Isolement de cellules avec des informations morphologiques et spatiales à partir d’échantillons de fibrose sous-muqueuse buccale par microdissection par capture laser

La fibrose sous-muqueuse buccale (OSF) est un type courant de trouble potentiellement malin dans la cavité buccale. L’atrophie de l’épithélium et la fibrose de la lamina propria et de la sous-muqueuse sont souvent retrouvées sur les lames histopathologiques. Il a été proposé que la dysplasie épithéliale, l’atrophie épithéliale et les fibroblastes sénescents soient associés à la transformation maligne de l’OSF. Cependant, en raison de l’hétérogénéité des maladies buccales potentiellement malignes et du carcinome épidermoïde buccal, il est difficile d’identifier les mécanismes moléculaires spécifiques de la transformation maligne dans l’OSF. Nous présentons ici une méthode permettant d’obtenir un petit nombre de cellules épithéliales ou mésenchymateuses portant des données morphologiques et des informations spatiales par microdissection à capture laser sur des lames de tissus enrobés de paraffine fixées au formol. À l’aide d’un microscope, nous pouvons capturer avec précision le tissu épithélial dysplasique ou atrophique à l’échelle microscopique (~500 cellules) et le tissu sous-épithélial fibrotique. Les cellules extraites peuvent être évaluées par séquençage du génome ou du transcriptome afin d’acquérir des données génomiques et transcriptomiques avec des informations morphologiques et spatiales. Cette approche élimine l’hétérogénéité du séquençage tissulaire OSF en vrac et l’interférence causée par les cellules dans les zones non lésionnelées, ce qui permet une analyse spatio-omique précise des tissus OSF.