Isolierung von Zellen mit morphologischen und räumlichen Informationen aus oralen submukösen Fibroseproben mittels Laser-Capture-Mikrodissektion

Die orale submuköse Fibrose (OSF) ist eine häufige Form einer potenziell bösartigen Erkrankung in der Mundhöhle. Die Atrophie des Epithels und die Fibrose der Lamina propria und der Submukosa sind häufig auf histopathologischen Objektträgern zu finden. Es wurde vorgeschlagen, dass epitheliale Dysplasie, epitheliale Atrophie und seneszente Fibroblasten mit der malignen Transformation von OSF assoziiert sind. Aufgrund der Heterogenität von potentiell malignen oralen Erkrankungen und oralen Plattenepithelkarzinomen ist es jedoch schwierig, die spezifischen molekularen Mechanismen der malignen Transformation bei OSF zu identifizieren. In dieser Arbeit stellen wir eine Methode vor, um eine kleine Anzahl von Epithel- oder Mesenchymzellen, die morphologische Daten und räumliche Informationen tragen, durch Laser-Capture-Mikrodissektion auf formalinfixierten, in Paraffin eingebetteten Gewebeobjektträgern zu erhalten. Mit einem Mikroskop können wir mikroskaliges (~500 Zellen) dysplastisches oder atrophisches Epithelgewebe und fibrotisches subepitheliales Gewebe präzise erfassen. Die extrahierten Zellen können durch Genom- oder Transkriptomsequenzierung ausgewertet werden, um genomische und transkriptomische Daten mit morphologischen und räumlichen Informationen zu erhalten. Dieser Ansatz beseitigt die Heterogenität der Massensequenzierung von OSF-Gewebe und die Interferenz, die durch Zellen in nicht läsionierten Bereichen verursacht wird, und ermöglicht eine präzise Spatial-Omics-Analyse von OSF-Gewebe.