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Cancer Research

便DNA完全性検出による大腸癌リスクと罹患率の評価

Published: June 8th, 2020

DOI:

10.3791/59426

1Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) IRCCS, Meldola, Italy, 2Diatech Pharmacogenetics srl

ERRATUM NOTICE

Important: There has been an erratum issued for this article. Read more …

提示された診断FL-DNAキットは、大腸癌病変の存在の信頼性の高い確率を決定するための時間を節約し、ユーザーフレンドリーな方法です。

今日では、便DNAは、いくつかの方法で単離し、分析することができます。便中のDNAの長い断片は、前腫瘍性または腫瘍性大腸病変の存在の信頼性の高い確率を提供するqPCRアッセイによって検出することができる。この方法は、蛍光長いDNA(FL-DNA)と呼ばれ、一次予防システム上の改善である迅速で非侵襲的な手順です。この方法は、ゲノムDNAの特異的標的の定量増幅による、便DNA完全性の評価に基づいている。特に、200bpを超えるDNA断片の評価は、非常に高い特異性を有する大腸病変患者の検出を可能にする。しかし、このシステムおよび現在利用可能なすべての便DNA検査は、対処する必要があるいくつかの一般的な問題を提示する(例えば、検査を行う頻度と各個人の各時点で収集された便サンプルの最適な数)。しかし、FL-DNAの主な利点は、免疫化学ベースの便潜血症血液検査(iFOBT)として知られているCRCスクリーニングプログラムで現在使用されている試験と関連してそれを使用する可能性である。実際、両方のテストは、コストを削減し、大腸病変の最終的な存在のより良い予測を達成し、同じサンプルで実行することができます。

大腸癌(CRC)は、健康な上皮がゆっくりと腺腫またはポリープに発達する多段階のプロセスから派生し、経時的に悪性癌に進行する11,2。2CRCの高い発生率にもかかわらず、過去10年間で死亡率の低下傾向が観察されました3.実際、スクリーニングプログラムで採用された早期診断ツールは、腫瘍前の腺腫またはポリープの早期発見と除去につながっている4.ただし、技術的な制限が異なるために、これらの方法のどれも最適ではありません。実際、感度と特異性を改善するために、多くの便DNA検査が単独で、または現在のルーチン診断検査55,66と組み合わせて提案されている。

典型的には、健康な粘膜は、アポトーシス大腸細胞の便流に流れ込むが、一方、病気の粘膜は非アポトーシス大腸細胞を剥離する。200bp以上の長さの断片は、非アポトーシスDNAを特徴付ける。このDNAは、ロングDNA(L-DNA)と呼ばれ、CRC早期診断に利用できるバイオマーカーとなっています。L-DNAは便標本から単離し、体外,診断FL-DNA,キット

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患者は、2013年から2015年の間にメルドラ(FC、イタリア)のロスタジオeラキュラデイ腫瘍(IRST)あたりイストティトゥエティフィティノロロで募集されました。登録された患者は、IRST - IRCCS AVRの倫理委員会によって承認されたプロトコルIRSTB002に入った(25/10/2012、ver.すべての方法は、関連するガイドラインと規制に従って行われました。書面によるインフォームド・コンセントは、すべての患者か.......

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このプロトコルのワークフローを図 1に示します。ワークフローには、2 つの制御ステップと、これらのステップの結果に応じた異なるアクションが用意されています。まず、サンプルが不適切なコントロールを提示する場合、増幅を繰り返す必要があります。第二に、増幅が阻害された場合、サンプルは最初から再処理されるか、または価値がないものとして分類されなければ?.......

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これまでの研究では、手動および半自動アプローチによって抽出された便のDNA完全性分析は、大腸病,,,7、8、9、10、11、128,9の早期発見のための代替ツールを表すことができることが実証されている。7101112分子的、非侵襲的なスクリーニング?.......

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著者は謝辞を持っていません。

....

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NameCompanyCatalog NumberComments
1.5 mL and 2 mL polypropylene twist-lock tubes (DNase-, RNase-, DNA-, PCR inhibitor-free)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Absolute Ethanol (quality of analytical degree)Reagent required for DNA extraction
Benchtop centrifuge Maximum speed of 20000 x g. Instrument required for DNA extraction
EasyPGX analysis software version 2.0.0Diatech PharmacogeneticsRT800-SWAnalysis software 
EasyPGX centrifuge/vortex 8-well stripsDiatech PharmacogeneticsRT803Instrument recommended for the Real Time PCR assay
EasyPGX qPCR instrument 96 Diatech PharmacogeneticsRT800-96Instrument recommended for the Real Time PCR assay
EasyPGX ready FL-DNADiatech PharmacogeneticsRT029Kit required for the Real Time PCR assay
Micropipettes (volumes from 1 to 1.000 µL)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Powder-free disposable glovesConsumables required for DNA extraction and Real Time PCR
QIAamp Fast DNA StoolQiagen51604Kit recommended for the DNA extraction and purification from stool
Sterile filter tips DNase-, RNase-free (volumes from 1 to 1.000 µL)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Thermal block e.g. EasyPGX dry blockDiatech PharmacogeneticsRT801Instrument required for DNA extraction
Vortex e.g. EasyPGX centrifuge/vortex 1.5 ml Diatech PharmacogeneticsRT802Instrument required for DNA extraction

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Erratum

Erratum: Evaluation of Colorectal Cancer Risk and Prevalence by Stool DNA Integrity Detection

An erratum was issued for: Evaluation of Colorectal Cancer Risk and Prevalence by Stool DNA Integrity Detection. An affiliation was updated.

The first affiliation was updated from:

Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST)

to:

Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) IRCCS, Meldola, Italy

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