Reconstituição de β-catenina degradação na<em&gt; Xenopus</em&gt; Extrato de ovo

Resumo

Um método é descrito para a análise de degradação de proteínas utilizando radiolabeled e proteínas luciferase de fusão em Xenopus extrato do ovo e sua adaptação para high-throughput screening para modulares de degradação de proteínas.

Resumo

Xenopus laevis extracto de ovo é, um sistema robusto bem caracterizado para estudar a bioquímica de diversos processos celulares. Xenopus extracto de ovo foi utilizada para estudar a rotatividade de proteínas, em muitos contextos celulares, incluindo o ciclo de célula e de transdução de sinal de caminhos ^1-3. Aqui, é descrito um método para o isolamento de Xenopus extracto de ovo que foi optimizada para promover a degradação do componente da via Wnt crítico, β-catenina. Dois métodos diferentes são descritas para avaliar a degradação das proteínas β-catenina no Xenopus extracto de ovo. Um método é visualmente informativo ^([35 S]-radiomarcado proteínas), enquanto o outro é mais facilmente dimensionado para ensaios de elevado rendimento (firefly proteínas de fusão de luciferase-marcada). As técnicas descritas podem ser utilizadas para, mas não estão limitados a, avaliar retorno da proteína β-catenina e identificar componentes moleculares que contribuem para a sua rotação. Além disso, a capacidade para purificar grandes quantidades de extracto de ovo de Xenopus homogénea combinada com a leitura quantitativa e fácil de proteínas marcadas-luciferase permite que este sistema possa ser facilmente adaptado para o rastreio de alto rendimento para moduladores da degradação β-catenina.

Introdução

Xenopus laevis extrato do ovo tem sido amplamente utilizado para estudar muitos processos biológicos celulares, incluindo a dinâmica do citoesqueleto, montagem e importação nuclear, apoptose, metabolismo ubiquitina, a progressão do ciclo celular, transdução de sinal, e turnover de proteína ^1-17. O sistema de extrato de ovos de Xenopus é passível de análise bioquímica de uma legião de processos celulares porque extrato do ovo representa essencialmente citoplasma não diluído que contém todos os componentes citoplasmáticos essenciais necessários para executar esses processos e permitir investigação. Grandes quantidades de extracto de ovo, podem ser preparados ao mesmo tempo para manipulações bioquímicas que requerem grandes quantidades de material (por exemplo, a purificação de proteínas ou de triagem de alto rendimento) ^18-20. Outra vantagem é que a concentração de proteínas específicas em Xenopus extracto de ovo pode ser ajustada com precisão por adição de proteína recombinante e / ou de imunodepleção endogproteínas enous em contraste com a transfecção do plasmídeo de DNA em que a expressão da proteína de interesse é difícil de controlar. Além disso, a ausência de proteínas recombinantes disponíveis pode ser eliminada pela adição de transcritos que codificam a proteína de interesse, tomando vantagem da elevada capacidade do extracto de ovo de Xenopus recentemente preparada para traduzir o mRNA exogenamente adicionado.

A regulação da degradação de proteínas é fundamental para o controle de muitas vias celulares e processa ^21. Xenopus extrato do ovo tem sido amplamente utilizado para estudar a degradação de proteínas como o sistema permite várias maneiras de monitorar turnover de proteína, sem influências de confusão de transcrição e tradução. A via de sinalização Wnt é uma via de sinalização altamente conservada, que desempenha um papel crítico no desenvolvimento e na doença. O volume de negócios de β-catenina, o principal efetor da via Wnt, é altamente regulado, e um aumento do estado de equilíbrio level de β-catenina é fundamental para a ativação de genes alvo de Wnt. A importância da degradação β-catenina é realçada pelo facto de que as mutações na via de Wnt que inibem a degradação β-catenina em ~ 90% de todos os casos esporádicos de cancro colorrectal ^22. degradação β-catenina por componentes da via Wnt podem ser fielmente recapitulado em Xenopus extracto de ovo para estudar o mecanismo da sua rotação, assim como para identificar novos moduladores de pequenas molécula do seu degradação ^{2, 19, 20, 23-29.}

