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Abstract

Biology

绿色荧光蛋白标记的质膜蛋白质的扩散系数的简易测量采用K空间图像相关光谱

Published: May 10th, 2014

DOI:

10.3791/51074

1Institute of Molecular Biology and Genetics and Interdisciplinary Nanoscience Center, Aarhus University, 2Departments of Chemistry and Physics, McGill University

横向扩散和质膜蛋白的条块被严格调控的细胞,因此,研究这些过程,就会发现新的见解到质膜蛋白的功能和调节。最近,K空间图像相关光谱(KICS)1的开发,使扩散系数的常规测量直接从荧光标记细胞膜蛋白的图像,即避免探头光物理引入系统偏差。虽然用于分析的理论基础是复杂的,该方法可以通过使用一个免费提供的代码来测量蛋白质的扩散系数非专家来实现。 KICS计算时间相关函数从荧光显微图像堆栈的每个图像的傅立叶变换倒数(K-)空间后。随后,圆形平均,自然对数变换和线性拟合的相关函数产生的扩散系数。这本文提供了一步一步的指导,通过KICS图像分析和扩散系数的测量。

首先,使用荧光显微镜获取荧光标记的细胞质膜蛋白质的高帧频的图像序列。然后,感兴趣区域(ROI)避免细胞内细胞器,移动囊泡或凸膜区域的区域被选中。投资回报率堆栈被导入到一​​个可以自由使用的代码和几个定义的参数(见方法部分)是为KICS分析设置。然后程序会生成一个情节从k空间时间相关函数“的坡坡”,而扩散系数是从该曲线的斜率计算。下面是一步一步的KICS程序使用肾水通道蛋白-3标有绿色荧光蛋白作为一个典型的例子来衡量一个膜蛋白的扩散系数。

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