تحليل التعبير الجيني العالمي باستخدام ميكروأري قليل النوكليوتيد منهاج اسماك الزرد

ميكروأرس الجينات هي أدوات قوية في التعبير الجيني التنميط على مستوى الجينوم واسعة. هذه التكنولوجيا وتطبيقها في مجموعة متنوعة من التخصصات بما في ذلك البيولوجيا التطورية البيولوجية والسمية. في هذا الفيديو ، ونحن بالتفصيل بروتوكولا لتحليل الجينات العالمية باستخدام تعبير ميكروأري قليل النوكليوتيد شاملة منصة لالزرد.

تكنولوجيا الجينات ميكروأري تصاريح قياس الكمي والتنميط الجيني التعبير عن مستويات النص على أساس الجينوم واسعة. وتستخدم تكنولوجيا الجينات ميكروأري في تخصصات عديدة البيولوجية في مجموعة متنوعة من التطبيقات بما في ذلك تحليل الجينات التعبير العالمي فيما يتعلق المرحلة التنموية ، إلى حالة المرض ، وسامة في الاستجابات هنا ، ونحن وتشمل التظاهرة العالمية باستخدام تعبير الجين تحليل شامل ميكروأري قليل النوكليوتيد الزرد منصة محددة. وميكروأري التعبير الزرد منصة تحتوي على 385000 تحقيقات ، أزواج قاعدة 60 في الطول ، واستجواب 37157 الأهداف مع ما يصل الى 12 في تحقيقات الهدف. لهذه المنصة ، تم جمع كل المعلومات المتاحة [كدنا] والجينومية لالزرد من قواعد بيانات مختلفة بما في ذلك الجينومية Ensembl (http://www.ensembl.org) ، فيغا (http://vega.sanger.ac.uk) ، UCSC ( http://genome.ucsc.edu) ، وZFIN (http://www.zfin.org). نتيجة هذا الصفيف التعبير يوفر تغطية كاملة لtranscriptome الزرد الحالي. تم طباعة ميكروأري التعبير الزرد التي NimbleGen روش (ماديسون ، ويسكونسن). هذه التظاهرة الفنية تشمل العلامات الفلورية منتج [كدنا] ، التهجين من الناتج المسمى [كدنا] [ميكروأري إلى المنصة ، والمسح الضوئي لاقتناء مجموعة إشارة باستخدام تحليل اللون استراتيجية واحدة.

الجزء 1 : وصفها نيون من [كدنا]

Cy3 الصبغة التي استخدمت في التجربة ميكروأري حساسة للتدهور ، الصورة. وينبغي إجراء تجري في كمية ضئيلة من الضوء. تم تعديل بروتوكول وضع العلامات من CGH صفيف BioPrime نظام وضع العلامات الجينية المختصر ^1.

بروتوكولات [ميكروأري كثيرة ، منها واحدة مفصلة هنا ، واستخدام الأصباغ الفلورية كوسيلة للقياس الكمي والتهجين. صبغة الفلورسنت Cy3 حساس للصور وتدهور طبقة الأوزون. فمن المستحسن أن يجري الإجراء في الحد الأدنى من الإضاءة. بالإضافة إلى ذلك ، يمكن للجزيئات الغبار الصغيرة تتدا.......