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Method Article
Um fluxo de trabalho é demonstrado para a quantificação absoluta das interações fármaco-célula transportadora usando citometria de fluxo para permitir uma melhor avaliação racional de novos sistemas de liberação de medicamentos. Este fluxo de trabalho é aplicável a portadores de medicamentos de qualquer tipo.
Um componente importante do projeto de sistemas de liberação de medicamentos diz respeito a como amplificar ou atenuar as interações com tipos específicos de células. Por exemplo, um quimioterápico pode ser funcionalizado com um anticorpo para melhorar a ligação às células cancerosas ("direcionamento") ou funcionalizado com polietilenoglicol para ajudar a evitar o reconhecimento de células imunes ("stealth"). Mesmo em um nível celular, otimizar a ligação e a absorção de um portador de medicamentos é um problema complexo de design biológico. Assim, é valioso separar o quão fortemente um novo transportador interage com uma célula da eficácia funcional da carga de uma transportadora uma vez entregue a essa célula.
Para continuar o exemplo quimioterápico, "quão bem ele se liga a uma célula cancerosa" é um problema separado de "quão bem ele mata uma célula cancerosa". Os ensaios quantitativos in vitro para estes últimos estão bem estabelecidos e geralmente dependem da medição da viabilidade. No entanto, a maioria das pesquisas publicadas sobre interações célula-portador é qualitativa ou semiquantitativa. Geralmente, essas medições dependem da marcação fluorescente do portador e, consequentemente, relatam interações com células em unidades relativas ou arbitrárias. No entanto, este trabalho pode ser padronizado e ser feito absolutamente quantitativo com um pequeno número de experimentos de caracterização. Essa quantificação absoluta é valiosa, pois facilita comparações racionais, inter e intraclasse de vários sistemas de liberação de drogas - nanopartículas, micropartículas, vírus, conjugados anticorpo-droga, células terapêuticas modificadas ou vesículas extracelulares.
Além disso, a quantificação é um pré-requisito para meta-análises subsequentes ou abordagens de modelagem in silico . Neste artigo, são apresentados guias em vídeo, bem como uma árvore de decisão sobre como alcançar a quantificação in vitro para sistemas de liberação de medicamentos transportadores, que levam em conta diferenças no tamanho do transportador e na modalidade de rotulagem. Além disso, outras considerações para a avaliação quantitativa de sistemas avançados de liberação de medicamentos são discutidas. Pretende-se que isso sirva como um recurso valioso para melhorar a avaliação racional e o design para a próxima geração de medicamentos.
O design de construções de entrega de medicamentos que exibem um comportamento específico e projetado, dependendo do tipo de célula que encontram, atraiu um interesse substancial da pesquisa. Potenciais construções de liberação de medicamentos ou "transportadores" incluem formulações lipídicas, inorgânicos nano-cultivados, conjuntos poliméricos, vesículas extracelulares, células bacterianas funcionalizadas ou vírus modificados. Todos estes podem apresentar especificidade de órgãos, tecidos ou células devido a propriedades físicas, propriedades de superfície ou funcionalizações químicas modificadas, como a fixação de anticorpos 1,2.
Um passo quase onipresente na avaliação do transportador in vitro é incubar células com uma suspensão contendo o referido transportador carregado de drogas. Após a incubação, o desempenho do transportador é medido por meio de uma leitura funcional do desempenho da carga do medicamento, por exemplo, eficiência ou toxicidade da transfecção. As leituras funcionais são úteis, pois são uma medida a jusante da eficácia da transportadora. No entanto, para construções de liberação de medicamentos mais complexas, é cada vez mais importante ir além das leituras funcionais e quantificar separadamente o grau de interação do transportador com a célula de interesse. Existem algumas razões para isso.
Primeiro, há um interesse crescente em descobrir (e melhorar iterativamente) tecnologias de transportadoras de "plataforma", que podem transportar uma variedade de cargas. Por exemplo, nanopartículas lipídicas (LNPs) projetadas para encapsular RNA podem trocar uma sequência de RNA por outra com poucas ressalvas3. Assim, para melhorar iterativamente a tecnologia da transportadora, é fundamental quantificar seu desempenho independentemente da funcionalidade da carga. Em segundo lugar, as leituras funcionais podem não ser simples para a carga de interesse, comprometendo a capacidade de iterar e avaliar rapidamente as formulações da transportadora. Embora se possa realizar a otimização in vitro usando uma carga modelo com uma leitura funcional direta (por exemplo, fluorescência), a alteração da carga pode alterar a resposta biológica a um transportador4 e, portanto, não produzir resultados representativos. Em terceiro lugar, muitos portadores são projetados para interagir e ser absorvidos por um tipo específico de célula. Essa capacidade de segmentação de um transportador pode e deve ser diferenciada do desempenho da sua segmentação terapêutica de postos de carga. Para continuar o exemplo do LNP, uma carga de RNA pode ser extremamente potente, mas se o LNP for incapaz de se ligar à célula, ser internalizado e liberar o RNA, nenhum efeito funcional a jusante será observado. Isso pode ser um problema particularmente para portadores destinados a atingir tipos de células difíceis de transfectar, como as células T5. Por outro lado, um LNP poderia atingir de forma extremamente eficaz, mas a carga de RNA pode não funcionar. Um ensaio a jusante que mede apenas a funcionalidade da carga não será capaz de diferenciar entre essas duas situações, complicando assim o desenvolvimento e a otimização dos sistemas de entrega de medicamentos transportadores.
Neste trabalho, discute-se como quantificar absolutamente a associação de operadores. Associação é um termo que se refere ao grau de interação medido experimentalmente entre um portador e uma célula. A associação não diferencia entre ligação à membrana e internalização – um transportador pode estar associado porque está ligado à superfície celular ou porque a célula o internalizou. A associação é comumente medida como parte de experimentos de incubação de portadores de células. Historicamente, a associação tem sido relatada em unidades fluorescentes arbitrárias (tipicamente "intensidade de fluorescência mediana" ou MFI) ou como "associação percentual", métricas cujas limitações foram discutidas anteriormente6. Em suma, essas medições não são comparáveis entre experimentos, laboratórios e portadores de medicamentos devido a diferenças nos protocolos experimentais, configurações de citômetros de fluxo e intensidades de marcação de diferentes portadores. Esforços têm sido feitos para superar o primeiro calibrando o citômetro, convertendo assim a medida relativa da IFM em uma medida absolutamente quantitativa de fluorescência7. No entanto, esse método não leva em conta a variabilidade na intensidade de marcação de vários portadores e, portanto, não permite a comparação racional de vários desempenhos de portadores em uma célula-alvo de escolha8.
Aqui, como converter praticamente de unidades fluorescentes arbitrárias relativas para a métrica quantitativa absoluta do "número de portadores por célula" é demonstrado pela realização de um pequeno número de experimentos de caracterização adicionais. Se outra métrica de concentração de transportador for desejada (por exemplo, massa de transportador por célula ou volume de transportador por célula), é simples converter de portadores por célula, desde que a caracterização do transportador tenha sido feita. Para brevidade e para evitar jargões, a palavra "portador" é usada neste trabalho para se referir à vasta variedade de construções de entrega de drogas. Essas técnicas de quantificação são igualmente aplicáveis, sejam aplicadas a uma partícula de ouro nano-modificada ou a uma bactéria de bioengenharia.
Alguns fatos permitem a conversão de unidades fluorescentes arbitrárias em portadores por célula. Primeiro, a intensidade de fluorescência medida é proporcional à concentração de um fluoróforo9 (ou um transportador marcado fluorescentemente), assumindo que a fluorescência está dentro dos limites de detecção do instrumento e as configurações de instrumentação são as mesmas. Assim, se a fluorescência de um transportador e a fluorescência de uma amostra são conhecidas, pode-se determinar quantos portadores estão presentes nessa amostra se todas as medições foram realizadas sob as mesmas configurações e condições. No entanto, especialmente para portadores menores, pode não ser possível medir a fluorescência do portador, a autofluorescência celular e a fluorescência associada à célula com portadores no mesmo instrumento com as mesmas configurações. Neste caso, há um segundo requisito para tornar possível a conversão entre a fluorescência medida em um instrumento e a fluorescência medida em outro. Para tanto, uma curva padrão de concentração de fluoróforo pode ser estabelecida para medir a intensidade de fluorescência em ambos os instrumentos, aproveitandoo padrão 9 de Moléculas de Fluorocromo Solúvel Equivalente (MESF). Isso permite a medição da fluorescência do transportador em massa em um não-citômetro, uma medição que pode ser feita em portadores de qualquer tamanho ou característica. Quando essa quantificação a granel é feita numa suspensão transportadora de concentração conhecida, o número de transportadores por célula de uma amostra pode, uma vez mais, ser calculado.
Embora este trabalho demonstre o processo de medição da associação do transportador (determinado pela intensidade de fluorescência medida), um protocolo análogo poderia ser realizado para outras medidas de interação célula-portador (por exemplo, um protocolo experimental que diferencia portadores internalizados e ligados à membrana). Além disso, este protocolo seria em grande parte o mesmo se a associação fosse medida através de um ensaio não fluorescente (por exemplo, através de citometria de massa).