Os métodos para a preparação do extracto de ovo de Xenopus para o estudo do ciclo celular têm sido descritos nas publicações anteriores JoVE ^30-32. O actual protocolo descreve uma modificação destes métodos e é optimizado para a degradação de ^[35 S]-radiomarcado β-catenina e marcaram-luciferase β-catenina emExtrato de ovos de Xenopus. O ensaio de degradação radiolabeled permite a visualização direta dos níveis de proteína através de auto-radiografia. ^[35 S]-metionina incorporada na proteína de interesse, utilizando uma reacção de tradução in vitro, que pode então ser directamente adicionado a uma reacção de degradação. Além disso, o ensaio de retorno da proteína marcada radioactivamente não requer um anticorpo contra a proteína de interesse ou um epitopo marcador, o qual pode influenciar a estabilidade da proteína. Porque até mesmo pequenas mudanças nos níveis de proteína, como reflectida em alterações na intensidade da banda de proteína marcada radioactivamente, são prontamente visualizados por auto-radiografia, o ^[35 S]-radiomarcado ensaio de degradação representa um método muito útil para a visualização da proteína volume ^2.

Fusão de β-catenina a luciferase de vaga-lume (adiante designado simplesmente como "luciferase") permite medições quantitativas precisas e fáceis de níveis de proteína, a fimpara determinar as propriedades cinéticas de rotação β-catenina ^{19, 20.} Uma grande vantagem do ensaio de luciferase é que ela proporciona um sistema forte quantitativa que pode ser facilmente dimensionada para cima. O protocolo seguinte fornece métodos simples para ensaiar a degradação β-catenina e um método robusto e eficiente, e eficaz para o rastreio de alto rendimento de novos moduladores β-catenina.

Protocolo

1. Preparação do extrato do ovo Xenopus

NOTA: Cada sapo produz cerca de 1 ml de extrato de ovo utilizável. Extratos de 10 rãs são normalmente preparados ao mesmo tempo, eo volume de tampão descrito abaixo é para realizar a 10 sapo Xenopus extrato do ovo de preparação. O volume do tampão pode ser ajustada em conformidade, para preparações maiores ou mais pequenas de extracto de ovo. Preps gerados desta maneira consistente originar concentrações de proteína ≥ 50 mg / ml. O processo de coleta de ovos e transformá-los em extrato é mais eficiente quando realizada por duas pessoas. (Para técnicas básicas de criação de sapo, ver Sive et al. ^33).

