Summary
Abstract
Introduction
Protocol
Representative Results
Discussion
Acknowledgements
Materials
References
Biochemistry
A cinesinismo mitostática bi-direcional-5 Cin8 acumula-se em aglomerados que se dividem e se fundem durante sua motilidade. O acúmulo em clusters também altera a velocidade e a direcionalidade do Cin8. Aqui, é descrito um protocolo de ensaios de motilidade com Cin8-GFP purificado e análise de propriedades motile de moléculas únicas e aglomerados de Cin8.
Os motores de cinesina bipolar mitotítica-5 desempenham funções essenciais na dinâmica do fuso. Estes motores exibem uma estrutura homo-tetramérica com dois pares de domínios motores catalíticos, localizados em extremidades opostas do complexo ativo. Esta arquitetura única permite que os motores kinesin-5 cruzem e deslizem para além de microtúbulos de eixo antiparaol (MTs), fornecendo assim a força direcionada externamente que separa os polos do eixo. Anteriormente, acreditava-se que os motores kinesin-5 eram exclusivamente mais-end dirigidos. No entanto, estudos recentes revelaram que vários motores fúngicos de cinesina-5 são menos-finais direcionados ao nível de molécula única e podem mudar a direcionalidade em várias condições experimentais. O Saccharomyces cerevisiae kinesin-5 Cin8 é um exemplo de tal proteína motora bidirecional: em alta resistência iônica, moléculas únicas de Cin8 se movem na direção menos final dos MTs. Também foi demonstrado que o Cin8 forma clusters motile, predominantemente na extremidade inferior dos MTs, e tal agrupamento permite que Cin8 mude de direcionalidade e se submeta a motilidade direcionada lenta e plus-end. Este artigo fornece um protocolo detalhado para todas as etapas de trabalho com kinesin-5 Cin8 marcado por GFP, desde a superexpressão de proteínas em células S. cerevisiae e sua purificação até o ensaio de motilidade de molécula única in vitro . Um método recém-desenvolvido descrito aqui ajuda a diferenciar entre moléculas únicas e aglomerados de Cin8, com base em sua intensidade de fluorescência. Este método permite a análise separada da motilidade de moléculas únicas e aglomerados de Cin8, proporcionando assim a caracterização da dependência da motilidade Cin8 em seu tamanho de cluster.
Um grande número de eventos de motilidade dentro das células eucarióticas são mediados pela função das proteínas motoras moleculares. Esses motores se movem ao longo dos filamentos citoesqueléticos, filamentos de actin e microtúbulos (MTs), e convertem a energia química da hidrólise ATP em forças cinéticas e mecânicas necessárias para conduzir a motilidade biológica dentro das células. O S. cerevisiae Cin8, baseado em MT, é uma proteína motora bipolar, homotetrameric quinase-5 que cruza e desliza MTs de eixo1. O Cin8 executa funções essenciais durante a mitose, na montagem do eixo 2,3,4
1. Preparação de tampões e reagentes
O experimento tem como objetivo investigar as características de motilidade da proteína motora bidirecional Cin8 de diferentes tamanhos de cluster em MTs únicos. A motilidade representativa do Cin8-GFP também é evidente a partir dos kymographs na Figura 5A, onde a posição espacial do motor ao longo do tempo é mostrada.
Para a análise das propriedades motile do Cin8-GFP, primeiro, o tamanho do cluster é atribuído (etapa 4.3) a cada partícula cin8-GFP an.......
Neste trabalho, é apresentado um protocolo para ensaio de motilidade de molécula única com a cinesina bidirecional-5 Cin8 e a análise de motilidade. O Cin818 de comprimento completo, incluindo o sinal de localização nuclear nativa (NLS) no terminal C foi purificado do hospedeiro nativo S. cerevisiae. Como o Cin8 é uma proteína motora nuclear, moer as células S. cerevisiae sob nitrogênio líquido é considerado o método mais eficiente para a lise celular. Após a lise, .......
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Adenine | FORMEDIUM | DOC0230 | |
ATP | Sigma | A7699 | |
Biotinylated-BSA | Sigma | A8549 | |
Casein | Sigma | C7078 | |
Catalase (C40) | Sigma | C40 | |
Creatine-Kinase | Sigma | C3755 | |
Dithiothreitol (DTT) | Sigma | D0632 | |
EDTA | Sigma | E5134 | |
EGTA | Sigma | E4378 | |
Fluorescence filter set for GFP | Chroma | 49002: ET-EGFP (FITC/Cy2) | |
Fluorescence filter set for Rhodamine | Chroma | 49004: ET-CY3/TRITC | |
Fluorescence inverted microscope | Zeiss | Axiovert 200M | |
Galactose | Tivan Biotech | GAL02 | |
Glucose | Sigma | G8270 | |
Glucose Oxidase | Sigma | G7141 | |
Glycerol | Sigma | G5516 | |
GlycylGlycine | Merck | G0674 | |
GMPCPP | Jana Bioscience | Nu-405L | |
GTB | Cytoskeleton | BST01-010 | |
GTP | Sigma | G8877 | |
Histidine | Duchefa Biochemie | H0710.0100 | |
ImageJ-FIJI software | https://imagej.net/plugins/trackmate/ | version 2.1.0/1.53c; Java 1.8.0_172 [64-bit] for Windows 10 | |
Imidazole | Sigma | I0125 | |
InstantBlue Coomassie Protein Stain | Abcam | ab119211 | |
Lens | Zeiss | 100x/1.4 oil DIC objective | |
Lysine | FORMEDIUM | DOC0161 | |
Magnesium Chloride | Sigma | M8266 | |
Methionine | Duchefa Biochemie | M0715.0100 | |
Neo | Andor Technologies | sCMOS camera | |
NeutraAvidin | Life | A2666 | |
Ni-NTA Agarose | Invitrogen | R901-15 | |
Phospho-Creatine | Sigma | P1937 | |
Pipes | Sigma | P1851 | |
Pluronic acid F-127 (poloxamer) | Sigma | P2443 | |
Potassium Chloride | Sigma | P9541 | |
Raffinose | Tivan Biotech | RAF01 | |
Size Exclusion chromatography instument | GE Healthcare | AKTA Pure | |
Spectrophotometer | ThermoFisher Scientific | NanoDrop | |
Superose-6 10/300 GL | GE Healthcare | 17-5172-01 | |
Tris | Roshe | 10708976001 | |
Triton X-100 | Sigma | T8787 | |
Tryptophan | Duchefa Biochemie | T0720.0100 | |
Tubulin protein | Cytoskeleton | T240 | |
Tubulin, biotinylated | Cytoskeleton | T333P | |
Tubulin, TRITC Rhodamine | Cytoskeleton | TL530M | |
Uracil | Sigma | U0750-100G | |
Yeast nitrogen base | FORMEDIUM | CYN0401S | |
α-GFP antibody | Santa Cruz Biotechnology | SC8036 | |
β-mercaptoethanol | Sigma | M3148 |
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