वैश्विक जीन एक्सप्रेशन विश्लेषण एक Zebrafish Oligonucleotide माइक्रोएरे प्लेटफार्म का उपयोग करना

जीन डीएनए जीन अभिव्यक्ति की रूपरेखा में एक जीनोम चौड़ा स्तर पर शक्तिशाली उपकरण हैं. इस प्रौद्योगिकी विकास जीव विज्ञान और विष विज्ञान सहित जैविक विषयों की एक किस्म में आवेदन किया है. इस वीडियो में, हम वैश्विक जीन अभिव्यक्ति zebrafish के लिए एक व्यापक oligonucleotide माइक्रोएरे मंच का उपयोग विश्लेषण के लिए एक प्रोटोकॉल विस्तार.

जीन माइक्रोएरे प्रौद्योगिकी एक जीनोम चौड़ा आधार पर मात्रात्मक और प्रतिलेख के स्तर के जीन अभिव्यक्ति की रूपरेखा माप परमिट. जीन माइक्रोएरे प्रौद्योगिकी विकास मंच के संबंध में वैश्विक जीन अभिव्यक्ति विश्लेषण एक रोग राज्य सहित आवेदनों की एक किस्म में कई जैविक विषयों में प्रयोग किया जाता है, और विषाक्त प्रतिक्रिया में. इस के साथ साथ, हम वैश्विक जीन अभिव्यक्ति एक व्यापक zebrafish विशिष्ट oligonucleotide माइक्रोएरे मंच का उपयोग विश्लेषण के प्रदर्शन में शामिल हैं. zebrafish अभिव्यक्ति माइक्रोएरे मंच 385.000 जांच, लंबाई में 60 आधार जोड़े, के साथ 37,157 लक्ष्य पूछताछ लक्ष्य प्रति 12 जांच करने के लिए शामिल हैं. इस मंच के लिए, सभी सीडीएनए और जीनोमिक zebrafish के लिए उपलब्ध जानकारी (http://www.ensembl.org) Ensembl, वेगा (http://vega.sanger.ac.uk), UCSC सहित विभिन्न जीनोमिक डेटाबेस से एकत्र किया गया था ( http://genome.ucsc.edu), और ZFIN (http://www.zfin.org). एक परिणाम के रूप में इस अभिव्यक्ति सरणी वर्तमान zebrafish transcriptome की पूरी कवरेज प्रदान करता है. zebrafish अभिव्यक्ति माइक्रोएरे Roche NimbleGen (मैडिसन, WI) के द्वारा मुद्रित किया गया था. यह तकनीकी प्रदर्शन एक सीडीएनए उत्पाद के फ्लोरोसेंट लेबलिंग, लेबल सीडीएनए उत्पाद के माइक्रोएरे मंच करने के लिए संकरण, और संकेत अधिग्रहण के लिए एक रंग विश्लेषण रणनीति का उपयोग सरणी स्कैनिंग शामिल हैं.

भाग 1: प्रतिदीप्त लेबल के सीडीएनए

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