1. Coleção do ovo
   1. Para preparar os sapos, injetar cada sapo fêmea com 100 U de grávida Mare Serum gonadotrofina (PMSG) de um recém-feitos 250 estoque U / ml. Use uma seringa de 3 ml de tuberculina com uma agulha G 27 para injectar por via subcutânea, com o bisel daa agulha para cima, para dentro do saco de linfa dorsal, que está localizado a aproximadamente 1 cm de distância da linha média das descolorações dentada ao longo do comprimento das pernas de rã.
   2. Armazene rãs condicionadas em água (além de NaCl 20 mM, consulte Sive et al. ³³⁾ a 18 ° C durante 5-10 dias. Para pé sistemas de tanques de água, a densidade animal é de aproximadamente 4 L de água por sapo fêmea. NOTA: O tempo mínimo necessário para aprontar para entrar em vigor é de 5 dias, e os efeitos de priming desgastar depois de 10 dias.
   3. Solução 0,5 x de Marc Modificado Ringer (MMR) a partir de um estoque de 20x MMR preparar. 20x MMR consiste de cloreto de sódio 2 M, cloreto de potássio 40 mM, cloreto de cálcio 40 mM, cloreto de magnésio 20 mM, e 100 mM de 4 - (2-hidroxietil)-1-piperazinoetanossulfónico ácido (HEPES), pH 7,4.
   4. Configure baldes para todos os sapos injetados (um sapo por 4 L balde). NOTA: Apesar de mais de uma rã pode ser colocado no mesmo depósito de recolha de ovos, se um dos sapospõe ovos predominantemente de baixa qualidade, uma quantidade substancial de esforço será necessário para separar os ovos de má qualidade daqueles que são adequados para a tomada de extrato. Assim, maximizar o número de rãs no mesmo tanque para minimizar a quantidade de tampão usado para coletar ovos não vale a pena o risco.
   5. Injetar 750 U gonadotrofina coriônica humana (HCG) no saco linfático dorsal de cada sapo usando uma agulha 27 G, conforme descrito em 1.1.1.
   6. Coloque cada um dos sapos com injecção de HCG em baldes de 4 L individuais contendo 0,5 x MMR arrefecido a 16 ° C.
   7. Coloque os contentores com as rãs em uma incubadora de 16 ° C para coletar ovos O / N (15-16 h). NOTA: Manter a temperatura adequada é fundamental para todo o processo, desde a coleta de ovos para preparar o extrato do ovo.
2. Dejellying Eggs
   NOTA: Os ovos são cobertos com um revestimento de gelatina que tem de ser removido antes de fazer extracto. A probabilidade de lise espontânea dos ovos aumenta à medida que o tempo between postura de ovos e extrair preparação aumenta. Assim, é importante levar a cabo através dos seguintes passos, tão rapidamente quanto possível.
   1. Prepare a 4 L de 1x MMR, 50 ml de 0,1 x MMR, e 400 ml de 2% de cisteína, pH 7,7, feita em água destilada. Manter todas as soluções a 16 ° C.
   2. Para expelir ovos adicionais, esprema delicadamente o lombar e abdômen do sapo.
   3. Retire os sapos e a maior parte do MMR, para deixar os ovos em cerca de 1-200 ml de MMR em cada balde.
   4. Retire os resíduos com uma pipeta de transferência, e avaliar a qualidade dos ovos: ovos de alta qualidade são geralmente marcadas por uma clara separação entre o hemisfério animais mais pigmentadas eo hemisfério vegetal levemente colorido e tem o maior contraste-escuro a luz. Descarte com uma pipeta de transferência de todos os ovos que aparecem pegajoso, malhada, ou lise (branco e inchado) como eles vão diminuir a qualidade global do extrato. Se> 10% dos ovos, são de fraca qualidade, a todalote deve ser descartada.
   5. Misture os ovos em um copo de vidro de 500 ml e derramar tanto MMR quanto possível, mantendo os ovos submersos.
   6. Lave os ovos, mexendo suavemente com o dobro do volume dos ovos de MMR. Repita duas vezes, e remover quaisquer detritos ou ovos obviamente de má qualidade.
   7. Adicionar cerca de 100 ml de 2% de cisteína para o recipiente de vidro, agite a mistura, e permitir que os ovos que se contentar com 5 min a 16 ° C. Decantar a cisteína. NOTA: Dejellying é marcado pelo aparecimento gradual de camadas de geléia flutuam acima dos ovos e embalagem mais compacta dos ovos como eles agora ocupam um volume menor, sem o casaco de geléia.
   8. Adicionar mais 100 ml de 2% cisteína, agite bem, espere 5 minutos, e em seguida despeje lentamente ao largo da cisteína. Repetir até que os ovos tornaram-se bem compactado (usualmente por tratamento terceira cisteína). Nota: Se os ovos são deixados demasiado tempo em cisteína, que são propensos a lise. Da mesma forma, os ovos dejellied são frágeis e propensos a lise mecânica sesão rodadas com muita força ou se eles são expostos ao ar. Uma vez que os ovos foram dejellied, é importante que prossiga rapidamente para os passos de centrifugação.
   9. Deitar fora cisteína, e enxaguar o casaco geléia e outros detritos, lavando suavemente ovos em 1x MMR. Decantar cuidadosamente tampão ao longo do lado do recipiente. Repita duas vezes ou até que a solução MMR não é mais nublado. Ao lavar com MMR 1x continuar a remover os ovos más usando uma pipeta de transferência.
