レーザーキャプチャーマイクロダイセクションによる口腔粘膜下線維症サンプルからの形態学的および空間的情報による細胞の分離

口腔粘膜下線維症(OSF)は、口腔内の悪性の可能性のある疾患の一般的なタイプです。上皮の萎縮および固有層および粘膜下層の線維症は、病理組織学的スライドにしばしば見られる。上皮異形成、上皮萎縮、および老化線維芽細胞は、OSFの悪性形質転換に関連していることが提案されています。しかし、潜在的に悪性の口腔疾患と口腔扁平上皮癌の不均一性のため、OSFにおける悪性形質転換の特定の分子機構を特定することは困難です。本研究では、ホルマリン固定パラフィン包埋組織スライド上にレーザー捕捉マイクロダイセクションにより、形態学的データや空間情報を有する少数の上皮細胞または間葉系細胞を得る方法を紹介します。顕微鏡を用いることで、マイクロスケール(~500細胞)の異形成性または萎縮性上皮組織や線維性上皮下組織を正確に捕捉することができます。抽出された細胞は、ゲノムまたはトランスクリプトームシーケンシングによって評価され、形態学的および空間的情報を含むゲノムおよびトランスクリプトームデータを取得できます。このアプローチにより、バルクOSF組織シーケンシングの不均一性や、非病変領域の細胞によって引き起こされる干渉が除去され、OSF組織の正確な空間オミクス解析が可能になります。