Birincil antikorun eklenmesine başlamak için, sığır serum albüminini veya BSA'yı sabit ve bloke transfekte HeLa hücrelerinden aspire edin ve kuyuda 10 mikrolitre BSA çözeltisi bırakın. Daha sonra PBS'de% 3 BSA'da hazırlanan 10 mikrolitre birincil antikor çözeltisini ekleyin ve plakayı karanlıkta gece boyunca dört santigrat derecede inkübe edin. Kuluçkadan sonra, her bir kuyucuğu 100 mikrolitre PBS ile dört kez durulayın ve son yıkamadan sonra 10 mikrolitre bırakın.
Daha sonra, 384 kuyucuk plakasına 10 mikrolitre ikincil antikor çözeltisi ekleyin. Alexa Fluor 488 ve Alexa Fluor 555 gibi florokromlara konjuge edilmiş izotipe özgü antikorlar kullanın. Plakayı karanlıkta bir saat inkübe ettikten sonra, her bir kuyucuğu 100 mikrolitre PBS ile dört kez durulayın ve son yıkamadan sonra kuyucukta 50 mikrolitre PBS bırakın.
Anti-DNA antikorlarının kullanımı, verilen deneysel koşullar altında hücredeki mitokondriyal DNA dağılımının izlenmesine izin verdi. Mitokondriyal transkripsiyon faktörü A TFAM'nin aşağı regülasyonu, mitokondriyal DNA dağılımında, kontrol hücrelerinden daha az mitokondriyal DNA lekesi ile ciddi değişikliklere yol açmıştır. Anti-DNA antikorundan gelen ortalama floresan sinyalinin ölçülmesi, test edilen diğer koşullara kıyasla TFAM susturulması üzerine birkaç kat artış göstermiştir.