Para começar, prepare um tanque semi-hexagonal, uma placa de base e um estágio de cabeça. Coloque o tanque semi-hexagonal sobre a plataforma experimental do microscópio. Aponte a luz infravermelha de 810 nanômetros e a câmera para o palco principal para gravação comportamental.
Em seguida, configure um filtro passa-curta de 875 nanômetros e um filtro passa-longa de 700 nanômetros na frente da câmera para evitar que o laser de dois fótons e o estímulo visual interfiram no registro comportamental. Para apresentar o estímulo visual, fixe filmes de retroprojeção na face interna das três paredes do tanque semi-hexagonal. Aponte os três projetores para as três superfícies do tanque.