Progettazione e utilizzo di matrici chemostato multiplexing

Chemostati sono sistemi di coltura continua in cui le cellule vengono coltivate in un ben ambiente controllato chimicamente costante dove è vincolato densità cultura limitando specifici nutrienti. ^1,2 I dati chemostati sono altamente riproducibili per la misurazione dei fenotipi quantitative che forniscono un tasso di crescita e l'ambiente allo stato stazionario. Per queste ragioni, chemostati sono diventati strumenti utili per la messa a livello della fisiologia caratterizzazione attraverso l'analisi di espressione genica ^3-6 e le altre caratteristiche di culture allo steady-state di equilibrio. ⁷ a lungo termine esperimenti chemostati può evidenziare traiettorie specifiche popolazioni microbiche adottano durante l'evoluzione adattativa in un ambiente controllato. Infatti, chemostati sono stati utilizzati per evoluzione sperimentale dalla loro invenzione. ⁸ Un risultato comune in esperimenti evoluzione è per ciascun replicato biologica di acquisire un repertorio di mutazioni. ^9-13 Questa diversità suggerisce che c'è ancora molto da scoprire eseguendo esperimenti di evoluzione con velocità di gran lunga maggiore.

Vi presentiamo qui la progettazione e gestione di una relativamente semplice, a basso costo di serie chemostati-o miniatura Ministat-e convalidare il loro uso nella determinazione della fisiologia e in esperimenti di evoluzione con lievito. Questo approccio comporta una crescita di decine di chemostati scappare un singolo multiplex pompa peristaltica. Le colture sono mantenuti ad un volume di 20 ml di lavoro, che è pratico per una varietà di applicazioni. La nostra speranza è che l'aumento della produttività, riduzione costi, e fornendo costruzione dettagliate e istruzioni operative può anche motivare la ricerca e l'applicazione industriale di questo progetto come una piattaforma generale per caratterizzare funzionalmente un gran numero di ceppi, specie, e parametri di crescita, oltre che genetica o farmaci biblioteche.