Replikasyon çatalının engelsiz ilerlemesi, tam DNA replikasyonu ve genom stabilitesi için gereklidir; bununla birlikte, replikasyon çatalı genellikle ilerlemesini yavaşlatabilen veya durdurabilen iç veya dış faktörler tarafından durdurulur ve replikasyon stresine neden olur. Replikasyon stresi, kanser gibi hastalıkların ayırt edici özelliği olan genomik kararsızlığa neden olur. Genomik kararsızlık, genomik değişiklikler ve zararlı mutasyonların sıklığı ile karakterizedir. Çoğaltma çatalının hareketi birkaç nedenden dolayı durabilir. Örneğin, hidroksiüre ilacı, replikasyon çatalını durdurarak, yavru iplikçiğine dahil edilmek üzere mevcut nükleotid havuzunu tüketir. Çoğaltma çatalının ilerlemesini engelleyebilecek diğer sorunlar, DNA lezyonları, bir çoğaltma çatalı ile bir transkripsiyon kompleksi arasındaki çarpışma ve DNA replikasyonunda yer alan enzimlerdeki kusurları içerir.