FC;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x53EF;&#x80FD;&#x3067;&#x3059;&#x3002;

&#x767A;&#x73FE;&#x914D;&#x5217;&#x30BF;&#x30B0;&#x30E9;&#x30A4;&#x30D6;&#x30E9;&#x30EA;&#x306E;&#x89E3;&#x6790;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#xFF09;&#x6839;&#x306E;&#x6C34;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6027;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;

&#xAC00;&#xBB44; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xBBF8;&#xAD6D; &#xB0A8;&#xB3D9;&#xBD80;&#xC758; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; &#xC232;&#xACFC; &#xC138;&#xACC4;&#xC758; &#xB2E4;&#xB978; &#xB9CE;&#xC740; &#xC232;&#xC774; &#xC6B0;&#xAC70;&#xC9C4;&#xB41C; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xBAA8; &#xC885; &#xC0AC;&#xB9DD;&#xB960;&#xC758; &#xC8FC; &#xC6D0;&#xC778;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD070; &#xB178;&#xB825;&#xC744;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xACAC;&#xC758; &#xC77C;&#xD658;&#xC73C;&#xB85C;,&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xB300;&#xC0C1;&#xC774; 3 &#xAE09;&#xC218; regimens &#xC138; &#xBB34;&#xAD00;&#xB41C; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; genotypes &#xC798;&#xB77C; &#xBFCC;&#xB9AC;. &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD0DC;&#xADF8; (ESTs) &#xB8E8;&#xD2B8; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC0DD;&#xC131; &#xB41C; 12,918 &#xBB34;&#xC791;&#xC704;&#xB85C; &#xC120;&#xD0DD; &#xB41C; Cdnas&#xC758; 3&#39;&#xC640; 5&#39; &#xB05D;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5BB;&#xC740; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; ESTs &#xC2DD;&#xBCC4; &#xACE0;&#xC720; &#xC131;&#xC801;&#xD45C; (UniScripts) 6,202 &#xC0C1; &#xB3C5;&#xD2B9;&#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; (UniGenes S)&#xC5D0;&#xC11C; &#xD30C;&#xC0DD; &#xB41C; 6,765 &#xD074;&#xB7EC;&#xC2A4;&#xD130; &#xD588;&#xB2E4;. &#xBBF8;&#xC815; &#xC8FC;&#xC11D; BLASTX &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; &#xC815;&#xBCF4; &#xB9AC;&#xC18C;&#xC2A4; &#xBE44;&#xC911;&#xBCF5; &#xCC38;&#xC870; (PIR NREF) &#xB370;&#xC774;&#xD130;&#xBCA0;&#xC774;&#xC2A4;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xBE44;&#xAD50;&#xB97C; &#xBC14;&#xD0D5;&#xC73C;&#xB85C; &#xC9C0;&#xC815; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. 42 &#xC2DD; &#xC218;&#xC900;&#xC758; UniScripts &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xB192;&#xC740; &#xD1B5;&#xACC4;&#xC801; &#xC758;&#xBBF8;&#xC640; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C;. &#xADF8;&#xB4E4; &#xC911; &#xB9CE;&#xC740; &#xB2EE;&#xC740; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC81C;&#xD488; dehydrins, endochitinases, &#xC2DC; &#xD1A0; &#xD06C;&#xB86C; P450 &#xD6A8;&#xC18C;, &#xB2E8;&#xBC31;&#xC9C8; pathogenesis &#xAD00;&#xB828; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C; &#xB2A6;&#xC740; embryogenesis &#xD48D;&#xBD80;&#xD55C; (&#xB808; &#xC544;) &#xC9C4; &#xC81C;&#xD488; &#xB4F1; &#xB2E4;&#xB978; &#xC885;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAC00;&#xBB44; &#xB0B4;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC911;&#xC694; &#xD55C; &#xD45C;&#xC2DC;. &#xB9C8;&#xCC2C;&#xAC00;&#xC9C0;&#xB85C;, &#xC2DD; &#xC218;&#xC900;&#xC758; 110 UniScripts genotypes,&#xC774; &#xC885; &#xC9C4; &#xC2DD; &#xD328;&#xD134;&#xC740; &#xCE58;&#xB8CC;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD615;&#xC5D0; &#xD6E8;&#xC52C; &#xB354; &#xC758;&#xC874;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0B4;&#xB294; &#xAC00;&#xC6B4;&#xB370; &#xB192;&#xC740; &#xD1B5;&#xACC4;&#xC801; &#xC758;&#xBBF8;&#xC640; &#xB2E4;&#xC591; &#xD55C;. &#xBB3C; &#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xC720;&#xBC1C; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; &#xAC00;&#xBB44; &#xD5C8;&#xC6A9; &#xC624;&#xCC28; &#xC694;&#xC778; &#xB2E4;&#xB978; &#xC885;&#xC871;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC744; &#xB2EE;&#xC740; &#xC81C;&#xD488;&#xC744; &#xB098;&#xD0C0;&#xB09C; Uniscripts&#xC758; &#xB300;&#xBD80;&#xBD84;&#xC740; &#xAC00;&#xC7A5; &#xB192;&#xC740; &#xAC00;&#xBB44; &#xD5C8;&#xC6A9;&#xC5D0; &#xB300;&#xD574; &#xD2B9;&#xD788; &#xC720;&#xC6A9; &#xC801;&#xC751;&#xD615; &#xB300;&#xB9BD;&#xC5D0;&#xC11C;&#xC774; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD615; &#xD2B9;&#xC9D5; cDNAs &#xCEEC;&#xB809;&#xC158; &#xB0B4; &#xC788;&#xC744; &#xC81C;&#xC548; &#xB2E8;&#xC77C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD615;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xB3C4; &#xB41C;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xC774;&#xB2DD; &#xBC0F; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xB370;&#xC774;&#xD130; &#xC9D1;&#xD569;&#xC744; &#xC2DC;&#xAC01;&#xD654;&#xB85C; EST&#xC640; UniScript contig &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4;&#xC758; &#xB2E4;&#xC6B4;&#xB85C;&#xB4DC; &#xB9E4;&#xC9C1; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xAC80;&#xC0C9;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; http://fungen.org/genediscovery/&#xC5D0; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xC2A4;&#xD2B8;&#xB808;&#xC2A4; &#xBC18;&#xC751; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xD45C;&#xD604;&#xB41C; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2A4; &#xD0DC;&#xADF8; &#xB77C;&#xC774;&#xBE0C;&#xB7EC;&#xB9AC;&#xC758; &#xBD84;&#xC11D;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2DD;&#xBCC4;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda) &#xBFCC;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xBB3C;.

