Kwantitatieve polymerasekettingreactie (qPCR)-gebaseerde snelle diagnose van Helicobacter pylori-infectie en antibioticaresistentie

Helicobacter pylori is een belangrijke menselijke ziekteverwekker die ongeveer de helft van de wereldbevolking infecteert en een ernstige bedreiging voor de gezondheid wordt vanwege de toenemende antibioticaresistentie. Het is de veroorzaker van chronische actieve gastritis, maagzweren en maagkanker en is geclassificeerd als een groep I carcinogeen door het Internationaal Agentschap voor Kankeronderzoek. Daarom zijn de snelle en nauwkeurige diagnose van H. pylori en de bepaling van de antibioticaresistentie belangrijk voor de efficiënte uitroeiing van deze bacteriële ziekteverwekker. Momenteel omvatten de diagnosemethoden van H. pylori voornamelijk de ureumademtest (UBT), de antigeentest, de serumantilichaamtest, gastroscopie, de snelle ureasetest (RUT) en bacteriecultuur. Onder hen zijn de eerste drie detectiemethoden niet-invasief, wat betekent dat het eenvoudige tests zijn om uit te voeren. Bacteriën kunnen echter niet via deze technieken worden opgehaald; Het testen van resistentie tegen geneesmiddelen kan dus niet worden uitgevoerd. De laatste drie zijn invasieve onderzoeken, maar ze zijn duur, vereisen hoge vaardigheden en hebben het potentieel om schade aan patiënten te veroorzaken. Daarom is een niet-invasieve, snelle en gelijktijdige methode voor H. pylori-detectie en medicijnresistentietests erg belangrijk voor het efficiënt uitroeien van H. pylori in de klinische praktijk. Dit protocol heeft tot doel een specifieke procedure te presenteren met de stringtest in combinatie met kwantitatieve polymerasekettingreactie (qPCR) voor de snelle detectie van H. pylori-infectie en antibioticaresistentie. In tegenstelling tot bacterieculturen zorgt deze methode voor een eenvoudige, snelle, niet-invasieve diagnose van de H. pylori-infectiestatus en medicijnresistentie. Specifiek gebruikten we qPCR om rea te detecteren voor H. pylori-infectie en mutaties in de 23S-rRNA- en gyrA-genen , die coderen voor resistentie tegen respectievelijk claritromycine en levofloxacine. In vergelijking met routinematig gebruikte kweektechnieken biedt dit protocol een niet-invasieve, goedkope en tijdbesparende techniek om H. pylori-infectie te detecteren en de antibioticaresistentie te bepalen met behulp van qPCR.