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Method Article
Descreveremos um protocolo detalhado para o ensaio de mutação de cII Lambda selecione em culturas de células de roedores transgênicos ou correspondentes animais tratados com um agente químico/físico de interesse. Esta abordagem tem sido amplamente utilizada para testes de mutagenicidade de substâncias cancerígenas em células de mamíferos.
Um número de modelos de animais transgênicos e sistemas de deteção de mutação foram desenvolvido para testes de mutagenicidade de substâncias cancerígenas em células de mamíferos. Destes, ratos transgénicos e o Lambda (λ) Select cII sistema de deteção de mutação têm sido empregadas para experimentos de mutagenicidade por muitos grupos de pesquisa em todo o mundo. Aqui, descrevemos um protocolo detalhado para o ensaio de mutação de cII selecione Lambda, que pode ser aplicado às células cultivadas de mouses/ratos transgénicos ou os correspondentes animais tratados com um agente químico/físico de interesse. O protocolo consiste das seguintes etapas: (1) isolamento do DNA genômico das células ou tecidos/órgãos de animais transgénicos trataram em vitro ou na vivo, respectivamente, com um composto de teste; (2) recuperação do vetor shuttle lambda carreg um gene repórter mutacional (ou seja, cII transgene) partir do DNA genômico; (3) embalagem dos vetores resgatados em bacteriófagos infecciosas; (4) infectar uma bactéria de acolhimento e cultivo seletivo condições para permitir a propagação das mutações induzidas cII ; e (5) marcando a cII-mutantes e DNA sequência análise para determinar a frequência de mutação cII e espectro de mutação, respectivamente.
Uma ampla gama de modelos de animais transgênicos e sistemas de deteção de mutação foram desenvolvidos para testes de mutagenicidade de substâncias cancerígenas em células de mamíferos. Destes, ratos transgénicos Big Blue (referido daqui em diante como BB) e o λ Select cII sistema de deteção de mutação têm sido empregadas para experimentos de mutagenicidade por este grupo e muitos outros pesquisa grupos em todo o mundo1,2, 3,4,5,6,7,8,9. Nos últimos 16 anos, temos investigado os efeitos mutagênicos de diversos agentes químicos e/ou físicos usando esses animais transgénicos ou suas correspondentes culturas de células embrionárias fibroblastos tratadocom com um composto de teste e posteriormente analisaram os fenótipo e genótipo do transgene cII pelo ensaio λ Select cII e sequenciamento de DNA, respectivamente,10,11,12,13,14 , 15 , 16 , 17 , 18 , 19 , 20 , 21 , 22 , 23 , 24. o genoma destes animais transgénicos contém um vetor de transporte λ do bacteriófago (λLIZ) integrado no cromossoma 4 como uma concatemer de cabeça-de-cauda multi cópia1,2,25. O vetor de transporte λLIZ carrega dois genes repórter mutacional, nomeadamente o Laureano e cII transgenes1,2,25,26,27, 28,29,30,31,32,33,34,35,36, 37,38,39,40,41,42,,43,44,45 , 46 , 47. o ensaio de Select cII λ baseia-se na recuperação dos vetores de transporte de λLIZ de DNA genômico de células derivadas de tecidos/órgãos de animais transgénicos1,2,25 . Os vetores de transporte λLIZ recuperados são então embalados nas cabeças do fago λ capazes de infectar um host indicador Escherichia coli. Posteriormente, as bactérias infectadas são cultivadas em condições seletivas para permitir a análise de mutações no cII transgene1,3e marcando.
Aqui, descrevemos um protocolo detalhado para o ensaio de Select cII λ, que consiste de isolamento do DNA genômico de células/órgãos de animais transgénicos tratados em vitro/na vivo com uma teste de recuperação composto, da λLIZ shuttle vetores partir do DNA genômico, embalagem dos vetores em fago λ infecciosas, infecção do hospedeiro e. coli com os bacteriófagos, identificação da cII-mutantes sob condições seletivas para determinar a frequência de mutação de cII , e Análise de sequências de DNA para estabelecer o espectro de mutação de cII . O protocolo pode ser aplicado a do mouse/rato transgénico célula culturas tratadas em vitro com um agente químico/físico de interesse, ou tecidos/órgãos dos animais correspondentes tratados na vivo com o teste químico/agente1, 2,4,,48,,49,50,51,52. Uma apresentação esquemática do ensaio λ Select cII é mostrada na Figura 1.
