Анализ экспрессии TMOD3 у резистентных и чувствительных к химиотерапии пациентов на основе платины и анализ мРНК-микроРНК

Для начала перейдите к ROC Plotter и нажмите на ROC Plotter for Ovarian Cancer. Вставьте TMOD3 в поле с символом гена. В поле для ответов выберите «Безрецидивная выживаемость через 6 месяцев».

В поле лечения выберите Platin. Затем нажмите «Рассчитать», чтобы получить результаты. Перейдите в TargetScan и вставьте TMOD3 в поле Введите символ человеческого гена.

Затем отправляйтесь на прием к cBIOPortal. Теперь выберите Ovarian serous cystadenocarcinoma, набор данных TCGA Nature 2011. Вставьте символы TMOD3 и микроРНК в поле «Введите гены».

Нажмите «Отправить запрос», чтобы получить данные корреляции TMOD3 с микроРНК в наборе данных TCGA по раку яичников. После этого визуализируйте результат с помощью кнопки Далее, перейдите в LinkedOmics и выберите выборку TCGA OV. Затем выберите «Клинический» в поле «Выбрать набор данных для поиска».

Выберите Platinum_status в поле Выбрать атрибут набора данных для поиска. Затем выберите секвенирование микроРНК в поле Выбрать целевой набор данных. Выберите T-критерий в разделе «Выбрать статистический метод» и нажмите «Отправить запрос», чтобы получить результаты.

Экспрессия TMOD3 была значительно снижена после химиотерапии на основе платины у пациентов с высокочувствительным раком яичников по сравнению с пациентами, не получавшими лечения. Экспрессия TMOD3 была значительно выше у пациентов с раком яичников с резистентностью к платине по сравнению с пациентами с чувствительностью к платине, а кривая ROC показала TMOD3 в качестве маркера для определения резистентности к платине. Была идентифицирована 21 микроРНК, нацеленная на TMOD3, причем большинство из них были связаны с резистентностью к цисплатину при раке яичников, а has-miR-133a-3p значительно отрицательно коррелировал с экспрессией TMOD3 и низко экспрессировался при цисплатин-резистентных раках.