Summary
Abstract
Introduction
Protocol
Representative Results
Discussion
Acknowledgements
Materials
References
Cancer Research
ERRATUM NOTICE
Important: There has been an erratum issued for this article. Read more …Представленный диагностический комплект FL-DNA является экономичным и удобным для пользователя методом определения надежной вероятности наличия колоректального рака.
В настоящее время ДНК стула может быть изолирована и проанализирована несколькими методами. Длинные фрагменты ДНК в стуле могут быть обнаружены с помощью анализа qPCR, который обеспечивает надежную вероятность наличия преднеопластических или неопластических колоректальных поражений. Этот метод, называемый флуоресценции долго ДНК (FL-ДНК), является быстрой, неинвазивной процедурой, которая является улучшением на первичной системы профилактики. Этот метод основан на оценке целостности фекальной ДНК путем количественного усиления конкретных целей геномной ДНК. В частности, оценка фрагментов ДНК длиной более 200 вт позволяет выявлять пациентов с колоректальными поражениями с очень высокой специфичностью. Тем не менее, эта система и все имеющиеся в настоящее время тесты ДНК стула представляют некоторые общие проблемы, которые необходимо решить (например, частота, с которой тесты должны быть проведены и оптимальное количество образцов стула, собранных в каждый момент для каждого человека). Тем не менее, основным преимуществом FL-ДНК является возможность использовать его в связи с тестом, который в настоящее время используется в программе скрининга CRC, известной как иммунохимический фекальный оккультный анализ крови (iFOBT). Действительно, оба теста могут быть выполнены на одной и той же выборке, что снижает затраты и достигает лучшего прогнозирования возможного присутствия колоректальных поражений.
Колоректальный рак (CRC) происходит от многоступенчатого процесса, в котором здоровый эпителий медленно развивается в аденомы или полипы, которые прогрессируют в злокачественные канциномы с течениемвремени 1,2. Несмотря на высокий уровень заболеваемости КРП, за последнее десятилетие наблюдается тенденция к снижению долисмертей. Действительно, ранние диагностические инструменты, принятые в программах скрининга, привели к раннему выявлению и удалению преднеопластических аденомы или полипов4. Однако из-за различных технических ограничений ни один из этих методов не ....
Пациенты были набраны в Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) из Meldola (FC, Италия) в период с 2013 по 2015 год. Зачисленные пациенты были в протокол IRSTB002, утвержденный Комитетом по этике IRST - IRCCS AVR (25/10/2012, ver. 1). Все методы осуществлялись в соответствии с соответствующими руководящими принципам?.......
Рабочий процесс этого протокола показан на рисунке 1. Рабочий процесс предоставляет два шага управления и различные действия в соответствии с результатами этих шагов. Во-первых, если образец представляет неподходящие элементы управления, усиление должно быть повторено. Во-вт?.......
Предыдущие исследования показали, что анализ целостности ДНК стула, извлеченный с помощью ручных и полуавтоматических подходов, может представлять собой альтернативный инструмент для раннего выявления колоректальных поражений7,,88,9,<.......
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5 mL and 2 mL polypropylene twist-lock tubes (DNase-, RNase-, DNA-, PCR inhibitor-free) | Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR | ||
Absolute Ethanol (quality of analytical degree) | Reagent required for DNA extraction | ||
Benchtop centrifuge | Maximum speed of 20000 x g. Instrument required for DNA extraction | ||
EasyPGX analysis software version 2.0.0 | Diatech Pharmacogenetics | RT800-SW | Analysis software |
EasyPGX centrifuge/vortex 8-well strips | Diatech Pharmacogenetics | RT803 | Instrument recommended for the Real Time PCR assay |
EasyPGX qPCR instrument 96 | Diatech Pharmacogenetics | RT800-96 | Instrument recommended for the Real Time PCR assay |
EasyPGX ready FL-DNA | Diatech Pharmacogenetics | RT029 | Kit required for the Real Time PCR assay |
Micropipettes (volumes from 1 to 1.000 µL) | Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR | ||
Powder-free disposable gloves | Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR | ||
QIAamp Fast DNA Stool | Qiagen | 51604 | Kit recommended for the DNA extraction and purification from stool |
Sterile filter tips DNase-, RNase-free (volumes from 1 to 1.000 µL) | Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR | ||
Thermal block e.g. EasyPGX dry block | Diatech Pharmacogenetics | RT801 | Instrument required for DNA extraction |
Vortex e.g. EasyPGX centrifuge/vortex 1.5 ml | Diatech Pharmacogenetics | RT802 | Instrument required for DNA extraction |
Erratum
Erratum: Evaluation of Colorectal Cancer Risk and Prevalence by Stool DNA Integrity DetectionAn erratum was issued for: Evaluation of Colorectal Cancer Risk and Prevalence by Stool DNA Integrity Detection. An affiliation was updated.
The first affiliation was updated from:
Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST)
to:
Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) IRCCS, Meldola, Italy
ABOUT JoVE
Copyright © 2024 MyJoVE Corporation. All rights reserved