Technical Demonstration of Whole Genome Array Comparative Genomic Hybridization

Array comparative genomic hybridization (array CGH) is a method for detecting gains and losses of DNA segments or gene dosage in the genome 1.  Recent ...

BC Cancer Research Centre

&#x57FA;&#x4E8E;&#x9635;&#x5217;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6742;&#x4EA4; &#xFF08;&#x5168;&#x606F;&#xFF09; &#x6280;&#x672F;&#x7684;&#x8FD1;&#x671F;&#x53D1;&#x5C55;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; DNA &#x62F7;&#x8D1D;&#x6570;&#x53D8;&#x5316;&#x7684;&#x68C0;&#x6D4B;&#x63D0;&#x4F9B;&#x6539;&#x8FDB;&#x7684;&#x51B3;&#x8BAE;&#x3002;&#x5728;&#x6570;&#x7EC4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x751F;&#x6210;&#x68C0;&#x4E3E;&#x89E3;&#x51B3;&#x65B9;&#x6848;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x591A;&#x6B65;&#x9AA4;&#x8FC7;&#x7A0B;&#xFF0C;&#x7EC6;&#x83CC;&#x4EBA;&#x5DE5;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53; (BAC) &#x514B;&#x9686;&#x8F6C;&#x4E3A;&#x4F7F;&#x7528;&#x4F5C;&#x4E3A;&#x8BC6;&#x522B;&#x82AF;&#x7247;&#x7684;&#x683C;&#x5F0F;&#x5728;&#x73BB;&#x7483;&#x57FA;&#x677F;&#x4E0A;&#x7684;&#x89E3;&#x51B3;&#x65B9;&#x6848;&#xFF0C;&#x8865;&#x5145; PCR &#x6269;&#x589E;&#x7247;&#x6BB5;&#x6C60; &#xFF08;&#x6CD5;&#x65B0;&#x793E;&#xFF09;&#x3002;&#x4EBA;&#x4E0E;&#x5C0F;&#x9F20;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x7684;&#x5B8C;&#x6210;&#xFF0C;&#x4E0E;&#x5927;&#x578B; BAC &#x514B;&#x9686;&#x96C6;&#x63D0;&#x4F9B;&#x5B8C;&#x6574;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x8986;&#x76D6;&#x73B0;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; BAC &#x6570;&#x7EC4;&#x6784;&#x9020;&#x3002;&#x76EE;&#x524D;&#xFF0C;&#x5357;&#x65B9;&#x6742;&#x4EA4;&#x3001; &#x8367;&#x5149;&#x539F;&#x4F4D;&#x6742;&#x4EA4;&#x6280;&#x672F; (FISH) &#x548C; BAC &#x7ED3;&#x675F;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x65B9;&#x6CD5;&#x901A;&#x5E38;&#x7528;&#x4E8E;&#x786E;&#x5B9A;&#x521D;&#x59CB;&#x7684; BAC &#x514B;&#x9686;&#xFF0C;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x7528;&#x4E8E;&#x8BC6;&#x522B;&#x9635;&#x5217;&#x7684;&#x6700;&#x7EC8;&#x4EA7;&#x54C1;&#x3002;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#x6240;&#x8FF0;&#x7684;&#x7532;&#x80CE;&#x86CB;&#x767D;&#x6D4B;&#x5E8F;&#x6280;&#x672F;&#x662F;&#x6570;&#x7EC4;&#x7684;&#x8BBE;&#x8BA1;&#x7528;&#x6765;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x8EAB;&#x4EFD;&#x4EE5;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x7684;&#x65B9;&#x5F0F;&#x8BC6;&#x522B;&#x89E3;&#x51B3;&#x65B9;&#x6848;&#x7684;&#x4E00;&#x79CD;&#x65B0;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;

&#x6784;&#x5EFA;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#x9635;&#x5217;&#x7684; BAC DNA &#x6269;&#x589E;&#x7684;&#x7247;&#x6BB5;&#x6C60;&#x7684;&#x9AD8;&#x541E;&#x5410;&#x91CF;&#x9A8C;&#x8BC1;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;

The recent development of array based comparative genomic hybridization (CGH) technology provides improved resolution for detection of genomic DNA copy number alterations. In array CGH, generating spotting solution is a multi-step process where bacterial artificial chromosome (BAC) clones are converted to replenishable PCR amplified fragments pools (AFP) for use as spotting solution in a microarray format on glass substrate. With completion of the human and mouse genome sequencing, large BAC clone sets providing complete genome coverage are available for construction of whole genome BAC arrays. Currently, Southern hybridization, fluorescent in-situ hybridization (FISH), and BAC end sequencing methods are commonly used to identify the initial BAC clone but not the end product used for spotting arrays. The AFP sequencing technique described in this study is a novel method designed to verify the identity of array spotting solution in a high throughput manner.

Methods for high throughput validation of amplified fragment pools of BAC DNA for constructing high resolution CGH arrays.

Le d&#xE9;veloppement r&#xE9;cent de r&#xE9;seau sur la base hybridation g&#xE9;nomique comparative (CGH) technologie offre une meilleure r&#xE9;solution pour la d&#xE9;tection des alt&#xE9;rations de l&#x26;#39;ADN g&#xE9;nomique du nombre de copies. En CGH array, g&#xE9;n&#xE9;rant une solution spotting est un processus multi-&#xE9;tapes o&#xF9; bact&#xE9;riennes artificielles chromosomiques (BAC) clones sont convertis en r&#xE9;approvisionnables amplifi&#xE9;s par PCR des fragments piscines (AFP) pour utilisation en tant que taches solution dans un format de micror&#xE9;seau sur substrat de verre. Avec l&#x26;#39;ach&#xE8;vement de l&#x26;#39;&#xEA;tre humain et s&#xE9;quen&#xE7;age du g&#xE9;nome de la souris, grande clone BAC fixe offrant une couverture compl&#xE8;te du g&#xE9;nome sont disponibles pour la construction de l&#x26;#39;ensemble des tableaux d&#x26;#39;alcool&#xE9;mie du g&#xE9;nome. Actuellement, l&#x26;#39;hybridation du Sud, in situ fluorescente (FISH), et les m&#xE9;thodes de s&#xE9;quen&#xE7;age BAC finaux sont couramment utilis&#xE9;s pour identifier le clone initial BAC mais pas le produit final utilis&#xE9; pour rep&#xE9;rer les r&#xE9;seaux. La technique de s&#xE9;quen&#xE7;age AFP d&#xE9;crit dans cette &#xE9;tude est une nouvelle m&#xE9;thode destin&#xE9;e &#xE0; v&#xE9;rifier l&#x26;#39;identit&#xE9; d&#x26;#39;une solution de r&#xE9;seau rep&#xE9;rer de mani&#xE8;re &#xE0; haut d&#xE9;bit.

M&#xE9;thodes pour la validation &#xE0; haut d&#xE9;bit des pools de fragment amplifi&#xE9; de BAC d&#x26;#39;ADN pour Construire haute r&#xE9;solution CGH arrays

Methoden zur Validierung von Hochdurchsatz-amplifizierte Fragment Pools von BAC-DNA f&#xFC;r den Aufbau hochaufl&#xF6;sende CGH-Arrays.

Il recente sviluppo della tecnologia di ibridazione genomic comparativa (CGH) array basato fornisce una migliore risoluzione per la rilevazione di alterazioni numeri copia di genomic del DNA. Array CGH, generando soluzione spotting &egrave; un processo multi-step, dove vengono convertiti in cromosomi artificiali batterici (BAC) cloni replenishable PCR amplificati frammenti piscine (AFP) per uso come spotting soluzione in un formato microarray su substrato di vetro. Con il completamento del sequenziamento del genoma del mouse e umani, sono disponibili per la costruzione di matrici intero genoma BAC grandi insiemi di clone BAC, fornire una copertura completa del genoma. Attualmente, l&#39;ibridazione del sud, ibridazione in situ fluorescente (FISH) e metodi di sequenziamento end BAC sono comunemente utilizzati per identificare il clone BAC iniziale ma non il prodotto finale utilizzato per matrici di spotting. La tecnica di sequenziamento AFP descritta in questo studio &egrave; un romanzo Metodo progettato per verificare l&#39;identit&agrave; di matrice spotting soluzione in un modo elevato throughput.

Metodi per la convalida di high throughput delle piscine del frammento amplificato di DNA di BAC per la costruzione di matrici di CGH ad alta risoluzione.

&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#xFF08;CGH&#xFF09;&#x6280;&#x8853;&#x306E;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306F;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;DNA&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x6570;&#x5909;&#x5316;&#x306E;&#x691C;&#x51FA;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6539;&#x826F;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;CGH&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x30BD;&#x30EA;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x751F;&#x6210;&#x3059;&#x308B;&#x7D30;&#x83CC;&#x4EBA;&#x5DE5;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#xFF08;BAC&#xFF09;&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x30AC;&#x30E9;&#x30B9;&#x57FA;&#x677F;&#x4E0A;&#x306E;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30DE;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x30BD;&#x30EA;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3068;&#x3057;&#x3066;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x88DC;&#x5145;PCR&#x5897;&#x5E45;&#x65AD;&#x7247;&#x30D7;&#x30FC;&#x30EB;&#xFF08;AFP&#xFF09;&#x306B;&#x5909;&#x63DB;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x30DE;&#x30EB;&#x30C1;&#x30B9;&#x30C6;&#x30C3;&#x30D7;&#x306E;&#x30D7;&#x30ED;&#x30BB;&#x30B9;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x30D2;&#x30C8;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x30DE;&#x30A6;&#x30B9;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x5B8C;&#x6210;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x5927;&#x578B;BAC&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30AB;&#x30D0;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B8;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3059;&#x308B;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;BAC&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3092;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x7528;&#x610F;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x73FE;&#x5728;&#x3001;&#x30B5;&#x30B6;&#x30F3;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3001;&#x86CD;&#x5149;in situ&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#xFF08;FISH&#xFF09;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;BAC&#x30A8;&#x30F3;&#x30C9;&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x65B9;&#x6CD5;&#x306F;&#x3001;&#x4E00;&#x822C;&#x7684;&#x306B;&#x914D;&#x5217;&#x3092;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x6700;&#x7D42;&#x88FD;&#x54C1;&#x306E;&#x6700;&#x521D;&#x306E;BAC&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x304C;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x8AAC;&#x660E;&#x3055;&#x308C;&#x3066;AFP&#x30B7;&#x30FC;&#x30B1;&#x30F3;&#x30B7;&#x30F3;&#x30B0;&#x6280;&#x8853;&#x306F;&#x3001;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x914D;&#x5217;&#x30B9;&#x30DD;&#x30C3;&#x30C6;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x30BD;&#x30EA;&#x30E5;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x306E;&#x8EAB;&#x5143;&#x3092;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x8A2D;&#x8A08;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x65B0;&#x898F;&#x306A;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;

&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;CGH&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3092;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;BAC DNA&#x306E;&#x5897;&#x5E45;&#x65AD;&#x7247;&#x30D7;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x9AD8;&#x30B9;&#x30EB;&#x30FC;&#x30D7;&#x30C3;&#x30C8;&#x306E;&#x691C;&#x8A3C;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x65B9;&#x6CD5;

&#xBC30;&#xC5F4; &#xAE30;&#xBC18; &#xBE44;&#xAD50; genomic &#xAD50; &#xC7A1; (CGH) &#xAE30;&#xC220;&#xC740; &#xCD5C;&#xADFC; &#xAC1C;&#xBC1C; genomic DNA &#xBCF5;&#xC0AC; &#xBC88;&#xD638; &#xBCC0;&#xACBD;&#xC758; &#xAC80;&#xC0C9;&#xC744; &#xC704;&#xD55C; &#xD5A5;&#xC0C1; &#xB41C; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4;&#xB97C; &#xC81C;&#xACF5;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBC30;&#xC5F4; CGH &#xD0D0;&#xC9C0; &#xC194;&#xB8E8;&#xC158; &#xC0DD;&#xC131; &#xC138;&#xADE0; &#xC778;&#xACF5; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; (BAC) &#xD074;&#xB860; replenishable PCR &#xC99D;&#xD3ED; &#xC870;&#xAC01; &#xD480; (afp = &#xC5F0;&#xD569; &#xB274;&#xC2A4;) &#xC720;&#xB9AC; &#xAE30;&#xD310;&#xC5D0; microarray &#xD615;&#xD0DC;&#xB85C; &#xC194;&#xB8E8;&#xC158;&#xC744; &#xC57C;&#xC0DD;&#xC73C;&#xB85C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xBCC0;&#xD658; &#xB418;&#xB294; &#xB2E4;&#xB2E8;&#xACC4; &#xD504;&#xB85C;&#xC138;&#xC2A4;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC778;&#xAC04;&#xACFC; &#xB9C8;&#xC6B0;&#xC2A4; &#xAC8C;&#xB188; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1;&#xC758; &#xC644;&#xB8CC;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xD070; BAC &#xD074;&#xB860; &#xC138;&#xD2B8; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xAC8C;&#xB188; &#xBCF4;&#xD5D8; &#xD61C;&#xD0DD;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; BAC &#xBC30;&#xC5F4;&#xC758; &#xAC74;&#xC124;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC7AC;, &#xB0A8;&#xBD80; &#xAD50; &#xC7A1;, &#xD615;&#xAD11; &#xC131; &#xC81C;&#xC790;&#xB9AC; &#xAD50; &#xC7A1; (&#xBB3C;&#xACE0;&#xAE30;), &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; &#xD608; &#xC911; &#xC54C;&#xCF54;&#xC62C; &#xB18D;&#xB3C4;&#xAC00; &#xCD5C;&#xC885; &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xBC29;&#xBC95; &#xCD08;&#xAE30; BAC &#xD074;&#xB860; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xC548;&#xBCF4; &#xBC30;&#xC5F4;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xB418;&#xB294; &#xCD5C;&#xC885; &#xC81C;&#xD488;&#xC774; &#xC544;&#xB2D9;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD1B5;&#xC6A9; &#xB41C;&#xB2E4;. AFP &#xC2DC;&#xD000;&#xC2F1; &#xAE30;&#xBC95;&#xC774;&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC124;&#xBA85; &#xD558;&#xB294; &#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xBC29;&#xC2DD;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC194;&#xB8E8;&#xC158;&#xC744; &#xBCF4; &#xC774;&#xB098; &#xBC30;&#xC5F4;&#xC758; id&#xB97C; &#xD655;&#xC778; &#xD558;&#xB3C4;&#xB85D; &#xACE0;&#xC548; &#xB41C; &#xC18C;&#xC124;.

&#xB192;&#xC740; &#xCC98;&#xB9AC;&#xB7C9; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; CGH &#xBC30;&#xC5F4; &#xAD6C;&#xC131;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; BAC DNA&#xC758; &#xC99D;&#xD3ED;&#xB41C; &#xD55C; &#xD30C;&#xD3B8; &#xD480;&#xC758; &#xC720;&#xD6A8;&#xC131; &#xAC80;&#xC0AC;&#xB97C; &#xC704;&#xD55C; &#xBC29;&#xBC95;.

El reciente desarrollo de la matriz de la base de hibridaci&#xF3;n gen&#xF3;mica comparada (CGH) la tecnolog&#xED;a ofrece una mejor resoluci&#xF3;n para la detecci&#xF3;n de las alteraciones gen&#xF3;micas de ADN el n&#xFA;mero de copias. En CGH matriz, generando soluci&#xF3;n manchado es un proceso de m&#xFA;ltiples pasos donde bacterianos artificiales cromosoma (BAC) clones se convierten en reponibles PCR amplificados piscinas fragmentos (AFP) para su uso como manchado soluci&#xF3;n en un formato de microarrays sobre sustrato de vidrio. Con la finalizaci&#xF3;n de los recursos humanos y la secuenciaci&#xF3;n del genoma del rat&#xF3;n, gran clon BAC establece una cobertura completa del genoma est&#xE1;n disponibles para la construcci&#xF3;n de matrices de todo el genoma de alcoholemia. En la actualidad, sur de la hibridaci&#xF3;n, fluorescente hibridaci&#xF3;n in situ (FISH), y los m&#xE9;todos de secuenciaci&#xF3;n de BAC finales se utilizan com&#xFA;nmente para identificar la primera clon BAC, pero no el producto final utilizado para detectar las matrices. La t&#xE9;cnica de secuenciaci&#xF3;n de AFP se describe en este estudio es un nuevo m&#xE9;todo dise&#xF1;ado para verificar la identidad de la soluci&#xF3;n de matriz manchado en un alto rendimiento.

M&#xE9;todos para la validaci&#xF3;n de alto rendimiento de las agrupaciones de fragmento amplificado de ADN BAC para la construcci&#xF3;n de alta resoluci&#xF3;n CGH arrays

&#x6211;&#x4EEC;&#x6784;&#x9020;&#x7EC4;&#x6210;&#x7684;&#x91CD;&#x53E0;&#x8986;&#x76D6;&#x6574;&#x4E2A;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; BAC &#x514B;&#x9686; 32,433 &#x7684;&#x5E73;&#x94FA;&#x51B3;&#x8BAE;&#x6570;&#x7EC4;&#x3002;&#x8FD9;&#x589E;&#x52A0;&#x4E86;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x80FD;&#x529B;&#x6765;&#x786E;&#x5B9A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x6539;&#x53D8;&#x548C;&#x6574;&#x4E2A;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E2D;&#x5355;&#x7684;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6742;&#x4EA4; &#xFF08;&#x5168;&#x606F;&#xFF09; &#x53CA;&#x5176;&#x8FB9;&#x754C;&#x7684;&#x5B9E;&#x9A8C;&#x3002;&#x5E73;&#x94FA;&#x89E3;&#x6790;&#x65F6;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x53D1;&#x73B0;&#x5206;&#x949F;&#x4EE5;&#x524D;&#x672A;&#x62A5;&#x544A;&#x8FC7;&#x7684; DNA &#x6539;&#x5EFA;&#x3002;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x6539;&#x52A8;&#x5305;&#x62EC; microamplifications &#x548C;&#x5220;&#x9664;&#x5305;&#x542B;&#x764C;&#x57FA;&#x56E0;&#x3001; &#x6291;&#x764C;&#x57FA;&#x56E0;&#x548C;&#x53EF;&#x80FD;&#x4E0E;&#x591A;&#x79CD;&#x80BF;&#x7624;&#x7C7B;&#x578B;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x65B0;&#x57FA;&#x56E0;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x663E;&#x793A;&#x5FC5;&#x987B;&#x8D85;&#x8D8A;&#x4F20;&#x7EDF;&#x7684;&#x57FA;&#x4E8E;&#x6807;&#x8BB0;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6BD4;&#x8F83;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x5206;&#x522B;&#x662F;&#x4F9D;&#x9760;&#x63A8;&#x7406;&#x7684;&#x95F4;&#x9694;&#x6807;&#x8BB0;&#x4E4B;&#x95F4;&#x7684;&#x8FDE;&#x7EED;&#x6027;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC; submegabase &#x53F7;&#x51B3;&#x8BAE;&#x5E73;&#x94FA;&#x4E3A;&#x6570;&#x7EC4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE; &#xFF08;&#x975E;&#x5E38;&#x9635;&#x5217;&#xFF09; &#x8BBE;&#x7F6E;&#x5141;&#x8BB8;&#x5168;&#x9762;&#x8BC4;&#x4F30;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x5B8C;&#x6574;&#x6027;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x800C;&#x4E0E;&#x75BE;&#x75C5;&#x76F8;&#x5173;&#x7684;&#x65B0;&#x57FA;&#x56E0;&#x7684;&#x9274;&#x5B9A;&#x3002;

&#x5E73;&#x94FA;&#x53F7;&#x51B3;&#x8BAE;&#x4E2D; DNA &#x5FAE;&#x9635;&#x5217;&#x6280;&#x672F;&#x4E0E;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x5168;&#x8986;&#x76D6;&#x3002;

We constructed a tiling resolution array consisting of 32,433 overlapping BAC clones covering the entire human genome. This increases our ability to identify genetic alterations and their boundaries throughout the genome in a single comparative genomic hybridization (CGH) experiment. At this tiling resolution, we identified minute DNA alterations not previously reported. These alterations include microamplifications and deletions containing oncogenes, tumor-suppressor genes and new genes that may be associated with multiple tumor types. Our findings show the need to move beyond conventional marker-based genome comparison approaches, that rely on inference of continuity between interval markers. Our submegabase resolution tiling set for array CGH (SMRT array) allows comprehensive assessment of genomic integrity and thereby the identification of new genes associated with disease.

