Para começar, adicione 150 mililitros de contas de vidro limpas de cinco milímetros ao frasco limpo e feche a tampa. Cubra o frasco fechado com papel alumínio suficiente para esconder a junção da tampa ao frasco e autoclave a 121 graus Celsius por 20 minutos. Quando as mudas estiverem prontas para serem transferidas para o frasco na bancada estéril, retire o papel alumínio e a tampa do frasco.
Adicione 35 mililitros de meio Murashige e Skoog de meia força de pH 5,7 a 5,9 ao frasco e mexa as contas para revestir uniformemente com o meio. Introduza de três a cinco mudas no frasco, garantindo que os sistemas radiculares sejam colocados entre as contas de vidro. Ajuste as contas com pinças ou colheres estéreis para cobrir as raízes e retirar as folhas do meio.
Fixe duas tiras de fita de micropore de 1,25 centímetro na parte superior do frasco e coloque suavemente a tampa por cima. Sele o espaço entre a tampa e o frasco com fita de micropore de 2,5 centímetros para manter a esterilidade enquanto permite a troca de ar e coloque o frasco em uma câmara de crescimento. Quando as plantas atingirem a idade desejada, retire a fita de micropore e a tampa do frasco.
Alíquota 20 microlitros de meio de crescimento em placa de ágar LB para teste de esterilidade. Usando uma pipeta volumétrica de 25 mililitros, remova o máximo possível de meio de crescimento sem danificar as raízes. Adicione 50 mililitros de meio coletor ao longo da parede do frasco para evitar molhar as folhas.
Feche o frasco com uma tampa e incube em condições estéreis por duas horas. Após a incubação, remova a quantidade desejada de meio de coleta em tubos. Meça o peso da raiz e da parte aérea da planta em um frasco para normalizar os exsudatos radiculares pelo peso da planta.
As plantas de Arabidopsis thaliana pareciam saudáveis em dois laboratórios diferentes. O sistema de frascos de vidro mostrou-se adaptável para diversas espécies vegetais e estádios de desenvolvimento. O trigo apresentou os maiores pesos de calha, seguido pelo sorgo e tomate.
Enquanto o sorgo apresentou os maiores pesos de raízes, seguido pelo trigo e Medicago truncatula. A inoculação de Arabidopsis thaliana com bactérias comensais não alterou o fenótipo da planta, e as bactérias inoculadas persistiram no sistema por pelo menos 12 dias, com discreto aumento das unidades formadoras de colônias.
