Summary
Abstract
Protocol
Discussion
Acknowledgements
Materials
References
Immunology and Infection
ERRATUM NOTICE
Important: There has been an erratum issued for this article. Read more …שיטה פשוטה כתם חריץ פותחה עבור כימות של hemagglutinin שפעת ויראלי neuraminidase באמצעות נוגדנים אוניברסלי מיקוד רצפים שימור ביותר שלהם מזוהה באמצעות ניתוחים ביואינפורמטיקה. גישה חדשנית זו עשויה לספק חלופה שימושי להגדרה כמותית של hemagglutinin כל נגיפיים neuraminidase.
Hemagglutinin (HA) ו neuraminidase (NA) הם שני חלבונים פני השטח של נגיפי שפעת אשר ידועים תפקיד חשוב במחזור החיים ויראלי הגיוס של 1,2 התגובות מגן החיסון. כאשר המטרה העיקרית נוגדנים מנטרלים, HA משמש כיום גם את הסמן חיסון שפעת הפוטנציאל נמדדת immunodiffusion רדיאלי יחיד (SRID) 3. עם זאת, התלות של SRID על הזמינות של antisera המקביל תת ספציפיים הגורמים מינימום של 2-3 חודשים עיכוב לשחרורו של חיסון כל חדש. יתר על כן, למרות העדויות כי NA גם גורם החסינות 4, כמות NA בחיסונים לשפעת אינה סטנדרטית אך בשל חוסר של ריאגנטים המתאימים או שיטה אנליטית 5. לכן, שיטות חלופיות פשוט מסוגל לכימות אנטיגנים HA ו NA רצויות לשחרור מהיר, בקרת איכות טובה יותר של החיסונים לשפעת.
אזורים שמורים אוניברסלי ב שפעת כולם זמינים HA ו NA רצפים זוהו על ידי מנתח ביואינפורמטיקה 6-7. אחת ברצף (יועד Uni-1) זוהה epitope רק את נשמרת אוניברסלית של HA, הפפטיד היתוך 6, בעוד שני רצפים שימור זוהו neuraminidases, אחד קרוב באתר הפעיל האנזימטית (יועד HCA-2) ואת קרובים אחרים הסופית-N (יועד HCA-3) 7. פפטידים אלו רצפים של חומצות אמיניות היו מסונתז ומשומשים לחסן ארנבות לייצור נוגדנים. נוגדנים נגד epitope Uni-1 של HA היה מסוגל להיקשר 13 subtypes של שפעת A HA (H1-H13) ואילו נוגדנים נגד HCA-2 ו HCA-3 אזורים של NA היו מסוגלים מחייב את כל 9 תת NA. כל הנוגדנים הראו סגוליות מדהים נגד רצפים ויראלי כפי שמעידים התצפית שלא לחצות תגובתיות לחלבונים allantoic זוהה. נוגדנים אלה אוניברסלי שימשו אז לפתח כתם מבחני חריץ לכמת HA ו NA של שפעת חיסונים ללא צורך antisera ספציפי 7,8. דגימות חיסון יושמו על קרום PVDF באמצעות מנגנון כתם חריץ יחד עם סטנדרטים התייחסות בדילול לריכוזים שונים. לצורך זיהוי של HA, דגימות תקן היו בדילול הראשון טריס שנאגרו מלוחים (TBS) המכיל אוריאה 4M בעוד למדידת NA הם מדולל TBS המכילה 0.01% Zwittergent התנאים האלה שיפרה בצורה משמעותית את רגישות הזיהוי. בעקבות גילוי של HA ו NA על ידי אנטיגנים immunoblotting עם נוגדנים אוניברסלי שלהם, בעוצמות האות היו לכמת ידי צפיפות. סכומי HA ו NA בחיסונים חושבו לאחר מכן באמצעות עקומת סטנדרט הוקמה עם עוצמות אות הריכוזים השונים של הפניות בשימוש.
בהתחשב בכך נוגדנים אלה נקשרים epitopes אוניברסלי HA או NA, החוקרים מעוניינים יכול להשתמש בהם ככלי מחקר immunoassays מלבד כתם חריץ בלבד.
1. הכנה של ריאגנטים וציוד
קביעה כמותית של שפעת נגיפית HA ו NA הם קריטיים עבור מחקר ופיתוח החיסון שכן אלה שני חלבונים פני השטח הם מרכיבים נגיפיים החשוב ביותר גרימת התגובה החיסונית 6-11. שיטות אימונולוגיות דיווחו בעבר לצורך זיהוי של חלבונים אלה דורשים מאמץ נוגדנים ספציפיים. כתם פשוט, לשחזור מ.......
Name | Company | Catalog Number | Comments |
שם מגיב או ציוד | חברה | מספר קטלוגי | תגובות |
---|---|---|---|
Bio-Dot-SF Apparatus Microfiltration | Bio-Rad | 170-6542 | |
Bio-Dot-SF נייר סינון | Bio-Rad | 162-0161 | |
Immobilon-FL העברת קרום (PVDF) | Millipore | IPFL00010 | |
לשאוב אבק | Millipore | WP6111560 | |
Chemiluminescence BioMax אור קולנוע | קודאק | 178 8207 | |
FluorChem ג'ל מערכת תיעוד | אלפא Innotech | 29-008-1896X | |
ארנב נוגדנים נגד יוניברסל HA ו NA אנטיגנים | Uni-1 (HA) HCA-2, HCA-3 (NA) | נוגדנים זמינים דרך MTA או יכול להיות שנוצר על ידי חוקרים מעוניינים פי הנהלים שתוארו לעיל 6,7. | |
התייחסות שפעת חיסון אנטיגן | CBER / או ה-FDA NIBSC | ||
חיסון נגד שפעת דגימות | זמין בדרך כלל ברוב המדינות | ||
דשן | סיגמא אולדריץ | U1250 | |
דטרגנט Zwittergent 3-14 | Calbiochem | 693017 | |
Tween-20 | פישר סיינטיפיק | BP337-500 | |
סופג חוסם כיתה ללא שומן יבש החלב | Bio-Rad | 170-6404 | |
ImmunoPure נגד ארנב עיזים IgG, (H + L), peroxidase מצומדות | Thermo Scientific | 31460 | |
SuperSignal המערבית דורה Extended תשתית משך | Thermo Scientific | 34075 |
Erratum
Erratum: Quantitative Analyses of all Influenza Type A Viral Hemagglutinins and Neuraminidases using Universal Antibodies in Simple Slot Blot AssaysAn author's affiliation was omitted from the publication of Quantitative Analyses of all Influenza Type A Viral Hemagglutinins and Neuraminidases using Universal Antibodies in Simple Slot Blot Assays.
ABOUT JoVE
Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved