JoVE Logo
Faculty Resource Center

Sign In

Abstract

Biology

Elektriciteit-Free, Sequential nucleïnezuur en eiwit isolatie

Published: May 15th, 2012

DOI:

10.3791/4202

1CUBRC, Inc., 2Department of Microbiology and Immunology, State University of New York at Buffalo, School of Medicine and Biomedical Sciences

Traditionele en nieuwe ziekteverwekkers zoals enterohemorragische Escherichia coli (EHEC), Yersinia pestis, of prion-ziekten te zijn van grote zorg voor overheden, industrie en medische professionals over de hele wereld. Bijvoorbeeld, EHECS, in combinatie met Shigella, zijn verantwoordelijk voor de dood van ongeveer 325.000 kinderen per jaar en zijn vooral in de ontwikkelingslanden, waar het laboratorium op basis van identificatie, gebruikelijk in de Verenigde Staten, is niet beschikbaar 1. De ontwikkeling en distributie van lage kosten, zou veld-based, point-of-care tools om te helpen bij de snelle identificatie en / of diagnose van pathogenen of ziekte markers drastisch veranderen progressie van de ziekte en de patiënt prognose. Wij hebben een tool ontwikkeld om nucleïnezuren en eiwitten uit een monster isoleren door vaste-fase-extractie (SPE) zonder elektriciteit of aanverwante laboratoriumapparatuur 2. De geïsoleerde macromoleculen kan worden gebruikt voor diagnosis hetzij in een voorwaartse lab of het gebruik van field-based point-of-care platformen. Belangrijk is dat deze methode voorziet in de directe vergelijking van nucleïnezuur en eiwit gegevens uit een niet-splitsing monster, met een vertrouwen door de bevestiging van genomics en proteomics analyse.

De isolatie gereedschap gebruikt de standaard voor vaste-fase geïsoleerd nucleïnezuur, de BOOM technologie, die nucleïnezuren een chaotropische zoutoplossing, gewoonlijk guanidine isothiocyanaat door binding aan silica gebaseerde deeltjes of filters 3 isoleert. Eigen vaste fase CUBRC de extractie chemie wordt gebruikt om eiwitten te zuiveren van chaotrope zoutoplossingen, in dit geval uit het afval of stroom-through na nucleïnezuursequentie isolatie 4.

Door verpakking chemie gekarakteriseerde in een kleine, goedkope en eenvoudige platform, hebben we een draagbaar gegenereerd voor nucleïnezuur en eiwit-extractie kan worden uitgevoerd onder variety voorwaarden. De geïsoleerde nucleïnezuren zijn stabiel en kunnen worden afgevoerd naar een positie waar vermogen voor PCR amplificatie terwijl het eiwitgehalte kan direct geanalyseerd door gehouden hand of andere immunologische gebaseerde assays. De snelle identificatie van ziekte markers in het veld kan de patiënt uitkomst significant te veranderen door de leiding van de juiste loop van de behandeling in een eerder stadium van de progressie van de ziekte. Het gereedschap en de beschreven methode zijn geschikt voor gebruik met vrijwel alle infectieuze agens en bieden de gebruiker de redundantie van multi-macromolecuul soort analyses en tegelijkertijd de vermindering van de logistieke last.

Tags

Chemie

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved