Optogenetikexperiment med hög genomströmning i jäst med hjälp av den automatiserade plattformen Lustro

Optogenetik erbjuder exakt kontroll över cellulärt beteende genom att använda genetiskt kodade ljuskänsliga proteiner. Att optimera dessa system för att uppnå önskad funktionalitet kräver dock ofta flera design-build-test-cykler, vilket kan vara tidskrävande och arbetskrävande. För att möta denna utmaning har vi utvecklat Lustro, en plattform som kombinerar ljusstimulering med laboratorieautomation, vilket möjliggör effektiv screening och karakterisering av optogenetiska system med hög genomströmning.

Lustro använder en automatiserad arbetsstation utrustad med en belysningsanordning, en skakanordning och en plattläsare. Genom att använda en robotarm automatiserar Lustro förflyttningen av en mikrobrunnsplatta mellan dessa enheter, vilket möjliggör stimulering av optogenetiska stammar och mätning av deras svar. Detta protokoll ger en steg-för-steg-guide om hur man använder Lustro för att karakterisera optogenetiska system för kontroll av genuttryck i den spirande jästen Saccharomyces cerevisiae. Protokollet täcker installationen av Lustros komponenter, inklusive integrationen av belysningsenheten med automationsarbetsstationen. Den ger också detaljerade instruktioner för programmering av belysningsanordningen, plattläsaren och roboten, vilket säkerställer smidig drift och datainsamling under hela experimentprocessen.