Tümör Mikroçevresinin Mekansal İmmün Hücre Manzarasının Multipleks İmmünohistokimyasal Analizi

Tümör mikroçevresinin bağışıklık hücresi manzarası, potansiyel olarak prognostik ve öngörücü biyobelirteçlerin keşfi için bilgi içerir. Multipleks immünohistokimya, mekansal bilgilerini korurken tümör dokularındaki farklı bağışıklık hücresi türlerini görselleştirmek ve tanımlamak için değerli bir araçtır. Burada, doku kesitlerindeki lenfosit, miyeloid ve dendritik hücre popülasyonlarını analiz etmek için ayrıntılı protokoller sunuyoruz. Formalinle sabitlenmiş parafine gömülü bölümlerin kesilmesinden, otomatik bir platformda otomatik multipleks boyama prosedürlerine, slaytların multispektral görüntüleme mikroskobunda taranmasına ve şirket içinde geliştirilen bir makine öğrenimi algoritması olan ImmuNet kullanılarak görüntülerin analizine kadar. Bu protokoller, numunenin farklı bölmelerindeki (tümör ve invaziv sınır) bağışıklık hücrelerini analiz etmek ve en yakın komşu analizini uygulamak için tümör belirteçlerini basitçe değiştirerek çeşitli tümör örneklerine uygulanabilir. Bu analiz tümör örnekleriyle sınırlı değildir, aynı zamanda diğer (olmayan) patojenik dokulara da uygulanabilir. Son birkaç yılda ekipman ve iş akışında yapılan iyileştirmeler, üretim sürelerini önemli ölçüde kısalttı ve bu da bu prosedürün teşhis ortamında gelecekteki uygulamasını kolaylaştırdı.