   10. Realizar um enxágüe final suave com 30 ml 0,1 x MMR, e gentilmente despeje o máximo de buffer possível. Mais uma vez, retire todos os ovos obviamente ruins.
3. Embalagem e Crushing ovos por centrifugação
   NOTA: O extracto descrito abaixo, que é usada para a degradação β-catenina é uma variante do factor de extracto citostático (metafase II-presos). Em contraste com o extracto de baixa velocidade e alta velocidade usada para estudos do ciclo celular, extracto de velocidade intermédia funciona melhor para a degradação β-catenina. Euextrato nterphase promove semelhante degradação β-catenina robusto, embora seja mais trabalhoso para se preparar.
   1. Adicionar leupeptina, pepstatina, aprotinina mistura (LPA, um inibidor da protease) a 10 ug / ml (diluído a partir de uma solução 10 mg / ml em DMSO) e citocalasina D em 20 ug / ml (diluído a partir de uma solução estoque de 10 mg / ml em DMSO) para os restantes 20 ml de 0,1 x MMR.
   2. Adicionar a 0. X MMR contendo LPA e citocalasina D para os ovos lavados, agite bem, e incubar por 5 min a 16 ° C.
   3. Transferir os ovos para 16 ° C previamente arrefecidos 50 ml de tubos de centrífuga, permita que os ovos de resolver, e remover o tampão residual a partir do topo. Para evitar a exposição ao ar, retiram uma pequena quantidade de solução tampão para a pipeta de transferência antes de retirar os ovos para transferência. Continuar a transferir os ovos adicionais para os tubos de centrifugação e remover o tampão residual a partir do topo do tubo até que os ovos de encher o tubo da centrífuga para o topo, o que vai maximizar o rendimento deextrair.
   4. Para embalar os ovos, tubos de centrifugação de centrifugação a 400 xg durante 60 seg a 4 ° C utilizando um rotor de ângulo fixo. Remover o tampão residual a partir do topo dos tubos de centrífuga.
   5. Para a rotação de esmagamento, girar tubos a 15.000 xg durante 5 min a 4 ° C.
4. Coleta camada citoplasmática de Extrato
   NOTA: O método descrito abaixo difere do método clássico de perfurar a parede do tubo da centrífuga de forma a recolher o citoplasma. Este protocolo foi adaptado para a simplificação e para utilização com determinados tubos de centrifugação, que são reutilizáveis. Não houve diferenças perceptíveis na cinética de degradação β-catenina encontram-se com qualquer um dos métodos. Neste ponto extracto deve ser mantido frio durante todo o processo, e todos os passos devem ser realizados a 4 ° C.
   1. Limpar um buraco na camada lipídica utilizando P1000 ponta da pipeta.
   2. Recolher a fase citoplasmática (entre a camada pigmentada escura ea light camada lipídica), utilizando uma nova ponta de pipeta P1000 em tubos de centrífuga limpas pré-refrigeradas (Figura 1). Para o extrato de alta qualidade que robustamente degrada β-catenina, minimizar a quantidade de camada pigmentada e lipídica que é retirado com a camada citoplasmática.
   3. Rotação extraída citoplasma a 15.000 xg durante 10 min a 4 ° C e novamente recolher o citoplasma. Repita a rotação e extração 1X. NOTA: O extrato deve ser "cor de palha". Se há contaminação substancial com as camadas pigmentadas e lipídicas, neste ponto, pode-se repetir a rotação mais uma vez, embora rotações excessivo irá diminuir a capacidade do extracto para degradar β-catenina.
   4. Adicionar LPA e citocalasina D para o extracto a concentrações finais de 10 ug / ml cada. NOTA: Usando o método descrito proporciona uma concentração razoavelmente consistente de proteína total de cerca de 50 mg / ml (52,41 ± 5,40 mg / ml, n = 3), em preparações separadas, por exemplo Xenopusextractos de g.
   5. (Opcional) para ensaios de tradução, adicionar tampado mRNA (0,1 mg / ml), RNAsin (1,5 U / ml), e mix de regeneração de energia (2.2.1) e incubar a reação à temperatura ambiente por 2 horas (para mais informações consulte sálica et ai. ² e Sive et ai. ^33). Use extrato traduzido imediatamente para ensaios de degradação β-catenina ou snap-congelamento em nitrogênio líquido para uso posterior. NOTA: extrato recentemente preparado tem uma alta capacidade de traduzir mRNA adicionado exogenamente, mas, infelizmente, essa capacidade se perde uma vez que o extrato é congelado. Tampado ARNm podem ser facilmente preparados utilizando kits disponíveis comercialmente.
   6. Extrato Snap-congelamento em nitrogênio líquido. NOTA: Os extratos são armazenados em pequenas (200 mL) alíquotas para uso único, porque eles perdem rapidamente sua capacidade de degradar β-catenina se novamente congelados. Para armazenamento a longo prazo, o extracto pode ser armazenado em azoto líquido. Para armazenagem a curto prazo, o extracto pode ser armazenada a -80 ° C, embora a capacidade de of extracto de degradar β-catenina pode ser reduzido drasticamente com o armazenamento prolongado à temperatura de -80 ° C (mais de 2 meses).

