Проверка распределения TMOD3 в иммунных клетках и сетях коэкспрессии TMOD3 при раке яичников

Для начала перейдите в HPA и вставьте TMOD3 в поле поиска, чтобы получить результат. Выберите «Иммунный», чтобы показать распределение TMOD3 в различных иммунных клетках. Перейдите в TIMER и вставьте TMOD3 в поле Gene Symbol.

Выберите OV в поле «Типы рака» и нажмите «Отправить», чтобы получить результат. Затем перейдите в TISIDB, вставьте TMOD3 в поле «Символ гена» и нажмите «Отправить». В LinkedOmics выберите выборочную когорту TCGAOV.

Выберите Секвенирование РНК в поле Выбрать набор данных для поиска и Выберите целевой набор данных. Теперь нажмите «Отправить запрос», чтобы получить результаты экспрессии генов совместно с TMOD3. Перейдите в раздел «Строка» и вставьте TMOD3 в поле «Название белка».

Затем выберите Homo sapiens в поле «Организмы» и нажмите «Поиск», чтобы получить результат. После этого отправляйтесь к ДАВИДУ. Вставьте перекрывающиеся гены в поле Введите список генов и выберите Ensemble Gene ID в поле Выбрать идентификатор.

Нажмите на «Отправить список», чтобы получить результаты. Затем перейдите в базу данных CTD и выберите «Запрос на химическое взаимодействие генов» в меню «Поиск». Вставьте TMOD3 в Gene Box и нажмите «Поиск», чтобы получить результаты.

Перейдите в базу данных PubChem и введите препараты в поле Поиск. TMOD3 был широко распространен в различных иммунных клетках и отрицательно коррелировал с чистотой опухоли, что указывает на его роль в иммунной инфильтрации тканей рака яичников. Экспрессия TMOD3 положительно коррелировала с В-лимфоцитами, CD-8-положительными Т-клетками, нейтрофилами и дендритными клетками, но не с CD-4-положительными Т-клетками и макрофагами.

Экспрессия TMOD3 в значительной степени коррелировала с различными иммуномодуляторами, включая иммунные контрольные точки, такие как PD-1, PDL-1 и CTLA-4.