El estr&#xE9;s h&#xED;drico es la principal causa de mortalidad de pl&#xE1;ntulas en los bosques de pinos en el sureste de los Estados Unidos y en muchas otras regiones forestales de todo el mundo. Como parte de un esfuerzo mayor para descubrir los genes de pino taeda, este estudio objeto de esquejes enraizados de tres genotipos de pino no est&#xE9;n relacionados con los tres reg&#xED;menes de riego. Etiquetas de secuencias expresadas (EST) se obtuvieron a partir tanto de la 3 &#x26;#39;y 5&#x26;#39; extremos de 12.918 ADNc seleccionados al azar generados a partir de tejidos de la ra&#xED;z. Estas tecnolog&#xED;as ecol&#xF3;gicamente racionales se agruparon para identificar 6.765 transcripciones &#xFA;nico (UniScripts) derivados de los 6.202 genes putativos &#xFA;nicos (unigenes-S). Anotaciones provisionales se asignaron sobre la base de comparaciones BLASTX a la prote&#xED;na de referencia de recursos de informaci&#xF3;n no redundante (PIR-nref) base de datos. Los niveles de expresi&#xF3;n de 42 UniScripts variaron con alta significaci&#xF3;n estad&#xED;stica con respecto al tratamiento. Muchos de ellos se parec&#xED;a a productos de los genes que han demostrado ser importante para la tolerancia a la sequ&#xED;a en otras especies, incluyendo dehidrinas y endochitinases, las enzimas del citocromo P450, prote&#xED;nas relacionadas con la patog&#xE9;nesis y varias finales de la embriog&#xE9;nesis abundantes (LEA) los productos g&#xE9;nicos. Del mismo modo, los niveles de expresi&#xF3;n de 110 UniScripts variado con alta significaci&#xF3;n estad&#xED;stica entre los genotipos, lo que indica que los patrones de expresi&#xF3;n gen&#xE9;tica en esta especie son mucho m&#xE1;s dependientes del genotipo que en el tratamiento. La mayor&#xED;a de los UniScripts pino de agua inducidos por el estr&#xE9;s que aparecieron para codificar los productos se asemejan a los factores de tolerancia a la sequ&#xED;a en otras especies fueron m&#xE1;s altamente inducida en un solo genotipo, lo que sugiere que los alelos de adaptaci&#xF3;n particularmente &#xFA;tiles para la tolerancia a la sequ&#xED;a podr&#xED;an existir dentro de la colecci&#xF3;n de ADNc caracterizado de este genotipo . La miner&#xED;a y la visualizaci&#xF3;n del conjunto completo de datos, as&#xED; como la descarga de dos secuencias de EST y UniScript contig, es posible descubrimiento de MAGIC en el uso de Gene http://fungen.org/genediscovery/.

