En mikro-CT-basert metode for å karakterisere lesjoner og finne elektrodene i små dyr hjernen

Lesjonen og elektroden plassering bekreftelse er tradisjonelt gjort via histologiske undersøkelse av farget hjernen skiver, en tidkrevende prosedyre som krever manuell beregning. Her beskriver vi en enkel, grei metode for kvantifisere lesjoner og finne elektrodene i hjernen som er mindre arbeidskrevende og gir mer detaljerte resultater. Hele hjernen er farget med osmium tetroxide, innebygd i harpiks og fotografert med en mikro-CT skanner. Skanner føre 3D digitale mengder hjernen med resolusjoner og virtuelle delen tykkelser avhengig av utvalgsstørrelsen (12-15 og 5 – 6 µm per voxel rotte og zebra finch hjerner, henholdsvis). Overflate og dyp lesjoner kan være preget og single tetrodes, sperrende matriser, elektrolytisk lesjoner og silisium sonder kan også være lokalisert. Gratis og proprietær programvare kan forskere å undersøke eksempel volumet fra flyet og segmentet volumet manuelt eller automatisk. Fordi denne metoden genererer hele hjernen volum, kan lesjoner og elektroder kvantifiseres i mye større grad enn i gjeldende metoder, som vil hjelpe standardisere sammenligninger innen og over studier.