Anestezi uygulanmış fareyi hayvan tutucuya yerleştirerek ve iki Velcro kayışla sabitleyerek başlayın. Bilgisayarı açın ve lazeri etkinleştirmek için yazılımı açın. Hayvan tutucuyu, lazeri farenin gözünde ortalayacak şekilde ayarlayın.
Arka kısmı yüz önizlemesi, yüzeysel vasküler pleksusun görüş alanı, B taraması ve görüş alanı içindeki retina kesiti ile görselleştirin. Optik odakta küçük ayarlamalar yaptıktan sonra görünür bir ışık optik koherens tomografisi veya OCT hacmine karşı alın. Optik sinir başını, farklı retina alanlarını kapsayacak şekilde görüş alanının dört köşesinin her birine hizalayın.
Retina yüzeyini tespit etmek için yoğunluğa dayalı bir eşik yöntemi kullanın ve hacimden OCT fiber gram oluşturun. İlk 16 mikrometre derinliğini seçerek retina sinir lifi tabakasını veya RNFL'yi kırpın. Ardından, retinal ganglion hücreli akson demetleri ve çevresindeki vaskülatürden oluşan fiber gram görüntüsünü oluşturmak için eksenel yön boyunca ortalama yoğunluk projeksiyonunu hesaplayın.
İşlem sonrası dört görüntüyü monte etmek için bir grafik düzenleyici kullanarak kan damarlarını hizalayın. Kompozit vis-OCT fiber gramı, RGC aksonları için TUJ1 ile immün boyanmış düz monte retinanın karşılık gelen konfokal görüntüsü ile karşılaştırıldı. Kan damarları, konfokal görüntüde ICAM II işaretli kan damarları ile eşleştirilebilen ayırt edilebilir dallanma yapıları sergiler.
Ex vivo konfokal mikroskopi ve in vivo vis-OKT arasındaki yan yana karşılaştırma, aynı RGC ekzon demeti ağlarını ve çevresindeki retina vaskülatürünü ortaya çıkardı.