Başlamak için, bir santrifüj tüpüne 10 mililitre diatom su numunesi alın. Tüpü beş dakika boyunca 13.400 G'de santrifüjleyin. Bir pipet tabancasıyla, süpernatanın 9.8 mililitresini dikkatlice atın.
Daha sonra 200 mikrolitre zenginleştirilmiş diatomlu su örneğini iki mililitrelik bir santrifüj tüpüne aktarın. Daha sonra, boğulmuş bir insan vücudundan 0.5 gram akciğer marjı dokusu alın. Makasla akciğer dokusunu çamurlu hale gelene kadar kesin.
Hem diatom hem de akciğer örneklerinden DNA ekstraksiyonu için, önce her iki örneğe de cam boncuklar ekleyin. Numuneleri iyice karıştırdıktan sonra, tüplere 40 mikrolitre proteinaz K ekleyin. Oda sıcaklığında 15 dakikalık bir inkübasyondan sonra, her iki tüpe 200 mikrolitre bağlayıcı tampon ekleyin.
Numuneleri hemen dört dakika boyunca bir vorteks karıştırıcı ile karıştırın. Ardından tüpleri 10 dakika boyunca 70 santigrat derecede bir su banyosuna yerleştirin. çözüm netleşene kadar.
Daha sonra, berrak çözeltiyi topaklaştırıcı çökelti ile aktarın. silikon matris ile paketlenmiş üç santimetre uzunluğunda bir adsorpsiyon kolonuna. Kolonu 30 saniye boyunca 8.000 G'de santrifüjleyin.
Ardından atık sıvıyı toplama tüpüne atın ve kolonu tekrar toplama tüpüne koyun. Şimdi kolona 500 mikrolitre inhibitör çıkarma tamponu ekleyin ve 30 saniye boyunca 13.400 G'de santrifüjleyin. Atık sıvıyı attıktan sonra, kolona 700 mikrolitre yıkama tamponu ekleyin ve tekrar santrifüjleyin.
Atık sıvıyı attıktan sonra, adsorpsiyon kolonunu tekrar boş toplama tüpüne yerleştirin. Mümkün olduğunca fazla yıkama tamponunu çıkarmak için sütunu iki dakika boyunca 14.500 G'de santrifüjleyin. Şimdi sütunu çıkarın ve temiz bir santrifüj tüpüne yerleştirin.
Adsorpsiyon membranının orta kısmına 100 mikrolitre elüsyon tamponu ekleyin. Kolonu oda sıcaklığında beş dakikalık bir inkübasyondan sonra bir dakika boyunca 13.400 G'de santrifüjleyin. Toplama tüpünde elde edilen çözeltiyi tekrar santrifüjlemeden önce adsorpsiyon kolonuna geri aktarın.
Ayrıştırılmış diatom DNA'sını ileride kullanmak üzere iki ila sekiz santigrat derecede saklayın. Agaroz jel elektroforezi, PCR amplifikasyonundan sonra hem su örneklerinde hem de dokularda 250 ila 500 BP arasında diatom DNA bantları gösterdi.
