Method Article
В этой работе представлен гибкий протокол для использования флуоресцентно меченых эластомерных сжимающих поверхностей (FLECS) в формате микровелл для упрощенной, непринужденной количественной оценки одноклеточных сократительных сил на основе визуализированных перемещений микропаттернов флуоресцентного белка.
Генерация клеточной сократительной силы является фундаментальной чертой, общей практически для всех клеток. Эти сократительные силы имеют решающее значение для правильного развития, функционируют как на клеточном, так и на тканевом уровнях и регулируют механические системы в организме. Многочисленные биологические процессы зависят от силы, включая подвижность, адгезию и деление одиночных клеток, а также сокращение и расслабление таких органов, как сердце, мочевой пузырь, легкие, кишечник и матка. Учитывая его важность в поддержании правильной физиологической функции, клеточная сократимость также может управлять болезненными процессами, когда они преувеличены или нарушены. Астма, гипертония, преждевременные роды, фиброзные рубцы и недостаточная активность мочевого пузыря являются примерами механически управляемых болезненных процессов, которые потенциально могут быть облегчены при надлежащем контроле клеточной сократительной силы. Здесь мы представляем комплексный протокол для использования новой технологии анализа сократимости на основе микропластин, известной как флуоресцентно меченые эластомерные сжимаемые поверхности (FLECS), которая обеспечивает упрощенный и интуитивно понятный анализ сократимости одиночных клеток в массовом масштабе. Здесь мы предоставляем пошаговый протокол для получения двух шеститочечных кривых дозы-ответа, описывающих влияние двух сократительных ингибиторов на сокращение первичных гладкомышечных клеток мочевого пузыря человека в простой процедуре с использованием только одной микропластины анализа FLECS, чтобы продемонстрировать надлежащую технику пользователям метода. Используя технологию FLECS, все исследователи с базовыми биологическими лабораториями и системами флуоресцентной микроскопии получают доступ к изучению этого фундаментального, но трудно поддающегося количественной оценке функционального фенотипа клеток, эффективно снижая входной барьер в область силовой биологии и фенотипического скрининга сократительной клеточной силы.
Механические силы, генерируемые клетками, необходимы для правильного функционирования в различных органах по всему телу, таких как кишечник, мочевой пузырь, сердце и другие. Эти органы должны генерировать стабильные паттерны сокращения и расслабления клеток для поддержания внутреннего гомеостатического состояния. Аномальное сокращение гладкомышечных клеток (СМК) может привести к возникновению различных расстройств, включая, например, дисмоторику кишечника, характеризующуюся аномальными паттернами сокращения гладкой мускулатуры кишечника1, а также урологические состояния гиперактивного2 или недостаточного мочевого пузыря3. В дыхательных путях SMC, которые демонстрируют нерегулярные паттерны сокращения, могут вызвать астматическую гиперчувствительность4, потенциально затягивая дыхательные пути и уменьшая воздушный поток кислорода в легкие. Другое широко распространенное физическое состояние, гипертония, вызвано колебаниями сокращения гладких мышц в кровеносных сосудах5. Очевидно, что сократительные механизмы в клетках и тканях могут привести к заболеваниям, которые требуют вариантов лечения. Поскольку эти условия безошибочно проистекают из дисфункционального сократительного поведения клеток, становится логичным и необходимым измерить саму сократительную функцию клетки при скрининге потенциальных кандидатов на лекарства.