A tiling resolution DNA microarray with complete coverage of the human genome.

Nous avons construit un r&#xE9;seau de r&#xE9;solution de carrelage compos&#xE9; de 32,433 clones BAC se chevauchent en couvrant l&#x26;#39;ensemble du g&#xE9;nome humain. Cela augmente notre capacit&#xE9; &#xE0; identifier les alt&#xE9;rations g&#xE9;n&#xE9;tiques et de leurs limites tout au long du g&#xE9;nome dans une hybridation simple g&#xE9;nomique comparative (CGH) exp&#xE9;rience. A cette r&#xE9;solution carrelage, nous avons identifi&#xE9; alt&#xE9;rations de l&#x26;#39;ADN minute, non signal&#xE9;s pr&#xE9;c&#xE9;demment. Ces modifications comprennent des microamplifications et les suppressions contenant oncog&#xE8;nes, g&#xE8;nes suppresseurs de tumeur et de nouveaux g&#xE8;nes qui peuvent &#xEA;tre associ&#xE9;s &#xE0; plusieurs types de tumeurs. Nos r&#xE9;sultats montrent la n&#xE9;cessit&#xE9; d&#x26;#39;aller au-del&#xE0; classiques marqueur des approches fond&#xE9;es sur de comparaison du g&#xE9;nome, qui s&#x26;#39;appuient sur l&#x26;#39;inf&#xE9;rence de la continuit&#xE9; entre les marqueurs d&#x26;#39;intervalle. Notre r&#xE9;solution submegabase carrelage fix&#xE9; pour CGH array (array SMRT) permet l&#x26;#39;&#xE9;valuation globale de l&#x26;#39;int&#xE9;grit&#xE9; g&#xE9;nomique et, par cons&#xE9;quent l&#x26;#39;identification de nouveaux g&#xE8;nes associ&#xE9;s &#xE0; la maladie.

Un micror&#xE9;seau d&#x26;#39;ADN R&#xE9;solution carrelage avec une couverture compl&#xE8;te du g&#xE9;nome humain

Ein DNA-Microarray-Tiling-Aufl&#xF6;sung mit vollst&#xE4;ndiger Abdeckung des menschlichen Genoms.

Abbiamo costruito una matrice di risoluzione piastrellatura costituita da 32.433 sovrapposizione cloni BAC che coprono l&#39;intero genoma umano. Questo aumenta la nostra capacit&agrave; di identificare le alterazioni genetiche e sperimentano i loro confini in tutto il genoma in una singola ibridazione genomic comparativa (CGH). A questa risoluzione di affiancamento, abbiamo identificato minuti alterazioni del DNA non precedentemente segnalati. Queste alterazioni includono microamplifications e delezioni contenenti oncogeni, geni del tumore-soppressore e nuovi geni che possono essere associati con pi&ugrave; tipi di tumore. I nostri risultati dimostrano la necessit&agrave; di andare oltre gli approcci di confronto convenzionali basati su marker del genoma, che si basano sull&#39;inferenza di continuit&agrave; tra i marcatori di intervallo. Il nostro affiancamento di risoluzione submegabase per array-CGH (array SMRT) permette completa valutazione dell&#39;integrit&agrave; genomica e quindi l&#39;identificazione di nuovi geni associati alla malattia.

Una risoluzione di affiancamento DNA microarray con copertura completa del genoma umano.

&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x3092;&#x8986;&#x3046;32433&#x91CD;&#x8907;BAC&#x30AF;&#x30ED;&#x30FC;&#x30F3;&#x304B;&#x3089;&#x6210;&#x308B;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;&#x914D;&#x5217;&#x3092;&#x69CB;&#x7BC9;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x306F;&#x3001;&#x5358;&#x4E00;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#xFF08;CGH&#xFF09;&#x306E;&#x5B9F;&#x9A13;&#x3067;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3068;&#x305D;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5883;&#x754C;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x80FD;&#x529B;&#x3092;&#x5411;&#x4E0A;&#x3055;&#x305B;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x306E;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3067;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x5831;&#x544A;&#x3055;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x5206;&#x306E;DNA&#x5909;&#x7570;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;microamplifications&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x6B20;&#x5931;&#x3092;&#x542B;&#x3080;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x6291;&#x5236;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x3068;&#x8907;&#x6570;&#x306E;&#x816B;&#x760D;&#x306E;&#x7A2E;&#x985E;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x65B0;&#x3057;&#x3044;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x304C;&#x542B;&#x307E;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x4ECA;&#x56DE;&#x306E;&#x77E5;&#x898B;&#x306F;&#x3001;&#x9593;&#x9694;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x3068;&#x306E;&#x9593;&#x306E;&#x9023;&#x7D9A;&#x6027;&#x306E;&#x63A8;&#x8AD6;&#x306B;&#x983C;&#x308B;&#x5F93;&#x6765;&#x306E;&#x30DE;&#x30FC;&#x30AB;&#x30FC;&#x30D9;&#x30FC;&#x30B9;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3092;&#x8D8A;&#x3048;&#x3066;&#x79FB;&#x52D5;&#x3059;&#x308B;&#x5FC5;&#x8981;&#x6027;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;submegabase&#x5206;&#x89E3;&#x80FD;&#x306F;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;CGH&#xFF08;SMRT&#x914D;&#x5217;&#xFF09;&#x306B;&#x8A2D;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x5305;&#x62EC;&#x7684;&#x306A;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x6027;&#x306E;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3068;&#x305D;&#x308C;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x75C5;&#x6C17;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x65B0;&#x305F;&#x306A;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x306E;&#x540C;&#x5B9A;&#x3092;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30D2;&#x30C8;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x30AB;&#x30D0;&#x30EC;&#x30C3;&#x30B8;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;DNA&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;

&#xC6B0;&#xB9AC; 32,433 BAC &#xD074;&#xB860; &#xCDE8;&#xC7AC; &#xC804;&#xCCB4; &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188; &#xC911;&#xBCF5; &#xAD6C;&#xC131; &#xB41C; &#xAE30;&#xC640; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xBC30;&#xC5F4; &#xC0DD;&#xC131;. &#xC774; &#xC720;&#xC804; &#xBCC0;&#xACBD; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558;&#xB294; &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xB2A5;&#xB825;&#xC744; &#xC99D;&#xAC00; &#xD558; &#xACE0; &#xAD50;&#xB294; &#xB2E8;&#xC77C; &#xBE44;&#xAD50; genomic &#xC7A1; (CGH) &#xAC8C;&#xB188;&#xC5D0; &#xAC78;&#xCCD0; &#xACBD;&#xACC4;&#xAC00; &#xC2E4;&#xD5D8;. &#xC774; &#xAE30;&#xC640; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xACE0; &#xB41C; &#xBD84; DNA &#xBCC0;&#xACBD; &#xC2DD;&#xBCC4;. &#xC774;&#xB7EC;&#xD55C; &#xBCC0;&#xACBD;&#xC73C;&#xB85C;&#xB294; microamplifications oncogenes, &#xC885;&#xC591; &#xC5B5;&#xC81C; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xBC0F; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xC885;&#xC591; &#xC885;&#xB958;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD3EC;&#xD568; &#xD558;&#xB294; &#xC0AD;&#xC81C; &#xB4F1;&#xC774; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xACB0;&#xACFC; &#xD45C;&#xC2DC; &#xAC04;&#xACA9; &#xD45C;&#xC2DC;&#xC790; &#xC0AC;&#xC774;&#xC758; &#xC5F0;&#xC18D;&#xC131;&#xC758; &#xC720;&#xCD94;&#xC5D0; &#xC758;&#xC874; &#xD558;&#xB294; &#xAE30;&#xC874;&#xC758; &#xB9C8;&#xCEE4; &#xAE30;&#xBC18; &#xAC8C;&#xB188; &#xBE44;&#xAD50; &#xC811;&#xADFC;&#xC744; &#xB118;&#xC5B4; &#xC774;&#xB3D9; &#xD558;&#xB294; &#xD544;&#xC694;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; submegabase &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xBC14;&#xB451;&#xD310;&#xC2DD; &#xBC30;&#xC5F4; CGH (SMRT &#xBC30;&#xC5F4;)&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xC124;&#xC815; &#xC218; &#xC218; &#xC885;&#xD569; &#xD3C9;&#xAC00; &#xAC8C;&#xB188; &#xBB34;&#xACB0;&#xC131; &#xBC0F; &#xADF8;&#xB85C; &#xC778;&#xD558;&#xC5EC; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xACFC; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC0C8;&#xB85C;&#xC6B4; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC758; &#xC2DD;&#xBCC4;.

&#xAE30;&#xC640; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; DNA microarray &#xC778;&#xAC04; &#xAC8C;&#xB188;&#xC758; &#xC644;&#xC804; &#xD55C; &#xC801;&#xC6A9;.

Hemos construido una amplia resoluci&#xF3;n de mosaico compuesto por 32,433 superposici&#xF3;n de clones BAC que cubren todo el genoma humano. Esto aumenta nuestra capacidad para identificar las alteraciones gen&#xE9;ticas y sus l&#xED;mites en todo el genoma en una sola hibridaci&#xF3;n gen&#xF3;mica comparada (CGH) experimento. En esta resoluci&#xF3;n suelo de baldosas, se identificaron alteraciones minutos de ADN no se inform&#xF3; previamente. Estas alteraciones incluyen microamplifications y supresiones que contienen oncogenes, genes supresores de tumores y nuevos genes que pueden estar asociados con m&#xFA;ltiples tipos de tumores. Nuestros hallazgos muestran la necesidad de ir m&#xE1;s all&#xE1; de convencionales basados &#x200B;&#x200B;en el marcador de los enfoques gen&#xF3;micos comparativos, que se basan en la inferencia de la continuidad entre los marcadores de intervalo. Nuestra resoluci&#xF3;n submegabase alicatado fijado para CGH array (array SMRT) permite una evaluaci&#xF3;n completa de la integridad gen&#xF3;mica y de ese modo la identificaci&#xF3;n de nuevos genes asociados con la enfermedad.

Una Resoluci&#xF3;n Pavimentaci&#xF3;n de microarrays de ADN con una cobertura completa del genoma humano

&#x9AA8;&#x8089;&#x7624; (OS) &#x7684;&#x7279;&#x70B9;&#x662F;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4E0D;&#x7A33;&#x5B9A;&#x548C;&#x9AD8;&#x62F7;&#x8D1D;&#x6570;&#x57FA;&#x56E0;&#x6269;&#x589E;&#x3002;&#x8BE5;&#x65AD;&#x88C2;&#x878D;&#x5408;&#x6865; &#xFF08;BFB&#xFF09; &#x5468;&#x671F;&#x662F;&#x80BF;&#x7624;&#x548C;&#x4F53;&#x5916;&#x6A21;&#x578B;&#x7528;&#x4E8E;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x8D77;&#x6E90;&#x590D;&#x6742;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x91CD;&#x6392;&#x548C;&#x764C;&#x75C7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6269;&#x589E;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E0D;&#x7A33;&#x5B9A;&#x7684;&#x4E00;&#x4E2A;&#x884C;&#x4E4B;&#x6709;&#x6548;&#x7684;&#x673A;&#x5236;&#x3002;&#x7136;&#x800C;&#xFF0C;&#x5230;&#x76EE;&#x524D;&#x4E3A;&#x6B62;&#xFF0C;&#x6CA1;&#x6709;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x7684;&#x7EC6;&#x80DE;&#x9057;&#x4F20;&#x6216;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x9635;&#x5217;&#x7814;&#x7A76; BFB &#x4E8B;&#x4EF6;&#x7684; OS&#x3002;&#x5728;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x591A;&#x8272;&#x6761;&#x7EB9;&#x5E73;&#x94FA;&#x96C6; (mBAND) &#x9C7C;&#x548C; submegabase &#x53F7;&#x51B3;&#x8BAE; &#xFF08;&#x516C;&#x53F8;&#xFF09; &#x9635;&#x5217;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6742;&#x4EA4; &#xFF08;&#x5168;&#x606F;&#xFF09; &#x88AB;&#x7528;&#x6765;&#x8BC6;&#x522B;&#x548C;&#x6620;&#x5C04;&#x7684; BFB &#x4E8B;&#x4EF6;&#x4E2D;&#x56DB;&#x4E2A; OS &#x7EC6;&#x80DE;&#x682A;&#x548C;&#x4E00;&#x4E2A;&#x75C5;&#x4EBA;&#x80BF;&#x7624;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7B7E;&#x540D;&#x3002;BFB &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x3001; &#x5012;&#x7ACB;&#x91CD;&#x53E0;&#x7684;&#x60C5;&#x51B5;&#xFF0C;&#x548C;&#x5185;&#x90E8;&#x548C; interchromosomal &#x7684;&#x653E;&#x5927;&#x4E0E;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x9884;&#x671F;&#x4E2D;&#x95F4;&#x4F53;-&#x786E;&#x5B9A;&#x4E86;&#x3002;mBAND &#x5206;&#x6790;&#x63D0;&#x4F9B;&#x8BE6;&#x7EC6;&#x7684;&#x91CD;&#x6392; 1 p&#x3001; 6 p &#x548C; 8q &#x7684;&#x6620;&#x5C04;&#x548C;&#x663E;&#x793A;&#x6613;&#x4F4D;&#x8DEF;&#x53E3;&#x5F80;&#x5F80;&#x662F;&#x8106;&#x5F31;&#x7684;&#x5730;&#x70B9;&#x9760;&#x8FD1;&#x3002;&#x66F4;&#x8BE6;&#x7EC6;&#x7684; OS &#x7684;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x884C;&#x6BEB;&#x514B; 63 &#x7684; mBAND &#x7814;&#x7A76;&#x63ED;&#x793A;&#x9636;&#x68AF;&#x5F62;&#x9C7C;&#x4FE1;&#x53F7;&#x540C;&#x6837;&#x95F4;&#x8DDD; interchromosomal coamplifications 6 p 21&#x3001; 8q24&#xFF0C;&#x548C; 9 p 21 p22 &#x5747;&#x5300;&#x67D3;&#x8272; (hsr) &#x5730;&#x533A;&#x3002;Concordantly &#x6620;&#x5C04;&#x5230; hsr &#x7684;&#x7126;&#x653E;&#x5927;&#x4E86;&#x516C;&#x53F8;&#x6570;&#x7EC4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#x7684;&#x5C40;&#x9650;&#x4E8E;&#x79BB;&#x6563;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x65F6;&#x95F4;&#x95F4;&#x9694;&#x3002;&#x5728;&#x6B64; hsr &#x7684;&#x590D;&#x6742;&#x6269;&#x589E;&#x5B50;&#x7ED3;&#x6784;&#x8868;&#x660E;&#x7D27;&#x90BB;&#x5FAE;&#x7F3A;&#x5931;&#x7684;&#x7126;&#x653E;&#x5927;&#x3002;&#x6B64;&#x5916;&#xFF0C;&#x5728;&#x5220;&#x9664;/&#x6269;&#x589E;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x533A;&#x57DF;&#x5DF2;&#x7ECF;&#x8106;&#x5F31;&#x7684;&#x7AD9;&#x70B9;&#x7684;&#x4F18;&#x52BF;&#x3002;&#x603B;&#x4E4B;&#xFF0C;&#x8FD9;&#x9879;&#x7814;&#x7A76;&#x63D0;&#x4F9B;&#x4E86;&#x8FDB;&#x4E00;&#x6B65;&#x652F;&#x6301; BFB &#x673A;&#x5236;&#x548C;&#x8106;&#x5F31;&#x7AD9;&#x70B9;&#x5728;&#x4FC3;&#x8FDB;&#x57FA;&#x56E0;&#x6269;&#x589E;&#x548C;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x91CD;&#x6392;&#x5728; OS &#x4E2D;&#x7684;&#x4F5C;&#x7528;&#x3002;

&#x7EFC;&#x5408; mBAND &#x548C; submegabase &#x51B3;&#x8BAE;&#x5E73;&#x94FA;&#x96C6; (&#x516C;&#x53F8;) &#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#x9635;&#x5217;&#x5206;&#x6790;&#x7126;&#x653E;&#x5927;&#x7684;&#x5FAE;&#x7F3A;&#x5931;&#xFF0C;&#x68AF;&#x5B50;&#x7ED3;&#x6784;&#x7B26;&#x5408;&#x65AD;&#x88C2;&#x878D;&#x5408;&#x6865;&#x5FAA;&#x73AF;&#x548C;&#x9AA8;&#x8089;&#x7624;&#x4E2D;&#x7684;&#x4E8B;&#x4EF6;&#x3002;

Osteosarcoma (OS) is characterized by chromosomal instability and high-copy-number gene amplification. The breakage-fusion-bridge (BFB) cycle is a well-established mechanism of genomic instability in tumors and in vitro models used to study the origins of complex chromosomal rearrangements and cancer genome amplification. However, until now, there have been no high-resolution cytogenetic or genomic array studies of BFB events in OS. In the present study, multicolor banding (mBAND) FISH and submegabase resolution tiling set (SMRT) array comparative genomic hybridization (CGH) were used to identify and map genomic signatures of BFB events in four OS cell lines and one patient tumor. The expected intermediates associated with BFB-dicentric chromosomes, inverted duplications, and intra- and interchromosomal amplifications-were identified. mBAND analysis provided detailed mapping of rearrangements in 1p, 6p, and 8q and showed that translocation junctions were often in close proximity to fragile sites. More detailed mBAND studies of OS cell line MG-63 revealed ladderlike FISH signals of equally spaced interchromosomal coamplifications of 6p21, 8q24, and 9p21-p22 in a homogeneously staining region (hsr). Focal amplifications that concordantly mapped to the hsr were localized to discrete genomic intervals by SMRT array CGH. The complex amplicon structure in this hsr suggests focal amplifications immediately adjacent to microdeletions. Moreover, the genomic regions in which there was deletion/amplification had a preponderance of fragile sites. In summary, this study has provided further support for the role of the BFB mechanism and fragile sites in facilitating gene amplification and chromosomal rearrangement in OS.

An integrated mBAND and submegabase resolution tiling set (SMRT) CGH array analysis of focal amplification, microdeletions, and ladder structures consistent with breakage-fusion-bridge cycle events in osteosarcoma.

Ost&#xE9;osarcome (OS) est caract&#xE9;ris&#xE9; par une instabilit&#xE9; chromosomique et haute nombre de copies d&#x26;#39;amplification g&#xE9;nique. La cassure-fusion-pont (BFB) du cycle est un m&#xE9;canisme bien &#xE9;tabli de l&#x26;#39;instabilit&#xE9; g&#xE9;nomique dans les tumeurs et dans des mod&#xE8;les in vitro utilis&#xE9;s pour &#xE9;tudier les origines de complexes r&#xE9;arrangements chromosomiques et l&#x26;#39;amplification du g&#xE9;nome du cancer. Toutefois, jusqu&#x26;#39;&#xE0; pr&#xE9;sent, il n&#x26;#39;ya pas eu cytog&#xE9;n&#xE9;tique &#xE0; haute r&#xE9;solution ou des &#xE9;tudes g&#xE9;nomiques tableau des &#xE9;v&#xE9;nements BFB dans OS. Dans la pr&#xE9;sente &#xE9;tude, multicolore baguage (mBAND) FISH et ensemble la r&#xE9;solution submegabase carrelage (SMRT) hybridation g&#xE9;nomique comparative (CGH) ont &#xE9;t&#xE9; utilis&#xE9;s pour identifier et cartographier les signatures g&#xE9;nomiques d&#x26;#39;&#xE9;v&#xE9;nements BFB dans quatre lign&#xE9;es cellulaires tumorales OS et un patient. Les interm&#xE9;diaires attendus associ&#xE9;s &#xE0; BFB-dicentriques chromosomes, les duplications invers&#xE9;es, et intra-et interchromosomique amplifications des ont &#xE9;t&#xE9; identifi&#xE9;s. analyse mBAND fourni une cartographie d&#xE9;taill&#xE9;e des r&#xE9;arrangements dans 1p, 6p, 8q et et a montr&#xE9; que les jonctions de translocation sont souvent &#xE0; proximit&#xE9; de sites fragiles. Des &#xE9;tudes plus d&#xE9;taill&#xE9;es mBAND de la lign&#xE9;e cellulaire OS MG-63 a r&#xE9;v&#xE9;l&#xE9; signaux FISH ladderlike de &#xE9;quidistants coamplifications interchromosomiques de 6p21, 8q24, 9p21-p22 et dans une r&#xE9;gion homog&#xE8;ne coloration (HSR). Amplifications focaux qui concordante mapp&#xE9;s &#xE0; l&#x26;#39;HSR ont &#xE9;t&#xE9; localis&#xE9;es &#xE0; intervalles discrets g&#xE9;nomiques par CGH tableau SMRT. La structure complexe amplicon dans ce hsr sugg&#xE8;re amplifications focaux imm&#xE9;diatement adjacentes &#xE0; des microd&#xE9;l&#xE9;tions. En outre, les r&#xE9;gions g&#xE9;nomiques dans lequel il y avait suppression / amplification eu une pr&#xE9;pond&#xE9;rance des sites fragiles. En r&#xE9;sum&#xE9;, cette &#xE9;tude a fourni un appui suppl&#xE9;mentaire pour le r&#xF4;le du m&#xE9;canisme de BFB et des sites fragiles en vue de faciliter l&#x26;#39;amplification du g&#xE8;ne et de r&#xE9;arrangement chromosomique dans OS.

Une d&#xE9;marche int&#xE9;gr&#xE9;e et MBAND Submegabase R&#xE9;solution Tiling Set (SMRT) Analyse de la CGH array Amplification focale, microd&#xE9;l&#xE9;tions, et des structures coh&#xE9;rentes avec Ladder &#xE9;v&#xE9;nements du cycle de cassure-fusion-pont dans l&#x26;#39;ost&#xE9;osarcome

Ein integrierter mBAND und submegabase Aufl&#xF6;sung Fliesen-Set (SMRT) CGH-Array-Analysen von fokalen Verst&#xE4;rkung, Mikrodeletionen und Leiter-Strukturen im Einklang mit Bruch-Fusions-Br&#xFC;cken-Zyklus Ereignisse in Osteosarkom.

L&#39;osteosarcoma (OS) &egrave; caratterizzata da instabilit&agrave; cromosomica e amplificazione ad alto numero di copie del gene. Il ciclo di rottura-fusione-bridge (BFB) &egrave; un meccanismo consolidato di instabilit&agrave; genomica in modelli in vitro utilizzati per studiare le origini del complessi riarrangiamenti cromosomici e amplificazione del genoma di cancro e tumori. Tuttavia, fino ad ora, ci sono stati studi ad alta risoluzione matrice genomica o citogenetica di eventi BFB in OS. Nel presente studio, multicolor banding (mBAND) risoluzione di pesce e submegabase affiancamento insieme il (SMRT) matrice ibridazione genomic comparativa (CGH) sono stati utilizzati per identificare e mappare genomiche firme degli eventi BFB in quattro linee di cellule di OS e un paziente tumorale. Intermedi attesi associati cromosomi BFB-dicentrico, duplicazione invertite e intra - e amplificazioni interchromosomal-sono stati identificati. mBAND analisi dettagliata mappatura dei riarrangiamenti in 1 p p 6 e 8q e ha mostrato che le giunzioni di traslocazione erano spesso in prossimit&agrave; di siti fragili. Studi pi&ugrave; dettagliati del mBAND della linea cellulare OS MG-63 ha rivelato ladderlike segnali di pesce di ugualmente distanziati interchromosomal coamplifications di p22 6 p 21, 8q24 e 9 p 21 - in una regione omogenea colorazione (hsr). Amplificazioni focale che concordemente mappato l&#39;hsr erano localizzati a intervalli discreti di genomici di matrice SMRT CGH. La struttura complessa ampliconi in questo hsr suggerisce focale amplificazioni immediatamente adiacenti a microdelezioni. Inoltre, le regioni genomiche in cui c&#39;era la cancellazione/amplificazione avevano una preponderanza di siti fragili. In sintesi, questo studio ha fornito un ulteriore supporto per il ruolo del meccanismo di BFB e siti fragili nell&#39;agevolare l&#39;amplificazione del gene e riarrangiamento cromosomico in OS.

Un&#39;integrato risoluzione mBAND e submegabase affiancamento analisi set (SMRT) CGH array focale amplificazione, microdelezioni e le strutture di scaletta coerente con rottura-fusione-ponte ciclo di eventi nell&#39;osteosarcoma.

&#x9AA8;&#x8089;&#x816B;&#xFF08;OS&#xFF09;&#x306F;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4E0D;&#x5B89;&#x5B9A;&#x6027;&#x3068;&#x9AD8;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x6570;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5897;&#x5E45;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x308B;&#x3002;&#x7834;&#x640D;&#x878D;&#x5408;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C3;&#x30B8;&#xFF08;BFB&#xFF09;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EB;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x3067;&#x3001;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x518D;&#x914D;&#x5217;&#x3068;&#x764C;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5897;&#x5E45;&#x306E;&#x8D77;&#x6E90;&#x3092;&#x7814;&#x7A76;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x308B;in vitro&#x30E2;&#x30C7;&#x30EB;&#x306B;&#x304A;&#x3051;&#x308B;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x4E0D;&#x5B89;&#x5B9A;&#x6027;&#x306E;&#x5341;&#x5206;&#x306B;&#x78BA;&#x7ACB;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;&#x4ECA;&#x307E;&#x3067;&#x3001;&#x306A;&#x3044;&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x7684;&#x307E;&#x305F;&#x306F;OS&#x306E;BFB&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x7814;&#x7A76;&#x304C;&#x884C;&#x308F;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#xFF08;SMRT&#xFF09;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#xFF08;CGH&#xFF09;&#x3092;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x591A;&#x8272;&#x30D0;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#xFF08;mBAND&#xFF09;FISH&#x3068;submegabase&#x306E;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306F;&#x3001;4&#x3064;&#x306E;OS&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x3068;&#x4E00;&#x4EBA;&#x306E;&#x60A3;&#x8005;&#x306E;&#x816B;&#x760D;&#x3067;BFB&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x7F72;&#x540D;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x3066;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; BFB-&#x4E8C;&#x52D5;&#x539F;&#x4F53;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x3001;&#x53CD;&#x8EE2;&#x8907;&#x88FD;&#x3001;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x30E9;&#x3068;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x9593;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x671F;&#x5F85;&#x3055;&#x308C;&#x308B;&#x4E2D;&#x9593;&#x4F53;&#x3092;&#x540C;&#x5B9A;&#x3057;&#x5897;&#x5E45;&#x306F;&#x3001;&#x3055;&#x308C;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; mBAND&#x5206;&#x6790;&#x3067;&#x306F;&#x3001;1P&#x3001;6P&#x3001;&#x3068;&#x200B;&#x200B;8Q&#x306E;&#x518D;&#x7DE8;&#x6210;&#x306E;&#x8A73;&#x7D30;&#x306A;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3001;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x63A5;&#x5408;&#x304C;&#x8106;&#x5F31;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306B;&#x8FD1;&#x63A5;&#x3057;&#x3066;&#x983B;&#x7E41;&#x306B;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3002; OS&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;MG-63&#x306E;&#x8A73;&#x7D30;mBAND&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x5747;&#x4E00;&#x67D3;&#x8272;&#x9818;&#x57DF;&#xFF08;HSR&#xFF09;&#x306E;6p21&#x3001;8q24&#x306E;&#x3001;&#x3068;&#x4F53;9p21-P22&#x306E;&#x7B49;&#x9593;&#x9694;&#x306E;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x9593;coamplifications&#x306E;ladderlike&#x306E;FISH&#x30B7;&#x30B0;&#x30CA;&#x30EB;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002; concordantly HSR&#x306B;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D7;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30AB;&#x30EB;&#x5897;&#x5E45;&#x306F;SMRT&#x306E;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;CGH&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x96E2;&#x6563;&#x7684;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x9593;&#x9694;&#x306B;&#x5C40;&#x5728;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x3053;&#x306E;HSR&#x306E;&#x8907;&#x96D1;&#x306A;&#x30A2;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EA;&#x30B3;&#x30F3;&#x306E;&#x69CB;&#x9020;&#x306F;&#x3001;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x6B20;&#x5931;&#x306B;&#x96A3;&#x63A5;&#x7126;&#x70B9;&#x5897;&#x5E45;&#x3092;&#x793A;&#x5506;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x307E;&#x305F;&#x3001;&#x6B20;&#x5931;/&#x5897;&#x5E45;&#x304C;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x9818;&#x57DF;&#x306F;&#x3001;&#x8106;&#x5F31;&#x30B5;&#x30A4;&#x30C8;&#x306E;&#x512A;&#x4F4D;&#x6027;&#x3092;&#x6301;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x8981;&#x7D04;&#x3059;&#x308B;&#x3068;&#x3001;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;BFB&#x306E;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x3068;OS&#x3067;&#x306E;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5897;&#x5E45;&#x3068;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x518D;&#x914D;&#x5217;&#x3092;&#x5BB9;&#x6613;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x8106;&#x5F31;&#x90E8;&#x4F4D;&#x306E;&#x5F79;&#x5272;&#x306E;&#x3055;&#x3089;&#x306A;&#x308B;&#x30B5;&#x30DD;&#x30FC;&#x30C8;&#x3092;&#x63D0;&#x4F9B;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30D5;&#x30A9;&#x30FC;&#x30AB;&#x30EB;&#x5897;&#x5E45;&#x3001;&#x5FAE;&#x5C0F;&#x6B20;&#x5931;&#x3001;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x9AA8;&#x8089;&#x816B;&#x306E;&#x7834;&#x640D;&#x878D;&#x5408;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C3;&#x30B8;&#x30B5;&#x30A4;&#x30AF;&#x30EB;&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x3068;&#x4E00;&#x81F4;&#x3057;&#x3066;&#x30E9;&#x30C0;&#x30FC;&#x69CB;&#x9020;&#x306E;&#x7D71;&#x5408;MBAND&#x3068;Submegabase&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x30BB;&#x30C3;&#x30C8;&#xFF08;SMRT&#xFF09;&#x306E;CGH&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x89E3;&#x6790;

&#xB2E4;&#xB9AC; (OS) &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xBD88;&#xC548;&#xC815;&#xACFC; &#xB192;&#xC740; &#xBCF5;&#xC0AC; &#xBC88;&#xD638; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC99D;&#xD3ED;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD2B9;&#xC9D5;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD30C;&#xC190; &#xD4E8;&#xC804; &#xBE0C;&#xB9AC;&#xC9C0; (BFB) &#xC0AC;&#xC774;&#xD074; &#xC885;&#xC591; &#xBC0F; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC7AC;&#xBC30;&#xC5F4; &#xBC0F; &#xC554; &#xAC8C;&#xB188; &#xC99D;&#xD3ED;&#xC758; &#xAE30;&#xC6D0;&#xC744; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xD558;&#xB294; &#xB370; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; &#xCCB4; &#xC678; &#xBAA8;&#xB378; genomic &#xBD88;&#xC548;&#xC815;&#xC131;&#xC758; &#xC798; &#xC124;&#xB9BD; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098;, &#xC9C0;&#xAE08;&#xAE4C;&#xC9C0; OS&#xC5D0; BFB &#xC0AC;&#xAC74;&#xC758; &#xC544;&#xBB34; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; cytogenetic &#xB610;&#xB294; &#xAC8C;&#xB188; &#xBC30;&#xC5F4; &#xC5F0;&#xAD6C; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xD604;&#xC7AC;&#xC758; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0; &#xBA40;&#xD2F0; &#xCEEC;&#xB7EC; &#xBC34;&#xB529; &#xAE30;&#xC640; &#xC138;&#xD2B8; (mBAND) &#xBB3C;&#xACE0;&#xAE30;&#xC640; submegabase &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; (SMRT) &#xBC30;&#xC5F4; &#xBE44;&#xAD50; genomic &#xAD50; &#xC7A1; (CGH) &#xB370; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xD558; &#xACE0; 4 &#xAC1C;&#xC758; OS &#xC140; &#xB77C;&#xC778;&#xACFC; &#xD55C; &#xD658;&#xC790; &#xC885;&#xC591;&#xC5D0; BFB &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8;&#xC758; &#xAC8C;&#xB188; &#xC11C;&#xBA85;&#xC744; &#xC9C0;&#xB3C4;. BFB dicentric &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4;, &#xAC70;&#xAFB8;&#xB85C; &#xC911;&#xBCF5; &#xBC0F; &#xB0B4;&#xBD80;&#xC640; interchromosomal &#xD655;&#xB300;&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xC608;&#xC0C1;&#xB41C; &#xC911;&#xAC04;&#xCCB4;-&#xBC1C;&#xACAC; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xB294; mBAND &#xBD84;&#xC11D; 1 p, 6p, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; 8q &#xC7AC;&#xBC30;&#xC5F4;&#xC758; &#xB9E4;&#xD551; &#xC0C1;&#xC138; &#xD558; &#xACE0; &#xAE68;&#xC9C0;&#xAE30; &#xC26C;&#xC6B4; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8; &#xADFC;&#xC811;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC804; &#xC811;&#xD569; &#xC790;&#xC8FC; &#xD588;&#xB2E4; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xC5C8;&#xB2E4;. OS &#xC140; &#xC120; MG-63&#xC758; &#xB354; &#xC790;&#xC138;&#xD55C; mBAND &#xC5F0;&#xAD6C; 6 p 21, 8q24, &#xBC0F; homogeneously &#xC5BC;&#xB8E9; &#xC9C0;&#xC5ED; (hsr) 9 p 21-p22 &#xB3D9;&#xB4F1; &#xD558; &#xAC8C; &#xAC04;&#xACA9; &#xB454;&#xB41C; interchromosomal coamplifications&#xC758; ladderlike &#xBB3C;&#xACE0;&#xAE30; &#xC2E0;&#xD638;&#xB97C; &#xBC1D;&#xD614;&#xB2E4;. Hsr&#xC5D0; &#xB9E4;&#xD551;&#xB41C; concordantly &#xCD08;&#xC810; &#xD655;&#xB300; SMRT &#xBC30;&#xC5F4; CGH &#xC5EC; &#xC774;&#xC0B0; &#xAC8C;&#xB188; &#xAC04;&#xACA9;&#xC5D0; &#xC9C0;&#xC5ED;&#xD654; &#xB41C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC774; hsr&#xC5D0; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD55C; amplicon &#xAD6C;&#xC870; &#xCD08;&#xC810; &#xD655;&#xB300; &#xBC14;&#xB85C; &#xC606; microdeletions&#xC5D0; &#xC81C;&#xC548;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB610;&#xD55C;, &#xAC8C;&#xB188; &#xC601;&#xC5ED; &#xD588;&#xB2E4; &#xC0AD;&#xC81C;/&#xC99D;&#xD3ED; &#xAE68;&#xC9C0;&#xAE30; &#xC26C;&#xC6B4; &#xC704;&#xCE58;&#xC758; &#xC911;&#xB7C9;&#xC5D0; &#xC788;&#xC5B4;&#xC11C; &#xC6B0;&#xC138;&#xB97C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xC694;&#xC57D; &#xD558;&#xC790;&#xBA74;,&#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C; BFB &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998; &#xBC0F; &#xC720;&#xC804;&#xC790; &#xC99D;&#xD3ED; &#xBC0F; &#xC6B4;&#xC601; &#xCCB4;&#xC81C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC7AC;&#xBC30;&#xCE58; &#xCD09;&#xC9C4;&#xC5D0; &#xAE68;&#xC9C0;&#xAE30; &#xC26C;&#xC6B4; &#xC0AC;&#xC774;&#xD2B8;&#xC758; &#xC5ED;&#xD560;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xCD94;&#xAC00; &#xC9C0;&#xC6D0;&#xC744; &#xC81C;&#xACF5; &#xD558;&#xACE0;&#xC788;&#xB2E4;.

&#xD1B5;&#xD569; &#xB41C; mBAND &#xBC0F; submegabase &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xC9D1;&#xD569; (SMRT) CGH &#xBC30;&#xC5F4; &#xBD84;&#xC11D; &#xCD08;&#xC810; &#xD655;&#xB300;&#xC758; &#xAE30;&#xC640;, microdeletions, &#xC0AC;&#xB2E4;&#xB9AC; &#xAD6C;&#xC870; &#xD30C;&#xC190; &#xD4E8;&#xC804; &#xBE0C;&#xB9AC;&#xC9C0;&#xC640; &#xC77C;&#xCE58; &#xB2E4;&#xB9AC;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8;&#xB97C; &#xC8FC;&#xAE30;.

El osteosarcoma (OS) se caracteriza por la inestabilidad cromos&#xF3;mica y de gran n&#xFA;mero de copias de amplificaci&#xF3;n de genes. La rotura-fusi&#xF3;n-puente (CBA) del ciclo es un mecanismo bien establecido de la inestabilidad gen&#xF3;mica en tumores y en modelos in vitro para estudiar los or&#xED;genes de complejos reordenamientos cromos&#xF3;micos y la amplificaci&#xF3;n del genoma del c&#xE1;ncer. Sin embargo, hasta ahora, no ha habido citogen&#xE9;tico de alta resoluci&#xF3;n o los estudios de gen&#xF3;mica de la matriz de eventos de BFB en OS. En el presente estudio, multicolor bandas (mBAND) de pescado y submegabase resoluci&#xF3;n de impresi&#xF3;n en mosaico (SMRT) variedad de hibridaci&#xF3;n gen&#xF3;mica comparada (CGH) fueron utilizados para identificar y mapear las firmas gen&#xF3;micas de eventos BFB en cuatro l&#xED;neas celulares del sistema operativo y un tumor del paciente. Los productos intermedios esperados asociados con BFB-dic&#xE9;ntricos cromosomas, duplicaciones invertidas, y las intra e interchromosomal amplificaciones fueron identificados. an&#xE1;lisis de mBAND siempre un mapeo detallado de reordenamientos en 1p, 6p, y 8q y mostr&#xF3; que las uniones translocaci&#xF3;n eran a menudo muy cerca de los sitios fr&#xE1;giles. Los estudios m&#xE1;s detallados de mBAND l&#xED;nea celular OS MG-63 revel&#xF3; se&#xF1;ales de escalera de FISH equidistantes coamplifications interchromosomal de 6p21, 8q24, 9p21 y p22-en una regi&#xF3;n homog&#xE9;nea tinci&#xF3;n (RSS). Amplificaciones focales que concordantemente asignadas a la ISS fueron localizados a intervalos discretos gen&#xF3;micas por CGH array SMRT. La estructura de amplificaci&#xF3;n en este complejo de la ISS sugiere ampliaciones de actividad inmediatamente adyacentes a microdeleciones. Adem&#xE1;s, las regiones gen&#xF3;micas en el que no hab&#xED;a supresi&#xF3;n / amplificaci&#xF3;n ten&#xED;an una preponderancia de sitios fr&#xE1;giles. En resumen, este estudio ha proporcionado apoyo adicional a la funci&#xF3;n del mecanismo de BFB y los sitios fr&#xE1;giles en la facilitaci&#xF3;n de la amplificaci&#xF3;n de genes y el reordenamiento cromos&#xF3;mico en el sistema operativo.

Un sistema integrado de MBAND y Submegabase Set Resoluci&#xF3;n Mosaico (SMRT) CGH array an&#xE1;lisis de amplificaci&#xF3;n focal, microdeleciones y Estructuras escalera consistente con los acontecimientos del ciclo de rotura de puente de fusi&#xF3;n en el osteosarcoma

&#x5F53;&#x524D;&#x7EC6;&#x80DE;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x65B9;&#x6CD5; &#xFF08;&#x4F8B;&#x5982;&#xFF0C;G &#x5E26;&#x548C;&#x591A;&#x8272;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7ED8;&#x753B;&#xFF09; &#x5141;&#x8BB8;&#x68C0;&#x6D4B;&#x7684;&#x6613;&#x4F4D;&#x4E8B;&#x4EF6;&#xFF0C;&#x4F46;&#x8BE5;&#x51B3;&#x8BAE;&#x4EE5; (a) &#x5B9A;&#x4F4D;&#x7CBE;&#x786E;&#x5728;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5E26;&#x4E00;&#x7EA7;&#x65AD;&#x70B9;&#x6216; (b) &#x6B67;&#x89C6;&#x5E73;&#x8861;&#x6613;&#x4F4D;&#x4E0E;&#x526F;&#x672C;&#x6570;&#x6539;&#x5EFA;&#x672A;&#x66FE;&#x62A5;&#x544A;&#xFF0C;&#x6216;&#x4E0D;&#x5B8C;&#x5168;&#x5E73;&#x8861;&#x7684;&#x6613;&#x4F4D;&#x6613;&#x4F4D;&#x7684;&#x7F3A;&#x4E4F;&#x3002;&#x5728;&#x6B64;&#x7814;&#x7A76;&#x4E2D;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x5C55;&#x793A; cytogenetically &#x5E73;&#x8861;&#x7684;&#x6613;&#x4F4D;&#x5176;&#x5B9E;&#x662F;&#x5E38;&#x4F34;&#x6709;&#x8282;&#x6BB5;&#x6027;&#x7684;&#x6536;&#x76CA;&#x6216;&#x635F;&#x5931;&#x7684; DNA&#x3002;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x62FC;&#x8D34;&#x8DEF;&#x5F84; BAC &#x6570;&#x7EC4;&#x7684;&#x6700;&#x65B0;&#x8FDB;&#x5C55;&#x5DF2;&#x542F;&#x7528;&#x62FC;&#x8D34;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x5206;&#x6790;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x8282;&#x6BB5;&#x526F;&#x672C;&#x7F16;&#x53F7;&#x72B6;&#x6001;&#x3002;&#x7EC4;&#x5408;&#x62FC;&#x8D34;&#x51B3;&#x8BAE; BAC &#x9635;&#x5217;&#x6BD4;&#x8F83;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6742;&#x4EA4; &#xFF08;&#x6570;&#x7EC4;&#x8BA1;&#x7B97;&#x5168;&#x606F;&#x56FE;&#xFF09; &#x4E0E; G &#x5E26;&#x5206;&#x6790;&#x548C;&#x591A;&#x8272;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7ED8;&#x753B;&#x7684;&#x505A;&#x6CD5;&#xFF0C;&#x5982;&#x6838;&#x578B;&#x5206;&#x6790;&#x5149;&#x8C31;&#x6280;&#x672F; (&#x5929;&#x7A7A;) &#x65B9;&#x4FBF;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x53D8;&#x5316;&#x4E0D;&#x5B8C;&#x5168;&#x5E73;&#x8861;&#x6613;&#x4F4D;&#x4E0E;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x6620;&#x5C04;&#x3002;&#x4F7F;&#x7528;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x5168;&#x606F;&#x6570;&#x7EC4;&#x7684;&#x6539;&#x8FDB;&#x7684;&#x7248;&#x672C;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x6709;&#x63A8;&#x8BBA;&#x6574;&#x4E2A;&#x4E09; cytogenetically &#x4EBA;&#x4EEC;&#x719F;&#x77E5;&#x7684;&#x524D;&#x5217;&#x817A;&#x764C;&#x7EC6;&#x80DE;&#x682A; &#xFF08;PC3&#x3001; DU145&#x3001; LNCaP)&#xFF0C;&#x4EE5;&#x786E;&#x5B9A;&#x662F;&#x5426;&#x6613;&#x4F4D;&#x5C40;&#x7076;&#x6027;&#x6536;&#x76CA;&#x548C;&#x635F;&#x5931;&#x7684; DNA &#x4E0E;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x7684;&#x590D;&#x5236;&#x7F16;&#x53F7;&#x72B6;&#x6001;&#x3002;&#x5728;&#x6211;&#x4EEC;&#x786E;&#x5B9A;&#x8FB9;&#x754C;&#x7684; 170&#x3001; 80&#xFF0C;&#x548C; 34 &#x7684;&#x5DF2;&#x77E5;&#x548C;&#x65B0;&#x526F;&#x672C;&#x7684; 78 kb &#x5E73;&#x94FA;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x5728;&#x8FD9;&#x4E9B;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x4E2D;&#x7684;&#x6570;&#x5B57;&#x6539;&#x5EFA; (CNA) &#x7EBF;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#xFF0C;&#x5206;&#x522B;&#x3002;&#x4E09;&#x5341;&#x4E09; 36 &#x5DF2;&#x77E5;&#x6613;&#x4F4D;&#x7CFB; &#xFF08;92%&#xFF0C;P &lt; 0.001) DU145 &#x5728;&#x4E0E;&#x8282;&#x6BB5; CNA &#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;&#x540C;&#x6837;&#xFF0C;80%(P &lt; 0.001&#xFF09; &#x5DF2;&#x77E5;&#x7684;&#x6613;&#x4F4D;&#x7CFB;&#x5728; LNCaP &#x4E2D;&#x663E;&#x793A;&#x534F;&#x4F1A;&#x3002;&#x867D;&#x7136;&#x8BB8;&#x591A;&#x6613;&#x4F4D;&#x65AD;&#x70B9;&#x5C55;&#x793A; PC3 &#x8282;&#x6BB5;&#x6027;&#x6539;&#x53D8;&#xFF0C;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x91CD;&#x6392;&#x7684;&#x6A21;&#x5F0F;&#x662F;&#x7528;&#x4E8E;&#x7EFC;&#x5408;&#x534F;&#x4F1A; CNA &#x8FB9;&#x754C;&#x592A;&#x590D;&#x6742;&#x3002;&#x6211;&#x4EEC;&#x7684;&#x7814;&#x7A76;&#x7ED3;&#x679C;&#x63ED;&#x793A;&#x80BF;&#x7624;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x4E2D;&#x7684;&#x4E0D;&#x5B8C;&#x5168;&#x5E73;&#x8861;&#x7684;&#x6613;&#x4F4D;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x51FA;&#x73B0;&#x9891;&#x7387;&#x8FDC;&#x9AD8;&#x4E8E;&#x5148;&#x524D;&#x8868;&#x73B0;&#x51FA;&#x7684;&#x73B0;&#x8C61;&#x3002;

Cytogenetically &#x5E73;&#x8861;&#x7684;&#x6613;&#x4F4D;&#x662F;&#x7126;&#x526F;&#x672C;&#x6570;&#x6539;&#x5EFA;&#x4E0E;&#x76F8;&#x5173;&#x8054;&#x3002;

Current cytogenetic methods (e.g., G-banding and multicolor chromosomal painting) allow detection of translocation events but lack the resolution to (a) locate the breakpoints precisely at the chromosome band level or (b) discriminate balanced translocations from translocations with copy number alterations not previously reported, or imperfectly balanced translocations. In this study, we demonstrate that cytogenetically balanced translocations are in fact frequently associated with segmental gain or loss of DNA. The recent development of a whole genome tiling path BAC array has enabled tiling resolution analysis of genomic segmental copy number status. Combining tiling resolution BAC array comparative genomic hybridization (array CGH) with G-Banding analysis and multicolor chromosomal painting approaches such as spectral karyotyping (SKY) facilitates high-resolution mapping of genomic alterations associated with imperfectly balanced translocations. Using a refined version of our CGH array we have deduced the copy number status throughout the genomes of three cytogenetically well-characterized prostate cancer cell lines (PC3, DU145, LNCaP) to determine whether translocations are associated with focal gains and losses of DNA. At 78 kb tiling resolution we identified the boundaries of 170, 80, and 34 known and novel copy number alterations (CNA) in these cell line genomes, respectively. Thirty-three of the 36 known translocations (92%, P < 0.001) in DU145 were associated with segmental CNA. Likewise, 80% (P < 0.001) of the known translocations showed association in LNCaP. Although many translocation breakpoints exhibit segmental alteration in PC3, the pattern of chromosomal rearrangements is too complex for use in comprehensive association with CNA boundaries. Our results reveal that imperfectly balanced translocations in tumor genomes are a phenomenon that occurs at frequencies much higher than previously demonstrated.

Cytogenetically balanced translocations are associated with focal copy number alterations.

M&#xE9;thodes cytog&#xE9;n&#xE9;tiques actuelles (par exemple, G-banding et multicolore peinture chromosomique) permettent la d&#xE9;tection des &#xE9;v&#xE9;nements de translocation, mais n&#x26;#39;ont pas la r&#xE9;solution de (a) de localiser les points d&#x26;#39;arr&#xEA;t pr&#xE9;cis&#xE9;ment au niveau de la bande chromosomique ou (b) une discrimination translocations &#xE9;quilibr&#xE9;es par des translocations avec des alt&#xE9;rations du nombre de copies non indiqu&#xE9; pr&#xE9;c&#xE9;demment, ou imparfaitement &#xE9;quilibr&#xE9;e translocations. Dans cette &#xE9;tude, nous d&#xE9;montrons que les translocations &#xE9;quilibr&#xE9;es sont cytog&#xE9;n&#xE9;tique en fait fr&#xE9;quemment associ&#xE9;e &#xE0; un gain ou une perte segmentaire de l&#x26;#39;ADN. Le d&#xE9;veloppement r&#xE9;cent d&#x26;#39;un carrelage g&#xE9;nome panoplie chemin BAC a permis l&#x26;#39;analyse de carrelage r&#xE9;solution de g&#xE9;nomique &#xE9;tat de la copie le num&#xE9;ro segmentaire. La combinaison de carrelage r&#xE9;solution tableau BAC g&#xE9;nomique comparative d&#x26;#39;hybridation (CGH array) avec des bandes G analyses et approches multicolores peinture chromosomiques telles que caryotype spectral (SKY) facilite la cartographie haute r&#xE9;solution des alt&#xE9;rations g&#xE9;nomiques associ&#xE9;es &#xE0; des translocations &#xE9;quilibr&#xE9;es imparfaitement. En utilisant une version raffin&#xE9;e de notre CGH array, nous avons d&#xE9;duit l&#x26;#39;&#xE9;tat de nombre de copies &#xE0; travers les g&#xE9;nomes de trois cytog&#xE9;n&#xE9;tique bien caract&#xE9;ris&#xE9;s lignes cellulaires du cancer de la prostate (PC3, DU145, LNCaP) afin de d&#xE9;terminer si les translocations sont associ&#xE9;es &#xE0; des gains et des pertes de liaison de l&#x26;#39;ADN. &#xC0; 78 KB R&#xE9;solution de carrelage, nous avons identifi&#xE9; les limites de 170, 80 et 34 connus et nouveaux alt&#xE9;rations du nombre de copies (CNA) dans ces g&#xE9;nomes de lign&#xE9;es cellulaires, respectivement. Trente-trois des 36 translocations connues (92%, P &#x26;lt;0,001) chez les DU145 ont &#xE9;t&#xE9; associ&#xE9;s &#xE0; segmentaire de l&#x26;#39;AIIC. De m&#xEA;me, 80% (P &#x26;lt;0,001) des translocations connues ont montr&#xE9; une association en LNCaP. Bien que les points d&#x26;#39;arr&#xEA;t de translocation de nombreux pr&#xE9;sentent alt&#xE9;ration segmentaire PC3, le mod&#xE8;le de r&#xE9;arrangements chromosomiques est trop complexe pour une utilisation en association compl&#xE8;te avec les limites de l&#x26;#39;AIIC. Nos r&#xE9;sultats r&#xE9;v&#xE8;lent que les translocations &#xE9;quilibr&#xE9;es imparfaitement dans les g&#xE9;nomes tumoraux sont un ph&#xE9;nom&#xE8;ne qui se produit &#xE0; des fr&#xE9;quences beaucoup plus &#xE9;lev&#xE9;es que pr&#xE9;c&#xE9;demment d&#xE9;montr&#xE9;.

Translocations &#xE9;quilibr&#xE9;es cytog&#xE9;n&#xE9;tique sont associ&#xE9;s avec focaux modifications du nombre de copies

Aktuelle Molekularzytogenetische Methoden (z.B. G-Streifenbildung und mehrfarbigen chromosomalen Gem&auml;lde) zulassen Erkennung von Translokation Ereignisse aber fehlen die Aufl&ouml;sung (a) suchen die Haltepunkte genau auf Chromosom-Band Ebene oder (b) diskriminieren Umsiedlung von Translokationen mit Kopie Zahl &Auml;nderungen bisher nicht gemeldet oder unvollst&auml;ndig ausgeglichen Translokationen ausgeglichen. In dieser Studie zeigen wir, dass zytogenetisch ausgewogene Translokationen in der Tat h&auml;ufig mit segmentaler Gewinn oder Verlust der DNA verbunden sind. Die j&uuml;ngste Entwicklung eines gesamten Genoms Fliesen Pfad-BAC-Arrays hat Fliesen Aufl&ouml;sung Analyse der genomischen segmentale Kopie Zahl Status aktiviert. Kombination Fliesen Aufl&ouml;sung BAC-Array vergleichende genomische Hybridisierung (CGH Array) mit G-Banding Analyse und mehrfarbigen chromosomalen Malerei Ans&auml;tze wie die spektrale Chromosomenanalyse (SKY) erm&ouml;glicht hochaufl&ouml;sende Kartierung der genomischen Ver&auml;nderungen, unvollst&auml;ndig ausgeglichen Translokationen zugeordnet. Eine verfeinerte Version der unsere CGH Array mithilfe haben wir abgeleitet Anzahl Kopierstatus in den Genomen von drei zytogenetisch gut charakterisierten Prostatakrebs-Zelllinien (PC3, DU145, LNCaP), um festzustellen, ob die Umsiedlung fokale Gewinne und Verluste der DNA zugeordnet sind. Bei 78 kb-Fliesen-Aufl&ouml;sung, dass wir die Grenzen der 170 und 80 34 bekannte und neuartige Kopie gekennzeichnet Zeile Anzahl &Auml;nderungen (CNA) in diese Zelle Genome, beziehungsweise. 33 Von 36 bekannten-Translokationen (92 %, P &lt; 0.001) DU145 segmentale CNA zugeordnet waren. Ebenso 80 % (P &lt; 0.001) von den bekannten Translokationen zeigte die Vereinigung in LNCaP. Obwohl viele Translokation Haltepunkte segmentale Ver&auml;nderung in PC3 aufweisen, ist das Muster der chromosomalen Rearrangements zu komplex f&uuml;r den Einsatz in umfassenden Verband mit CNA Grenzen. Unsere Ergebnisse zeigen unvollst&auml;ndig ausgeglichen Umsiedlung im Tumor Genome sind ein Ph&auml;nomen, das auftritt, bei Frequenzen deutlich h&ouml;her als zuvor gezeigt.

Zytogenetisch ausgewogene Translokationen sind fokale Kopie Zahl &Auml;nderungen zugeordnet.

Metodi citogenetici correnti (ad esempio, G-fascia e multicolor cromosomica pittura) consentono il rilevamento di eventi di traslocazione, ma la mancanza di risoluzione (a) individuare i punti di interruzione proprio a livello di banda cromosomica o (b) discriminare bilanciato traslocazioni da traslocazioni con alterazioni numeri di copia non precedentemente segnalati, o traslocazioni imperfettamente equilibrate. In questo studio dimostriamo che traslocazioni citogeneticamente equilibrate infatti sono frequentemente associate con segmentale guadagno o perdita di DNA. Il recente sviluppo di una matrice di BAC percorso affiancamento intero genoma ha permesso analisi risoluzione piastrellatura di stato numero copia genomic segmentale. Risoluzione di affiancamento combinando BAC matrice ibridazione genomic comparativa (CGH array) con analisi G-fascia e approcci multicolor pittura cromosomiche come spettrale cariotipo (SKY) facilita la mappatura ad alta risoluzione di alterazioni genomiche connesso con traslocazione bilanciate imperfettamente. Utilizzando una versione raffinata del nostro array CGH noi abbiamo dedotto lo stato numero della copia in tutto il genoma di tre linee di cellule di cancro alla prostata citogeneticamente ben caratterizzati (PC3, DU145, LNCaP) per determinare se le traslocazioni sono associate con focali guadagni e le perdite del DNA. A risoluzione di affiancamento 78 kb che abbiamo individuato i limiti di 170, 80 e 34 noto e romanzo copia numeri alterazioni (CNA) in queste cellule linea genomi, rispettivamente. Le traslocazioni note 36 e trenta-tre (92%, P &lt; 0.001) nel DU145 erano associati CNA segmentale. Allo stesso modo, l&#39;80% (P &lt; 0,001) delle traslocazioni note ha mostrato associazione LNCaP. Anche se molti punti di interruzione traslocazione esibiscono segmentale alterazione in PC3, il modello dei riarrangiamenti cromosomici &egrave; troppo complesso per l&#39;uso in associazione completa con i confini CNA. I nostri risultati rivelano che imperfettamente equilibrate traslocazioni in genomi tumorali sono un fenomeno che si verifica a frequenze molto pi&ugrave; elevate rispetto dimostrato in precedenza.

Traslocazioni citogeneticamente equilibrate sono associate con numeri alterazioni focali copia.

&#x73FE;&#x5728;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#xFF08;&#x4F8B;&#x3048;&#x3070;&#x3001;G-&#x30D0;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x3068;&#x591A;&#x8272;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5857;&#x88C5;&#xFF09;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x4E8B;&#x8C61;&#x306E;&#x691C;&#x51FA;&#x3092;&#x53EF;&#x80FD;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x304C;&#x3001;&#xFF08;&#xFF09;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x30D0;&#x30F3;&#x30C9;&#x30EC;&#x30D9;&#x30EB;&#x3067;&#x6B63;&#x78BA;&#x306B;&#x30D6;&#x30EC;&#x30FC;&#x30AF;&#x30DD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x3092;&#x898B;&#x3064;&#x3051;&#x308B;&#x304B;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#xFF08;b&#xFF09;&#x306E;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x6570;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x306F;&#x306A;&#x3044;&#x3068;&#x306E;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x304B;&#x3089;&#x30D0;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x3068;&#x308C;&#x305F;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x3092;&#x533A;&#x5225;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x304C;&#x4E0D;&#x8DB3;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x4E0D;&#x5B8C;&#x5168;&#x30D0;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x3068;&#x308C;&#x305F;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x3092;&#x5831;&#x544A;&#x3057;&#x305F;&#x3002;&#x672C;&#x7814;&#x7A76;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x7D30;&#x80DE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x30D0;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x3068;&#x308C;&#x305F;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x304C;&#x5B9F;&#x969B;&#x306B;&#x983B;&#x7E41;&#x306B;DNA&#x306E;&#x30BB;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;&#x640D;&#x76CA;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x793A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x3002;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EA;&#x30F3;&#x30B0;&#x306E;&#x30D1;&#x30B9;BAC&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x6700;&#x8FD1;&#x306E;&#x958B;&#x767A;&#x306F;&#x3001;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5206;&#x7BC0;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x6570;&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x306E;&#x5206;&#x89E3;&#x80FD;&#x89E3;&#x6790;&#x3092;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x306B;&#x306A;&#x308A;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; G-&#x30D0;&#x30F3;&#x30C7;&#x30A3;&#x30F3;&#x30B0;&#x5206;&#x6790;&#x306A;&#x3069;&#x306E;&#x30B9;&#x30DA;&#x30AF;&#x30C8;&#x30EB;&#x6838;&#x578B;&#x5206;&#x6790;&#x306E;&#x3088;&#x3046;&#x306A;&#x591A;&#x8272;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5857;&#x88C5;&#x30A2;&#x30D7;&#x30ED;&#x30FC;&#x30C1;&#x3067;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;BAC&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#xFF08;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;CGH&#xFF09;&#x3092;&#x7D44;&#x307F;&#x5408;&#x308F;&#x305B;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3067;&#x3001;&#xFF08;SKY&#xFF09;&#x4E0D;&#x5B8C;&#x5168;&#x30D0;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x3068;&#x308C;&#x305F;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3059;&#x308B;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5909;&#x7570;&#x306E;&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x306E;&#x30DE;&#x30C3;&#x30D4;&#x30F3;&#x30B0;&#x3092;&#x5BB9;&#x6613;&#x306B;&#x3057;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x79C1;&#x305F;&#x3061;&#x306E;CGH&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x306E;&#x6D17;&#x7DF4;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30D0;&#x30FC;&#x30B8;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;&#x3001;&#x6211;&#x3005;&#x306F;&#x3001;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x304C;&#x7126;&#x70B9;&#x5229;&#x76CA;&#x304A;&#x3088;&#x3073;DNA&#x306E;&#x640D;&#x5931;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;&#x304B;&#x3069;&#x3046;&#x304B;&#x3092;&#x5224;&#x65AD;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306E;3&#x3064;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x3088;&#x304F;&#x7279;&#x5FB4;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x305F;&#x524D;&#x7ACB;&#x817A;&#x764C;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#xFF08;PC3&#x3001;DU145&#x3001;LNCaP&#x7D30;&#x80DE;&#xFF09;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5168;&#x4F53;&#x306E;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x6570;&#x306E;&#x72B6;&#x614B;&#x3092;&#x63A8;&#x5B9A;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x308C;&#x305E;&#x308C;&#x3001;78&#x30AD;&#x30ED;&#x30D0;&#x30A4;&#x30C8;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x306E;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x3067;&#x306F;&#x3001;80&#x3001;170&#x306E;&#x5883;&#x754C;&#x3092;&#x8B58;&#x5225;&#x3057;&#x3001;&#x3053;&#x308C;&#x3089;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x682A;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;34&#x65E2;&#x77E5;&#x304A;&#x3088;&#x3073;&#x65B0;&#x898F;&#x306E;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x6570;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#xFF08;CNA&#xFF09;&#x3002; DU145 36&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306E;&#x4E09;&#x5341;&#x4E09;&#xFF08;92&#xFF05;&#x3001;P &#x26;lt;0.001&#xFF09;&#x304C;&#x5206;&#x7BC0;CNA&#x3068;&#x95A2;&#x9023;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x540C;&#x69D8;&#x306B;&#x3001;&#x65E2;&#x77E5;&#x306E;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306E;80&#xFF05;&#xFF08;P &#x26;lt;0.001&#xFF09;&#x306F;&#x3001;LNCaP&#x7D30;&#x80DE;&#x306B;&#x95A2;&#x9023;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x3002;&#x591A;&#x304F;&#x306E;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306E;&#x30D6;&#x30EC;&#x30FC;&#x30AF;&#x30DD;&#x30A4;&#x30F3;&#x30C8;&#x306F;&#x3001;PC3&#x306E;&#x5206;&#x7BC0;&#x5909;&#x5316;&#x3092;&#x793A;&#x3059;&#x304C;&#x3001;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x518D;&#x914D;&#x5217;&#x306E;&#x30D1;&#x30BF;&#x30FC;&#x30F3;&#x306F;&#x3001;CNA&#x306E;&#x5883;&#x754C;&#x3068;&#x306E;&#x5305;&#x62EC;&#x7684;&#x306A;&#x95A2;&#x9023;&#x3067;&#x4F7F;&#x7528;&#x3059;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x306F;&#x8907;&#x96D1;&#x3059;&#x304E;&#x308B;&#x3002;&#x6211;&#x3005;&#x306E;&#x7D50;&#x679C;&#x306F;&#x3001;&#x816B;&#x760D;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x306E;&#x4E0D;&#x5B8C;&#x5168;&#x306A;&#x30D0;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x3068;&#x308C;&#x305F;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x306F;&#x3001;&#x4EE5;&#x524D;&#x306B;&#x793A;&#x3057;&#x305F;&#x3088;&#x308A;&#x3082;&#x306F;&#x308B;&#x304B;&#x306B;&#x9AD8;&#x3044;&#x5468;&#x6CE2;&#x6570;&#x3067;&#x767A;&#x751F;&#x3059;&#x308B;&#x73FE;&#x8C61;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x3092;&#x660E;&#x3089;&#x304B;&#x306B;&#x3057;&#x305F;&#x3002;

&#x7D30;&#x80DE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x7684;&#x306B;&#x30D0;&#x30E9;&#x30F3;&#x30B9;&#x306E;&#x3068;&#x308C;&#x305F;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x304C;&#x7126;&#x70B9;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x6570;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x3068;&#x95A2;&#x9023;&#x4ED8;&#x3051;&#x3089;&#x308C;&#x3066;&#x3044;&#x308B;

&#xD604;&#xC7AC; cytogenetic &#xBA54;&#xC11C;&#xB4DC; (&#xC608;&#xB97C; &#xB4E4;&#xC5B4;, G &#xB760;&#xC640; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAC00;&#xC9C0; &#xBE5B;&#xAE54;&#xC758; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xADF8;&#xB9BC;) &#xC804; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8; &#xD558;&#xC9C0;&#xB9CC; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4;&#xB97C; () &#xC815;&#xD655; &#xD558; &#xAC8C; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xBC34;&#xB4DC; &#xC218;&#xC900;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC911;&#xB2E8;&#xC810;&#xC744; &#xCC3E;&#xAC70;&#xB098; (b) &#xCC28;&#xBCC4; &#xADE0;&#xD615; &#xBCF5;&#xC0AC;&#xBCF8; &#xBC88;&#xD638; &#xBCC0;&#xACBD; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xBCF4;&#xACE0; &#xB41C; translocations &#xB610;&#xB294; &#xBD88;&#xC644;&#xC804; &#xADE0;&#xD615;&#xB41C; translocations translocations &#xBD80;&#xC871;&#xC758; &#xAC80;&#xCD9C;&#xC744; &#xD5C8;&#xC6A9;. &#xC774; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xC5D0;&#xC11C;&#xB294; cytogenetically &#xADE0;&#xD615;&#xB41C; translocations&#xB294; &#xC0AC;&#xC2E4; segmental &#xC774;&#xB4DD; &#xB610;&#xB294; &#xC190;&#xC2E4;&#xC758; DNA&#xC640; &#xC790;&#xC8FC; &#xC5F0;&#xACB0; &#xBCF4;&#xC5EC; &#xC90D;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xAE30;&#xC640; &#xACBD;&#xB85C; BAC &#xBC30;&#xC5F4;&#xC758; &#xCD5C;&#xADFC; &#xAC1C;&#xBC1C;&#xC740; &#xAC8C;&#xB188; segmental &#xBCF5;&#xC0AC;&#xBCF8; &#xBC88;&#xD638; &#xC0C1;&#xD0DC;&#xC758; &#xAE30;&#xC640; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xBD84;&#xC11D;&#xC744; &#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xD558; &#xACE0; &#xC788;&#xB2E4;. &#xC870;&#xD569; &#xAE30;&#xC640; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xAD50; BAC &#xBC30;&#xC5F4; &#xBE44;&#xAD50; genomic &#xC7A1; (&#xBC30;&#xC5F4; CGH) G &#xBC34;&#xB529; &#xBD84;&#xC11D;&#xACFC; &#xC2A4;&#xD399;&#xD2B8;&#xB7FC; karyotyping (&#xC2A4;&#xCE74;&#xC774;) &#xB4F1; &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAC00;&#xC9C0; &#xBE5B;&#xAE54;&#xC758; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xADF8;&#xB9BC; &#xC811;&#xADFC; &#xC6A9;&#xC774; &#xBD88;&#xC644;&#xC804; &#xADE0;&#xD615;&#xB41C; translocations&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; genomic &#xBCC0;&#xACBD;&#xC758; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xB9E4;&#xD551;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; CGH &#xBC30;&#xC5F4;&#xC758; &#xC815;&#xC81C; &#xB41C; &#xBC84;&#xC804;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xBCF5;&#xC0AC; &#xBC88;&#xD638; &#xC0C1;&#xD0DC; 3 cytogenetically well-characterized &#xC804;&#xB9BD;&#xC120; &#xC554; &#xC138;&#xD3EC; &#xB77C;&#xC778; translocations &#xCD08;&#xC810; &#xC190;&#xC775; DNA&#xC640; &#xC5F0;&#xACB0; &#xC5EC;&#xBD80; &#xD655;&#xC778; (PC3, DU145, LNCaP)&#xC758; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xB97C; &#xD1B5;&#xD574; &#xCD94;&#xB860; &#xC788;&#xB2E4; &#xC6B0;&#xB9AC;. 78 Kb &#xAE30;&#xC640; &#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; 170, 80, &#xADF8;&#xB9AC;&#xACE0; 34 &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; &#xC18C;&#xC124; &#xCE74;&#xD53C;&#xC758; &#xACBD;&#xACC4; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xBC88;&#xD638; &#xBCC0;&#xACBD; (CNA)&#xC774;&#xC774; &#xC140;&#xC5D0; &#xAC01;&#xAC01; &#xAC8C;&#xB188;, &#xB77C;&#xC778;. 36 &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; translocations&#xC758; 30-3 (92%, P &lt; 0.001) DU145 segmental CNA&#xC640; &#xAD00;&#xB828; &#xB41C; &#xD588;&#xB2E4;. &#xB9C8;&#xCC2C;&#xAC00;&#xC9C0;&#xB85C;, 80% (P &lt; 0.001) &#xC54C;&#xB824;&#xC9C4;&#xB41C; translocations&#xC758; Lncap&#xC5D0;&#xC11C; &#xD611;&#xD68C;&#xB97C; &#xBCF4;&#xC5EC;&#xC8FC;&#xC5C8;&#xB2E4;. &#xB9CE;&#xC740; &#xC804; &#xC911;&#xB2E8;&#xC810; PC3 segmental &#xBCC0;&#xACBD; &#xC804;&#xC2DC;, &#xBE44;&#xB85D; &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC7AC;&#xBC30;&#xC5F4;&#xC758; &#xD328;&#xD134;&#xC740; CNA &#xACBD;&#xACC4;&#xC640; &#xD3EC;&#xAD04;&#xC801;&#xC778; &#xD611;&#xD68C;&#xC5D0; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xAE30; &#xC704;&#xD574; &#xB108;&#xBB34; &#xBCF5;&#xC7A1; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xC758; &#xACB0;&#xACFC; &#xACF5;&#xAC1C; &#xC885;&#xC591; &#xC720;&#xC804;&#xC790;&#xC5D0; &#xBD88;&#xC644;&#xC804; &#xADE0;&#xD615;&#xB41C; translocations&#xB294; &#xC774;&#xC804;&#xC5D0; &#xC124;&#xBA85; &#xBCF4;&#xB2E4; &#xD6E8;&#xC52C; &#xB354; &#xB192;&#xC740; &#xC8FC;&#xD30C;&#xC218;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558;&#xB294; &#xD604;&#xC0C1;.

Cytogenetically &#xADE0;&#xD615;&#xB41C; translocations &#xCD08;&#xC810; &#xBCF5;&#xC0AC;&#xBCF8; &#xBC88;&#xD638; &#xBCC0;&#xACBD; &#xC5F0;&#xACB0; &#xB429;&#xB2C8;&#xB2E4;.