1. Escolhendo o fluxo apropriado
Figura 1: Árvore de decisão do fluxo de trabalho. A decisão sobre qual Stream usar depende principalmente do tipo de interesse da operadora. Portadores maiores e portadores com altas propriedades de dispersão podem ser mais facilmente detectados individualmente em citômetros, tornando-os adequados para quantificação usando o Cytometer Stream. O Bulk Stream é adequado para todos os outros tipos de transportadoras. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 2: Visão geral dos fluxos de trabalho. Este protocolo é dividido em dois fluxos diferentes. O Cytometer Stream usa um citômetro sensível para contar os portadores em suspensão, medir sua fluorescência individual e, em seguida, determinar a fluorescência das células incubadas com portadores. O Bulk Stream usa técnicas não baseadas em citometria, como a Análise de Rastreamento de Nanopartículas, para contar os portadores em suspensão. A fluorescência do transportador individual é então quantificada usando um leitor de microplacas ou espectrofluorômetro. O uso do citômetro de fluxo restringe-se, portanto, à mensuração da fluorescência final de células incubadas com portadores, medida que pode ser feita em uma faixa mais ampla de citômetros e que independe do tipo de transportador utilizado. Abreviaturas: MESF = Moléculas de Fluorocromo Solúvel Equivalente; IFM = intensidade mediana da fluorescência. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
2. O fluxo do citômetro
3. O fluxo em massa
Como discutido anteriormente, diferentes tipos de portadores de drogas requerem o uso de diferentes técnicas para a quantificação absoluta da associação célula-portador. Por exemplo, as partículas de núcleo-casca de poli(ácido metacrílico) estabilizadas com dissulfeto de 633 nm (PMASH) são grandes e densas o suficiente para detecção usando um citômetro de fluxo sensível. Dessa forma, essas partículas foram marcadas fluorescentemente, depois fechadas e contadas por meio de espalhamento de luz de...
Caracterizar as interações entre portadores de drogas e células está se tornando cada vez mais importante no desenvolvimento de novos sistemas de liberação de medicamentos. Especificamente, para permitir a avaliação racional e a comparação de vários construtos de portadores, a quantificação absoluta do desempenho do referido portador para interagir com células-alvo e fora do alvo é fundamental. Este protocolo descreve uma metodologia de dois fluxos que permite a qualquer pesquisador que trabalhe com um por...
Os autores não têm conflitos de interesse a divulgar.
Este trabalho foi apoiado pelo Australian National Health and Medical Research Council (NHMRC; Subsídio do Programa No. GNT1149990), o Centro Australiano de Pesquisa em Virologia de HIV e Hepatite (ACH2), bem como um presente do espólio de Réjane Louise Langlois. F.C. reconhece a concessão de uma Bolsa de Pesquisa Principal Sênior do Conselho Nacional de Saúde e Pesquisa Médica (NHMRC) (GNT1135806). A Figura 1 e a Figura 2 foram criadas com BioRender.com.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Alexa Fluor 647 C2 Maleimide | Invitrogen | A20347 | pH-stable dye used to label 150 nm, 235 nm, or 633 nm PMASH carriers; example of good dye to use in cell-carrier association studies |
Apogee A50 Microflow | Apogee | Sensitive flow cytometer capable of detecting small carriers for counting | |
CytoFLEX S Flow Cytometer | Beckman Coulter | Sensitive flow cytometer capable of detecting small carriers for counting and read out for final cell-barrier experiments | |
FCS Express | De Novo Software | Software used to analyze flow cytometry data, i.e., perform gating and derive median fluorescence intensity values of populations of choice. Alternatives include FlowJo, OMIQ, Python | |
Infinite 200 PRO | Tecan Lifesciences | Standard microplate reader instrument used for bulk fluorescence measurements of carriers in solution | |
LSRFortessa Cell Analyzer | BD Biosciences | Less sensitive flow cytometer, but one more generally available to researchers. Can be used to read out final cell-carrier experiment | |
NanoSight NS300 | Malvern Panalytical | Instrument used for Nanoparticle Tracking Analysis | |
Prism 8 | GraphPad | Software used to graph and calculate standard curves. Alternatives include Microsoft Excel, Origin, Minitab, Python amongst many others | |
Quantum MESF kits Alexa Fluor 647 | Bangs Laboratories | 647 | Absolute quantitation beads for flow cytometery. Used to convert fluorescence intensities measured in bulk on a microplate reader to fluorescence intensities measured on a flow cytometer using the MESF standard |
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