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Biology

Saccharomyces cerevisiae श्वसन और Fermentative चयापचय का विश्लेषण करने के लिए बैच संस्कृति में घातीय वृद्धि कैनेटीक्स

Published: September 30th, 2018

DOI:

10.3791/58192

1Department of Chemistry, Universidad Autónoma de Querétaro, 2Department of Biochemical Engineering, Instituto Tecnológico de Morelia, 3Department of Biochemical Engineering, Instituto Tecnológico Superior de Ciudad Hidalgo

यहां हम एक प्रोटोकॉल वर्तमान घातीय वृद्धि समीकरण को Saccharomyces cerevisiae की घातीय वृद्धि फिटिंग द्वारा श्वसन और fermentative चयापचय का अनुमान है । काइनेटिक मापदंडों की गणना किण्वन या mitochondrial श्वसन पर पदार्थों/यौगिकों के प्रभाव की स्क्रीनिंग के लिए अनुमति देता है ।

घातीय चरण में Saccharomyces cerevisiae कोशिकाओं किण्वन और/या mitochondrial श्वसन के माध्यम से एटीपी उत्पादन द्वारा उनके विकास को बनाए रखने । किण्वन कार्बन एकाग्रता मुख्य रूप से नियंत्रित करता है कि कैसे खमीर कोशिकाओं एटीपी उत्पंन; इस प्रकार, किण्वन कार्बोहाइड्रेट के स्तर में भिंनता एस cerevisiaeके ऊर्जावान चयापचय ड्राइव । यह कागज एक उच्च प्रवाह घातीय खमीर विकास के आधार पर विधि का वर्णन करने के लिए एकाग्रता में परिवर्तन और श्वसन और fermentative चयापचय पर कार्बन स्रोत की प्रकृति के प्रभाव का अनुमान है । एस cerevisiae की वृद्धि एक microplate में मापा जाता है या ६०० एनएम पर ऑप्टिकल घनत्व (आयुध डिपो) का निर्धारण करके एक शंकु कुप्पी हिल । फिर, एक वृद्धि वक्र आयुध डिपो बनाम समय है, जो पहचान और घातीय चरण के चयन की अनुमति देता है की साजिश रचने के द्वारा बनाया गया है, और काइनेटिक मापदंडों प्राप्त करने के लिए घातीय वृद्धि समीकरण के साथ फिट है । उच्च दोहरीकरण समय के साथ कम विशिष्ट विकास दर आम तौर पर एक श्वसन विकास का प्रतिनिधित्व करते हैं । इसके विपरीत, कम दोहरीकरण समय के साथ उच्च विशिष्ट विकास दर fermentative वृद्धि का संकेत है । समय और विशिष्ट वृद्धि दर दोहरीकरण के दहलीज मूल्यों इस तरह के गैर-किण्वित कार्बन स्रोतों या किण्वित शर्करा की उच्च सांद्रता के रूप में अच्छी तरह से ज्ञात श्वसन या fermentative शर्तों, का उपयोग कर का अनुमान है । यह प्रत्येक विशिष्ट तनाव के लिए प्राप्त की है । अंत में, परिकलित काइनेटिक मापदंडों दहलीज मूल्यों के साथ तुलना कर रहे हैं स्थापित करने के लिए कि क्या खमीर से पता चलता है fermentative और/या श्वसन विकास. इस विधि का लाभ एक पदार्थ के प्रभाव को समझने के लिए अपने रिश्तेदार सादगी fermentative या श्वसन चयापचय पर यौगिक/ यह महत्वपूर्ण है कि विकास को उजागर करने के लिए एक जटिल और जटिल जैविक प्रक्रिया है; इसलिए, इस विधि से प्रारंभिक डेटा ऑक्सीजन की खपत और किण्वन शोधकार्य के संचय के ठहराव द्वारा पुष्टि किया जाना चाहिए । इस तरह, इस तकनीक यौगिकों की एक प्रारंभिक स्क्रीनिंग के रूप में इस्तेमाल किया जा सकता/पदार्थ है कि परेशान या fermentative या श्वसन चयापचय में वृद्धि हो सकती है ।

Saccharomyces cerevisiae वृद्धि शारीरिक और आणविक तंत्र के दर्जनों की पहचान करने के लिए एक महत्वपूर्ण उपकरण के रूप में सेवा की है । विकास मुख्य रूप से तीन तरीकों से मापा जाता है: स्पॉट परीक्षण के लिए सीरियल कमजोर पड़ने, कॉलोनी बनाने इकाई गिनती, और विकास घटता. इन तकनीकों को अकेले या संयोजन में सब्सट्रेट, पर्यावरणीय स्थितियों, म्यूटेंट, और रसायनों की एक किस्म के साथ विशिष्ट प्रतिक्रियाओं या phenotypes की जांच करने के लिए इस्तेमाल किया जा सकता है ।

Mitochondrial श्वसन एक जैविक प्रक्रिया है जिसमें वृद्धि कैनेटीक्स सफलतापूर्वक अज्ञात तंत्र की खोज के लिए लागू किया गया है । इस मामले में, ग्लिसरॉल, स्तनपान, या इथेनॉल के रूप में गैर-किण्वन क....

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इस परियोजना को Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (अनुदान संख्या २९३९४०) और Fundación TELMEX-TELCEL (अनुदान संख्या १६२००५५८५), दोनों को IKOM के अनुदान द्वारा समर्थित किया गया था.

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NameCompanyCatalog NumberComments
Orbital ShakerThermo Scientific4353For inoculum incubation or conical fask cultures
Bioscreen Growth curvesC MBRFor batch cultures in microplates
GlucoseSigma G7021For YPD broth preparation
Peptone from casein, enzymatic digestSigma 82303For YPD broth preparation
Yeast extractSigma 09182-1KG-FFor YPD broth preparation
Bacteriological AgarSigma A5306For YPD agar preparation
NaH2PO4Sigma S8282For SC broth preparation
(NH4)2SO4Sigma A4418For SC broth preparation
Yeast nitrogen base without amino acids and ammonium sulfateSigma Y1251For SC broth preparation
Yeast synthetic drop-Out medium supplementsSigma Y1501For SC broth preparation
Ammonium sulfate granularJ.T. Baker0792-RFor medium supplementation example
ResveratrolSigma R5010For medium supplementation example
GalactoseSigma G8270For medium supplementation example
SucroseSigma S7903For medium supplementation example
Absolut ethanolMerck107017For medium supplementation example
GlycerolJ.T. Baker2136-01For medium supplementation example
GraphPad PrismGraphPad SoftwareFor data analysis
Honeycomb microplatesThermo Scientific9502550For microplate cultures

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