L.reuteri'yi uygun bir antibiyotik içeren 10 mililitre MRS suyuna aşılayın ve gece boyunca aerobik olarak 37 santigrat derecede inkübe edin. Ertesi gün, kültürü önceden soğutulmuş bir santrifüjde santrifüj edin Süpernatantı atın ve peletleri iki mililitre standart P1 tamponunda tekrar yıkayın Santrifüj ve pelet 250 mikrolitre modifiye P1 tamponunda yeniden askıya almadan önce süpernatantı atın. 37 santigrat derecede bir ila iki saat boyunca inkübe edin.
Daha sonra, 250 mikrolitre tampon P2 ekleyin ve dört ila altı kez ters çevirerek karıştırın. Beş dakika sonra, 350 mikrolitre tampon N3 ekleyin ve tüpü ters çevirerek karıştırın. 10.000 G'de 10 dakika boyunca santrifüj yapın ve bir spin sütununa mümkün olduğunca fazla süpernatant aktarın.
60 saniye boyunca tekrar santrifüj yapın ve akışı atın. Sıkma kolonunu 500 mikrolitre tampon PB ve santrifüj ile yıkayarak akışı atın. Spin kolonunu 750 mikrolitre tampon PE ile yıkayın ve 60 saniye boyunca 10.000 G'de santrifüj.
Kalan tamponları çıkarmak için akışı ve santrifüjü 60 saniye boyunca tekrar atın. Spin sütununu 1,5 mililitrelik bir mikrosantrifüj tüpüne yerleştirin. Sıkma kolonu filtresine 20 ila 30 mikrolitre Dnaz ve RNaz içermeyen çift damıtılmış su ekleyin ve 60 saniye boyunca 10.000 G'de santrifüj yapmadan önce bir ila iki dakika bekletin.
E.coli mini prep'ten türetilen bir plazmid ile pozitif bir kontrol de dahil olmak üzere, şablon DNA'yı sağlayan elüatlı plazmid-spesifik primerler kullanarak standart bir PCR reaksiyonu gerçekleştirin. Mini prep elüatını bir agaroz jelinden geçirmek, gözlemlenebilir bantlar yerine bir yayma ile sonuçlanır. Bununla birlikte, elüatı bir DNA şablonu olarak kullanan sonraki PCR, beklenen bant boyutlarını üretir.