Los m&#xE9;todos actuales citogen&#xE9;ticas (por ejemplo, el Grupo de anillamiento y la pintura multicolor de los cromosomas) permitir la detecci&#xF3;n de eventos de translocaci&#xF3;n, pero carecen de la resoluci&#xF3;n (a) localizar los puntos de interrupci&#xF3;n, precisamente, en el nivel de la banda cromos&#xF3;mica o (b) discriminar translocaciones equilibradas de desplazamientos con alteraciones n&#xFA;mero de copias no se inform&#xF3; anteriormente, o imperfectamente translocaciones equilibradas. En este estudio, se demuestra que las translocaciones equilibradas citogen&#xE9;ticamente son, de hecho, con frecuencia asociada con el aumento o p&#xE9;rdida de segmentos de ADN. El reciente desarrollo de un suelo de baldosas todo el genoma amplia trayectoria BAC ha permitido el an&#xE1;lisis de suelo de baldosas resoluci&#xF3;n de gen&#xF3;mica estado segmentaria n&#xFA;mero de copias. La combinaci&#xF3;n de azulejos de resoluci&#xF3;n variedad de hibridaci&#xF3;n gen&#xF3;mica comparada BAC (CGH array) con el Grupo de anillamiento de an&#xE1;lisis y enfoques de la pintura multicolor cromos&#xF3;micas como el cariotipo espectral (SKY) facilita la cartograf&#xED;a de alta resoluci&#xF3;n de las alteraciones gen&#xF3;micas asociadas con translocaciones equilibradas imperfecta. Utilizando una versi&#xF3;n mejorada de nuestro CGH array que hemos deducido el estado el n&#xFA;mero de copias a lo largo de los genomas de tres citogen&#xE9;ticamente bien caracterizados l&#xED;neas celulares de c&#xE1;ncer de pr&#xF3;stata (PC3, DU145, LNCaP) para determinar si las translocaciones se asocian con las ganancias de coordinaci&#xF3;n y las p&#xE9;rdidas de ADN. A los 78 kb resoluci&#xF3;n de suelo de baldosas se identificaron los l&#xED;mites de 170, 80 y 34 alteraciones copia conocidos y nuevos n&#xFA;meros (CNA) en estos genomas de l&#xED;neas celulares, respectivamente. Treinta y tres de los 36 desplazamientos conocidos (92%, P &#x26;lt;0,001) en DU145 se asociaron con la CNA y segmentaria. Del mismo modo, el 80% (P &#x26;lt;0,001) de las translocaciones conocidas mostraron asociaci&#xF3;n en LNCaP. Aunque muchos puntos de ruptura de translocaci&#xF3;n muestran una alteraci&#xF3;n segmentaria en el CP3, el patr&#xF3;n de reordenamientos cromos&#xF3;micos es demasiado complejo para su uso en asociaci&#xF3;n global con los l&#xED;mites de la CNA. Nuestros resultados revelan que las translocaciones equilibradas imperfecta en los genomas de tumores son un fen&#xF3;meno que se produce en frecuencias mucho m&#xE1;s altas de lo que se ha demostrado.

Las translocaciones balanceadas citogen&#xE9;ticamente est&#xE1;n asociados con alteraciones focales n&#xFA;mero de copias

&#x798F;&#x5C14;&#x9A6C;&#x6797;&#x56FA;&#x5B9A;&#x77F3;&#x8721;&#x5305;&#x57CB; &#xFF08;FFPE&#xFF09; &#x7EC4;&#x7EC7;&#x4EE3;&#x8868;&#x6863;&#x6848;&#x751F;&#x7269;&#x6750;&#x6599;&#x53EF;&#x7528;&#x7684;&#x4EBA;&#x7C7B;&#x764C;&#x75C7;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x5B66;&#x7814;&#x7A76;&#x7684;&#x6700;&#x5927;&#x6765;&#x6E90;&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6700;&#x597D;&#x7684;&#x53D1;&#x5C55;&#x4F7F;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6269;&#x589E; (WGA) &#x4F7F;&#x7528;&#x4ECE; FFPE &#x7EC4;&#x7EC7;&#x4E2D;&#x63D0;&#x53D6; DNA &#x7684;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x591A;&#x7EDE;&#x7EBF;&#x4F4D;&#x79FB;&#x653E;&#x5927; (MDA) &#x662F;&#x4F7F;&#x7528; Bst DNA &#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x7684;&#x5927;&#x7247;&#x6BB5;&#x7684; WGA &#x7B49;&#x6E29;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3002;&#x5230;&#x76EE;&#x524D;&#x4E3A;&#x6B62;&#xFF0C;MDA &#x5DF2;&#x53EF;&#x884C;&#x53EA;&#x4E3A;&#x65B0;&#x9C9C;&#x6216;&#x51B7;&#x51BB;&#x7BA1;&#x7406;&#x5355;&#x5143;&#x7EC4;&#x7EC7;&#x4E2D;&#x5206;&#x79BB;&#x7684;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; DNA &#x548C;&#x6536;&#x76CA;&#x7387;&#x7684;&#x4E0D;&#x5C11;&#x4E8E;&#x4E09;&#x4E2A;&#x65B9;&#x9762;&#x7684;&#x4EE3;&#x8868;&#x6027;&#x5931;&#x771F;&#x3002;

&#x4ECE;&#x798F;&#x5C14;&#x9A6C;&#x6797;&#x56FA;&#x5B9A;&#x77F3;&#x8721;&#x5305;&#x57CB;&#x7EC4;&#x7EC7; DNA &#x7684;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4;&#x6269;&#x589E;&#x7684;&#x5927;&#x7247;&#x6BB5; Bst DNA &#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x3002;

Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues represent the largest source of archival biological material available for genomic studies of human cancer. Therefore, it is desirable to develop methods that enable whole genome amplification (WGA) using DNA extracted from FFPE tissues. Multiple-strand Displacement Amplification (MDA) is an isothermal method for WGA that uses the large fragment of Bst DNA polymerase. To date, MDA has been feasible only for genomic DNA isolated from fresh or snap-frozen tissue, and yields a representational distortion of less than threefold.

Large fragment Bst DNA polymerase for whole genome amplification of DNA from formalin-fixed paraffin-embedded tissues.

Fix&#xE9;s au formol inclus en paraffine (FFPE) les tissus repr&#xE9;sentent la plus grande source du mat&#xE9;riel biologique d&#x26;#39;archives disponibles pour des &#xE9;tudes g&#xE9;nomiques du cancer humain. Par cons&#xE9;quent, il est souhaitable de d&#xE9;velopper des m&#xE9;thodes qui permettent d&#x26;#39;amplification du g&#xE9;nome entier (WGA) utilisant l&#x26;#39;ADN extrait &#xE0; partir de tissus FFPE. Multiple Displacement Amplification brin (MDA) est une m&#xE9;thode isotherme pour WGA qui utilise le grand fragment de l&#x26;#39;ADN polym&#xE9;rase Bst. &#xC0; ce jour, MDA a &#xE9;t&#xE9; possible seulement pour l&#x26;#39;ADN g&#xE9;nomique isol&#xE9; &#xE0; partir de tissus frais ou congel&#xE9;s composant logiciel enfichable, et donne une distorsion de repr&#xE9;sentation de moins que tripl&#xE9;.

Grand ADN polym&#xE9;rase fragment Bst pour l&#x26;#39;amplification du g&#xE9;nome entier de l&#x26;#39;ADN de la formaline-fixes inclus en paraffine tissus

Formalin-&ouml;rtlich Paraffin-eingebetteten (FFPE) stellen Gewebe die gr&ouml;&szlig;te Quelle f&uuml;r biologische Archivmaterial zur Verf&uuml;gung f&uuml;r genomischer Studien &uuml;ber menschliche Krebs. Daher ist es w&uuml;nschenswert, Methoden zu entwickeln, die gesamte Genom-Verst&auml;rkung (WGA) mit DNA extrahiert aus FFPE-Gewebe zu erm&ouml;glichen. Multiple-Strang Displacement Amplification (MDA) ist eine Isotherme f&uuml;r WGA, die das gro&szlig;e Fragment Bst DNA Polymerase verwendet. Bis dato MDA wurde nur f&uuml;r genomische DNA isoliert von frischen oder gefrorenen Snap Gewebe durchf&uuml;hrbar, und ergibt eine gegenst&auml;ndliche Verzerrung von weniger als drei Gr&uuml;nde.

Gro&szlig;e Fragment-Bst-DNA-Polymerase f&uuml;r gesamten Genoms Verst&auml;rkung von DNA von Formalin-&ouml;rtlich Paraffin-eingebetteten Geweben.

Formalina-fisso paraffina-incastonati (FFPE) tessuti rappresentano la maggiore fonte di materiale biologico d&#39;archivio disponibile per studi di genomici del cancro umano. Pertanto, &egrave; auspicabile sviluppare metodi che consentono di amplificazione intero genoma (WGA) usando il DNA estratto dai tessuti FFPE. Multipli cilindrata amplificazione (MDA) &egrave; un metodo isotermico per WGA che utilizza il grande frammento di polimerasi del DNA Bst. Ad oggi, MDA &egrave; stata fattibile solo per DNA genomico isolato dal tessuto fresco o congelato di snap e produce una distorsione di representational di meno di tre volte.

Grande frammento Bst DNA polimerasi per amplificazione intero genoma del DNA da tessuti inclusi in paraffina formalina-fisso.

&#x30DB;&#x30EB;&#x30DE;&#x30EA;&#x30F3;&#x56FA;&#x5B9A;&#x30D1;&#x30E9;&#x30D5;&#x30A3;&#x30F3;&#x5305;&#x57CB;&#xFF08;FFPE&#xFF09;&#x7D44;&#x7E54;&#x306F;&#x3001;&#x30D2;&#x30C8;&#x764C;&#x306E;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x7814;&#x7A76;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x4F7F;&#x7528;&#x3067;&#x304D;&#x308B;&#x30A2;&#x30FC;&#x30AB;&#x30A4;&#x30D6;&#xB7;&#x751F;&#x7269;&#x5B66;&#x7684;&#x7269;&#x8CEA;&#x306E;&#x6700;&#x5927;&#x306E;&#x6E90;&#x3092;&#x8868;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x3057;&#x305F;&#x304C;&#x3063;&#x3066;&#x3001;FFPE&#x7D44;&#x7E54;&#x304B;&#x3089;&#x62BD;&#x51FA;&#x3057;&#x305F;DNA&#x3092;&#x7528;&#x3044;&#x3066;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5897;&#x5E45;&#xFF08;WGA&#xFF09;&#x3092;&#x6709;&#x52B9;&#x306B;&#x3059;&#x308B;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3092;&#x958B;&#x767A;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x671B;&#x307E;&#x3057;&#x3044;&#x3002;&#x8907;&#x6570;&#x9396;&#x7F6E;&#x63DB;&#x5897;&#x5E45;&#xFF08;MDA&#xFF09;&#x306F;&#x3001;Bst DNA&#x30DD;&#x30EA;&#x30E1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;&#x306E;&#x5927;&#x65AD;&#x7247;&#x3092;&#x4F7F;&#x7528;&#x3057;&#x3066;WGA&#x306E;&#x7B49;&#x6E29;&#x65B9;&#x6CD5;&#x3067;&#x3059;&#x3002;&#x73FE;&#x5728;&#x307E;&#x3067;&#x306B;&#x3001;MDA&#x306F;&#x3001;&#x65B0;&#x9BAE;&#x306A;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30B9;&#x30CA;&#x30C3;&#x30D7;&#x51CD;&#x7D50;&#x7D44;&#x7E54;&#x304B;&#x3089;&#x5358;&#x96E2;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;DNA&#x306E;&#x53EF;&#x80FD;&#x884C;&#x3063;&#x3066;&#x304A;&#x308A;&#x3001;&#x500D;&#x672A;&#x6E80;&#x306E;&#x8868;&#x8C61;&#x306E;&#x6B6A;&#x307F;&#x3092;&#x3082;&#x305F;&#x3089;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x30DB;&#x30EB;&#x30DE;&#x30EA;&#x30F3;&#x56FA;&#x5B9A;&#x30D1;&#x30E9;&#x30D5;&#x30A3;&#x30F3;&#x5305;&#x57CB;&#x7D44;&#x7E54;&#x304B;&#x3089;&#x306E;DNA&#x306E;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x5897;&#x5E45;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x5927;&#x304D;&#x306A;&#x30D5;&#x30E9;&#x30B0;&#x30E1;&#x30F3;&#x30C8;Bst DNA&#x30DD;&#x30EA;&#x30E1;&#x30E9;&#x30FC;&#x30BC;

&#xD3EC; &#xB974; &#xB9D0;&#xB9B0; &#xACE0;&#xC815; &#xD30C;&#xB77C;&#xD540; &#xD3EC;&#xD568; (FFPE) &#xC870;&#xC9C1; &#xC778;&#xAC04;&#xC758; &#xC554; &#xAC8C;&#xB188; &#xC5F0;&#xAD6C;&#xB97C; &#xC704;&#xD574; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xC544;&#xCE74;&#xC774;&#xBE0C; &#xC0DD;&#xBB3C; &#xC790;&#xB8CC;&#xC758; &#xAC00;&#xC7A5; &#xD070; &#xC18C;&#xC2A4;&#xB97C; &#xB098;&#xD0C0;&#xB0C5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xC99D;&#xD3ED; (WGA) FFPE &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xCD94;&#xCD9C;&#xD55C; DNA&#xB97C; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558; &#xC5EC; &#xC0AC;&#xC6A9;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xB294; &#xBC29;&#xBC95;&#xC744; &#xAC1C;&#xBC1C; &#xD558;&#xB294; &#xAC83;&#xC774; &#xBC14;&#xB78C;&#xC9C1;&#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xB7EC; &#xAC00;&#xB2E5; &#xBCC0;&#xC704; &#xC99D;&#xD3ED; (MDA) Bst DNA &#xC911; &#xD569; &#xD6A8;&#xC18C;&#xC758; &#xD070; &#xC870;&#xAC01;&#xC744; &#xC0AC;&#xC6A9; &#xD558;&#xB294; WGA &#xC704;&#xD55C; &#xB4F1;&#xC628; &#xBC29;&#xBC95;&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xB0A0;&#xC9DC; &#xD558;&#xB824;&#xBA74;, MDA genomic DNA &#xC2E0;&#xC120;&#xD55C; &#xB610;&#xB294; &#xC2A4;&#xB0C5; &#xB0C9;&#xB3D9; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBD84;&#xB9AC; &#xB41C; &#xACBD;&#xC6B0;&#xC5D0; &#xC2E4;&#xD604; &#xB418;&#xC5C8;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4; &#xACE0; &#xBBF8;&#xB9CC; &#xC0BC; &#xBC30; &#xD45C;&#xD604; &#xC65C;&#xACE1;&#xC744; &#xC0DD;&#xC131; &#xD569;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xD3EC; &#xB974; &#xB9D0;&#xB9B0; &#xACE0;&#xC815; &#xD30C;&#xB77C;&#xD540; &#xB07C;&#xC6CC; &#xB123;&#xC5B4;&#xC9C4; &#xC870;&#xC9C1;&#xC5D0;&#xC11C; DNA&#xC758; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xC99D;&#xD3ED;&#xC5D0; &#xB300; &#xD55C; &#xD070; &#xC870;&#xAC01; Bst DNA &#xC911; &#xD569; &#xD6A8;&#xC18C;.

Fijado en formol embebidos en parafina (FFPE) los tejidos representan la mayor fuente de material de archivo biol&#xF3;gica para estudios de gen&#xF3;mica del c&#xE1;ncer humano. Por lo tanto, es deseable desarrollar m&#xE9;todos que permitan la amplificaci&#xF3;n del genoma completo (WGA) utilizando ADN extra&#xED;do de tejidos FFPE. M&#xFA;ltiples-hebra amplificaci&#xF3;n de desplazamiento (MDA) es un m&#xE9;todo isot&#xE9;rmico de WGA que utiliza el fragmento grande de DNA polimerasa Bst. Hasta la fecha, MDA ha sido factible s&#xF3;lo para el ADN gen&#xF3;mico aislado a partir de tejido fresco o congelado-complemento, y produce una distorsi&#xF3;n de representaci&#xF3;n de menos de tres veces.

Gran fragmento Bst ADN polimerasa para la amplificaci&#xF3;n del genoma completo del ADN de Fijado en formol e incrustados en parafina tejidos

&#x5375;&#x5DE2;&#x65E9;&#x8870; &#xFF08;POF&#xFF09; &#x662F;&#x66F4;&#x5E74;&#x671F;&#x7684;&#x53D1;&#x751F;&#x5728; 40 &#x5C81;&#x524D;&#x548C;&#x5C0F;&#x5B66;&#x6216;&#x4E2D;&#x5B66;&#x95ED;&#x7ECF;&#x60A3;&#x8005;&#x53EF;&#x51FA;&#x73B0;&#x3002;&#x65E0;&#x6570;&#x7684;&#x5973;&#x6027; x &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7F3A;&#x5931;&#x6216;&#x6613;&#x4F4D; POF &#x75C5;&#x4F8B; &#xFF1B;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6709;&#x53EF;&#x80FD;&#x65E0;&#x6CD5;&#x901A;&#x8FC7;&#x5E38;&#x89C4;&#x7EC6;&#x80DE;&#x9057;&#x4F20;&#x5B66;&#x68C0;&#x6D4B;&#x5C0F;&#x91CD;&#x6392;&#x53EF;&#x80FD;&#x6709;&#x52A9;&#x4E8E; POF &#x90E8;&#x5206;&#x60A3;&#x8005;&#x3002;&#x5973;&#x6027;&#x7684; X &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5F02;&#x5E38;&#xFF0C;&#x5728;&#x6B63;&#x5E38; X &#x7684;&#x5931;&#x6D3B;&#x4E0E;&#x53EF;&#x80FD;&#x9009;&#x62E9;&#x5355;&#x5143;&#x683C;&#x53CD;&#x5BF9;&#xFF0C;&#x9020;&#x6210;&#x626D;&#x66F2;&#x7684; x &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5931;&#x6D3B; (XCI)&#x3002;&#x56E0;&#x6B64;&#xFF0C;&#x6211;&#x4EEC;&#x4F5C;&#x51FA;&#x8BC4;&#x4F30; XCI &#x7531;&#x7532;&#x57FA;&#x5316;&#x654F;&#x611F;&#x7684;&#x9650;&#x5236;&#x6D88;&#x5316;&#x548C; PCR &#x6269;&#x589E;&#x5728;&#x96C4;&#x6FC0;&#x7D20;&#x53D7;&#x4F53; (AR) &#x6848;&#x53D1;&#x73B0;&#x573A;&#xFF0C;4 &#x4E3B; 55 &#x4E2D;&#x5B66; POF &#x60A3;&#x8005;&#x548C; 109 &#x63A7;&#x5236;&#x5987;&#x5973;&#x3002;&#x5728;&#x6837;&#x54C1;&#x5728; AR &#x6742;&#x5408;&#x6027;&#x548C;&#x503E;&#x659C;&#x6D4B;&#x5B9A;&#x56E0;&#x6B64;&#x7FD4;&#x5B9E;&#xFF0C;&#x626D;&#x66F2; XCI &#x7EE7;&#x53D1;&#x6027;&#x95ED;&#x7ECF;&#x5973;&#x6027;&#x7684;&#x9891;&#x7387;&#x662F;&#x76F8;&#x540C;&#x5728;&#x63A7;&#x5236;&#x5987;&#x5973;&#xFF0C;4 &#x4E2A; 48 (8.3%) &#x4E8C;&#x6B21;&#x5375;&#x5DE2;&#x8870;&#x7AED;&#x75C5;&#x4EBA;&#x548C; 8 &#x4E2A; 97 (8.2%) &#x63A7;&#x5236;&#x5987;&#x5973;&#x6709; &gt; = 90%&#x6216;&#x503E;&#x659C;&#x3002;&#x503C;&#x5F97;&#x6CE8;&#x610F;&#x7684;&#x662F;&#xFF0C;&#x6240;&#x6709;&#x4E09;&#x4E2A;&#x539F;&#x53D1;&#x6027;&#x95ED;&#x7ECF;&#x60A3;&#x8005;&#x662F;&#x5728; AR &#x5185;&#x5BB9;&#x4E30;&#x5BCC;&#x4E86;&#x503E;&#x659C; XCI &gt; &#x6216; = 90%(P = 0.001 &#x4E0E;&#x63A7;&#x5236;&#x5987;&#x5973; &#xFF1B;&#x8D39;&#x96EA;&#x7684;&#x7CBE;&#x786E;&#x6D4B;&#x8BD5;&#xFF09;&#x3002;&#x8981;&#x8C03;&#x67E5; x &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x590D;&#x5236;&#x7F16;&#x53F7;&#x6539;&#x5EFA;&#x662F;&#x5426;&#x8D1F;&#x8D23;&#x4EFB;&#xFF0C;&#x4ECE;&#x6240;&#x9009;&#x60A3;&#x8005; DNA &#x4E0E;&#x626D;&#x66F2; XCI &#x5BA1;&#x67E5;&#x4E86;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387; DNA &#x82AF;&#x7247;&#xFF0C;&#x800C;&#x9C7C;&#x6216;&#x805A;&#x5408;&#x9176;&#x94FE;&#x53CD;&#x5E94;&#x8BC1;&#x5B9E; DNA &#x6DFB;&#x52A0;&#x6216;&#x5220;&#x9664;&#x7684;&#x4F46;&#x662F;&#x6CA1;&#x6709;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x5730;&#x533A;&#x3002;X &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x5F02;&#x5E38;&#x65E0;&#x6CD5;&#x63A2;&#x6D4B;&#x7684;&#x6570;&#x7EC4;&#x6216;&#x7531;&#x4E8E;&#x65E9;&#x671F;&#x5229;&#x7528;&#x4E09;&#x500D;&#x4F53;&#x6551;&#x63F4;&#x4E8B;&#x4EF6;&#xFF0C;&#x51CF;&#x5C11;&#x6EE4;&#x6CE1;&#x6C60;&#x53EF;&#x80FD;&#x89E3;&#x91CA; POF &#x539F;&#x53D1;&#x6027;&#x95ED;&#x7ECF;&#x60A3;&#x8005;&#x4E2D;&#x89C2;&#x5BDF;&#x5230;&#x7684;&#x626D;&#x66F2;&#x7684; XCI&#x3002;