Agua estr&#xE9;s genes de respuesta en el pino de incienso (Pinus taeda) Ra&#xED;ces identificados por el an&#xE1;lisis de las expresadas bibliotecas de secuencias de etiquetas

&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x706B;&#x70AC;&#x677E; L.&#xFF09; &#x5168;&#x7403;&#x8F6C;&#x5F55;&#x5206;&#x6790;&#x662F;&#x7531;&#x4E8E;&#x6709;&#x9650;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x5DE5;&#x5177;&#x5177;&#x6709;&#x6311;&#x6218;&#x6027;&#x3002;PtGen2&#xFF0C;26,496 &#x529F;&#x80FD;&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#xFF0C;&#x662F;&#x634F;&#x9020;&#xFF0C;&#x5E76;&#x7528;&#x4E8E;&#x8BC4;&#x4F30;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x7E41;&#x6B96;&#x4F53;&#x6839;&#x5E72;&#x65F1;&#x8BF1;&#x5BFC;&#x57FA;&#x56E0;&#x8868;&#x8FBE;&#x3002;&#x7EDF;&#x8BA1;&#x5206;&#x6790;&#x7684;&#x5DEE;&#x5F02;&#x8868;&#x8FBE;&#x4E0E;&#x52A0;&#x6743;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x76F8;&#x5173;&#x6027;&#x7F51;&#x7EDC;&#x5206;&#x6790;&#x88AB;&#x7528;&#x6765;&#x786E;&#x5B9A;&#x5E72;&#x65F1;&#x654F;&#x611F;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x8FA8;&#x522B;&#x706B;&#x70AC;&#x677E;&#x6297;&#x65F1;&#x6027;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x7840;&#x3002;

&#x57FA;&#x56E0;&#x82AF;&#x7247;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x57FA;&#x56E0;&#x65E0;&#x6807;&#x5EA6;&#x7F51;&#x7EDC;&#x786E;&#x5B9A;&#x5019;&#x9009;&#x4EBA;&#x5E72;&#x65F1;&#x5F3A;&#x8C03;&#x6839;&#x7684;&#x706B;&#x70AC;&#x677E; (&#x4F53;&#x80B2;&#x706B;&#x70AC; L.&#xFF09; &#x7684;&#x76D1;&#x7BA1;&#x673A;&#x6784;&#x3002;

Global transcriptional analysis of loblolly pine (Pinus taeda L.) is challenging due to limited molecular tools. PtGen2, a 26,496 feature cDNA microarray, was fabricated and used to assess drought-induced gene expression in loblolly pine propagule roots. Statistical analysis of differential expression and weighted gene correlation network analysis were used to identify drought-responsive genes and further characterize the molecular basis of drought tolerance in loblolly pine.

Microarray analysis and scale-free gene networks identify candidate regulators in drought-stressed roots of loblolly pine (P. taeda L.).

