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नदी के मैक्रोअकशेरुकी जीवों की सामुदायिक आकार संरचना निर्धारित करने के लिए स्वचालित छवि प्रसंस्करण

Published: January 13th, 2023

DOI:

10.3791/64320

1Center for the Study of Mediterranean Rivers (CERM), Universitat de Vic - Universitat Central de Catalunya, 2Laboratoire Evolution et Diversité Biologique (EDB), UMR5174, Université Toulouse 3 Paul Sabatier, Centre national de la recherche scientifique (CNRS), Institut de Recherche pour le Développement (IRD), 3Department of Marine Biology and Oceanography, Institut de Ciències del Mar, Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), 4Aquatic Ecology Group, Universitat de Vic - Universitat Central de Catalunya

शरीर का आकार एक महत्वपूर्ण कार्यात्मक विशेषता है जिसका उपयोग प्राकृतिक समुदायों में गड़बड़ी के प्रभावों का आकलन करने के लिए बायोइंडिकेटर के रूप में किया जा सकता है। समुदाय आकार संरचना जैविक और अजैविक ग्रेडिएंट्स का जवाब देती है, जिसमें टैक्सा और पारिस्थितिक तंत्र में मानवजनित गड़बड़ी शामिल है। हालांकि, छोटे शरीर वाले जीवों जैसे कि बेंटिक मैक्रोअकशेरुकी जीवों का मैनुअल माप (उदाहरण के लिए, >500 μm से कुछ सेंटीमीटर लंबा) समय लेने वाला है। सामुदायिक आकार संरचना के आकलन में तेजी लाने के लिए, यहां, हमने संरक्षित नदी मैक्रोअकशेरुकी जीवों के व्यक्तिगत शरीर के आकार को अर्ध-स्वचालित रूप से मापने के लिए एक प्रोटोकॉल विकसित किया है, जो मीठे पानी के पारिस्थितिक तंत्र की पारिस्थितिक स्थिति का आकलन करने के लिए सबसे अधिक उपयोग किए जाने वाले जैव संकेतकों में से एक है। यह प्रोटोकॉल पानी के नमूनों के लिए डिज़ाइन की गई स्कैनिंग प्रणाली के साथ समुद्री मेसोज़ोप्लांकटन को स्कैन करने के लिए विकसित एक मौजूदा पद्धति से अनुकूलित है। प्रोटोकॉल में तीन मुख्य चरण होते हैं: (1) नदी मैक्रोअकशेरुकी जीवों के सूक्ष्म (ठीक और मोटे नमूना आकार अंश) को स्कैन करना और प्रत्येक छवि में प्रत्येक पता लगाई गई वस्तु को अलग करने के लिए डिजिटल छवियों को संसाधित करना; (2) स्कैन किए गए नमूनों में डेट्रिटस और कलाकृतियों से मैक्रोअकशेरुकी की व्यक्तिगत छवियों को अर्ध-स्वचालित रूप से अलग करने के लिए कृत्रिम बुद्धि के माध्यम से एक सीखने के सेट का निर्माण, मूल्यांकन और सत्यापन करना; और (3) मैक्रोअकशेरुकी समुदायों की आकार संरचना को दर्शाता है। प्रोटोकॉल के अलावा, इस काम में अंशांकन परिणाम शामिल हैं और मैक्रोअकशेरुकी नमूनों के लिए प्रक्रिया को अनुकूलित करने और आगे के सुधारों पर विचार करने के लिए कई चुनौतियों और सिफारिशों की गणना करता है। कुल मिलाकर, परिणाम नदी मैक्रोअकशेरुकी जीवों के स्वचालित शरीर के आकार के माप के लिए प्रस्तुत स्कैनिंग सिस्टम के उपयोग का समर्थन करते हैं और सुझाव देते हैं कि उनके आकार स्पेक्ट्रम का चित्रण मीठे पानी के पारिस्थितिक तंत्र के तेजी से जैव मूल्यांकन के लिए एक मूल्यवान उपकरण है।

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