Integração da operação da rede molecular ao 2D-HPLC-MS para a análise de amostras de pêndulo de acônito

Para iniciar a preparação dos dados, exporte os dados espectrais de massa bruta 2D HPLC-MS. Em seguida, para conectar-se ao servidor FTP GNPS na interface WINSCP na página Configuração da sessão, preencha as informações de conexão. Depois de preencher as informações, clique no botão Iniciar para estabelecer uma conexão com o servidor FTP GNPS.

Crie redes moleculares abrindo um navegador da Web e visitando o site do GNPS. Novos usuários precisam se inscrever em uma conta e fazer login. Na interface principal do site do GNPS, clique em Criar Rede Molecular em Análise de Dados.

Na página Criação de tarefas, clique no botão selecionar arquivos de entrada e, em seguida, selecione e carregue o arquivo de dados. Nas guias Opção de fluxo de trabalho, defina os vários parâmetros que geram a rede molecular ou MN. Esses parâmetros incluem o algoritmo de extração de pico, valor de pico sobre viagem, método de cálculo de similaridade e assim por diante. Depois de fazer as configurações de parâmetro apropriadas conforme necessário, clique no botão Enviar na parte inferior da página para executar a tarefa.

Depois que a tarefa for executada, localize as tarefas criadas na guia Trabalhos e clique no nome do fluxo de trabalho para exibir os resultados da análise. O site fornece diagramas MN, substitutos, redes simbióticas e outras informações relacionadas. Quatro dos componentes alcalóides nas amostras de APB identificados pelo MN foram aconitina, 14-benzoilacina, 14-O-acetilneolina e hipacontina.

Os quatro compostos tinham o mesmo núcleo pai. Aconitina, 14-benzil aconina, 14-benzoilaconina e hipaconitina foram semelhantes, e apenas os substituintes foram diferentes.