&#x76F8;&#x5173;&#x4E3B;&#x8981;&#x4F46;&#x4E0D;&#x662F;&#x6B21;&#x8981;&#x7684;&#x5375;&#x5DE2;&#x8870;&#x7AED;&#x7684;&#x503E;&#x659C; x &#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x706D;&#x6D3B;&#x3002;

Premature ovarian failure (POF) is the occurrence of menopause before the age of 40, and may present with either primary or secondary amenorrhea. Numerous cases of POF in women with X-chromosome deletions or translocations have been reported; thus, it is possible that smaller rearrangements undetectable by conventional cytogenetics may contribute to POF in some patients. In females with an abnormal X chromosome, cells with inactivation of the normal X may be selected against, causing skewed X-chromosome inactivation (XCI). We therefore assessed XCI by methylation sensitive restriction digestion and PCR amplification at the androgen receptor (AR) locus, in 4 primary and 55 secondary POF patients and 109 control women. In samples heterozygous at AR and therefore informative for the skewing assay, the frequency of skewed XCI among the women with secondary amenorrhea was identical to that in control women, with 4 out of 48 (8.3%) secondary ovarian failure patients and 8 out of 97 (8.2%) control women having > or =90% skewing. Notably, all three primary amenorrhea patients that were informative at AR had skewed XCI > or =90% (P = 0.001 vs. control women; Fisher's exact test). To investigate whether X-chromosome copy number alterations were responsible, DNA from selected patients with skewed XCI was examined by high resolution DNA microarray, however no potential regions of DNA addition or deletion were confirmed by FISH or PCR. X-chromosome abnormalities undetectable by array, or reduced follicular pool due to an early trisomic rescue event, may explain the skewed XCI observed in POF patients presenting with primary amenorrhea.

Skewed X-chromosome inactivation is associated with primary but not secondary ovarian failure.

Insuffisance ovarienne pr&#xE9;matur&#xE9;e (IOP) est la survenue de la m&#xE9;nopause avant l&#x26;#39;&#xE2;ge de 40 ans, et peut pr&#xE9;senter une am&#xE9;norrh&#xE9;e primaire ou secondaire. De nombreux cas de POF chez les femmes atteintes du chromosome X suppressions ou translocations ont &#xE9;t&#xE9; signal&#xE9;s; par cons&#xE9;quent, il est possible que les petits r&#xE9;arrangements ind&#xE9;tectables par la cytog&#xE9;n&#xE9;tique conventionnelle peut contribuer &#xE0; POF chez certains patients. Chez les femelles avec un chromosome X anormal, les cellules dont l&#x26;#39;inactivation de l&#x26;#39;X normal peut &#xEA;tre contre-s&#xE9;lectionn&#xE9;es, ce qui provoque asym&#xE9;trique inactivation du chromosome X (XCI). Nous avons donc &#xE9;valu&#xE9; XCI par digestion de restriction sensible &#xE0; la m&#xE9;thylation et l&#x26;#39;amplification PCR au niveau du r&#xE9;cepteur des androg&#xE8;nes (AR) locus, en 4 primaires et 55 patients POF secondaires et 109 femmes t&#xE9;moins. Dans les &#xE9;chantillons h&#xE9;t&#xE9;rozygotes &#xE0; AR et donc d&#x26;#39;information pour le dosage d&#x26;#39;inclinaison, la fr&#xE9;quence des biais&#xE9;e XCI parmi les femmes ayant une am&#xE9;norrh&#xE9;e secondaire est identique &#xE0; celui chez les femmes de contr&#xF4;le, avec 4 sur 48 (8,3%) patients souffrant d&#x26;#39;insuffisance ovarienne secondaire et 8 sur 97 (8,2%) des femmes ayant de contr&#xF4;le&#x26;gt; ou = inclinaison de 90%. Notamment, tous les trois patients am&#xE9;norrh&#xE9;e primaire qui ont &#xE9;t&#xE9; instructive &#xE0; AR avait fauss&#xE9; XCI&#x26;gt; ou = 90% (p = 0,001 vs contr&#xF4;le des femmes; test exact de Fisher). Afin de d&#xE9;terminer si des modifications du chromosome X du nombre de copies &#xE9;taient responsables, l&#x26;#39;ADN de patients s&#xE9;lectionn&#xE9;s avec biais&#xE9;e XCI a &#xE9;t&#xE9; examin&#xE9; par des puces &#xE0; ADN &#xE0; haute r&#xE9;solution, toutefois, aucune des r&#xE9;gions potentielles de plus l&#x26;#39;ADN ou la suppression a &#xE9;t&#xE9; confirm&#xE9;e par FISH ou par PCR. X-chromosome anomalies ind&#xE9;tectables par tableau, ou sur la piscine folliculaire r&#xE9;duite en raison d&#x26;#39;une &#xE9;preuve de sauvetage trisomique pr&#xE9;coce, peut expliquer le biais&#xE9;e XCI observ&#xE9;e chez les patients pr&#xE9;sentant des POF am&#xE9;norrh&#xE9;e primaire.

Est inclin&#xE9;e inactivation du chromosome X est associ&#xE9;e &#xE0; une insuffisance ovarienne primaire, mais pas secondaire

Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF) ist das Eintreten der Menopause vor dem Alter von 40 und kann mit entweder prim&auml;re oder sekund&auml;re Amenorrhoe vorlegen. Zahlreiche F&auml;lle von POF bei Frauen mit Wissenschaftlerhaus L&ouml;schungen oder Umsiedlung wurden beschrieben; Somit ist es m&ouml;glich, dass kleinere Umlagerungen undetectable beim konventionellen Zytogenetik bei einigen Patienten zu POF beitragen k&ouml;nnen. Bei Frauen mit einer abnormen x-Chromosom k&ouml;nnen Zellen mit Inaktivierung des normalen X gegen, ausgew&auml;hlt werden, wodurch verzerrte Darstellung Inaktivierung (XCI). Wir daher XCI durch Methylierung sensibel Beschr&auml;nkungsverdauung und PCR-Verst&auml;rkung an der Androgen-Rezeptor (AR)-Locus in 4 prim&auml;re und 55 sekund&auml;re POF-Patienten und 109 Steuerelement Frauen gepr&uuml;ft. In Proben, heterozygote bei AR und deshalb informativ f&uuml;r den neigen-Assay, die H&auml;ufigkeit der verschrobene XCI unter den Frauen mit sekund&auml;rer Amenorrhoe entsprach, dass Kontrolle bei Frauen, mit sekund&auml;ren Ovarialinsuffizienz (8,3 %) 4 von 48 Patienten und 8 von 97 (8,2 %) Frauen kontrollieren &gt; oder = 90 % neigen. Vor allem hatten alle drei prim&auml;re Amenorrhoe-Patienten, die bei AR informativ waren verzerrt XCI &gt; oder = 90 % (P = 0,001 vs. Kontrolle Frauen; Fisher&#39;s exakter Test). Um zu untersuchen, ob die Darstellung Kopie Zahl Ver&auml;nderungen verantwortlich waren, wurde die DNA aus ausgew&auml;hlten Patienten mit verzerrter XCI durch hochaufl&ouml;sende DNAmicroarray, jedoch keine m&ouml;gliche Regionen der DNA Addition oder Deletion von FISH oder PCR best&auml;tigt wurden untersucht. Darstellung Anomalien durch Array oder reduzierte follikul&auml;ren Pool aufgrund eines fr&uuml;hen trisomic Rettungs-Ereignisses, erkl&auml;rt die Schiefe XCI in POF Patienten mit prim&auml;rer Amenorrhoe beobachtet.

Verzerrte Darstellung Inaktivierung ist prim&auml;r aber nicht sekund&auml;re Ovarialinsuffizienz zugeordnet.

Insufficienza ovarica prematura (POF) &egrave; la ricorrenza della menopausa prima dei 40 anni e possa presentare con amenorrea primaria o secondaria. Sono stati segnalati numerosi casi di POF nelle donne con delezioni del cromosoma x o traslocazioni; cos&igrave;, &egrave; possibile che piccoli riarrangiamenti inosservabile da citogenetica convenzionale possono contribuire al POF in alcuni pazienti. Nelle femmine con un cromosoma X anormale, cellule con inattivazione del X normale possono essere selezionate contro, causando inclinate inattivazione del cromosoma x (XCI). Abbiamo quindi valutato XCI da metilazione sensibile restrizione digestione e amplificazione di PCR presso il locus androgeno recettore (AR), in 4 primaria e 55 pazienti POF secondari e 109 donne di controllo. Nei campioni eterozigoti AR e quindi informativi per il dosaggio di inclinazione, la frequenza del XCI inclinate tra le donne con amenorrea secondaria era identica a quello che le donne di controllo, con insufficienza ovarica secondaria 4 di 48 (8,3%) pazienti e 8 di 97 (8,2%) controllo donne avendo &amp;gt; o = 90% inclinazione. In particolare, tutti i pazienti amenorrea primaria tre erano informativi presso AR erano inclinata XCI &amp;gt; o = 90% (P = 0.001 vs donne di controllo; Test esatto di Fisher). Per indagare se alterazioni numeri di copia del cromosoma x sono stati responsabili, DNA di pazienti selezionati con XCI obliqua &egrave; stato esaminato dal microarray del DNA ad alta risoluzione, tuttavia non potenziali regioni di DNA o la delezione sono stati confermati da pesce o PCR. Anomalie del cromosoma x rilevabile dalla matrice, o ridotto pool follicolare a causa di un evento trisomiche soccorso precoce, possono spiegare la XCI inclinate osservati in pazienti POF con amenorrea primaria.

Inclinate inattivazione del cromosoma x &egrave; associata a insufficienza ovarica primaria ma non secondario.

&#x65E9;&#x767A;&#x5375;&#x5DE3;&#x4E0D;&#x5168;&#xFF08;POF&#xFF09;&#x306F;&#x3001;40&#x6B73;&#x524D;&#x306B;&#x9589;&#x7D4C;&#x306E;&#x767A;&#x751F;&#x3067;&#x3042;&#x308A;&#x3001;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30EA;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x30BB;&#x30AB;&#x30F3;&#x30C0;&#x30EA;&#x306E;&#x3069;&#x3061;&#x3089;&#x304B;&#x7121;&#x6708;&#x7D4C;&#x3092;&#x5448;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3042;&#x308B;&#x3002; X&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x6B20;&#x5931;&#x3084;&#x8EE2;&#x5EA7;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x5973;&#x6027;&#x306E;POF&#x306E;&#x591A;&#x6570;&#x306E;&#x75C7;&#x4F8B;&#x304C;&#x5831;&#x544A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x3053;&#x3068;&#x306B;&#x3088;&#x308A;&#x3001;&#x5F93;&#x6765;&#x306E;&#x7D30;&#x80DE;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B66;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x691C;&#x51FA;&#x3055;&#x308C;&#x306A;&#x3044;&#x5C0F;&#x898F;&#x6A21;&#x306A;&#x518D;&#x7DE8;&#x6210;&#x306F;&#x3001;&#x4E00;&#x90E8;&#x306E;&#x60A3;&#x8005;&#x3067;&#x306F;POF&#x306B;&#x5BC4;&#x4E0E;&#x3059;&#x308B;&#x53EF;&#x80FD;&#x6027;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x7570;&#x5E38;&#x306A;X&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x3092;&#x6301;&#x3064;&#x5973;&#x6027;&#x3067;&#x3001;&#x901A;&#x5E38;&#x306E;X&#x306E;&#x4E0D;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x7D30;&#x80DE;&#x306F;&#x3001;&#x6B6A;&#x3093;&#x3060;X&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4E0D;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#xFF08;XCI&#xFF09;&#x3092;&#x5F15;&#x304D;&#x8D77;&#x3053;&#x3057;&#x3001;&#x306B;&#x5BFE;&#x3057;&#x3066;&#x9078;&#x629E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3067;&#x304D;&#x307E;&#x3059;&#x3002;&#x305D;&#x3053;&#x3067;&#x6211;&#x3005;&#x306F;4&#x3064;&#x306E;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30EA;&#x3068;55&#x306E;&#x4E8C;&#x6B21;POF&#x60A3;&#x8005;&#x3068;109&#x306E;&#x5236;&#x5FA1;&#x306E;&#x5973;&#x6027;&#x3067;&#x3001;&#x30A2;&#x30F3;&#x30C9;&#x30ED;&#x30B2;&#x30F3;&#x53D7;&#x5BB9;&#x4F53;&#xFF08;AR&#xFF09;&#x907A;&#x4F1D;&#x5B50;&#x5EA7;&#x306E;&#x30E1;&#x30C1;&#x30EB;&#x5316;&#x611F;&#x53D7;&#x6027;&#x5236;&#x9650;&#x9175;&#x7D20;&#x6D88;&#x5316;&#x3057;&#x3001;PCR&#x5897;&#x5E45;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;XCI&#x3092;&#x8A55;&#x4FA1;&#x3057;&#x305F;&#x3002; AR&#x3067;&#x306E;&#x30D8;&#x30C6;&#x30ED;&#x63A5;&#x5408;&#x3001;&#x50BE;&#x659C;&#x30A2;&#x30C3;&#x30BB;&#x30A4;&#x7528;&#x5F93;&#x3063;&#x3066;&#x6709;&#x76CA;&#x306A;&#x30B5;&#x30F3;&#x30D7;&#x30EB;&#x3067;&#x306F;&#x3001;&#x200B;&#x200B;&#x7D9A;&#x767A;&#x6027;&#x7121;&#x6708;&#x7D4C;&#x306E;&#x3042;&#x308B;&#x5973;&#x6027;&#x306E;&#x9593;&#x3067;&#x6B6A;&#x3093;&#x3060;XCI&#x306E;&#x5468;&#x6CE2;&#x6570;&#x306F;48&#x306E;&#x3046;&#x3061;4&#xFF08;8.3&#xFF05;&#xFF09;&#x4E8C;&#x6B21;&#x6027;&#x5375;&#x5DE3;&#x4E0D;&#x5168;&#x60A3;&#x8005;&#x304A;&#x3088;&#x3073;97&#x306E;&#x3046;&#x3061;8&#x3068;&#x3001;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;&#x306E;&#x5973;&#x6027;&#x306E;&#x305D;&#x308C;&#x3068;&#x540C;&#x4E00;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;&#xFF08;8.2&#xFF05;&#xFF09;&#x5236;&#x5FA1;&#x306F;&#x3001;&#x5973;&#x6027;&#x26;gt;&#x307E;&#x305F;&#x306F;= 90&#xFF05;&#x306E;&#x50BE;&#x659C;&#x3092;&#x6709;&#x3059;&#x308B;&#x3002;&#x7279;&#x306B;&#x3001;AR&#x3067;&#x6709;&#x76CA;&#x3067;&#x3042;&#x3063;&#x305F;3&#x3064;&#x306E;&#x3059;&#x3079;&#x3066;&#x306E;&#x539F;&#x767A;&#x6027;&#x7121;&#x6708;&#x7D4C;&#x306E;&#x60A3;&#x8005;&#x306F;&#x3001;XCI&#x26;gt;&#x307E;&#x305F;&#x306F;= 90&#xFF05;&#xFF08;;&#x30D5;&#x30A3;&#x30C3;&#x30B7;&#x30E3;&#x30FC;&#x306E;&#x6B63;&#x78BA;&#x78BA;&#x7387;&#x691C;&#x5B9A;P = 0.001&#x5BFE;&#x30B3;&#x30F3;&#x30C8;&#x30ED;&#x30FC;&#x30EB;&#x306B;&#x5973;&#x6027;&#xFF09;&#x304C;&#x504F;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x307E;&#x3057;&#x305F;&#x3002; X&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x30B3;&#x30D4;&#x30FC;&#x6570;&#x306E;&#x5909;&#x5316;&#x304C;&#x62C5;&#x5F53;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x305F;&#x304B;&#x3069;&#x3046;&#x304B;&#x3092;&#x8ABF;&#x3079;&#x308B;&#x305F;&#x3081;&#x306B;&#x3001;&#x504F;&#x3063;&#x305F;XCI&#x9078;&#x629E;&#x3057;&#x305F;&#x60A3;&#x8005;&#x304B;&#x3089;DNA&#x3092;&#x9AD8;&#x5206;&#x89E3;&#x80FD;DNA&#x200B;&#x200B;&#x30DE;&#x30A4;&#x30AF;&#x30ED;&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x3067;&#x8ABF;&#x3079;&#x305F;&#x3001;&#x3057;&#x304B;&#x3057;&#x3001;DNA&#x306E;&#x8FFD;&#x52A0;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x524A;&#x9664;&#x306E;&#x6F5C;&#x5728;&#x7684;&#x306A;&#x9818;&#x57DF;&#x306F;&#x3001;FISH&#x3084;PCR&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x78BA;&#x8A8D;&#x3055;&#x308C;&#x306A;&#x304B;&#x3063;&#x305F;&#x3002;&#x914D;&#x5217;&#x3001;&#x307E;&#x305F;&#x306F;&#x521D;&#x671F;&#x306E;&#x4E09;&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x306E;&#x6551;&#x52A9;&#x30A4;&#x30D9;&#x30F3;&#x30C8;&#x306E;&#x305F;&#x3081;&#x306E;&#x6E1B;&#x5C11;&#x3001;&#x6FFE;&#x80DE;&#x30D7;&#x30FC;&#x30EB;&#x306B;&#x3088;&#x3063;&#x3066;&#x691C;&#x51FA;&#x3067;&#x304D;&#x306A;&#x3044;X&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x7570;&#x5E38;&#x306F;&#x3001;&#x539F;&#x767A;&#x6027;&#x7121;&#x6708;&#x7D4C;&#x3092;&#x5448;&#x3059;&#x308B;POF&#x60A3;&#x8005;&#x3067;&#x89B3;&#x5BDF;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x504F;&#x3063;&#x305F;XCI&#x3092;&#x8AAC;&#x660E;&#x3059;&#x308B;&#x3053;&#x3068;&#x304C;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x3059;&#x3002;

