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Cancer Research

स्टूल डीएनए इंटीग्रिटी डिटेक्शन द्वारा कोलोरेक्टल कैंसर जोखिम और व्यापकता का मूल्यांकन

Published: June 8th, 2020

DOI:

10.3791/59426

1Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) IRCCS, Meldola, Italy, 2Diatech Pharmacogenetics srl

ERRATUM NOTICE

Important: There has been an erratum issued for this article. Read more …

प्रस्तुत नैदानिक FL-डीएनए किट कोलोरेक्टल कैंसर घावों की उपस्थिति की विश्वसनीय संभावना निर्धारित करने के लिए एक समय की बचत और उपयोगकर्ता के अनुकूल विधि है।

आजकल, मल डीएनए अलग और कई तरीकों से विश्लेषण किया जा सकता है । मल में डीएनए के लंबे टुकड़ों का पता क्यूपीसीआर परख द्वारा लगाया जा सकता है, जो पूर्व-नियोप्लास्टिक या नियोप्लास्टिक कोलोरेक्टल घावों की उपस्थिति की विश्वसनीय संभावना प्रदान करता है। फ्लोरेसेंस लांग डीएनए (FL-DNA) नामक यह विधि एक तेज, गैर-आक्रामक प्रक्रिया है जो प्राथमिक रोकथाम प्रणाली पर सुधार है। यह विधि जीनोमिक डीएनए के विशिष्ट लक्ष्यों के मात्रात्मक प्रवर्धन द्वारा मल डीएनए अखंडता के मूल्यांकन पर आधारित है। विशेष रूप से, 200 बीपी से अधिक समय तक डीएनए टुकड़ों का मूल्यांकन बहुत उच्च विशिष्टता वाले कोलोरेक्टल घावों वाले रोगियों का पता लगाने की अनुमति देता है। हालांकि, यह प्रणाली और वर्तमान में उपलब्ध सभी मल डीएनए परीक्षण कुछ सामान्य मुद्दों को प्रस्तुत करते हैं जिन्हें संबोधित करने की आवश्यकता होती है (उदाहरण के लिए, जिस आवृत्ति पर परीक्षण किए जाने चाहिए और प्रत्येक व्यक्ति के लिए प्रत्येक समय बिंदु पर एकत्र किए गए मल नमूनों की इष्टतम संख्या)। हालांकि, FL-डीएनए का मुख्य लाभ वर्तमान में सीआरसी स्क्रीनिंग कार्यक्रम में उपयोग किए जाने वाले परीक्षण के सहयोग से इसका उपयोग करने की संभावना है, जिसे इम्यूनोकेमिकल-आधारित मल मनोगत रक्त परीक्षण (आईएफओबीटी) के रूप में जाना जाता है। दरअसल, दोनों परीक्षण एक ही नमूने पर किए जा सकते हैं, लागत को कम करने और कोलोरेक्टल घावों की अंतिम उपस्थिति की बेहतर भविष्यवाणी प्राप्त कर सकते हैं।

कोलोरेक्टल कैंसर (सीआरसी) एक बहु-चरण प्रक्रिया से प्राप्त होता है जिसमें स्वस्थ एपिथेलियम धीरे-धीरे एडेनोमा या जंतु में विकसित होता है, जो समय1,,2के साथ घातक कार्सिनोमा में प्रगति करता है। सीआरसी की उच्च घटना दर के बावजूद, पिछले3दशक में मौतों के प्रतिशत में गिरावट देखी गई है । दरअसल, स्क्रीनिंग कार्यक्रमों में अपनाए गए प्रारंभिक नैदानिक उपकरणों के कारण पूर्व-नियोप्लास्टिक एडेनोमा या जंतु4का जल्दी पता लगाया गया है। हालांकि, विभिन्न तकनीकी सीमाओं के कारण, इनमें से कोई भी तरीका इष्टतम नहीं है। दरअसल, संवेदनशीलता और विशिष्टता में सुधार करने के लिए, कई मल डीएनए परीक्ष....

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२०१३ और २०१५ के बीच मेलडोला (एफसी, इटली) के इस्टिटो साइंटिफिकरो रोमाग्नोलो प्रति लो स्टूडियो ई ला कुरा देई ट्यूमरी (आईआरएसटी) में मरीजों को भर्ती किया गया । नामांकित रोगियों प्रोटोकॉल IRSTB002 में थे, IRST की नै?.......

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इस प्रोटोकॉल का कार्यप्रवाह चित्र 1में दिखाया गया है । कार्यप्रवाह इन चरण परिणामों के अनुसार दो नियंत्रण चरण और विभिन्न कार्य प्रदान करता है। सबसे पहले, यदि कोई नमूना अनुपयुक्त नियंत्रण प्रस्त?.......

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पिछले अध्ययनों से पता चला है कि मैनुअल और अर्ध - स्वचालित दृष्टिकोणों द्वारा निकाले गए मल का डीएनए अखंडता विश्लेषण कोलोरेक्टलघावों 7,8,9,109,,11

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लेखकों को कोई पावती नहीं है ।

....

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NameCompanyCatalog NumberComments
1.5 mL and 2 mL polypropylene twist-lock tubes (DNase-, RNase-, DNA-, PCR inhibitor-free)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Absolute Ethanol (quality of analytical degree)Reagent required for DNA extraction
Benchtop centrifuge Maximum speed of 20000 x g. Instrument required for DNA extraction
EasyPGX analysis software version 2.0.0Diatech PharmacogeneticsRT800-SWAnalysis software 
EasyPGX centrifuge/vortex 8-well stripsDiatech PharmacogeneticsRT803Instrument recommended for the Real Time PCR assay
EasyPGX qPCR instrument 96 Diatech PharmacogeneticsRT800-96Instrument recommended for the Real Time PCR assay
EasyPGX ready FL-DNADiatech PharmacogeneticsRT029Kit required for the Real Time PCR assay
Micropipettes (volumes from 1 to 1.000 µL)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Powder-free disposable glovesConsumables required for DNA extraction and Real Time PCR
QIAamp Fast DNA StoolQiagen51604Kit recommended for the DNA extraction and purification from stool
Sterile filter tips DNase-, RNase-free (volumes from 1 to 1.000 µL)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Thermal block e.g. EasyPGX dry blockDiatech PharmacogeneticsRT801Instrument required for DNA extraction
Vortex e.g. EasyPGX centrifuge/vortex 1.5 ml Diatech PharmacogeneticsRT802Instrument required for DNA extraction

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Erratum

Erratum: Evaluation of Colorectal Cancer Risk and Prevalence by Stool DNA Integrity Detection

An erratum was issued for: Evaluation of Colorectal Cancer Risk and Prevalence by Stool DNA Integrity Detection. An affiliation was updated.

The first affiliation was updated from:

Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST)

to:

Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) IRCCS, Meldola, Italy

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