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1. isolamento do DNA genômica de fibroblastos embrionários de Mouse
Nota: Fibroblastos embrionários de mouse principal são isolados de embriões derivados de ratos transgénicos BB com fundo genético C57BL/6, de acordo com o protocolo publicado53. A matéria-prima para este protocolo consiste de 1 x 106 a 1 x 107 células de fibroblasto embrionário tratados com um teste composto versus controle. A colheita e a contagem destas células usando os métodos padrão são descritos em referências10,54,55.
2. in Vitro Packaging reação
3. preparar a cultura de bactérias Escherichia coli G1250
4. as amostras de DNA empacotado do chapeamento
5. examinar o título e placas de triagem para determinar a cII frequência mutante
6. verificação da Putative λ cII mutantes, amplificação por PCR e sequenciamento de DNA
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Dependendo da distribuição de dados, testes paramétricos ou não-paramétricos são usados para determinar a importância da diferença na frequência de mutação a cII entre os grupos tratamento e controle (ou seja, induzida contra frequências mutantes espontâneas) . Comparação das frequências induzidas cII mutante entre grupos diferentes de tratamento é feita por vários (emparelhada) testes estatísticos, conforme aplicável. Teste de Adams e Skopek...
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O ensaio de Select cII λ é usado para detecção de mutações no transgene cII recuperadas o DNA genômico de células derivadas de tecidos/órgãos de roedores de BB3. O genoma destes animais transgénicos contém várias cópias em tandem do vetor cromossomicamente integrado λLIZ shuttle, que transporta a cII (294 bp) e Laureano (1.080 bp) transgenes, como o repórter mutacional genes1, 2 ,
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Todos os autores não declaram nenhum conflito de interesses.
Nós gostaríamos de reconhecer as contribuições de todos os colegas e colaboradores para nossos estudos originais, cujos resultados têm sido referidos neste manuscrito (para fins ilustrativos). O trabalho dos autores é suportado por doações do Instituto Nacional de dentárias e craniofaciais pesquisa do National Institutes of Health (1R01DE026043) para AB e pela Universidade do programa de pesquisa de doença California Tobacco-Related a AB ( TRDRP-26IR-0015) e ST (TRDRP-25IP-0001). Os patrocinadores do estudo não tinham qualquer papel no projeto de estudo, coleta de dados, análise de dados, interpretação dos dados, redação do relatório, ou na decisão de enviar para publicação.
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Name | Company | Catalog Number | Comments |
Agar | MO Bio Laboratories, Inc. | 12112-05 | Bacteriological grade |
BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit | Thermo Fisher Scientific | 4337455 | None |
Casein Peptone | Alfa Aesar | H26557 | None |
Gelatine | J. T. Baker | 2124-01 | Powder |
Glycerol | Fisher Scientific | BP 229-1 / M-13750 | None |
LB Agar | Fisher Scientific | BP 9724-500 | None |
QIAquick PCR purification kit | Qiagen | 8104 | 50 PCR purification reactions |
Sodium Acetate Trihydrate | Fisher Scientific | M-15756 | None |
Taq5000 DNA Polymerase | Qiagen | 201207 | None |
Thiamine Hydrochloride | Macron Fine Chemicals | 2722-57 | None |
Transpack Packaging Extract | Stratagene Corp., Acquired by BioReliance | Sigma-Aldrich Corp. | 200223 | 50 packaging reactions |
Tris Base | Fisher Scientific | BP 152-1 / EC 201-064-4 | None |
Trypton | Biosciences | RC-110 | None |
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