&#x6B6A;&#x3093;&#x3060;X&#x67D3;&#x8272;&#x4F53;&#x4E0D;&#x6D3B;&#x6027;&#x5316;&#x306F;&#x3001;&#x30D7;&#x30E9;&#x30A4;&#x30DE;&#x30EA;&#x304C;&#x30BB;&#x30AB;&#x30F3;&#x30C0;&#x30EA;&#x3067;&#x306F;&#x3042;&#x308A;&#x307E;&#x305B;&#x3093;&#x3002;&#x5375;&#x5DE3;&#x4E0D;&#x5168;&#x306B;&#x95A2;&#x4FC2;&#x3057;&#x3066;&#x3044;&#x308B;

&#xC870;&#xAE30; &#xB09C;&#xC18C; &#xC2E4;&#xD328; (POF)&#xC740; 40 &#xC138; &#xC774;&#xC804; &#xD3D0; &#xACBD; &#xBC1C;&#xC0DD; &#xD558; &#xACE0; &#xAE30;&#xBCF8; &#xB610;&#xB294; &#xBCF4;&#xC870; amenorrhea &#xC81C;&#xC2DC; &#xB420; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xC5EC;&#xC131;&#xC758; x &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC0AD;&#xC81C; &#xB610;&#xB294; translocations&#xC5D0;&#xC11C;&#xC758; POF&#xC758; &#xACBD;&#xC6B0; &#xB2E4; &#xC218; &#xBCF4;&#xACE0; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C;, &#xADF8;&#xAC83;&#xC740; &#xAC00;&#xB2A5;&#xD55C; &#xC77C;&#xBD80; &#xD658;&#xC790;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAE30;&#xC874;&#xC758; &#xC138;&#xD3EC; &#xC720;&#xC804;&#xD559;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xBC1C;&#xACAC;&#xD560; &#xC218; &#xC5C6;&#xB294; &#xC791;&#xC740; &#xC7AC;&#xBC30;&#xC5F4; POF&#xC5D0; &#xAE30;&#xC5EC;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xBE44;&#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; X &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4;&#xC640; &#xC5EC;&#xC131;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC815;&#xC0C1;&#xC801;&#xC778; X&#xC758; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xB41C; &#xC140; &#xC120;&#xD0DD;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;, &#xAD34;&#xC0C1; &#xD55C; x &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131;&#xD654; (XCI)&#xB97C; &#xC77C;&#xC73C;&#xD0A4;&#xB294;. &#xC6B0;&#xB9AC;&#xB294; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xBA54; &#xD2F8; &#xD654; &#xACFC;&#xBBFC; &#xD55C; &#xAE08;&#xC9C0; &#xC18C;&#xD654; &#xD558; &#xACE0; 4 &#xC8FC;&#xC5D0; &#xC548; &#xB4DC;&#xB85C; &#xAC90; &#xC218;&#xC6A9; &#xCCB4; (&#xC544;&#xCE78;&#xC18C; &#xC8FC;) &#xB85C;&#xCEE4; &#xC2A4;&#xC5D0;&#xC11C; PCR &#xC99D;&#xD3ED; &#xBC0F; 55 &#xBCF4;&#xC870; POF &#xD658;&#xC790;&#xC640; 109 &#xC81C;&#xC5B4; &#xC5EC;&#xC790;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; XCI &#xD3C9;&#xAC00;. &#xC0D8;&#xD50C; heterozygous &#xC544;&#xCE78;&#xC18C;&#xC5D0; &#xB530;&#xB77C;&#xC11C; &#xAE30;&#xC6B8;&#xC774;&#xAE30; &#xBD84;&#xC11D; &#xACB0;&#xACFC; &#xB300; &#xD55C; &#xC720;&#xC775;&#xD55C; &#xBE44;&#xC6B0;&#xB294; XCI &#xBCF4;&#xC870; amenorrhea&#xC640; &#xC5EC;&#xC131;&#xB4E4;&#xC758; &#xC8FC;&#xD30C;&#xC218;&#xB294; &#xADF8; &#xC81C;&#xC5B4; &#xC5EC;&#xC131;, 4 &#xAC1C; &#xC911; 48 (8.3%) &#xBCF4;&#xC870; &#xB09C;&#xC18C; &#xC2E4;&#xD328;&#xC640; &#xD568;&#xAED8; &#xD658;&#xC790;&#xC640; 8 &#xAC1C; &#xC911; 97 (8.2%) &#xC81C;&#xC5B4; &#xB370; &#xC5EC;&#xC131; &#xB3D9;&#xC77C; &amp;gt; 90% = &#xB610;&#xB294; &#xAE30;&#xC6B8;&#xC774;&#xAE30;. &#xD2B9;&#xD788;, &#xC544;&#xCE78;&#xC18C;&#xC5D0;&#xC11C; &#xC720;&#xC775; &#xD588;&#xB2E4; &#xBAA8;&#xB450; &#xC138; &#xAC00;&#xC9C0; &#xAE30;&#xBCF8; amenorrhea &#xD658;&#xC790; XCI &#xBE44;&#xC6B0;&#xB294; &#xD588;&#xB2E4; &amp;gt; = 90% &#xB610;&#xB294; (P = 0.001 &#xC81C;&#xC5B4; &#xC5EC;&#xC790;; &#xB300; &#xD53C;&#xC154;&#xC758; &#xC815;&#xD655;&#xD55C; &#xC2DC;&#xD5D8;)&#xC785;&#xB2C8;&#xB2E4;. &#xADF8;&#xB7EC;&#xB098; x &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xBCF5;&#xC0AC;&#xBCF8; &#xBC88;&#xD638; &#xBCC0;&#xACBD; &#xD588;&#xB2E4; &#xCC45;&#xC784; &#xC5EC;&#xBD80; &#xC870;&#xC0AC;&#xB97C; &#xBE44;&#xC6B0;&#xB294; XCI&#xC640; &#xC120;&#xD0DD; &#xB41C; &#xD658;&#xC790;&#xC5D0; &#xAC8C; &#xC11C; DNA DNA &#xCD94;&#xAC00; &#xB098; &#xC0AD;&#xC81C;&#xC758; &#xB354; &#xC7A0;&#xC7AC;&#xC801;&#xC778; &#xC9C0;&#xC5ED; &#xBB3C;&#xACE0;&#xAE30; &#xB610;&#xB294; PCR&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xD655;&#xC778; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; DNA microarray&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC870;&#xC0AC; &#xB418;&#xC5C8;&#xB2E4;. X &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xC774;&#xC0C1;&#xC774; &#xBC30;&#xC5F4;, &#xB610;&#xB294; &#xCD08;&#xAE30; trisomic &#xAD6C;&#xC870; &#xC774;&#xBCA4;&#xD2B8; &#xB54C;&#xBB38;&#xC5D0; &#xAC10;&#xC18C; follicular &#xD480;&#xC5D0;&#xC11C; &#xBC1C;&#xACAC;&#xD560; &#xC218; &#xC5C6;&#xB294; &#xAE30;&#xBCF8; amenorrhea &#xC81C;&#xC2DC; POF &#xD658;&#xC790;&#xC5D0;&#xC11C; &#xAD00;&#xCC30; &#xBE44;&#xC6B0;&#xB294; XCI &#xC124;&#xBA85;&#xD560; &#xC218; &#xC788;&#xC2B5;&#xB2C8;&#xB2E4;.

&#xAD34;&#xC0C1; &#xD55C; x &#xC5FC;&#xC0C9;&#xCCB4; &#xBE44;&#xD65C;&#xC131;&#xD654; &#xAE30;&#xBCF8;&#xB9CC; &#xD558;&#xC9C0; &#xBCF4;&#xC870; &#xB09C;&#xC18C; &#xC2E4;&#xD328;&#xC640; &#xC5F0;&#xAD00; &#xB41C;.

La insuficiencia ov&#xE1;rica prematura (FOP) es la aparici&#xF3;n de la menopausia antes de los 40 a&#xF1;os, y pueden presentarse con amenorrea primaria o secundaria. Numerosos casos de POF en mujeres con deleciones cromosoma X o translocaciones se ha informado, por lo que es posible que los peque&#xF1;os reordenamientos indetectables por citogen&#xE9;tica convencional puede contribuir a la POF en algunos pacientes. En las mujeres con un cromosoma X anormal, las c&#xE9;lulas con la inactivaci&#xF3;n del X normal, se puede seleccionar en contra, causando sesgada del cromosoma X inactivaci&#xF3;n (XCI). Por lo tanto, evalu&#xF3; XCI por digesti&#xF3;n de restricci&#xF3;n metilaci&#xF3;n sensible y de amplificaci&#xF3;n de PCR en el receptor de andr&#xF3;genos (AR), el locus, en 4 pacientes POF primarias y 55 secundarias y 109 mujeres control. En las muestras heterozigotas en AR y por lo tanto informativo para el ensayo de sesgo, la frecuencia de sesgada XCI entre las mujeres con amenorrea secundaria era id&#xE9;ntica a la de las mujeres de control, con 4 de cada 48 (8,3%) secundarias pacientes con insuficiencia ov&#xE1;ricos y 8 de los 97 (8,2%) mujeres del grupo control con&#x26;gt; o = inclinaci&#xF3;n del 90%. Cabe destacar que los tres pacientes que fueron amenorrea primaria informativo en AR se hab&#xED;a sesgado XCI&#x26;gt; o = 90% (P = 0,001 frente a las mujeres de control, la prueba exacta de Fisher). Para investigar si el cromosoma X de las alteraciones de n&#xFA;mero de copias fueron los responsables, el ADN de pacientes seleccionados con sesgada XCI fue examinado por el de alta resoluci&#xF3;n de microarrays de ADN, sin embargo hay regiones potenciales de adici&#xF3;n o supresi&#xF3;n del ADN fueron confirmados por FISH o PCR. Cromosoma X anomal&#xED;as no detectables por la matriz, o en la piscina folicular reducida debido a un evento de rescate tris&#xF3;mico temprana, puede explicar la desigual XCI observado en pacientes que presentan POF con amenorrea primaria.

Sesgada del cromosoma X. La inactivaci&#xF3;n se asocia con insuficiencia ov&#xE1;rica primaria pero no secundaria

(CaP) &#x524D;&#x5217;&#x817A;&#x764C;&#x662F;&#x4E00;&#x4E2A;&#x4E25;&#x91CD;&#x7684;&#x5065;&#x5EB7;&#x95EE;&#x9898;&#x3002;&#x6539;&#x53D8;&#x7684;&#x5206;&#x5B50;&#x673A;&#x5236;&#xFF0C;&#x5BFC;&#x81F4;&#x6B64;&#x75C5;&#x4E0D;&#x751A;&#x4E86;&#x89E3;&#x3002;

&#x6700;&#x4F4E;&#x6539;&#x53D8;&#x7531;&#x5E73;&#x94FA;&#x8DEF;&#x5F84;&#x9AD8;&#x5206;&#x8FA8;&#x7387;&#x5168;&#x57FA;&#x56E0;&#x7EC4; BAC &#x6570;&#x7EC4;&#x6BD4;&#x8F83;&#x6742;&#x4EA4;&#x6807;&#x8BC6;&#x7684;&#x65E9;&#x671F;&#x524D;&#x5217;&#x817A;&#x764C;&#x8FDB;&#x5C55;&#x4E2D;&#x7684;&#x533A;&#x57DF;&#x3002;

Carcinoma of the prostate (CaP) is a serious health problem. The altered molecular mechanisms that lead to this disease are poorly understood.

Minimum altered regions in early prostate cancer progression identified by high resolution whole genome tiling path BAC array comparative hybridization.

Carcinome de la prostate (CaP) est un grave probl&#xE8;me de sant&#xE9;. Les m&#xE9;canismes alt&#xE9;r&#xE9;s mol&#xE9;culaires qui conduisent &#xE0; cette maladie sont encore mal compris.

Minimum r&#xE9;gions alt&#xE9;r&#xE9;es dans la progression de cancer de la prostate pr&#xE9;coce rep&#xE9;r&#xE9;e par G&#xE9;nome Haute entier Carrelage hybridation tableau comparatif BAC chemin

Karzinom der Prostata (GAP) ist ein ernsthaftes Gesundheitsproblem. Die ver&auml;nderten molekularen Mechanismen, die zu dieser Krankheit f&uuml;hren werden oft missverstanden.

Minimal ver&auml;ndert Regionen in fr&uuml;hen Prostatakrebs Progression durch hochaufl&ouml;sende gesamten Genoms Fliesen Pfad BAC-Array komparativen Hybridisierung identifiziert.

Carcinoma della prostata (CaP) &egrave; un grave problema di salute. Alterati meccanismi molecolari che portano a questa malattia sono capiti male.

Minimo alterato regioni in precoce progressione del cancro alla prostata identificato dal percorso di affiancamento intero genoma ad alta risoluzione l&#39;ibridazione comparativa di matrice del BAC.

&#x524D;&#x7ACB;&#x817A;&#x764C;&#xFF08;CAP&#xFF09;&#x306F;&#x3001;&#x6DF1;&#x523B;&#x306A;&#x5065;&#x5EB7;&#x554F;&#x984C;&#x3067;&#x3042;&#x308B;&#x3002;&#x3053;&#x306E;&#x75C5;&#x6C17;&#x306B;&#x3064;&#x306A;&#x304C;&#x308B;&#x5909;&#x66F4;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x5206;&#x5B50;&#x30E1;&#x30AB;&#x30CB;&#x30BA;&#x30E0;&#x306F;&#x307B;&#x3068;&#x3093;&#x3069;&#x308F;&#x304B;&#x3063;&#x3066;&#x3044;&#x306A;&#x3044;&#x3002;

&#x30D1;&#x30B9;BAC&#x30A2;&#x30EC;&#x30A4;&#x6BD4;&#x8F03;&#x30CF;&#x30A4;&#x30D6;&#x30EA;&#x30C0;&#x30A4;&#x30BC;&#x30FC;&#x30B7;&#x30E7;&#x30F3;&#x3092;&#x30BF;&#x30A4;&#x30EB;&#x9AD8;&#x89E3;&#x50CF;&#x5EA6;&#x5168;&#x30B2;&#x30CE;&#x30E0;&#x3067;&#x540C;&#x5B9A;&#x3055;&#x308C;&#x305F;&#x65E9;&#x671F;&#x524D;&#x7ACB;&#x817A;&#x764C;&#x306E;&#x9032;&#x884C;&#x306E;&#x6700;&#x5C0F;&#x5909;&#x5316;&#x3057;&#x305F;&#x5730;&#x57DF;

(&#xBAA8;&#xC790;) &#xC804;&#xB9BD;&#xC120; &#xC554;&#xC740; &#xC2EC;&#xAC01;&#xD55C; &#xAC74;&#xAC15; &#xBB38;&#xC81C; &#xC774;&#xB2E4;. &#xC774; &#xC9C8;&#xBCD1;&#xC73C;&#xB85C; &#xC774;&#xC5B4;&#xC9C8; &#xBCC0;&#xACBD; &#xB41C; &#xBD84;&#xC790; &#xBA54;&#xCEE4;&#xB2C8;&#xC998;&#xC740; &#xC11C; &#xD22C;&#xB974; &#xAC8C; &#xC774;&#xD574;.

&#xCD5C;&#xC18C; &#xACE0;&#xD574;&#xC0C1;&#xB3C4; &#xC804;&#xCCB4; &#xAC8C;&#xB188; &#xAE30;&#xC640; &#xACBD;&#xB85C; BAC &#xBC30;&#xC5F4; &#xBE44;&#xAD50; &#xAD50; &#xC7A1;&#xC5D0; &#xC758;&#xD574; &#xC2DD;&#xBCC4; &#xB41C; &#xCD08;&#xAE30; &#xC804;&#xB9BD;&#xC120; &#xC554; &#xC9C4;&#xD589;&#xC758; &#xC601;&#xC5ED;&#xC744; &#xBCC0;&#xACBD;.

El carcinoma de pr&#xF3;stata (CaP) es un problema grave de salud. Los mecanismos alterados moleculares que conducen a esta enfermedad son poco conocidos.

M&#xED;nimos Regiones alterados en la progresi&#xF3;n del c&#xE1;ncer de pr&#xF3;stata temprano Identificado por Genoma alta resoluci&#xF3;n entero Pavimentaci&#xF3;n Ruta variedad de hibridaci&#xF3;n BAC comparativo

Spencer K. Watson

Department of Cancer Genetics

BC Cancer Research Centre

Technical Demonstration of Whole Genome Array Comparative Genomic Hybridization

Spencer K. Watson

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BC Cancer Research Centre

Technical Demonstration of Whole Genome Array Comparative Genomic Hybridization

Department of Cancer Genetics