Sojabonen harige worteltransformatie voor de analyse van de genfunctie

Soja (Glycine max) is een waardevol gewas in de landbouw dat duizenden industriële toepassingen heeft. Sojawortels zijn de primaire plaats van interactie met bodemmicroben die symbiose vormen om stikstof en pathogenen te fixeren, waardoor onderzoek met sojawortelgenetica van het grootste belang is om de landbouwproductie te verbeteren. De genetische transformatie van sojabonen harige wortels (HRs) wordt gemedieerd door de Agrobacterium rhizogenes stam NCPPB2659 (K599) en is een efficiënt hulpmiddel voor het bestuderen van de genfunctie in sojawortels, die slechts 2 maanden van begin tot eind duurt. Hier bieden we een gedetailleerd protocol dat de methode schetst voor het overexpressie en het uitschakelen van een gen dat van belang is in HRs van sojabonen. Deze methodologie omvat sterilisatie van sojazaad, infectie van zaadlobben met K599 en de selectie en oogst van genetisch getransformeerde HRs voor RNA-isolatie en, indien gerechtvaardigd, metabolietanalyses. De doorvoer van de aanpak is voldoende om tegelijkertijd verschillende genen of netwerken te bestuderen en zou de optimale engineeringstrategieën kunnen bepalen voordat ze zich committeren aan stabiele transformatiebenaderingen op lange termijn.