Признавая необходимость инструментов для изучения клеточной сократительной силы, академическими исследователями было разработано несколько количественных методов анализа сокращения, включая микроскопию силы тяги (TFM)6, микроструктурированный TFM7, плавающие гелевые анализы8 и эластомерные микропостовые анализы9. Эти технологии использовались в формате одной тарелки, а также в формате нескольких скважин в многочисленных исследованиях и даже были предложены для трехмерных измерений силы10,11,12,13,14. Хотя эти технологии позволили провести новаторские исследования в обширной области биологии клеточных сил, все они были в значительной степени ограничены лабораториями, обладающими конкретными возможностями и ресурсами, в частности: способностью изготавливать субстраты TFM, способностью правильно применять сложные и неинтуитивные алгоритмы для решения карт смещения TFM и относительно точными системами микроскопии, которые могут регистрировать изображения, сделанные до и после удаления образца со стадии (для диссоциации клеток). Таким образом, для неподготовленного исследователя входной барьер для использования этих методов может быть достаточно высоким, учитывая обширный набор требований к применению этих технологий. Кроме того, разрешение изображения, требуемое для многих существующих технологий (40-кратные цели или более), может значительно ограничить экспериментальную пропускную способность, в то время как технологии массовых измерений могут маскировать вклад от выделяющихся клеток и предотвращать обнаружение более мягких сократительных различий. Следует отметить, что, насколько известно авторам, только низкопроизводительный и полуколичественный подход к анализу плавающего геля достаточно созрел, чтобы стать доступным для исследователей (см. Рисунок 1).
Рисунок 1: Общая схема метода технологии FLECS. (A) Клетки прилипают к микрошарам адгезивного белка, которые ковалентно встроены в тонкий эластомерный слой, поддерживаемый стеклом. (B) Вид сверху различных возможных микрошаблонных форм и взрыв ячейки, сжимающей микрошарику в форме "X". (C) Наложение флуоресцентных микрошариков и фазовых контрастных изображений сжимающейся ячейки. D) изображения с течением времени одной договаривающейся ячейки. Шкала стержней = 25 мкм. Эта цифра была адаптирована с разрешения Пушкарского и др.15. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Следуя недавним достижениям в области микротехнологий, авторы разработали технологию на основе микропластин, позволяющую проводить количественные измерения сокращения одиночных клеток в сотнях тысяч клеток, называемых FLECS (флуоресцентно меченые эластомерные сжимаемые поверхности)15,16,17,18,19,20 , в качестве альтернативы TFM. В этом подходе флуоресцентные белковые микрошарики встроены в мягкие пленки, которые деформируются и сжимаются, когда клетки прикладывают к ним силы тяги, интуитивно понятным и измеримым образом. Важно отметить, что белковые микрошарики ограничивают положение, форму и область распространения клеток, что приводит к однородным условиям тестирования. Они позволяют проводить простые измерения, основанные только на их размерных изменениях, которые высоко разрешаются пространственно даже на изображениях с 4-кратным увеличением. Метод включает в себя модуль анализа изображений на основе браузера и позволяет проводить простой анализ сократительной клеточной силы, не требуя деликатных процедур обработки или регистрации фидуциарных маркеров, так что он должен быть оперируем любым исследователем с базовой установкой клеточной культуры и простым флуоресцентным микроскопом с низким увеличением (рисунок 2). ). Эта технология, которая готова к полке и коммерчески доступна, была разработана с учетом конечного пользователя и направлена на снижение барьера входа для любого лабораторного ученого для изучения биологии клеточной силы.
Рисунок 2: Схема формата пластины с 24 лунками для анализа сократимости одной ячейки. Этот формат был использован в экспериментах, описанных здесь и изображенных в видеочасти статьи. Шкала = 25 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
В этой работе мы представляем протокол для применения формата пластины 24 лунок платформы FLECS Technology для количественной оценки влияния силовых модулирующих препаратов на клеточную сократимость в первичных гладкомышечных клетках мочевого пузыря. Этот протокол общего назначения может быть адаптирован и модифицирован по мере необходимости для учета различных других временных шкал, типов клеток и условий лечения, представляющих интерес, и масштабирован для ответа на другие вопросы в области биологии.
1. День 1: Подготовка плиты из 24 скважин
2. День 1: Посев клеток
3. День 2: Добавление тестового препарата
ПРИМЕЧАНИЕ: Конечная концентрация диметилсульфоксида (ДМСО) в скважинах, содержащих прилипшие клетки, не может превышать 1%, и лекарственное средство/ДМСО не может быть добавлено непосредственно в клетки, а сначала должно быть разбавлено и смешано с промежуточным раствором клеточной среды.
