मेजबान पैथोजन प्रोटीन से प्रोटीन सहभागिता के लैंडस्केप विशेषताएँ एक तुलनात्मक दृष्टिकोण

महत्वपूर्ण प्रयास बड़े पैमाने पर व्यापक प्रोटीन, प्रोटीन बातचीत नेटवर्क के नक्शे उत्पन्न करने के लिए एकत्र हुए थे. इस रोगज़नक़ मेजबान रिश्तों को समझने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाई है और अनिवार्य रूप से खमीर दो संकर प्रणालियों में आनुवंशिक स्क्रीनिंग के द्वारा किया गया था. एक Gaussia luciferase आधारित टुकड़ा पूरक परख द्वारा प्रोटीन, प्रोटीन बातचीत का पता लगाने के हाल ही के सुधार अब कड़ाई से सेलुलर कारकों में से एक आम सेट के खिलाफ विभिन्न रोगज़नक़ तनाव वेरिएंट से प्रोटीन की बातचीत प्रोफाइल की तुलना करने के लिए आवश्यक एकीकृत तुलनात्मक interactomic दृष्टिकोण विकसित करने का अवसर प्रदान करता है.

इस कागज विशेष रूप से प्रोटीन, प्रोटीन बातचीत डेटासेट उत्पन्न करने के लिए दो orthogonal विधियों के संयोजन की उपयोगिता पर केंद्रित है: खमीर दो संकर (Y2H) और एक नई परख, स्तनधारी कोशिकाओं में प्रदर्शन उच्च throughput Gaussia princeps प्रोटीन पूरक परख (एच टी-GPCA). NT के "एक रोगज़नक़ प्रोटीन की सेलुलर भागीदारों के> एक बड़े पैमाने पर पहचान कई रोगज़नक़ तनाव वेरिएंट का उपयोग कर सीडीएनए पुस्तकालयों की दो संकर चोकर संभोग आधारित खमीर द्वारा किया जाता है. एक उच्च आत्मविश्वास सांख्यिकीय स्कोरिंग पर चयनित बातचीत भागीदारों की एक सबसेट आगे है हिंदुस्तान टाइम्स-GPCA उपयोग कर रोगज़नक़ वेरिएंट प्रोटीन के पूरे सेट के साथ जोड़ी के लिहाज से बातचीत के लिए स्तनधारी कोशिकाओं में मान्य है. दो पूरक तरीकों का यह मिश्रण बातचीत डाटासेट की मजबूती में सुधार, और एक कड़े तुलनात्मक बातचीत के विश्लेषण के प्रदर्शन की अनुमति देता है. इस तरह की तुलनात्मक interactomics पढ़ना किसी भी रोगज़नक़ मेजबान interplays के लिए एक विश्वसनीय और शक्तिशाली रणनीति बनाते हैं.