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Cancer Research

Evaluación del riesgo y la prevalencia del cáncer colorrectal mediante la detección de la integridad del ADN de las heces

Published: June 8th, 2020

DOI:

10.3791/59426

1Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) IRCCS, Meldola, Italy, 2Diatech Pharmacogenetics srl

ERRATUM NOTICE

Important: There has been an erratum issued for this article. Read more …

El kit de diagnóstico de FL-DNA presentado es un método fácil de ahorrar tiempo y fácil de usar para determinar la probabilidad confiable de la presencia de lesiones por cáncer colorrectal.

Hoy en día, el ADN de las heces puede ser aislado y analizado por varios métodos. Los fragmentos largos de ADN en las heces pueden ser detectados por un ensayo qPCR, que proporciona una probabilidad confiable de la presencia de lesiones colorrectales pre-neoplásicas o neoplásicas. Este método, llamado ADN largo de fluorescencia (FL-DNA), es un procedimiento rápido y no invasivo que mejora el sistema de prevención primaria. Este método se basa en la evaluación de la integridad del ADN fecal mediante la amplificación cuantitativa de objetivos específicos del ADN genómico. En particular, la evaluación de fragmentos de ADN de más de 200 bp permite la detección de pacientes con lesiones colorrectales con muy alta especificidad. Sin embargo, este sistema y todas las pruebas de ADN de heces disponibles actualmente presentan algunas cuestiones generales que deben abordarse (por ejemplo, la frecuencia con la que se deben llevar a cabo las pruebas y el número óptimo de muestras de heces recogidas en cada punto de tiempo para cada individuo). Sin embargo, la principal ventaja de FL-DNA es la posibilidad de utilizarlo en asociación con una prueba utilizada actualmente en el programa de cribado de CRC, conocido como análisis de sangre oculta en heces basada en inmunoquímicos (iFOBT). De hecho, ambas pruebas se pueden realizar en la misma muestra, reduciendo los costos y logrando una mejor predicción de la presencia final de lesiones colorrectales.

El cáncer colorrectal (CRC) deriva de un proceso de varios pasos en el que el epitelio sano se convierte lentamente en adenomas o pólipos, que progresan en carcinomas malignos con el tiempo1,,2. A pesar de la alta tasa de incidencia de la CRC, se ha observado una tendencia a la baja en el porcentaje de muertes en la última década3. De hecho, las herramientas de diagnóstico temprano adoptadas en los programas de cribado han llevado a la detección y eliminación temprana de adenomas pre-neoplásicos o pólipos4. Sin embargo, debido a los diferentes límites técnicos, n....

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Los pacientes fueron reclutados en el Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) de Meldola (FC, Italia) entre 2013 y 2015. Los pacientes inscritos estaban en el protocolo IRSTB002, aprobado por el Comité de ética del IRST - IRCCS AVR (25/10/2012, ver. 1). Todos los métodos se realizaron de acuerdo con las directrices y regulaciones pertinentes. Se obtuvo el consentimiento informado por escrito de todos los pacientes.

1. Extracción de ADN de heces

  1. Ut.......

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El flujo de trabajo de este protocolo se muestra en la figura 1. El flujo de trabajo proporciona dos pasos de control y acciones diferentes según estos resultados de paso. En primer lugar, si una muestra presenta controles inadecuados, la amplificación debe repetirse. En segundo lugar, si se inhibe la amplificación, la muestra debe ser reprocesada desde el principio o clasificada como no valiosa.

La Figura 2 muestra las curvas de fluorescencia producidas po.......

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Estudios anteriores han demostrado que el análisis de la integridad del ADN de las heces extraídas por enfoques manuales y semiautomáticos puede representar una herramienta alternativa para la detección temprana de lesiones colorrectales7,8,9,10,11,12. A lo largo de los años se han desarrollado pruebas de detección mole.......

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Los autores no tienen reconocimientos.

....

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NameCompanyCatalog NumberComments
1.5 mL and 2 mL polypropylene twist-lock tubes (DNase-, RNase-, DNA-, PCR inhibitor-free)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Absolute Ethanol (quality of analytical degree)Reagent required for DNA extraction
Benchtop centrifuge Maximum speed of 20000 x g. Instrument required for DNA extraction
EasyPGX analysis software version 2.0.0Diatech PharmacogeneticsRT800-SWAnalysis software 
EasyPGX centrifuge/vortex 8-well stripsDiatech PharmacogeneticsRT803Instrument recommended for the Real Time PCR assay
EasyPGX qPCR instrument 96 Diatech PharmacogeneticsRT800-96Instrument recommended for the Real Time PCR assay
EasyPGX ready FL-DNADiatech PharmacogeneticsRT029Kit required for the Real Time PCR assay
Micropipettes (volumes from 1 to 1.000 µL)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Powder-free disposable glovesConsumables required for DNA extraction and Real Time PCR
QIAamp Fast DNA StoolQiagen51604Kit recommended for the DNA extraction and purification from stool
Sterile filter tips DNase-, RNase-free (volumes from 1 to 1.000 µL)Consumables required for DNA extraction and Real Time PCR
Thermal block e.g. EasyPGX dry blockDiatech PharmacogeneticsRT801Instrument required for DNA extraction
Vortex e.g. EasyPGX centrifuge/vortex 1.5 ml Diatech PharmacogeneticsRT802Instrument required for DNA extraction

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Erratum

Erratum: Evaluation of Colorectal Cancer Risk and Prevalence by Stool DNA Integrity Detection

An erratum was issued for: Evaluation of Colorectal Cancer Risk and Prevalence by Stool DNA Integrity Detection. An affiliation was updated.

The first affiliation was updated from:

Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST)

to:

Istituto Scientifico Romagnolo per lo Studio e la Cura dei Tumori (IRST) IRCCS, Meldola, Italy

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