4. День 2: Визуализация плиты скважины
5. Постэксперимент: Анализ изображений
ПРИМЕЧАНИЕ: Анализ изображений проводился с использованием Biodock.ai портального и графического программного обеспечения.
Области изображений, полученных из скважин, которые были обработаны только ДМСО, и те, которые были обработаны блеббистатином 40 мкМ, показаны бок о бок на рисунке 3. Можно четко заметить, что клетки, обработанные только DMSO, демонстрируют значительный уровень сокращения, основанный на очень заметных деформациях микроструктур, прилипших к гладкомышечным клеткам мочевого пузыря (BSMC) в этой скважине. И наоборот, на изображении хорошо обработанного 40 мкМ блеббистатина наблюдается значительная клеточная релаксация7, поскольку микрошарики, к которым прилипают БСМК, почти неотличимы по размеру от микрошариков, к которым не прилипают клетки, что указывает на минимальное сокращение. Эти изображения демонстрируют интуитивное и четкое визуальное представление сократимости одной клетки, предлагаемое методом флуоресцентного микроструктурирования. В отличие от методов на основе TFM, где всенаправленное движение многочисленных флуоресцентных частиц, случайным образом распределенных под плотным монослоем ячейки, предназначено для передачи относительной сократительной силы, здесь однородная и выраженная сжатая геометрия микрошариков обеспечивает немедленную и легко интерпретируемую качественную информацию о сокращении отдельных клеток. Они могут быть непосредственно количественно определены путем применения стандартных операций с двоичными объектами к изображениям.
Рисунок 3: Параллельные сравнения изображений, сделанных из скважин, содержащих либо только 1% лечения ДМСО (слева), либо содержащих 40 мкМ блеббистатина (справа). Можно четко заметить, что лечение блеббистатином значительно снижает сократимость одиночных клеток, о чем свидетельствуют более крупные, неконцентрированные микроструктуры. Синие ядра указывают, какие микрошарики связаны клетками. Шкала = 25 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Применяя модуль анализа на основе браузера для анализа полученных пар изображений микрошаблонов и клеточных ядер, для каждой популяции получаются распределения сократимости одиночных клеток, как показано на рисунке 4. Подробно описанный в предыдущем отчете по методологии FLECS15, анализ работает путем определения положения и ориентации каждого микрошаблона в форме «X», подсчета количества ядер, прикрепленных непосредственно к центру каждой микрошаблоны, вычисления средней длины каждого микрошаблона и вычисления пиксельного расстояния сжатия каждой микрошаблоны по отношению к средней длине пустых микрошаблонов (ссылка на нулевое сокращение). Поэтому пустые микрошарики служат важной цели для нормализации данных о сокращении. Важно отметить, что клетки, которые не связываются с микроструктурами, будут накапливаться на границах скважин из-за микротоков, где они не будут влиять на анализ изображений. Как видно на этих графиках, невозмутимая сократимость клеточной популяции, обработанной только с помощью элементов управления DMSO, охватывает большой диапазон до 20 пикселей, причем центр находится на уровне около 10 пикселей. Между тем, клетки, обработанные блеббистатином, сокращаются значительно меньше, и их распределение опускается до центра чуть более 6 пикселей. Важно отметить, что каждый микрошаблон, найденный на изображении, который связывается точно на клетке, представлен в этих распределениях. Это демонстрирует способность метода передавать дифференциальные клеточные реакции на медикаментозное лечение.
Рисунок 4: Гистограммы, изображающие данные о сократимости одноклеточных клеток, полученные в результате анализа изображений, полученных из скважин, содержащих только 1% ДМСО (синий) или 40 мкМ блеббистатина. Распределение клеток, обработанных ДМСО, является широким и сосредоточено на гораздо большем значении сокращения (~ 10 пикселей), чем распределение, обработанное блеббистатином, демонстрируя количественные эффекты лечения клеток блеббистатином. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
При использовании всех скважин на одной 24-луночной пластине и визуализации по меньшей мере 3 участков на скважину одновременно генерируются шеститочечные кривые «доза-реакция» для двух лекарственных соединений. На рисунке 5 показаны данные о концентрации-ответе для БСМК, получавших одинаковый диапазон доз блеббистатина или цитохалазина D (оба известных ингибитора сократимости). Как видно из профилей концентрации-ответа, цитохалазин D является более мощным ингибитором тонического сокращения в этих клетках. Подгоняя сигмоидальную кривую к точкам данных, значения IC50 могут быть рассчитаны для каждого препарата. Наши эксперименты показывают, что IC50 составляет 7,9 мкМ и 100 нМ для блеббистатина и цитохалазина D, соответственно, после ~ 30 мин воздействия лекарств. Важно отметить, что в целом эти значения согласуются с предыдущими отчетами, подтверждающими количественную точность метода определения эффективности ингибиторов сокращения7,21.
Рисунок 5: Кривые концентрация-реакция, изображающие влияние блеббистатина и цитохалазина D на клеточную сократимость в одиночных клетках. Каждая точка данных содержит три изображения для этого условия. Сигмоидальная кривая соответствовала каждому набору данных. Результаты показывают, что цитохалазин D является более мощным, имея более низкое значение IC50 . Эти данные собираются с одной 24-луночной пластины FLECS. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Этот упрощенный метод количественного измерения сокращения в сотнях тысяч клеток одновременно при различных условиях лечения и использовании только стандартных инструментов микроскопии обеспечивает доступную альтернативу традиционному TFM для исследователей для изучения клеточной силовой биологии. Поскольку представленная технология обеспечивает визуальное отображение сокращения клеток путем анализа изменений в регулярно сформированных флуоресцентных микроструктурах, величина сокращения, производимого любой данной клеткой, интуитивно понятна - чем меньше микрошаблон, тем больше сократительная сила, оказываемая клеткой.
Примечательно, что, предлагая контроль над такими факторами, как форма, область распространения и молекула адгезии, содержащая микрошарики (все факторы, которые, как известно, регулируют сократимость клеток22,23,24), представленная технология систематически устраняет дополнительные переменные, которые могут сбить с толку интерпретации исследований сокращения клеток.
В этом эксперименте в геле использовалась жесткость 10 кПа, а микрошагонная матрица 70 мкм (диагональная длина) состояла из коллагена IV типа. Помимо этих параметров, адгезивная молекула может быть заменена различными коллагенами, фибронектином, желатином и другим внеклеточным матриксом (ECM). Жесткость геля может быть настроена до 0,1 кПа и до диапазона МПа. Геометрия микрошаблона может быть спроектирована de novo так, чтобы иметь любую форму с минимальным размером объекта ~ 5 мкм. Эти параметры разъединены и могут быть независимо оптимизированы для конкретного биологического контекста.
Эта технология была широко проверена на совместимость с высокоадгезионными и сократительными типами клеток мезенхимального фенотипа, включая различные типы гладкомышечных клеток человека (первичный мочевой пузырь человека, кишечник, трахея, бронхиальный, маточный, аортальный и артериальный), мезенхимальные стволовые клетки и их дифференцированное потомство, различные фибробласты (легочные, дермальные и сердечные), миофибробласты и эндотелиальные клетки. Кроме того, макрофаги, полученные из моноцитов, также будут производить большую измеримую фагоцитарную силу на микрошаблонах, особенно если микроструктура состоит из известного опсонина. Различные линии рака также могут быть проанализированы с использованием метода.
Метод может создавать некоторые проблемы для использования с клетками, которые либо относительно малы, такими как Т-клетки и нейтрофилы, либо с типами клеток с преимущественно эпителиальным фенотипом. Основная причина этого заключается в том, что метод опирается на сильную адгезию и полное распространение клеток по микрошаблону с целью генерации измеримого сократительного сигнала. Клетки, которые слабо связываются, связываются друг с другом или не распространяются полностью, не будут производить измеримые сократительные сигналы. Это поведение, которое относительно редко, может быть смягчено путем корректировки размера микрошаблона, чтобы он был меньше, или путем использования альтернативных адгезивных молекул в микрошаблонах, которые будут лучше способствовать адгезии и распространению в этих клетках.
Пользователи технологии должны тщательно оценивать различные возможные составы клеточной культуральной среды для их конкретного типа клеток, поскольку различные компоненты, факторы роста, уровни сыворотки и чувствительность к рН могут управлять переменным поведением в разных клетках. Оптимизация протокола должна предшествовать масштабированию любых экспериментальных рабочих процессов, а компоненты носителей всегда должны быть свежими, стерильными и соответствовать предыдущим партиям.
В конечном счете, если разрешение одной ячейки не является необходимым для целей пользователя, или если целевой тип ячейки имеет минимальную способность к распространению, то традиционный TFM может быть в равной степени или более подходящим для таких экспериментов. Цель и надежда авторов заключается в том, что этот инструмент предоставляет клеточным биологам дополнительный путь для изучения клеточного сокращения, особенно в контексте автоматизированных высокопроизводительных фенотипических скринингов лекарств.
В зависимости от будущего использования в скринингах лекарств могут использоваться пластины с более высокой пропускной способностью, такие как пластина FLECS с 384 скважинами. В таких пластинах 4-кратные цели на многих микроскопах могут захватывать целую единственную скважину в поле зрения, гарантируя, что все клеточные сократительные реакции будут захвачены. Используя высокопроизводительную систему визуализации, вся пластина из 384 скважин может быть получена примерно за 5 минут, что делает эту систему значительно быстрее, чем другие варианты, и, следовательно, подходит для открытия высокопроизводительных фенотипических лекарств. Действительно, авторы регулярно проводят еженедельные скрининги лекарств на ~ 50 384 скважинах (в общей сложности более 19 000 скважин) с использованием автоматизации.
И.П. является изобретателем по выданному семейству патентов, защищающих методы и системы технологии FLECS. I.P., Y.W., J.Z., E.C. и R.H. являются сотрудниками Forcyte Biotechnologies, Inc. R.D. является профессором UCLA и соучредителем Forcyte Biotechnologies, Inc. I.P., Y.W., J.Z. и R.D. имеют финансовые интересы в Forcyte Biotechnologies, Inc., которая является эксклюзивным лицензиатом вышеуказанных патентов и коммерциализирует технологию FLECS.
Лабораторные работы проводились при поддержке UCLA Molecular Shared Screening Resource (MSSR), где Forcyte спонсирует исследовательскую деятельность, и Инкубатора Magnify в Калифорнийском институте наносистем (CNSI), где Forcyte Biotechnologies, Inc. является компанией-резидентом. Авторы предоставят доступ к Biodock.ai аналитическому модулю FLECS всем академическим исследователям по запросу. Л.Х. и И.П. внесли равный вклад в эту работу.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Bladder smooth muscle cell culture | Sciencell | #4310 | |
Blebbistatin | Sigma-Aldrich | B0560 | |
Cell culture media | Thermofisher | 11765054 | Ham's F12 medium supplemented with 10% FBS and 1% p/s |
Cell strainer | Fisher Scientific | 7201432 | |
Conical Tube | Fisher Scientific | 05-539-13 | |
Culture flask | Fisher Scientific | FB012941 | |
Cytochalasin D | Sigma-Aldrich | C8273 | |
DMSO (Dimethyl sulfoxide) | Fisher Scientific | D1284 | |
Eppendorf tubes | Fisher Scientific | 05-402-31 | |
Fluorescent microscope | Molecular Devices | ImageXpress Confocal | |
Forcyte-manufactured 24-well plate | Forcyte Biotechnologies | 24-HC4R-X1-QB12 | |
Hoescht 3342 Live Nuclear Stain | Thermofisher | 62249 | |
Phosphate Buffered Saline (PBS) | Fisher Scientific | BP39920 |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены