Automatische Bildverarbeitung zur Bestimmung der Gemeinschaftsgrößenstruktur von Flussmakroinvertebraten

Die Körpergröße ist ein wichtiges funktionelles Merkmal, das als Bioindikator verwendet werden kann, um die Auswirkungen von Störungen in natürlichen Lebensgemeinschaften zu bewerten. Die Struktur der Gemeinschaftsgröße reagiert auf biotische und abiotische Gradienten, einschließlich anthropogener Störungen zwischen Taxa und Ökosystemen. Die manuelle Messung von kleinwüchsigen Organismen wie benthischen Makroinvertebraten (z.B. >500 μm bis wenige Zentimeter lang) ist jedoch zeitaufwendig. Um die Schätzung der Populationsgröße zu beschleunigen, haben wir hier ein Protokoll entwickelt, um die individuelle Körpergröße von konservierten Flussmakroinvertebraten halbautomatisch zu messen, die einer der am häufigsten verwendeten Bioindikatoren zur Beurteilung des ökologischen Zustands von Süßwasserökosystemen sind. Dieses Protokoll basiert auf einer bestehenden Methodik, die entwickelt wurde, um marines Mesozooplankton mit einem Scansystem für Wasserproben zu scannen. Das Protokoll besteht aus drei Hauptschritten: (1) Scannen von Teilproben (feine und grobe Probengrößenfraktionen) von Flussmakroinvertebraten und Verarbeitung der digitalisierten Bilder, um jedes detektierte Objekt in jedem Bild zu individualisieren; (2) Erstellen, Auswerten und Validieren eines Lernsets durch künstliche Intelligenz, um die einzelnen Bilder von Makroinvertebraten halbautomatisch von Detritus und Artefakten in den gescannten Proben zu trennen; und (3) die Darstellung der Größenstruktur der Makroinvertebratengemeinschaften. Neben dem Protokoll enthält diese Arbeit die Kalibrierungsergebnisse und listet mehrere Herausforderungen und Empfehlungen auf, um das Verfahren an Makroinvertebratenproben anzupassen und für weitere Verbesserungen in Betracht zu ziehen. Insgesamt unterstützen die Ergebnisse den Einsatz des vorgestellten Scanning-Systems für die automatische Körpergrößenmessung von Flussmakroinvertebraten und legen nahe, dass die Darstellung ihres Größenspektrums ein wertvolles Werkzeug für die schnelle Biobewertung von Süßwasserökosystemen ist.