2. Preparando Extrato para β-catenina Degradação Assay

1. Esgotamento de Extrato Xenopus
   Observação: Uma grande vantagem do extracto de Xenopus é a capacidade para esgotar rapidamente os componentes de uma via e precisamente adicionar novamente uma quantidade definida de uma proteína, a fim de determinar os seus efeitos dependentes da dose.
   1. Use preparada na hora extrato do ovo de Xenopus ou rapidamente descongelar extrato congelado e colocar no gelo. Realize todas as manipulações no frio.
   2. Adicionar extracto para 1/10 do volume de anticorpo peletizada ou grânulos de afinidade (por exemplo, 20 ml de esferas sedimentadas a 200 ml de extracto). De modo a minimizar a diluição do extracto, retirar o máximo de líquido a partir das esferas quanto possível, antes da adição do extracto usando pontas de carregamento de gel, com pontas afiladas longos.
   3. Gire extrato-mistura de esferas, a 4 ° C durante 1 hora.
   4. Rotação mistura-extracto de talão em 12.600 xg em microcentrifuga a 4 ° C durante 30 seg. Alternativamente, se as esferas magnéticas são utilizadas, aplicam-se o campo magnético para recolher as esferas.
   5. Transferência esgotados extrato para um tubo de microcentrífuga fresco no gelo. Tenha cuidado para não transferir quaisquer contas com o extrato.
   6. Confirme eficiência de esgotamento por immunoblotting tanto extrato empobrecido e miçangas.
   7. Prepare extrato para ensaio de degradação β-catenina, como descrito em 2.2.
2. Otimizando Xenopus Extrato para β-catenina Degradação
   NOTA: degradação β-catenina em Xenopus extrato do ovo é um processo dependente de energia que se esgota rapidamente os estoques de ATP endógenos. Consequentemente, um sistema de regeneração de energia é necessária para manter a degradação β-catenina robusta.
   1. Prepare uma mistura de 20x de regeneração de energia (ER), constituído por 150 mM fosfato de creatina, ATP 20 mM, 600 mg / ml creatinofosfoquinase,e 20 mM _MgCl2. ER devem ser divididos em alíquotas e armazenado a -80 ° C. Evitar ciclos de congelamento / descongelamento repetidos usando pequenas alíquotas congeladas.
   2. Descongelar rapidamente Xenopus extrato do ovo, esfregando o tubo congelado entre as mãos. Colocar o tubo em gelo imediatamente antes de todo o extracto tenha derretido.
   3. Adicionar 10 ml de mistura de regeneração de energia (20x ER) em uma alíquota (200 mL) de Xenopus extrato do ovo. Misture bem por rapidamente sacudindo o tubo e pulso vórtex. Pulso-spin e coloque imediatamente em gelo.
   4. (Opcional) O volume de β-catenina pode ser ligeiramente aumentada no extracto de ovo de Xenopus, por adição de ubiquitina (1,25 mg / ml final). Cicloheximida (0,1 mg / ml final), também pode ser adicionado para minimizar a tradução dos transcritos endógenos.
   5. Alíquota os volumes apropriados para o ensaio de degradação em tubos de microcentrífuga de pré-arrefecidas em gelo. Para os ensaios de degradação radiomarcados β-catenina, retirar 2-5 extrair ml para cada ponto de tempo.

3. Radiolabeled ensaio de degradação β-catenina em Xenopus extrato do ovo

Nota: Todos os passos devem ser executados em gelo, a menos que indicado de outra forma.

1. Preparando Radiolabeled β-catenina
   1. Preparar mesmo em sintetizado in vitro ^[35 S] metionina-proteína radiomarcada utilizando kits disponíveis comercialmente. NOTA: A geração de ³⁵ S-marcado (semi-vida de 87 dias) as proteínas são facilmente e eficientemente produzido usando disponíveis comercialmente em kits acoplada in vitro de transcrição-tradução. É importante que a proteína traduzida é suficientemente marcado de modo que alterações no volume de proteína pode ser facilmente visualizada.
   2. Para confirmar a marcação radioactiva bem sucedida, realizar SDS-PAGE/autoradiography com 0,5 mL da proteína traduzida. Quantificar a intensidade da banda de β-catenina radiomarcado utilizando o ImageJ, ImageQuant, ou um progr software quantitativa alternativasou. NOTA: A banda radiolabeled proteína β-catenina deve ser claramente visível no filme dentro de algumas horas (4-6 horas).
   3. Encaixe-congelar a proteína radiomarcada em nitrogênio líquido para o armazenamento até o uso. Nota: O armazenamento prolongado (> 2 meses) e múltiplos de congelação / descongelação (maior que 2) pode impactar severamente a capacidade do radiomarcado β-catenina para degradar de forma robusta em Xenopus extracto de ovo. Tipicamente, a estabilidade das proteínas radiomarcadas diminui significativamente depois de 1 mês de armazenamento à temperatura de -80 ° C; assim, relativamente recentemente preparada radiomarcado β-catenina dá melhores resultados obtidos nestes ensaios de degradação.
2. Realizando β-catenina Degradação Assay
   1. Adicionar 1-3 ul (dependendo da potência do sinal de banda radiomarcada) in vitro traduzida β-catenina (e outras proteínas, moléculas pequenas, etc, que estão a ser testados) em 20 ul de mistura de reacção em gelo de Xenopus. Misture bem por quickly sacudindo o tubo e um curto pulso de centrifugação; este é um passo importante como Xenopus extrato do ovo é muito viscoso e mistura incompleta irá afetar a consistência dos resultados. Rotação do pulso e colocar no gelo.
   2. Inicie o β-catenina reacção de degradação, deslocando os tubos à temperatura ambiente.
   3. No ponto de tempo designado, remover 1-5 ml de amostra e misturar imediatamente com tampão de amostra de SDS (volume de 5x) para parar a reacção. Para garantir que a reação de degradação está completamente terminado, o tubo de filme várias vezes e vortex vigorosamente.
   4. Realize SDS-PAGE/autoradiography. Executar 1 ml equivalentes (~ 50 mg de proteína) do extrato para cada ponto de tempo / pista. Degradação de β-catenina em Xenopus extracto de ovo deve ser evidenciado pela diminuição dependente do tempo na intensidade da radiomarcado β-catenina banda Figura 2. Quantificar os resultados utilizando o ImageJ, ImageQuant, ou outro software de imagem preferido, se necessário.
   5. (Optional) Soak gel de SDS-poliacrilamida em solução (ácido acético a 10% e 30% de metanol, que fixa em água destilada) antes de secagem para reduzir o fundo de radioactividade e aumentar a qualidade da imagem.

4. Β-catenina-luciferase Degradação Ensaio no extrato do ovo Xenopus

Execute todas as etapas no gelo, salvo indicação em contrário.

1. Preparação β-catenina-luciferase
   1. Sintetizar não-radioactivamente, marcado com luciferase β-catenina utilizando o sistema acoplado de transcrição-tradução com uma mistura de aminoácidos completa.
   2. Confirmar produção do marcado com luciferase β-catenina pela medição da actividade da luciferase 0,5-1 ul de reacção. Avaliar fundo luminescência através da medição da luminescência de uma mistura de reacção não traduzida. NOTA: Vários kits comerciais estão disponíveis para medir a atividade de luciferase. Luminescência de longa duração, no entanto, funciona particularmente bem para o assa degradaçãoy.
2. Realizando β-catenina-luciferase Degradação Ensaio
   1. Descongele e prepare Xenopus extrato do ovo como em 2.2.
   2. Adicionar em traduziu-vitro fusão β-catenina-luciferase (de 4.1) para preparar mistura de reacção Xenopus (de 2,2) em gelo e misture bem como em 3.2.1. NOTA: A actividade da luciferase β-catenina, que é adicionado ao extracto é tipicamente entre 20 - 50.000 unidades de luminescência relativa (RLU) / ml de extracto (com base em medições obtidas a partir de 4.1.2). Sinal de partida deve ser de aproximadamente 100.000 RLU (2-5 ml da β-catenina-luciferase fusão in vitro-traduzido).
   3. Deslocar o extrato de RT para iniciar a reacção de degradação.
   4. Retirar uma aliquota da reacção no momento indicado e encaixe por congelação em azoto líquido. NOTA: As amostras triplicadas são normalmente removidas para análise em cada ponto de tempo. Extracto congelado pode ser armazenado a -80 ° C until eles estão prontos para serem analisados.
   5. Descongelar as amostras em gelo, as amostras de transferência para placas de 96 poços brancos padrão sobre gelo, e processo para a actividade da luciferase.

