Design og syntese af en omkonfigurerbare DNA harmonika Rack

DNA nanostrukturer-baserede mekaniske systemer eller DNA nanomaskiner, der producerer komplekse nanoskala bevægelse i 2D og 3D i nanometer ångström beslutning, viser stort potentiale inden for forskellige områder af nanoteknologi som de molekylære reaktorer, medicinafgivelse, og nanoplasmonic systemer. Den omkonfigurerbare DNA harmonika rack, som kan kollektivt manipulere en 2D eller 3D nanoskala netværk af elementer, i flere stadier i svar til DNA input, er beskrevet. Platformen har potentiale til at øge antallet af elementer, der DNA nanomaskiner kan styre fra et par elementer til en netværk skala med flere faser af omkonfiguration.

I denne protokol beskriver vi hele eksperimentelle processen med omkonfigurerbare DNA harmonika rack af 6 af 6 masker. Protokollen indeholder en design regel og simulation procedure af strukturerne og en våd-lab eksperiment for syntese og rekonfiguration. Derudover er analyse af strukturen ved hjælp af TEM (transmissions elektron mikroskopi) og FRET (Fluorescens resonans energioverførsel) medtaget i protokollen. De nye design og simulering metoder er omfattet af denne protokol vil hjælpe forskere at bruge DNA harmonika rack for yderligere programmer.