En mikro-CT-baserad metod för att karaktärisera lesioner och placera elektroderna i små djurs hjärnor

Lesion och elektroden läge verifiering görs traditionellt via Histologisk undersökning av färgade hjärnan skivor, en tidskrävande procedur som kräver manuell uppskattning. Här, beskriver vi en enkel metod för att kvantifiera lesioner och placera elektroder i hjärnan som är mindre arbetskrävande och ger mer detaljerade resultat. Hela hjärnan är fläckade osmium vanligtvis, inbäddade i harts och avbildas med en mikro-CT-skanner. Skanningar resultera i 3D digital volymer av hjärnor med resolutioner och virtuella snittjocklekar beroende av urvalets storlek (12 – 15 och 5 – 6 µm per voxel för råtta och zebra Fink hjärna, respektive). Yta och djup lesioner kan karakteriseras, och enda tetrodes, tetrod matriser, elektrolytiska lesioner, och kisel sonder kan också lokaliseras. Gratis och egenutvecklade programvara tillåter praktiker att undersöka provvolymen från planet och segmentet volymen manuellt eller automatiskt. Eftersom denna metod genererar hela hjärnvolym, kan lesioner och elektroder kvantifieras i mycket högre grad än i nuvarande metoder, som hjälper dig att standardisera jämförelser inom och mellan studier.