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Biology

Electricité-libre, l'acide nucléique et séquentielle isolement des protéines

Published: May 15th, 2012

DOI:

10.3791/4202

1CUBRC, Inc., 2Department of Microbiology and Immunology, State University of New York at Buffalo, School of Medicine and Biomedical Sciences

Pathogènes traditionnels et émergents, tels que Escherichia coli entérohémorragique (EHEC), Yersinia pestis, ou prion à base de maladies sont une préoccupation importante pour les gouvernements, les industries et professionnels de la santé à travers le monde. Par exemple, EHECs, combinées avec Shigella, sont responsables de la mort d'environ 325 000 enfants chaque année et sont particulièrement répandues dans le monde en développement où le laboratoire basée sur l'identification, commune aux États-Unis, n'est pas disponible 1. Le développement et la distribution de faible coût, sur le terrain, les points de soins des outils pour aider à l'identification rapide et / ou le diagnostic d'agents pathogènes ou des marqueurs de maladies pourrait modifier radicalement progression de la maladie et le pronostic du patient. Nous avons développé un outil pour isoler des acides nucléiques et des protéines à partir d'un échantillon par extraction en phase solide (SPE), sans électricité ni matériel de laboratoire associé 2. Les macromolécules isolées peuvent être utilisés pour diagnosticsis soit dans un laboratoire de l'avant ou à l'aide sur le terrain au point de plates-formes de soins. Surtout, cette méthode fournit pour la comparaison directe d'acides nucléiques et de protéines de données à partir d'un échantillon non-scission, offrant un niveau de confiance par le biais de corroboration de l'analyse génomique et protéomique.

Nos outil isolement utilise la norme industrielle en phase solide pour l'isolement d'acide nucléique, la technologie BOOM, qui isole les acides nucléiques à partir d'une solution de sel chaotropique, généralement isothiocyanate de guanidine, en se liant à base de silice ou des filtres particules 3. CUBRC de chimie exclusive d'extraction en phase solide est utilisé pour purifier la protéine à partir de solutions salines chaotropes, dans ce cas, les déchets ou les flux de-thru suite à l'isolement d'acide nucléique 4.

En emballage bien caractérisé chimies dans une petite plate-forme, simple et peu coûteuse, nous avons généré un système portable pour l'extraction des acides nucléiques et des protéines qui peut être effectuée en vertu d'une variety de conditions. Les acides nucléiques isolés sont stables et peuvent être transportés à un poste où le pouvoir est disponible pour l'amplification PCR alors que la teneur en protéines peuvent être immédiatement analysé par main levée ou d'autres tests basés sur immunologique. L'identification rapide des marqueurs de maladies dans le domaine pourrait modifier sensiblement les résultats du patient en dirigeant le bon déroulement du traitement à un stade précoce de la progression de la maladie. L'outil et la méthode décrite conviennent pour une utilisation avec n'importe quel agent infectieux et offrir à l'utilisateur la redondance des analyses de type multi-macromolécule tout en réduisant leur fardeau logistique.

Tags

Chimie

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