Analyse globale de la transcription de pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.) est difficile en raison de l&#x26;#39;insuffisance des outils mol&#xE9;culaires. PtGen2, un micror&#xE9;seau d&#x26;#39;ADNc 26496 fonctionnalit&#xE9;, a &#xE9;t&#xE9; fabriqu&#xE9; et utilis&#xE9; pour &#xE9;valuer l&#x26;#39;expression des g&#xE8;nes induite par la s&#xE9;cheresse dans les racines de pins &#xE0; encens de propagules. L&#x26;#39;analyse statistique de l&#x26;#39;expression diff&#xE9;rentielle et l&#x26;#39;analyse de r&#xE9;seau pond&#xE9;r&#xE9;e g&#xE8;ne de corr&#xE9;lation ont &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;s pour identifier les g&#xE8;nes sensibles &#xE0; la s&#xE9;cheresse et de mieux caract&#xE9;riser la base mol&#xE9;culaire de la tol&#xE9;rance &#xE0; la s&#xE9;cheresse chez le pin &#xE0; encens.

Analyse de Microarray et des r&#xE9;seaux de g&#xE8;nes sans &#xE9;chelle identifier des r&#xE9;gulateurs candidats dans la s&#xE9;cheresse de stress Racines de pin &#xE0; encens (Pinus taeda L.)

Transkriptionelle Gesamtanalyse der Weihrauch-Kiefer (Pinus Taeda L.) ist eine Herausforderung aufgrund der begrenzten Molekulare Werkzeuge. PtGen2, ein 26.496 Feature cDNA-Microarray, war hergestellt und zur Bewertung der D&uuml;rre-induzierte Genexpression in Loblolly Pine Diaspore Wurzeln verwendet. Statistische Analyse der differenziellen Ausdruck und gewichteten Gen Korrelation Netzwerkanalyse wurden zur D&uuml;rre-responsive Gene zu identifizieren und weitere charakterisieren die molekulare Basis Trockenheitstoleranz Loblolly Pine.

Microarray Analyse und skalenfreies gen Netzwerke identifizieren Kandidaten Regulatoren in D&uuml;rre-betonte Wurzeln der Weihrauch-Kiefer (p. Taeda L.).

Analisi globale di transcriptional del loblolly pine (Pinus taeda L.) sono difficile a causa della limitata strumenti molecolari. PtGen2, un 26.496 caratteristica cDNA microarray, &egrave; stato fabbricato e utilizzato per valutare l&#39;espressione genica indotta da siccit&agrave; nelle radici propagule loblolly pine. Analisi statistica dell&#39;espressione differenziale e analisi di rete di correlazione ponderata gene sono stati utilizzati per identificare i geni sensibili alla siccit&agrave; e caratterizzare ulteriormente le basi molecolari della tolleranza alla siccit&agrave; in loblolly pine.

Analisi di Microarray e reti scale-free gene identificano regolatori candidato nella siccit&agrave;-ha sottolineato le radici di pino loblolly (p. taeda L.).

&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x30B0;&#x30ED;&#x30FC;&#x30D0;&#x30EB;&#x8EE2;&#x5199;&#x89E3;&#x6790;&#xFF08;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x9650;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x5206;&#x5B50;&#x30C4;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6311;&#x6226;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002; PtGen2&#x3001;26496&#x6A5F;&#x80FD;cDNA&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306F;&#x3001;&#x88FD;&#x4F5C;&#x3057;&#x3001;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x7E41;&#x6B96;&#x306E;&#x6839;&#x3067;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x8A98;&#x5C0E;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x767A;&#x73FE;&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x5DEE;&#x52D5;&#x5F0F;&#x3068;&#x91CD;&#x307F;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x76F8;&#x95A2;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x89E3;&#x6790;&#x306E;&#x7D71;&#x8A08;&#x7684;&#x5206;&#x6790;&#x306F;&#x3001;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x5FDC;&#x7B54;&#x6027;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x3001;&#x3055;&#x3089;&#x306B;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x4E7E;&#x71E5;&#x8010;&#x6027;&#x306E;&#x5206;&#x5B50;&#x57FA;&#x76E4;&#x3092;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x89E3;&#x6790;&#x3068;&#x30B9;&#x30B1;&#x30FC;&#x30EB;&#x30D5;&#x30EA;&#x30FC;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x30CD;&#x30C3;&#x30C8;&#x30EF;&#x30FC;&#x30AF;&#x306F;&#x3001;&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;&#x306E;&#x5E72;&#x3070;&#x3064;&#x30B9;&#x30C8;&#x30EC;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30C4;&#xFF08;P.&#x30C6;&#x30FC;&#x30C0;&#x30DE;&#x30C4;L.&#xFF09;&#x306E;&#x5019;&#x88DC;&#x30EC;&#x30AE;&#x30E5;&#x30EC;&#x30FC;&#x30BF;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;

&#xAE00;&#xB85C;&#xBC8C; transcriptional &#xBD84;&#xC11D;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; (Pinus taeda L.)&#xC758; &#xC81C;&#xD55C; &#xB41C; &#xBD84;&#xC790; &#xB3C4;&#xAD6C; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xB3C4;&#xC804; &#xC774;&#xB2E4;. PtGen2, 26,496 &#xAE30;&#xB2A5; cDNA microarray &#xC870;&#xC791; &#xB418;&#xC5C8;&#xACE0;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34; propagule &#xBFCC;&#xB9AC;&#xC5D0; &#xAC00;&#xBB44;&#xC744; &#xC774;&#xC6A9;&#xD55C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC1C;&#xD604;&#xC744; &#xD3C9;&#xAC00; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xCC28;&#xB3D9; &#xC2DD;&#xC758; &#xD1B5;&#xACC4; &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F;&#xAC00; &#xC911;&#xB41C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC0C1;&#xAD00; &#xAD00;&#xACC4; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xBD84;&#xC11D; &#xAC00;&#xBB44; &#xBC18;&#xC751; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; &#xCD94;&#xAC00; &#xD2B9;&#xC131; &#xAC00;&#xBB44; &#xAD00;&#xC6A9;&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xBD84;&#xC790; &#xAE30;&#xC900;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD588;&#xB2E4;.

Microarray &#xBD84;&#xC11D; &#xBC0F; &#xADDC;&#xBAA8; &#xBB34;&#xB8CC; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xB124;&#xD2B8;&#xC6CC;&#xD06C; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD6C4;&#xBCF4; &#xB808; &#xADE4; &#xB808;&#xC774; &#xD130; (P. taeda L.)&#xACFC; &#xC18C;&#xB098;&#xBB34;&#xC758; &#xBFCC;&#xB9AC; &#xAC00;&#xBB44;&#xC744; &#xAC15;&#xC870; &#xD588;&#xB2E4;.

An&#xE1;lisis global de la transcripci&#xF3;n de pino taeda (Pinus taeda L.) es un reto debido a la escasez de herramientas moleculares. PtGen2, un microarray de 26.496 funci&#xF3;n de ADNc, se fabric&#xF3; y se utiliza para evaluar la sequ&#xED;a inducida por la expresi&#xF3;n de genes en las ra&#xED;ces de pino taeda de prop&#xE1;gulos. El an&#xE1;lisis estad&#xED;stico de la expresi&#xF3;n diferencial y el an&#xE1;lisis ponderado de la correlaci&#xF3;n gen&#xE9;tica de la red se utiliza para identificar genes de respuesta a la sequ&#xED;a y caracterizar las bases moleculares de la tolerancia a la sequ&#xED;a en el pino de incienso.

An&#xE1;lisis de microarrays y redes libres de escala de genes reguladores Identificar candidatos en la sequ&#xED;a estr&#xE9;s ra&#xED;ces del pino tea (P. taeda L.)

W. Walter Lorenz

Warnell School of Forestry and Natural Resources

University of Georgia (UGA)

Processing the Loblolly Pine PtGen2 cDNA Microarray

An Improved Method of RNA Isolation from Loblolly Pine (P. taeda L.) and Other Conifer Species