Resultados

Um esquema de degradação β-catenina no Xenopus extracto de ovo é mostrado na Figura 2A. ^35S-marcado β-catenina foi incubada em Xenopus extracto de ovo, aliquotas (1 ml de extracto equivalente) foram removidos em tempos apropriados, e as amostras foram submetidas a SDS-PAGE seguido por autorradiografia. degradação β-catenina por componentes da via Wnt é mediada pelo sistema de ubiquitina-proteassoma ^2, e a degradação de ^[35 S]-radiomarcado β-...

Discussão

Xenopus extrato do ovo é um sistema bioquímico robusta para investigar rotatividade β-catenina. A concentração de β-catenina no Xenopus extracto de ovo é de ~ 25 nM ^2. Sob condições ideais, o extracto de ovo é capaz de degradar β-catenina, a uma taxa de 50-100 nM / h e é metade do máximo a 200 nm ^24. Há vários passos críticos para a reconstituição bem sucedida de degradação β-catenina usando Xenopus extrato do ovo. Estes incluem: 1) a geração de alt...

Materiais

Name	Company	Catalog Number	Comments
Pregnant mare serum gonadotropin (PMSG)	ProSpec	hor-272-A	Reconstituted with distilled water before use.
Human chorionic gonadotropin	Sigma	CG10-10VL
Potassium chloride	Fisher	BP366-1
Sodium chloride	Research Products International	S23020-5000.0
Magnesium chloride	Fisher	BP214-500
Calcium chloride	Acros Organics	AC42352-5000
HEPES	Fisher	BP310-1
Cysteine	Acros Organics	AC17360-1000
Leupeptin	Sigma	L2884-10MG
Aprotinin	Sigma	A1153-10MG
Pepstatin	Sigma	P4265-5MG
Cytochalasin B	Sigma	C8273-10MG
3 ml syringe: Luer Lock tip	Becton Dickinson	309657
27 G needle	Becton Dickinson	305109
96 well solid white polystyrene microplate, round bottomed	Corning	3605
Steady-Glo luciferase assay system	Promega	E2520	Store long-term at -80 °C, can store for up to 1 month at -20 °C
TNT Sp6 coupled reticulocyte lysate system	Promega	L4600
TNT Sp6 high-yield wheat germ protein expression system	Promega	L3260	Generally higher yield than reticulocyte lysate
EasyTag Express protein labeling mix [S35]	Perkin Elmer	NEG772007MC
Creatine phosphate	Sigma	27920-5G
ATP	Sigma	A2383-5G
Creatine phosphokinase	Sigma	C3755-35KU
Dimethyl sulfoxide (DMSO)	Sigma	D8418-50ML
Dual-Glo luciferase assay system	Promega	E2920	Same storage conditions as Steady-Glo
50 ml Centrifuge tubes	Fisher Scientific	0556214D
Sorvall SS-34 fixed angle rotor	Thermo Scientific	28020
115 V 50/60 Hz Minicentrifuge	Fisher Scientific	05-090-128
mMessage mMachine Sp6 kit	Ambion	AM1340
Anti-firefly luciferase antibody	Abcam	ab16466
Anti-GSK3 antibody	BD Transduction Laboratories	610201
FLUOStar Optima	BMG Labtech
Sorvall RC-6 Plus centrifuge	Thermo Scientific
16 °C Incubator	Percival Scientific