Evaluatie van colorectale kanker risico en prevalentie door ontlasting DNA Integriteit Detectie

De gepresenteerde diagnostische FL-DNA kit is een tijdbesparende en gebruiksvriendelijke methode om de betrouwbare waarschijnlijkheid van de aanwezigheid van colorectale kankerlaesies te bepalen.

Tegenwoordig kan ontlasting DNA worden geïsoleerd en geanalyseerd door verschillende methoden. De lange fragmenten van DNA in ontlasting kunnen worden gedetecteerd door een qPCR-test, die een betrouwbare waarschijnlijkheid biedt van de aanwezigheid van pre-neoplastische of neoplastische colorectale laesies. Deze methode, genaamd fluorescentie lang DNA (FL-DNA), is een snelle, niet-invasieve procedure die een verbetering is ten opzichte van het primaire preventiesysteem. Deze methode is gebaseerd op de evaluatie van fecale DNA-integriteit door kwantitatieve versterking van specifieke doelen van genomisch DNA. Met name de evaluatie van DNA-fragmenten langer dan 200 bp maakt detectie van patiënten met colorectale laesies met een zeer hoge specificiteit mogelijk. Dit systeem en alle momenteel beschikbare dna-tests met ontlasting geven echter een aantal algemene problemen die moeten worden aangepakt (bijvoorbeeld de frequentie waarop tests moeten worden uitgevoerd en een optimaal aantal ontlastingsmonsters die op elk tijdstip voor elk individu worden verzameld). Het belangrijkste voordeel van FL-DNA is echter de mogelijkheid om het te gebruiken in combinatie met een test die momenteel wordt gebruikt in het CRC-screeningprogramma, bekend als de immunochemische fecale occulte bloedtest (iFOBT). Beide tests kunnen namelijk op hetzelfde monster worden uitgevoerd, waardoor de kosten worden verlaagd en een betere voorspelling wordt gedaan van de uiteindelijke aanwezigheid van colorectale laesies.

Colorectale kanker (CRC) is afgeleid van een multi-step proces waarbij gezond epitheel zich langzaam ontwikkelt tot adenomen of poliepen, die in de loop van de tijd uitgroeien tot kwaadaardige carcinomen^1,2. Ondanks het hoge incidentiepercentage van CRC is er de afgelopen^tienjaar een neerwaartse trend in het percentage sterfgevallen waargenomen . Inderdaad, vroege diagnostische instrumenten die in screeningsprogramma's zijn aangenomen, hebben geleid tot vroegtijdige opsporing en verwijdering van pre-neoplastische adenomen of poliepen⁴. Echter, vanwege de verschil....

Tussen 2013 en 2015 werden patiënten aangeworven bij de Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) van Meldola (FC, Italië). Ingeschreven patiënten waren opgenomen in protocol IRSTB002, goedgekeurd door de Ethische Commissie van IRST - IRCCS AVR (25/10/2012, ver. 1). Alle methoden werden uitgevoerd in overeenstemming met relevante richtlijnen en voorschriften. Schriftelijke geïnformeerde toestemming werd verkregen van alle patiënten.

1. DNA-extractie uit ontlas.......

De werkstroom van dit protocol wordt weergegeven in figuur 1. De werkstroom biedt twee controlestappen en verschillende acties op basis van deze stapresultaten. Ten eerste, als een monster ongeschikte besturingselementen bevat, moet de versterking worden herhaald. Ten tweede, als de versterking wordt geremd, moet het monster vanaf het begin worden herverwerkt of als niet waardevol worden geclassificeerd.

Figuur 2 toont de fluorescentiecurven die worden geprodu.......

Eerdere studies hebben aangetoond dat DNA-integriteitsanalyse van ontlasting die wordt geëxtraheerd door handmatige en semi-automatische benaderingen een alternatief instrument kan zijn voor de vroegtijdige detectie van colorectale laesies^{7,8,9,10,11,12}. Moleculaire, niet-invasieve screening tests zijn ontwikkeld door de jar.......

De auteurs hebben geen erkenningen.