Summary
Abstract
Introduction
Protocol
Representative Results
Discussion
Acknowledgements
Materials
References
Biochemistry
双方向有糸分裂キネシン-5 Cin8は、運動性の間に分裂して融合するクラスターに蓄積する。クラスターへの蓄積は、Cin8の速度と方向性も変化させます。ここでは、精製Cin8−GFPを用いた運動性アッセイおよびCin8の単一分子およびクラスターの運動性特性の分析のためのプロトコルが記載されている。
有糸分裂バイポーラキネシン-5モーターは、スピンドルダイナミクスにおいて重要な機能を果たします。これらのモーターは、活性複合体の両端に位置する2対の触媒モータードメインを有するホモ四量体構造を示す。このユニークなアーキテクチャにより、キネシン-5モータは、逆平行スピンドル微小管(MT)を架橋してスライドさせることができ、スピンドルポールを分離する外向きの力を提供します。以前は、キネシン-5モーターはもっぱらプラスエンド指向であると考えられていました。しかし、最近の研究では、いくつかの真菌キネシン-5モーターがマイナス末端が単一分子レベルに向けられており、さまざまな実験条件下で方向性を切り替えることができることが明らかになりました。 サッカロミセス・セレビシエ・ キネシン−5 Cin8は、そのような双方向モータータンパク質の一例である:高イオン強度条件下では、Cin8の単一分子はMTのマイナス末端方向に移動する。また、Cin8は主にMTのマイナス端で運動性クラスターを形成し、そのようなクラスタリングはCin8が方向性を切り替え、ゆっくりとしたプラスエンド指向性を経験することを可能にすることも示された。この記事では、 S. cerevisiae 細胞におけるタンパク質過剰発現およびその精製から in vitro 単一分子運動性アッセイまで、GFPタグ付きキネシン-5 Cin8を使用するすべてのステップについて詳細なプロトコルを提供します。ここで説明する新しく開発された方法は、蛍光強度に基づいてCin8の単一分子とクラスターを区別するのに役立ちます。この方法は、Cin8の単一分子およびクラスターの運動性の別々の分析を可能にし、したがって、Cin8の運動性のクラスターサイズに対する依存性の特性評価を提供する。
真核細胞内の多数の運動性事象は、分子運動タンパク質の機能によって媒介される。これらのモーターは、細胞骨格フィラメント、アクチンフィラメント、および微小管(MT)に沿って移動し、ATP加水分解の化学エネルギーを細胞内の生物学的運動性を駆動するために必要な運動学的および機械的力に変換する。MTベースのS. cerevisiae Cin8は、双極性のホモ四量体キネシン-5モータータンパク質であり、スピンドルMTを架橋してスライドさせる1。Cin8は、有糸分裂中、紡錘体アセンブリ2,3,4および分裂後期5,6,7中の紡錘体伸長において、本質的な機能を果たす。これまで、Cin8は双方向モータであり、異なる実験条件下で方向性を切り替えることが実証されていました。例えば、高いイオン強度条件下では、単一のCin8モータはMTのマイナス端に向かって移動するが、クラスタでは、マルチモータMTグライダーアッセイでは、および反並列MT間では、Cin8モータは主にMTのプラス端に向かって移動する
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Adenine | FORMEDIUM | DOC0230 | |
ATP | Sigma | A7699 | |
Biotinylated-BSA | Sigma | A8549 | |
Casein | Sigma | C7078 | |
Catalase (C40) | Sigma | C40 | |
Creatine-Kinase | Sigma | C3755 | |
Dithiothreitol (DTT) | Sigma | D0632 | |
EDTA | Sigma | E5134 | |
EGTA | Sigma | E4378 | |
Fluorescence filter set for GFP | Chroma | 49002: ET-EGFP (FITC/Cy2) | |
Fluorescence filter set for Rhodamine | Chroma | 49004: ET-CY3/TRITC | |
Fluorescence inverted microscope | Zeiss | Axiovert 200M | |
Galactose | Tivan Biotech | GAL02 | |
Glucose | Sigma | G8270 | |
Glucose Oxidase | Sigma | G7141 | |
Glycerol | Sigma | G5516 | |
GlycylGlycine | Merck | G0674 | |
GMPCPP | Jana Bioscience | Nu-405L | |
GTB | Cytoskeleton | BST01-010 | |
GTP | Sigma | G8877 | |
Histidine | Duchefa Biochemie | H0710.0100 | |
ImageJ-FIJI software | https://imagej.net/plugins/trackmate/ | version 2.1.0/1.53c; Java 1.8.0_172 [64-bit] for Windows 10 | |
Imidazole | Sigma | I0125 | |
InstantBlue Coomassie Protein Stain | Abcam | ab119211 | |
Lens | Zeiss | 100x/1.4 oil DIC objective | |
Lysine | FORMEDIUM | DOC0161 | |
Magnesium Chloride | Sigma | M8266 | |
Methionine | Duchefa Biochemie | M0715.0100 | |
Neo | Andor Technologies | sCMOS camera | |
NeutraAvidin | Life | A2666 | |
Ni-NTA Agarose | Invitrogen | R901-15 | |
Phospho-Creatine | Sigma | P1937 | |
Pipes | Sigma | P1851 | |
Pluronic acid F-127 (poloxamer) | Sigma | P2443 | |
Potassium Chloride | Sigma | P9541 | |
Raffinose | Tivan Biotech | RAF01 | |
Size Exclusion chromatography instument | GE Healthcare | AKTA Pure | |
Spectrophotometer | ThermoFisher Scientific | NanoDrop | |
Superose-6 10/300 GL | GE Healthcare | 17-5172-01 | |
Tris | Roshe | 10708976001 | |
Triton X-100 | Sigma | T8787 | |
Tryptophan | Duchefa Biochemie | T0720.0100 | |
Tubulin protein | Cytoskeleton | T240 | |
Tubulin, biotinylated | Cytoskeleton | T333P | |
Tubulin, TRITC Rhodamine | Cytoskeleton | TL530M | |
Uracil | Sigma | U0750-100G | |
Yeast nitrogen base | FORMEDIUM | CYN0401S | |
α-GFP antibody | Santa Cruz Biotechnology | SC8036 | |
β-mercaptoethanol | Sigma | M3148 |
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