Anüs Egzaması için ShiDuGao Tedavisinin GEO Veri Setleri ve Ağ Farmakolojisine Dayalı Etkinliği ve Altta Yatan Yol Mekanizmaları

Özet

Bu araştırma çabası, ağ farmakolojisi ve gen ekspresyonu omnibus (GEO) veri kümelerinin sinerjik bir entegrasyonunu kullanarak topikal ilaç uygulama mekanizmasını aydınlatmaya çalıştı. Bu makalede anüs egzamasının tedavisinde ShiDuGao'nun (SDG) uygulanabilirliği, hedefi ve mekanizması değerlendirilmiştir.

Özet

Anüs egzaması, anüs çevresini etkileyen kronik ve tekrarlayan inflamatuar bir cilt hastalığıdır. Lezyonlar öncelikle anal ve perianal deride meydana gelirken, perine veya genital bölgeye de uzanabilir. ShiDuGao'nun (SDG) anal kaşıntıya, eksüdasyon kontrolüne, nem azaltmaya ve cilt onarımına karşı önemli onarıcı özelliklere sahip olduğu bulunmuştur. Bununla birlikte, SDG'nin anal egzama üzerindeki genetik hedefleri ve farmakolojik mekanizmaları henüz tam olarak aydınlatılmamış ve tartışılmamıştır. Sonuç olarak, bu çalışmada ağ farmakolojik bir yaklaşım kullanılmış ve gen hedeflerini araştırmak için gen ekspresyon omnibus (GEO) veri kümeleri kullanılmıştır. Ek olarak, bir protein-protein etkileşim ağı (PPI) kuruldu ve bunun sonucunda "ilaç-hedef-hastalık" etkileşim ağı içinde 59'u merkez gen olarak kabul edilen 149 hedefin tanımlanması sağlandı.

Perianal egzama tedavisinde SDG'nin gen fonksiyonu, Kyoto Genler ve Genomlar Ansiklopedisi (KEGG) ve Gen Ontolojisi (GO) analizi kullanılarak değerlendirildi. Daha sonra, ağ farmakolojik analizinde tanımlandığı gibi SDG'nin anti-perianal egzama fonksiyonu ve potansiyel yolu, moleküler yerleştirme metodolojisi kullanılarak doğrulandı. Anüs egzamasının tedavisinde SDG hedefli genler ve proteinlerle ilişkili biyolojik süreçler, diğerlerinin yanı sıra öncelikle sitokin aracılı yanıtları, inflamatuar yanıtları ve lipopolisakkarite yanıtları kapsar. Yol zenginleştirme ve fonksiyonel açıklama analizlerinin sonuçları, SDG'nin Shigellosis ve herpes simpleks virüs 1 enfeksiyon yolaklarını düzenleyerek anal egzamanın önlenmesinde ve yönetilmesinde çok önemli bir rol oynadığını göstermektedir. Ağ farmakolojisi ve GEO veri tabanı analizi, anal egzama tedavisinde, özellikle TNF ve MAPK sinyal yollarında çok önemli merkez hedefleri olan TNF, MAPK14 ve CASP3'ü modüle ederek SDG'nin çok hedefli doğasını doğrulamaktadır. Bu bulgular, SDG'nin anal egzama için terapötik mekanizması hakkında daha fazla araştırma için net bir yön sağlarken, bu zayıflatıcı durum için etkili bir tedavi yaklaşımı olma potansiyelini vurgulamaktadır.

Giriş

Anal egzama, perianal bölgeyi ve mukozayı etkileyen, çeşitli klinik belirtiler gösteren alerjik bir cilt rahatsızlığıdır¹. Karakteristik semptomlar arasında anal eritem, papüller, kabarcıklar, erozyon, eksüdalar ve kabuklanma bulunur. Bu belirtiler çoğunlukla etkilenen bölgenin çizilmesi, kalınlaşması ve pürüzlülüğü nedeniyle ortaya çıkar².

Hastalığın uzun sürmesi, tekrarlayan ataklar ve zorlu tedavi ile karakterize edilen anal egzama, hastaların fiziksel ve zihinsel sağlığı üzerinde olumsuz etkilere neden olabilir³. Anal egzamanın patogenezi henüz net değildir ve moder....

Protokol

Bu çalışma etik kurul onayı ve katılım onayı anlamına gelmemektedir. Bu çalışmada kullanılan veriler gen veri tabanlarından elde edilmiştir.

1. Hastalık hedeflerinin tahmini

1. GeneCards veritabanına (https://www.genecards.org) ve insan veritabanında (OMIM, https://www.omim.org) çevrimiçi Mendel kalıtımına erişin ve hastalık hedefleri için arama terimi olarak "anüs egzaması" kullanın.
2. Hastalık hedeflerinin elektronik tablolarını indirin. Anüs egzaması hedeflerini elde etmek için tekrarlanan hedefleri silin.

2. Aktif bileşenlerin seçimi

1. SDG'nin ada....

Tartışmalar

Atopik dermatit, egzama ile altta yatan mekanizmaları paylaşan spesifik bir egzama şeklidir. Bu durumla ilişkili olduğuna inanılan hub genleri TNF, MAPK14 ve CASP3'tür. SDG'nin anal egzama üzerindeki terapötik etkileri, esas olarak bu üç hub geni¹⁷ aracılığıyla TNF ve MAPK sinyal yolları üzerindeki etkisine atfedilir.

SDG beş farklı ilaç içerir: indigo naturalis, altın selvi, kalsine alçıtaşı, kalamin ve Çin Gall'i. Geleneksel Çin tıbbında,.......

Malzemeler

Name	Company	Catalog Number	Comments
AutoDockTools	AutoDock	https://autodocksuite.scripps.edu/adt/
Cytoscape 3.9.1	Cytoscape	https://cytoscape.org/
GeneCards database	GeneCards	https://www.genecards.org
GEO database	National Center for Biotechnology Information	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
GEO2R tool	National Center for Biotechnology Information	https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/
Metascape	Metascape	https://metascape.org/
Online Mendelian inheritance in man database	OMIM	https://www.omim.org
RCSB protein database	RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB)	http://www.pdb.org/
STRING database	STRING	https://string-db.org/
Swiss ADME database	Swiss Institute of Bioinformatics	http://www.swissadme.ch/index.php
Traditional Chinese Medicine system's pharmacology database (TCMSP)	Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform	http://tcmspw.com/tcmsp.php
Venny2.1	BioinfoGP	https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html