Otomasyon iş istasyonunu kurarak başlayın. Robotun kavrayıcı koluna uygun erişim sağlayan optoPlate gibi bir mikroplaka aydınlatma cihazı kullanın. Ardından, optoPlate'i programlamak için mevcut MATLAB komut dosyasıyla bir elektronik tabloyu işleyin.
OptoPlate üzerine yanıp sönerek ışık stimülasyon programını yürütün. Robotu programlamak için, taşıyıcının ve LabWare tanımlarının düzgün çalışmasını sağlamak için olası hataları giderin. Robot tutucu kolunun plakayı doğru bir şekilde alma ve yerleştirme yeteneğini doğrulamak için boş bir plakayı komut dosyası döngüsünden birkaç kez geçirin.
Ardından, numune plakasını ayarlamak için plakalardan kolonileri seçin. Daha sonra bunları cam kültür tüplerinde üç mililitre sentetik tam ortama aşılayın. Bu kültürleri gece boyunca 30 santigrat derecede karanlıkta bir silindir tambur üzerinde inkübe edin.
Küvette, 200 mikrolitre kültürü bir mililitre sentetik tam ortamda seyreltin. Bir spektrofotometre kullanarak optik yoğunluğunu kaydedin. Daha sonra, her gece kültürünü cam kültür tüplerinde 0.1'lik bir optik yoğunluğa seyreltin.
Seyreltilmiş kültürleri 96 oyuklu bir plakaya pipetleyin. Negatif kontroller olarak boş ortam ve floresan olmayan hücreler içeren kuyucukları dahil edin. Numune plakasını bir çalkalayıcı inkübatörde 30 santigrat derecede beş saat inkübe edin.
Şimdi, s'yi yerleştirinample, ısıtıcı çalkalayıcıya plaka. Çalıştır'a tıklayarak otomasyon komut dosyasını başlatın. İlk ölçüm plaka okuyucuya kaydedildikten sonra, aydınlatma cihazının anahtarlı uzatma kablosunu açarak ışık stimülasyon programını başlatın.
Optogenetik bir suş için zaman içindeki floresan değerleri, genel floresan seviyesinin ışık stimülasyonunun görev döngüsü ile orantılı olduğunu gösterdi. Karşılık gelen optik yoğunluk değerleri tutarlıydı, bu da büyümenin değişen ışık koşullarından etkilenmediğini gösteriyordu. Farklı optogenetik suşlar, ışık nabız yoğunluğuna, periyoduna ve görev döngüsü varyasyonlarına farklı tepkiler kullandı.
